More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3147 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3147  DNA repair protein RecN  100 
 
 		 611 aa  1139    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.0041532  normal  0.691504 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6056  DNA repair and genetic recombination  54.63 
 
 		 570 aa  516  1.0000000000000001e-145  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0143027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2171  DNA repair protein RecN  55.48 
 
 		 575 aa  513  1e-144  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00879264  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2032  DNA repair protein RecN  53.83 
 
 		 567 aa  514  1e-144  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3025  DNA repair protein RecN  55.56 
 
 		 569 aa  509  1e-143  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.185029 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1518  DNA repair protein RecN  52.67 
 
 		 579 aa  509  1e-143  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.301856  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1517  DNA repair protein RecN  52.23 
 
 		 579 aa  491  1e-137  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000776355 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1753  DNA repair protein RecN  55.69 
 
 		 583 aa  489  1e-137  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.391848  hitchhiker  0.000930146 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3158  DNA repair protein RecN  54.43 
 
 		 584 aa  489  1e-137  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0998846  normal  0.788962 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2011  DNA repair protein RecN  55.1 
 
 		 580 aa  483  1e-135  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.270463  normal  0.0516704 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1659  DNA repair protein RecN  58.52 
 
 		 578 aa  476  1e-133  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0674828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22130  DNA replication and repair protein RecN  52.67 
 
 		 583 aa  471  1.0000000000000001e-131  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.120117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1904  DNA repair protein RecN  53.6 
 
 		 585 aa  463  1e-129  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0641483  hitchhiker  0.00014462 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1342  DNA repair protein RecN  54.14 
 
 		 574 aa  461  9.999999999999999e-129  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2482  DNA repair protein RecN  52.57 
 
 		 584 aa  457  1e-127  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.315988  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5429  DNA repair protein RecN  49.91 
 
 		 580 aa  453  1.0000000000000001e-126  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.477052 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25450  DNA replication and repair protein RecN  51.42 
 
 		 593 aa  449  1e-125  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1126  DNA repair protein RecN  49.66 
 
 		 577 aa  446  1.0000000000000001e-124  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5439  DNA repair protein RecN  52.9 
 
 		 592 aa  444  1e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4437  DNA repair protein RecN  52.67 
 
 		 583 aa  444  1e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.297367  normal  0.304528 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1913  DNA repair protein RecN  52.23 
 
 		 585 aa  445  1e-123  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0988612  normal  0.166083 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1245  DNA repair protein RecN  50 
 
 		 592 aa  436  1e-121  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.790366 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3010  DNA repair protein RecN  53.16 
 
 		 610 aa  413  1e-114  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2355  DNA repair protein RecN  51.82 
 
 		 612 aa  412  1e-113  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.887863  hitchhiker  0.00822868 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14210  DNA repair protein RecN  51.29 
 
 		 580 aa  402  1e-111  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0453265  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4072  DNA repair protein RecN  46.77 
 
 		 588 aa  383  1e-105  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0367674  normal  0.136098 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2381  DNA repair protein RecN  47.81 
 
 		 590 aa  382  1e-104  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3288  DNA repair protein RecN  45.9 
 
 		 591 aa  366  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2826  DNA repair protein RecN  42.62 
 
 		 590 aa  360  4e-98  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.327916  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2949  DNA repair protein RecN  44.94 
 
 		 590 aa  358  9.999999999999999e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2993  DNA repair protein RecN  44.94 
 
 		 590 aa  358  9.999999999999999e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.311205  normal  0.473383 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3507  DNA repair protein RecN  44.33 
 
 		 598 aa  357  3.9999999999999996e-97  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0691312 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11711  DNA repair protein recN  45.58 
 
 		 587 aa  356  7.999999999999999e-97  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.31285  normal  0.395213 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2964  DNA repair protein RecN  45.18 
 
 		 587 aa  355  1e-96  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13670  DNA repair protein RecN  43.4 
 
 		 590 aa  333  4e-90  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.325794  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1896  DNA repair protein RecN  30.99 
 
 		 567 aa  301  2e-80  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000247727  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2316  DNA repair protein RecN  30.74 
 
 		 573 aa  293  9e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0793  DNA repair ATPase  39.25 
 
 		 608 aa  282  1e-74  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0681  DNA repair protein RecN  34.22 
 
 		 594 aa  281  2e-74  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0866  DNA repair protein RecN  31.87 
 
 		 555 aa  276  1.0000000000000001e-72  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0254  DNA repair protein RecN  31.83 
 
 		 573 aa  276  1.0000000000000001e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3082  DNA repair protein RecN  40.35 
 
 		 556 aa  274  3e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1666  DNA repair protein RecN  32.57 
 
 		 577 aa  273  5.000000000000001e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1301  DNA repair protein RecN  32.11 
 
 		 561 aa  273  7e-72  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0942  DNA repair protein RecN  35.7 
 
 		 554 aa  272  1e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1763  DNA repair protein RecN  36.11 
 
 		 560 aa  269  8.999999999999999e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137867  normal  0.0495571 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2064  DNA repair protein RecN  35.71 
 
 		 558 aa  269  1e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.488529  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1544  DNA repair protein RecN  28.85 
 
 		 566 aa  269  1e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06570  DNA repair protein RecN  30.84 
 
 		 565 aa  269  1e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000129264  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1578  DNA repair protein RecN  37.44 
 
 		 556 aa  269  1e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3483  DNA repair protein RecN  31.9 
 
 		 555 aa  268  2e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2579  DNA repair protein RecN  31.11 
 
 		 562 aa  268  2.9999999999999995e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.183283 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1084  DNA repair protein RecN  31.54 
 
 		 565 aa  267  4e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000955113  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1104  recombination and repair protein  32.34 
 
 		 552 aa  266  8.999999999999999e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.239344  normal  0.154382 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3462  recombination and repair protein  31.87 
 
 		 552 aa  265  1e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3916  DNA repair protein  29.77 
 
 		 579 aa  265  1e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000027559  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0814  DNA repair protein RecN  28.6 
 
 		 570 aa  265  2e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4194  DNA repair protein RecN  29.6 
 
 		 579 aa  265  2e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.9666000000000002e-33 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4304  DNA repair protein RecN  29.6 
 
 		 579 aa  264  3e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000470862  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2680  DNA repair protein RecN  37.67 
 
 		 554 aa  264  3e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1170  recombination and repair protein  32.39 
 
 		 552 aa  264  4e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0260908 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3825  DNA repair protein RecN  28.55 
 
 		 561 aa  263  6e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.321139  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1104  recombination and repair protein  32.22 
 
 		 552 aa  263  6e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.562592 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4246  DNA repair protein RecN  29.43 
 
 		 583 aa  263  8e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00786878  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3927  DNA repair protein  29.43 
 
 		 583 aa  263  8e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0317713  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4284  DNA repair protein RecN  29.43 
 
 		 579 aa  263  8e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0425411  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4078  DNA repair protein RecN  29.43 
 
 		 579 aa  263  8.999999999999999e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4397  DNA repair protein RecN  29.43 
 
 		 579 aa  263  8.999999999999999e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000441756  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0596  DNA repair protein RecN  33.22 
 
 		 572 aa  263  8.999999999999999e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4026  DNA repair protein RecN  29.36 
 
 		 579 aa  262  1e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0028037  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0950  DNA repair protein RecN  29.26 
 
 		 579 aa  261  3e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0157368  hitchhiker  0.0000335441 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2421  DNA repair protein RecN  35.76 
 
 		 563 aa  261  4e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.955613  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3364  DNA repair protein RecN  34.61 
 
 		 559 aa  260  4e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.276138  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2491  DNA repair protein RecN  40.27 
 
 		 571 aa  259  8e-68  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2867  DNA repair protein RecN  29.53 
 
 		 579 aa  259  9e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0998  DNA repair protein RecN  35.1 
 
 		 589 aa  259  1e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.553113 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1774  DNA repair protein RecN  34.85 
 
 		 556 aa  258  2e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2472  DNA repair protein RecN  36.88 
 
 		 605 aa  258  2e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.400775 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1047  DNA repair protein RecN  30.92 
 
 		 580 aa  258  2e-67  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.266577  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2096  DNA repair protein RecN  36.41 
 
 		 523 aa  258  3e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1178  DNA repair protein RecN  31.38 
 
 		 559 aa  258  3e-67  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000946399  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1507  DNA repair protein RecN  36.2 
 
 		 558 aa  257  4e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1773  DNA repair protein RecN  35.68 
 
 		 553 aa  257  4e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000824865 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2771  recombination and repair protein  31.29 
 
 		 552 aa  257  5e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.170925  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02504  recombination and repair protein  32.69 
 
 		 553 aa  256  8e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0788874  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02468  hypothetical protein  32.69 
 
 		 553 aa  256  8e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.116899  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2627  DNA repair protein RecN  25.43 
 
 		 574 aa  256  8e-67  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.434189  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1059  DNA repair protein RecN  32.69 
 
 		 553 aa  256  9e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0987529  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1068  recombination and repair protein  32.69 
 
 		 553 aa  256  9e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0569436  normal  0.137036 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2774  recombination and repair protein  32.69 
 
 		 553 aa  256  9e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000103072  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1218  recombination and repair protein  31.47 
 
 		 552 aa  256  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.187963  normal  0.0934404 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3005  recombination and repair protein  32.86 
 
 		 553 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000658292  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3153  recombination and repair protein  31.47 
 
 		 552 aa  256  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000145597  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3296  recombination and repair protein  31.47 
 
 		 552 aa  256  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.182341  decreased coverage  0.000158665 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3151  recombination and repair protein  31.47 
 
 		 552 aa  256  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0961248  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1281  recombination and repair protein  30.72 
 
 		 553 aa  256  1.0000000000000001e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000117137 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2900  recombination and repair protein  32.51 
 
 		 553 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.004413  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0756  DNA repair ATPase  28.92 
 
 		 562 aa  254  2.0000000000000002e-66  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000000414406  hitchhiker  0.0000280252 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2768  recombination and repair protein  32.34 
 
 		 553 aa  254  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00054696  normal  0.107417 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3856  recombination and repair protein  32.51 
 
 		 553 aa  252  1e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00344363  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>