More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1342 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_1342  DNA repair protein RecN  100 
 
 		 574 aa  1081    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1659  DNA repair protein RecN  65.01 
 
 		 578 aa  585  1e-166  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0674828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1126  DNA repair protein RecN  56.53 
 
 		 577 aa  568  1e-161  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22130  DNA replication and repair protein RecN  57.89 
 
 		 583 aa  548  1e-155  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.120117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2171  DNA repair protein RecN  55.69 
 
 		 575 aa  510  1e-143  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00879264  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2032  DNA repair protein RecN  53.16 
 
 		 567 aa  503  1e-141  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3147  DNA repair protein RecN  54.4 
 
 		 611 aa  483  1e-135  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.0041532  normal  0.691504 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1518  DNA repair protein RecN  50.86 
 
 		 579 aa  483  1e-135  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.301856  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1913  DNA repair protein RecN  52.61 
 
 		 585 aa  480  1e-134  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0988612  normal  0.166083 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1517  DNA repair protein RecN  51.03 
 
 		 579 aa  480  1e-134  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000776355 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6056  DNA repair and genetic recombination  52.26 
 
 		 570 aa  481  1e-134  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0143027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1904  DNA repair protein RecN  51.53 
 
 		 585 aa  477  1e-133  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0641483  hitchhiker  0.00014462 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3025  DNA repair protein RecN  51.92 
 
 		 569 aa  471  1.0000000000000001e-131  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.185029 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2011  DNA repair protein RecN  52.92 
 
 		 580 aa  466  9.999999999999999e-131  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.270463  normal  0.0516704 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3158  DNA repair protein RecN  51.21 
 
 		 584 aa  464  1e-129  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0998846  normal  0.788962 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5429  DNA repair protein RecN  48.29 
 
 		 580 aa  449  1e-125  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.477052 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25450  DNA replication and repair protein RecN  48.9 
 
 		 593 aa  443  1e-123  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1753  DNA repair protein RecN  50.34 
 
 		 583 aa  438  1e-121  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.391848  hitchhiker  0.000930146 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4437  DNA repair protein RecN  50.76 
 
 		 583 aa  438  1e-121  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.297367  normal  0.304528 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5439  DNA repair protein RecN  50.78 
 
 		 592 aa  429  1e-119  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2482  DNA repair protein RecN  49.91 
 
 		 584 aa  432  1e-119  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.315988  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2381  DNA repair protein RecN  48.81 
 
 		 590 aa  424  1e-117  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1245  DNA repair protein RecN  49.65 
 
 		 592 aa  421  1e-116  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.790366 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2355  DNA repair protein RecN  51.05 
 
 		 612 aa  418  9.999999999999999e-116  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.887863  hitchhiker  0.00822868 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2964  DNA repair protein RecN  48.74 
 
 		 587 aa  409  1e-113  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2826  DNA repair protein RecN  44.96 
 
 		 590 aa  409  1e-113  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.327916  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2949  DNA repair protein RecN  48.99 
 
 		 590 aa  411  1e-113  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2993  DNA repair protein RecN  48.99 
 
 		 590 aa  411  1e-113  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.311205  normal  0.473383 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3010  DNA repair protein RecN  52.25 
 
 		 610 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11711  DNA repair protein recN  45.99 
 
 		 587 aa  402  1e-111  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.31285  normal  0.395213 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14210  DNA repair protein RecN  49.23 
 
 		 580 aa  387  1e-106  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0453265  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3288  DNA repair protein RecN  47.41 
 
 		 591 aa  389  1e-106  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3507  DNA repair protein RecN  46.37 
 
 		 598 aa  382  1e-105  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0691312 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4072  DNA repair protein RecN  45.59 
 
 		 588 aa  369  1e-100  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0367674  normal  0.136098 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13670  DNA repair protein RecN  43.77 
 
 		 590 aa  355  1e-96  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.325794  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0793  DNA repair ATPase  42.86 
 
 		 608 aa  344  2e-93  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0681  DNA repair protein RecN  37.42 
 
 		 594 aa  323  4e-87  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1666  DNA repair protein RecN  33.39 
 
 		 577 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2579  DNA repair protein RecN  33.33 
 
 		 562 aa  301  2e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.183283 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2316  DNA repair protein RecN  30.58 
 
 		 573 aa  296  9e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0950  DNA repair protein RecN  30.77 
 
 		 579 aa  294  4e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0157368  hitchhiker  0.0000335441 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4284  DNA repair protein RecN  30.77 
 
 		 579 aa  293  5e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0425411  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4304  DNA repair protein RecN  30.77 
 
 		 579 aa  291  3e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000470862  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3916  DNA repair protein  30.77 
 
 		 579 aa  290  4e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000027559  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4026  DNA repair protein RecN  30.2 
 
 		 579 aa  290  4e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0028037  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4246  DNA repair protein RecN  30.6 
 
 		 583 aa  289  9e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00786878  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4194  DNA repair protein RecN  30.77 
 
 		 579 aa  289  9e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.9666000000000002e-33 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4078  DNA repair protein RecN  30.6 
 
 		 579 aa  288  2e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3927  DNA repair protein  30.6 
 
 		 583 aa  288  2e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0317713  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4397  DNA repair protein RecN  30.6 
 
 		 579 aa  288  2e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000441756  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1453  DNA repair protein RecN  40.18 
 
 		 557 aa  288  2e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0975706  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0254  DNA repair protein RecN  32.42 
 
 		 573 aa  286  5e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2491  DNA repair protein RecN  40.78 
 
 		 571 aa  286  5e-76  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3483  DNA repair protein RecN  34.2 
 
 		 555 aa  286  5.999999999999999e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2867  DNA repair protein RecN  30.38 
 
 		 579 aa  286  5.999999999999999e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0942  DNA repair protein RecN  35.96 
 
 		 554 aa  282  1e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1084  DNA repair protein RecN  32.05 
 
 		 565 aa  282  1e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000955113  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1301  DNA repair protein RecN  31.71 
 
 		 561 aa  281  2e-74  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1578  DNA repair protein RecN  34.43 
 
 		 556 aa  279  1e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0587  DNA repair and genetic recombination protein  31.72 
 
 		 560 aa  278  2e-73  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3218  recombination and repair protein  32.11 
 
 		 553 aa  278  3e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1178  DNA repair protein RecN  31.77 
 
 		 559 aa  276  9e-73  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000946399  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3082  DNA repair protein RecN  41.88 
 
 		 556 aa  274  3e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05390  DNA repair protein RecN  37.69 
 
 		 578 aa  272  9e-72  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.256403  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2627  DNA repair protein RecN  27.35 
 
 		 574 aa  273  9e-72  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.434189  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0930  ATPase for DNA repair  29.88 
 
 		 555 aa  272  1e-71  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1179  DNA repair and genetic recombination protein  30.69 
 
 		 556 aa  270  4e-71  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2516  DNA repair protein RecN  32.48 
 
 		 572 aa  270  7e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3298  recombination and repair protein  32.52 
 
 		 553 aa  269  1e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.121559  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1896  DNA repair protein RecN  29.62 
 
 		 567 aa  268  1e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000247727  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0832  DNA repair protein RecN  36.13 
 
 		 554 aa  268  1e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.013795  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2064  DNA repair protein RecN  35.17 
 
 		 558 aa  268  2e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.488529  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1544  DNA repair protein RecN  28.65 
 
 		 566 aa  268  2e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4337  DNA repair protein RecN  38.24 
 
 		 559 aa  267  2.9999999999999995e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0513473  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0814  DNA repair protein RecN  30.33 
 
 		 570 aa  266  8.999999999999999e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0903  DNA repair protein RecN  35.95 
 
 		 554 aa  266  1e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2680  DNA repair protein RecN  36.19 
 
 		 554 aa  265  2e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3602  DNA repair protein RecN  36.08 
 
 		 557 aa  264  3e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00779581 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1773  DNA repair protein RecN  35.57 
 
 		 553 aa  264  4e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000824865 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2444  DNA repair protein RecN  34.88 
 
 		 553 aa  264  4e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0113802  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0596  DNA repair protein RecN  33.97 
 
 		 572 aa  263  8e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1774  DNA repair protein RecN  35.18 
 
 		 556 aa  262  1e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1385  DNA repair protein  30.7 
 
 		 608 aa  261  2e-68  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0276871  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1446  DNA repair protein RecN  30.7 
 
 		 556 aa  261  2e-68  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000211173  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0119  DNA repair protein RecN  35.81 
 
 		 599 aa  260  5.0000000000000005e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1507  DNA repair protein RecN  36.22 
 
 		 558 aa  259  8e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0728  recombination and repair protein  32.57 
 
 		 553 aa  259  1e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.118324  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0501  DNA repair protein RecN  29.98 
 
 		 552 aa  258  3e-67  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.424659  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1578  DNA repair protein RecN  27.85 
 
 		 559 aa  257  5e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1611  DNA repair protein RecN  27.85 
 
 		 559 aa  257  5e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000188364  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3005  recombination and repair protein  31.76 
 
 		 553 aa  257  5e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000658292  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2768  recombination and repair protein  31.76 
 
 		 553 aa  256  6e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00054696  normal  0.107417 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2900  recombination and repair protein  31.59 
 
 		 553 aa  256  6e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.004413  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0866  DNA repair protein RecN  31.27 
 
 		 555 aa  256  8e-67  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1059  DNA repair protein RecN  31.59 
 
 		 553 aa  256  9e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0987529  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0361  DNA repair protein RecN  34.63 
 
 		 601 aa  256  9e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00213355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1068  recombination and repair protein  31.59 
 
 		 553 aa  256  9e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0569436  normal  0.137036 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2774  recombination and repair protein  31.59 
 
 		 553 aa  256  9e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000103072  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02504  recombination and repair protein  31.59 
 
 		 553 aa  255  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0788874  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01130  recombination and repair protein  31.29 
 
 		 554 aa  256  1.0000000000000001e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>