More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_1233 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008528  OEOE_1233  DNA repair ATPase  100 
 
 		 551 aa  1108    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.337705  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1599  DNA repair ATPase  41.58 
 
 		 555 aa  395  1e-109  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1178  DNA repair protein RecN  38.28 
 
 		 559 aa  390  1e-107  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000946399  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4026  DNA repair protein RecN  38.84 
 
 		 579 aa  377  1e-103  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0028037  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4304  DNA repair protein RecN  38.49 
 
 		 579 aa  374  1e-102  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000470862  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4284  DNA repair protein RecN  38.49 
 
 		 579 aa  375  1e-102  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0425411  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4246  DNA repair protein RecN  38.31 
 
 		 583 aa  372  1e-102  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00786878  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3916  DNA repair protein  38.49 
 
 		 579 aa  374  1e-102  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000027559  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3927  DNA repair protein  38.31 
 
 		 583 aa  372  1e-102  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0317713  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2316  DNA repair protein RecN  38.73 
 
 		 573 aa  374  1e-102  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0950  DNA repair protein RecN  38.31 
 
 		 579 aa  373  1e-102  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0157368  hitchhiker  0.0000335441 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4078  DNA repair protein RecN  38.31 
 
 		 579 aa  371  1e-101  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4194  DNA repair protein RecN  38.31 
 
 		 579 aa  371  1e-101  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.9666000000000002e-33 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4397  DNA repair protein RecN  38.31 
 
 		 579 aa  371  1e-101  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000441756  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0756  DNA repair ATPase  38.82 
 
 		 562 aa  369  1e-101  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000000414406  hitchhiker  0.0000280252 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0930  ATPase for DNA repair  38.13 
 
 		 555 aa  367  1e-100  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1179  DNA repair and genetic recombination protein  38.04 
 
 		 556 aa  365  1e-99  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2867  DNA repair protein RecN  38.31 
 
 		 579 aa  363  5.0000000000000005e-99  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0501  DNA repair protein RecN  37.86 
 
 		 552 aa  356  5e-97  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.424659  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0254  DNA repair protein RecN  36.97 
 
 		 573 aa  350  4e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1544  DNA repair protein RecN  34.53 
 
 		 566 aa  338  9.999999999999999e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1578  DNA repair protein RecN  36.8 
 
 		 559 aa  329  9e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1611  DNA repair protein RecN  36.8 
 
 		 559 aa  329  9e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000188364  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1080  DNA repair protein RecN  36.33 
 
 		 558 aa  328  2.0000000000000001e-88  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0378  recombination and repair protein  33.82 
 
 		 554 aa  327  4.0000000000000003e-88  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.116911  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2064  DNA repair protein RecN  34.41 
 
 		 558 aa  327  5e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.488529  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0942  DNA repair protein RecN  34.66 
 
 		 554 aa  325  1e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2680  DNA repair protein RecN  34.71 
 
 		 554 aa  324  2e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0814  DNA repair protein RecN  35.04 
 
 		 570 aa  322  9.999999999999999e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3096  DNA repair protein RecN  34.28 
 
 		 574 aa  321  1.9999999999999998e-86  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.155422 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2475  recombination and repair protein  32.67 
 
 		 565 aa  317  3e-85  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1691  DNA repair protein RecN  34.29 
 
 		 557 aa  312  1e-83  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.893605  hitchhiker  0.00244544 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01130  recombination and repair protein  32.91 
 
 		 554 aa  312  1e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1773  DNA repair protein RecN  33.09 
 
 		 553 aa  311  2.9999999999999997e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000824865 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004296  DNA repair protein RecN  32.55 
 
 		 554 aa  311  2.9999999999999997e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.782069  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0594  DNA repair protein RecN  34.68 
 
 		 569 aa  308  2.0000000000000002e-82  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0859323 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2326  DNA repair protein RecN  33.45 
 
 		 560 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000910227  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2069  DNA repair protein RecN  34.15 
 
 		 565 aa  305  2.0000000000000002e-81  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1783  DNA repair protein RecN  33.98 
 
 		 565 aa  305  2.0000000000000002e-81  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1047  DNA repair protein RecN  31.56 
 
 		 580 aa  304  3.0000000000000004e-81  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.266577  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2444  DNA repair protein RecN  33.27 
 
 		 553 aa  301  2e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0113802  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1666  DNA repair protein RecN  32.75 
 
 		 577 aa  301  2e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3298  recombination and repair protein  32.91 
 
 		 553 aa  301  3e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.121559  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1026  recombination and repair protein  32.31 
 
 		 554 aa  300  5e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1084  DNA repair protein RecN  33.39 
 
 		 565 aa  299  9e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000955113  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1707  DNA repair protein RecN  32.62 
 
 		 553 aa  298  1e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1151  recombination and repair protein  32.67 
 
 		 554 aa  299  1e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.901201  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0596  DNA repair protein RecN  32.86 
 
 		 572 aa  298  1e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1043  recombination and repair protein  31.59 
 
 		 552 aa  298  1e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2706  DNA repair protein RecN  34.57 
 
 		 552 aa  297  4e-79  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0651  DNA repair protein  31.54 
 
 		 559 aa  296  5e-79  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3218  recombination and repair protein  32.91 
 
 		 553 aa  296  5e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1714  DNA repair protein RecN  32.25 
 
 		 557 aa  294  2e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2771  recombination and repair protein  31.41 
 
 		 552 aa  294  4e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.170925  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1196  recombination and repair protein  32.49 
 
 		 553 aa  293  4e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02504  recombination and repair protein  32.19 
 
 		 553 aa  292  1e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0788874  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1059  DNA repair protein RecN  32.19 
 
 		 553 aa  292  1e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0987529  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2774  recombination and repair protein  32.19 
 
 		 553 aa  292  1e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000103072  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1068  recombination and repair protein  32.19 
 
 		 553 aa  292  1e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0569436  normal  0.137036 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3483  DNA repair protein RecN  32.17 
 
 		 555 aa  291  1e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02468  hypothetical protein  32.19 
 
 		 553 aa  292  1e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.116899  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2900  recombination and repair protein  32.19 
 
 		 553 aa  291  2e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.004413  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1578  DNA repair protein RecN  32.92 
 
 		 556 aa  291  2e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3005  recombination and repair protein  32.19 
 
 		 553 aa  290  5.0000000000000004e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000658292  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2516  DNA repair protein RecN  34.09 
 
 		 572 aa  290  5.0000000000000004e-77  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3096  recombination and repair protein  32.13 
 
 		 553 aa  290  5.0000000000000004e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.316238  normal  0.467754 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0370  DNA repair protein RecN  31.2 
 
 		 578 aa  289  7e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.431573  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3856  recombination and repair protein  32.01 
 
 		 553 aa  289  9e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00344363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2768  recombination and repair protein  32.01 
 
 		 553 aa  289  1e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00054696  normal  0.107417 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3151  recombination and repair protein  31.23 
 
 		 552 aa  288  2e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0961248  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3153  recombination and repair protein  31.23 
 
 		 552 aa  288  2e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000145597  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1170  recombination and repair protein  31.23 
 
 		 552 aa  288  2e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0260908 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1218  recombination and repair protein  31.23 
 
 		 552 aa  288  2e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.187963  normal  0.0934404 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3296  recombination and repair protein  31.23 
 
 		 552 aa  288  2e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.182341  decreased coverage  0.000158665 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1104  recombination and repair protein  31.23 
 
 		 552 aa  288  2e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.239344  normal  0.154382 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3462  recombination and repair protein  31.05 
 
 		 552 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1763  DNA repair protein RecN  31.62 
 
 		 560 aa  287  2.9999999999999996e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137867  normal  0.0495571 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1749  DNA repair protein RecN  34.33 
 
 		 574 aa  287  4e-76  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2579  DNA repair protein RecN  34.22 
 
 		 562 aa  286  5e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.183283 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1281  recombination and repair protein  31.65 
 
 		 553 aa  286  7e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000117137 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3825  DNA repair protein RecN  31.55 
 
 		 561 aa  286  8e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.321139  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1104  recombination and repair protein  31.05 
 
 		 552 aa  286  9e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.562592 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3011  recombination and repair protein  32.19 
 
 		 553 aa  284  3.0000000000000004e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1169  recombination and repair protein  31.1 
 
 		 553 aa  284  3.0000000000000004e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1896  DNA repair protein RecN  34.34 
 
 		 567 aa  284  3.0000000000000004e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000247727  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2879  recombination and repair protein  32.19 
 
 		 553 aa  283  4.0000000000000003e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.158329 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2829  recombination and repair protein  32.19 
 
 		 553 aa  283  4.0000000000000003e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00407233  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2897  recombination and repair protein  32.19 
 
 		 553 aa  283  4.0000000000000003e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2899  recombination and repair protein  32.19 
 
 		 553 aa  283  4.0000000000000003e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_923  DNA repair protein  31.94 
 
 		 588 aa  283  5.000000000000001e-75  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0553147  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1385  DNA repair protein  32.43 
 
 		 608 aa  283  7.000000000000001e-75  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0276871  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0963  recombination and repair protein  32.19 
 
 		 553 aa  283  7.000000000000001e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0199907  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1446  DNA repair protein RecN  32.43 
 
 		 556 aa  282  9e-75  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000211173  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1055  DNA repair protein RecN  31.77 
 
 		 588 aa  281  3e-74  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0728  recombination and repair protein  32.19 
 
 		 553 aa  281  3e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.118324  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3397  DNA repair protein RecN  34.99 
 
 		 586 aa  280  4e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00306133  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0537  DNA repair protein RecN  32 
 
 		 568 aa  280  6e-74  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.674533  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0701  DNA repair protein RecN  32.1 
 
 		 567 aa  279  7e-74  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0934  DNA repair protein RecN  31.42 
 
 		 588 aa  278  1e-73  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.590863  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3096  DNA repair protein RecN  31.24 
 
 		 557 aa  278  3e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>