More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH9_1578 on replicon NC_009487
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1080  DNA repair protein RecN  85.23 
 
 		 558 aa  963    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1578  DNA repair protein RecN  100 
 
 		 559 aa  1125    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1611  DNA repair protein RecN  100 
 
 		 559 aa  1125    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000188364  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2316  DNA repair protein RecN  43.74 
 
 		 573 aa  442  1e-123  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0950  DNA repair protein RecN  42.76 
 
 		 579 aa  433  1e-120  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0157368  hitchhiker  0.0000335441 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2867  DNA repair protein RecN  43.46 
 
 		 579 aa  434  1e-120  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4304  DNA repair protein RecN  42.58 
 
 		 579 aa  429  1e-119  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000470862  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4246  DNA repair protein RecN  42.21 
 
 		 583 aa  429  1e-119  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00786878  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0254  DNA repair protein RecN  42.81 
 
 		 573 aa  429  1e-119  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4026  DNA repair protein RecN  42.4 
 
 		 579 aa  431  1e-119  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0028037  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4284  DNA repair protein RecN  42.76 
 
 		 579 aa  431  1e-119  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0425411  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4078  DNA repair protein RecN  42.4 
 
 		 579 aa  426  1e-118  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3916  DNA repair protein  42.4 
 
 		 579 aa  427  1e-118  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000027559  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3927  DNA repair protein  42.4 
 
 		 583 aa  427  1e-118  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0317713  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4194  DNA repair protein RecN  42.4 
 
 		 579 aa  427  1e-118  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.9666000000000002e-33 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4397  DNA repair protein RecN  42.4 
 
 		 579 aa  426  1e-118  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000441756  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1178  DNA repair protein RecN  39.93 
 
 		 559 aa  412  1e-113  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000946399  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1544  DNA repair protein RecN  39.5 
 
 		 566 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0942  DNA repair protein RecN  39.75 
 
 		 554 aa  393  1e-108  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0930  ATPase for DNA repair  38.45 
 
 		 555 aa  385  1e-106  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1179  DNA repair and genetic recombination protein  36.92 
 
 		 556 aa  371  1e-101  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2064  DNA repair protein RecN  38.35 
 
 		 558 aa  368  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.488529  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0814  DNA repair protein RecN  38.01 
 
 		 570 aa  369  1e-100  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0501  DNA repair protein RecN  36.8 
 
 		 552 aa  364  2e-99  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.424659  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1773  DNA repair protein RecN  39.71 
 
 		 553 aa  362  8e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000824865 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2444  DNA repair protein RecN  40.14 
 
 		 553 aa  357  2.9999999999999997e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0113802  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2326  DNA repair protein RecN  37.43 
 
 		 560 aa  354  2e-96  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000910227  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1599  DNA repair ATPase  36.46 
 
 		 555 aa  355  2e-96  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2680  DNA repair protein RecN  36.09 
 
 		 554 aa  354  2.9999999999999997e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1896  DNA repair protein RecN  36.62 
 
 		 567 aa  348  1e-94  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000247727  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1783  DNA repair protein RecN  36.81 
 
 		 565 aa  347  4e-94  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1578  DNA repair protein RecN  37.43 
 
 		 556 aa  347  5e-94  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3483  DNA repair protein RecN  35.67 
 
 		 555 aa  346  8e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1707  DNA repair protein RecN  39.04 
 
 		 553 aa  345  2e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2069  DNA repair protein RecN  36.64 
 
 		 565 aa  344  2e-93  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06570  DNA repair protein RecN  36.77 
 
 		 565 aa  345  2e-93  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000129264  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0370  DNA repair protein RecN  36.01 
 
 		 578 aa  334  2e-90  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.431573  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1335  DNA repair protein RecN  35.44 
 
 		 551 aa  335  2e-90  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1691  DNA repair protein RecN  37.7 
 
 		 557 aa  333  5e-90  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.893605  hitchhiker  0.00244544 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2579  DNA repair protein RecN  34.47 
 
 		 562 aa  333  5e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.183283 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1084  DNA repair protein RecN  36.2 
 
 		 565 aa  332  8e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000955113  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1233  DNA repair ATPase  36.8 
 
 		 551 aa  329  9e-89  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.337705  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2499  DNA repair protein RecN  33.81 
 
 		 561 aa  327  4.0000000000000003e-88  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0756  DNA repair ATPase  35.05 
 
 		 562 aa  325  2e-87  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000000414406  hitchhiker  0.0000280252 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0596  DNA repair protein RecN  34.39 
 
 		 572 aa  322  1.9999999999999998e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3096  DNA repair protein RecN  33.99 
 
 		 574 aa  319  9e-86  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.155422 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2706  DNA repair protein RecN  34.54 
 
 		 552 aa  318  1e-85  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1047  DNA repair protein RecN  32.75 
 
 		 580 aa  317  3e-85  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.266577  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0587  DNA repair and genetic recombination protein  34.89 
 
 		 560 aa  315  1.9999999999999998e-84  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1666  DNA repair protein RecN  34.88 
 
 		 577 aa  312  7.999999999999999e-84  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0594  DNA repair protein RecN  34.89 
 
 		 569 aa  311  2e-83  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0859323 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1026  recombination and repair protein  34.4 
 
 		 554 aa  311  2e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1749  DNA repair protein RecN  34.79 
 
 		 574 aa  311  2.9999999999999997e-83  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3397  DNA repair protein RecN  33.9 
 
 		 586 aa  307  3e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00306133  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1507  DNA repair protein RecN  33.63 
 
 		 558 aa  305  1.0000000000000001e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1774  DNA repair protein RecN  33.39 
 
 		 556 aa  305  1.0000000000000001e-81  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0968  DNA repair protein RecN  32.73 
 
 		 567 aa  305  2.0000000000000002e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.858596  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2877  DNA repair protein recN  33.57 
 
 		 555 aa  304  3.0000000000000004e-81  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3364  DNA repair protein RecN  33.75 
 
 		 559 aa  303  4.0000000000000003e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.276138  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1763  DNA repair protein RecN  33.1 
 
 		 560 aa  303  4.0000000000000003e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137867  normal  0.0495571 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2739  DNA repair protein recN  33.39 
 
 		 555 aa  302  1e-80  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0576  DNA repair protein RecN  33.69 
 
 		 568 aa  302  1e-80  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0877  DNA repair protein RecN  32.85 
 
 		 552 aa  301  2e-80  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0119  DNA repair protein RecN  32.76 
 
 		 599 aa  300  5e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1281  recombination and repair protein  33.27 
 
 		 553 aa  299  1e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000117137 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3012  DNA repair protein  32.74 
 
 		 551 aa  298  2e-79  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.398213 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1904  DNA repair protein RecN  34.4 
 
 		 564 aa  298  2e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3462  recombination and repair protein  32.68 
 
 		 552 aa  296  6e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1031  DNA repair protein RecN  32.33 
 
 		 572 aa  296  6e-79  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3096  DNA repair protein RecN  32.33 
 
 		 557 aa  295  1e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1191  DNA repair protein RecN  31.62 
 
 		 559 aa  295  2e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2771  recombination and repair protein  32.86 
 
 		 552 aa  294  2e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.170925  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1043  recombination and repair protein  33.04 
 
 		 552 aa  295  2e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1104  recombination and repair protein  32.68 
 
 		 552 aa  294  3e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.562592 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1714  DNA repair protein RecN  33.16 
 
 		 557 aa  293  4e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1104  recombination and repair protein  32.68 
 
 		 552 aa  294  4e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.239344  normal  0.154382 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1170  recombination and repair protein  32.68 
 
 		 552 aa  293  5e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0260908 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3320  DNA repair protein RecN  33.22 
 
 		 587 aa  293  6e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0361  DNA repair protein RecN  32.31 
 
 		 601 aa  293  8e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00213355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5483  DNA repair protein RecN  34.59 
 
 		 558 aa  292  1e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.582199  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1169  recombination and repair protein  32.8 
 
 		 553 aa  291  2e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0378  recombination and repair protein  33.15 
 
 		 554 aa  291  2e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.116911  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2482  DNA repair protein RecN  33.33 
 
 		 568 aa  291  3e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1385  DNA repair protein  34.53 
 
 		 608 aa  290  5.0000000000000004e-77  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0276871  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4507  DNA repair protein RecN  35.25 
 
 		 557 aa  290  6e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1394  DNA repair protein RecN  32.26 
 
 		 551 aa  290  6e-77  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1376  recombination and repair protein  34.05 
 
 		 553 aa  290  7e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000000100313  normal  0.0248594 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2976  recombination and repair protein  34.05 
 
 		 553 aa  290  7e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0819489  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2889  recombination and repair protein  34.05 
 
 		 553 aa  289  8e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000988342  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2651  DNA repair protein  33.16 
 
 		 569 aa  289  1e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.829393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3153  recombination and repair protein  32.68 
 
 		 552 aa  289  1e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000145597  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2888  DNA repair protein RecN  33.27 
 
 		 568 aa  289  1e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3686  recombination and repair protein  34.29 
 
 		 553 aa  288  1e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00128842  normal  0.127979 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1303  DNA repair protein RecN  33.63 
 
 		 557 aa  288  1e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.523963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1218  recombination and repair protein  32.68 
 
 		 552 aa  289  1e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.187963  normal  0.0934404 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1446  DNA repair protein RecN  34.53 
 
 		 556 aa  288  1e-76  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000211173  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3151  recombination and repair protein  32.68 
 
 		 552 aa  289  1e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0961248  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3296  recombination and repair protein  32.68 
 
 		 552 aa  289  1e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.182341  decreased coverage  0.000158665 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1059  DNA repair protein RecN  34.34 
 
 		 553 aa  288  2e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0987529  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1068  recombination and repair protein  34.34 
 
 		 553 aa  288  2e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0569436  normal  0.137036 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>