More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_25450 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_25450  DNA replication and repair protein RecN  100 
 
 		 593 aa  1134    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5439  DNA repair protein RecN  69.61 
 
 		 592 aa  727    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11711  DNA repair protein recN  55.67 
 
 		 587 aa  559  1e-158  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.31285  normal  0.395213 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2826  DNA repair protein RecN  54.45 
 
 		 590 aa  561  1e-158  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.327916  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1913  DNA repair protein RecN  56.73 
 
 		 585 aa  545  1e-153  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0988612  normal  0.166083 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1904  DNA repair protein RecN  56.03 
 
 		 585 aa  540  9.999999999999999e-153  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0641483  hitchhiker  0.00014462 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2381  DNA repair protein RecN  55.48 
 
 		 590 aa  535  1e-151  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2949  DNA repair protein RecN  56.14 
 
 		 590 aa  526  1e-148  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2993  DNA repair protein RecN  56.14 
 
 		 590 aa  526  1e-148  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.311205  normal  0.473383 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3288  DNA repair protein RecN  55.2 
 
 		 591 aa  523  1e-147  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2964  DNA repair protein RecN  56.31 
 
 		 587 aa  520  1e-146  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3507  DNA repair protein RecN  53.58 
 
 		 598 aa  516  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0691312 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2171  DNA repair protein RecN  54.34 
 
 		 575 aa  503  1e-141  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00879264  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4072  DNA repair protein RecN  53.16 
 
 		 588 aa  499  1e-140  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0367674  normal  0.136098 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5429  DNA repair protein RecN  53.11 
 
 		 580 aa  501  1e-140  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.477052 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2032  DNA repair protein RecN  52.67 
 
 		 567 aa  494  9.999999999999999e-139  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4437  DNA repair protein RecN  53.74 
 
 		 583 aa  492  9.999999999999999e-139  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.297367  normal  0.304528 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6056  DNA repair and genetic recombination  52.66 
 
 		 570 aa  489  1e-137  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0143027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3158  DNA repair protein RecN  52.79 
 
 		 584 aa  484  1e-135  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0998846  normal  0.788962 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2011  DNA repair protein RecN  54.29 
 
 		 580 aa  475  1e-132  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.270463  normal  0.0516704 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3025  DNA repair protein RecN  52.57 
 
 		 569 aa  468  1.0000000000000001e-131  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.185029 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3010  DNA repair protein RecN  54.48 
 
 		 610 aa  462  1e-129  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1753  DNA repair protein RecN  50.35 
 
 		 583 aa  452  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.391848  hitchhiker  0.000930146 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1518  DNA repair protein RecN  49.58 
 
 		 579 aa  453  1.0000000000000001e-126  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.301856  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1659  DNA repair protein RecN  52.38 
 
 		 578 aa  449  1e-125  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0674828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2482  DNA repair protein RecN  50.17 
 
 		 584 aa  452  1e-125  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.315988  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1517  DNA repair protein RecN  49.33 
 
 		 579 aa  446  1.0000000000000001e-124  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000776355 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1126  DNA repair protein RecN  46.61 
 
 		 577 aa  432  1e-120  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3147  DNA repair protein RecN  51.26 
 
 		 611 aa  428  1e-118  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.0041532  normal  0.691504 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22130  DNA replication and repair protein RecN  49.08 
 
 		 583 aa  426  1e-118  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.120117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1342  DNA repair protein RecN  48.9 
 
 		 574 aa  416  9.999999999999999e-116  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1245  DNA repair protein RecN  45.58 
 
 		 592 aa  370  1e-101  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.790366 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14210  DNA repair protein RecN  47.12 
 
 		 580 aa  363  6e-99  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0453265  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2355  DNA repair protein RecN  45.93 
 
 		 612 aa  343  7e-93  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.887863  hitchhiker  0.00822868 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1666  DNA repair protein RecN  37.11 
 
 		 577 aa  335  9e-91  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0254  DNA repair protein RecN  34.13 
 
 		 573 aa  320  3e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13670  DNA repair protein RecN  41.67 
 
 		 590 aa  318  2e-85  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.325794  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2316  DNA repair protein RecN  31.73 
 
 		 573 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4284  DNA repair protein RecN  31.62 
 
 		 579 aa  306  9.000000000000001e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0425411  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4026  DNA repair protein RecN  31.1 
 
 		 579 aa  304  3.0000000000000004e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0028037  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4304  DNA repair protein RecN  31.62 
 
 		 579 aa  304  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000470862  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0950  DNA repair protein RecN  31.62 
 
 		 579 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0157368  hitchhiker  0.0000335441 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4246  DNA repair protein RecN  31.45 
 
 		 583 aa  302  1e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00786878  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3916  DNA repair protein  31.62 
 
 		 579 aa  302  1e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000027559  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3927  DNA repair protein  31.45 
 
 		 583 aa  302  1e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0317713  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4194  DNA repair protein RecN  31.62 
 
 		 579 aa  302  1e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.9666000000000002e-33 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4078  DNA repair protein RecN  31.45 
 
 		 579 aa  301  2e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4397  DNA repair protein RecN  31.45 
 
 		 579 aa  301  2e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000441756  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0814  DNA repair protein RecN  32.08 
 
 		 570 aa  296  7e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0793  DNA repair ATPase  39.64 
 
 		 608 aa  296  1e-78  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1896  DNA repair protein RecN  31.28 
 
 		 567 aa  294  3e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000247727  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0681  DNA repair protein RecN  34.49 
 
 		 594 aa  293  4e-78  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1544  DNA repair protein RecN  30.14 
 
 		 566 aa  291  2e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1047  DNA repair protein RecN  32.5 
 
 		 580 aa  291  2e-77  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.266577  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2867  DNA repair protein RecN  31.5 
 
 		 579 aa  290  5.0000000000000004e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2627  DNA repair protein RecN  28.64 
 
 		 574 aa  288  1e-76  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.434189  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01130  recombination and repair protein  33.85 
 
 		 554 aa  288  2e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1301  DNA repair protein RecN  32.93 
 
 		 561 aa  285  1.0000000000000001e-75  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004296  DNA repair protein RecN  33.68 
 
 		 554 aa  285  1.0000000000000001e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.782069  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_923  DNA repair protein  33.22 
 
 		 588 aa  285  2.0000000000000002e-75  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0553147  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0934  DNA repair protein RecN  33.05 
 
 		 588 aa  284  3.0000000000000004e-75  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.590863  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1055  DNA repair protein RecN  33.05 
 
 		 588 aa  283  6.000000000000001e-75  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0378  recombination and repair protein  34.6 
 
 		 554 aa  282  1e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.116911  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0942  DNA repair protein RecN  35.69 
 
 		 554 aa  280  4e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0594  DNA repair protein RecN  32.25 
 
 		 569 aa  280  7e-74  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0859323 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3218  recombination and repair protein  32.93 
 
 		 553 aa  278  1e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2579  DNA repair protein RecN  30.68 
 
 		 562 aa  278  1e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.183283 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0596  DNA repair protein RecN  34.81 
 
 		 572 aa  278  3e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1178  DNA repair protein RecN  31.14 
 
 		 559 aa  277  4e-73  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000946399  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3320  DNA repair protein RecN  35.83 
 
 		 587 aa  277  4e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0930  ATPase for DNA repair  31.3 
 
 		 555 aa  277  5e-73  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2472  DNA repair protein RecN  35.55 
 
 		 605 aa  276  6e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.400775 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1084  DNA repair protein RecN  32.76 
 
 		 565 aa  276  9e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000955113  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1179  DNA repair and genetic recombination protein  32.59 
 
 		 556 aa  275  1.0000000000000001e-72  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1578  DNA repair protein RecN  35.47 
 
 		 556 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3462  recombination and repair protein  32.64 
 
 		 552 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3397  DNA repair protein RecN  34.41 
 
 		 586 aa  274  4.0000000000000004e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00306133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3296  recombination and repair protein  32.41 
 
 		 552 aa  273  9e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.182341  decreased coverage  0.000158665 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3151  recombination and repair protein  32.41 
 
 		 552 aa  273  9e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0961248  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1218  recombination and repair protein  32.41 
 
 		 552 aa  273  9e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.187963  normal  0.0934404 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3153  recombination and repair protein  32.41 
 
 		 552 aa  273  9e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000145597  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1170  recombination and repair protein  32.06 
 
 		 552 aa  271  2e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0260908 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3298  recombination and repair protein  32.93 
 
 		 553 aa  271  2.9999999999999997e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.121559  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1104  recombination and repair protein  32.47 
 
 		 552 aa  271  2.9999999999999997e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.562592 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1026  recombination and repair protein  32.99 
 
 		 554 aa  270  5e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2680  DNA repair protein RecN  36.25 
 
 		 554 aa  270  5.9999999999999995e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1104  recombination and repair protein  31.72 
 
 		 552 aa  269  8.999999999999999e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.239344  normal  0.154382 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02504  recombination and repair protein  32.64 
 
 		 553 aa  269  1e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0788874  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02468  hypothetical protein  32.64 
 
 		 553 aa  269  1e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.116899  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1151  recombination and repair protein  32.99 
 
 		 554 aa  269  1e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.901201  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2768  recombination and repair protein  32.64 
 
 		 553 aa  269  1e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00054696  normal  0.107417 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2475  recombination and repair protein  32.99 
 
 		 565 aa  269  1e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2069  DNA repair protein RecN  27.01 
 
 		 565 aa  268  2e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1059  DNA repair protein RecN  32.47 
 
 		 553 aa  267  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0987529  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3082  DNA repair protein RecN  38.31 
 
 		 556 aa  268  2.9999999999999995e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1068  recombination and repair protein  32.47 
 
 		 553 aa  267  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0569436  normal  0.137036 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2774  recombination and repair protein  32.47 
 
 		 553 aa  267  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000103072  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3856  recombination and repair protein  32.47 
 
 		 553 aa  267  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00344363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3364  DNA repair protein RecN  34.66 
 
 		 559 aa  267  4e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.276138  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1196  recombination and repair protein  31.24 
 
 		 553 aa  267  4e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>