More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2826 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2826  DNA repair protein RecN  100 
 
 		 590 aa  1146    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.327916  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25450  DNA replication and repair protein RecN  54.45 
 
 		 593 aa  568  1e-161  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2381  DNA repair protein RecN  55.95 
 
 		 590 aa  558  1e-158  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3288  DNA repair protein RecN  54.73 
 
 		 591 aa  548  1e-155  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3507  DNA repair protein RecN  53.55 
 
 		 598 aa  544  1e-153  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0691312 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11711  DNA repair protein recN  52.52 
 
 		 587 aa  541  9.999999999999999e-153  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.31285  normal  0.395213 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2949  DNA repair protein RecN  53.2 
 
 		 590 aa  528  1e-148  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2993  DNA repair protein RecN  53.2 
 
 		 590 aa  528  1e-148  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.311205  normal  0.473383 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2964  DNA repair protein RecN  53.79 
 
 		 587 aa  521  1e-146  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5439  DNA repair protein RecN  52.84 
 
 		 592 aa  518  1.0000000000000001e-145  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1913  DNA repair protein RecN  50.08 
 
 		 585 aa  483  1e-135  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0988612  normal  0.166083 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1904  DNA repair protein RecN  50 
 
 		 585 aa  477  1e-133  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0641483  hitchhiker  0.00014462 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4437  DNA repair protein RecN  48.08 
 
 		 583 aa  423  1e-117  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.297367  normal  0.304528 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2171  DNA repair protein RecN  47.91 
 
 		 575 aa  413  1e-114  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00879264  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2032  DNA repair protein RecN  47.31 
 
 		 567 aa  410  1e-113  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3025  DNA repair protein RecN  46.39 
 
 		 569 aa  399  9.999999999999999e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.185029 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6056  DNA repair and genetic recombination  46.21 
 
 		 570 aa  397  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0143027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4072  DNA repair protein RecN  45.29 
 
 		 588 aa  398  1e-109  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0367674  normal  0.136098 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1342  DNA repair protein RecN  44.19 
 
 		 574 aa  395  1e-108  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1518  DNA repair protein RecN  44.65 
 
 		 579 aa  395  1e-108  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.301856  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1517  DNA repair protein RecN  43.54 
 
 		 579 aa  390  1e-107  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000776355 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1126  DNA repair protein RecN  44.48 
 
 		 577 aa  387  1e-106  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3010  DNA repair protein RecN  46.81 
 
 		 610 aa  383  1e-105  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2482  DNA repair protein RecN  44.5 
 
 		 584 aa  373  1e-102  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.315988  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2011  DNA repair protein RecN  45.32 
 
 		 580 aa  371  1e-101  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.270463  normal  0.0516704 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5429  DNA repair protein RecN  43.54 
 
 		 580 aa  368  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.477052 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3158  DNA repair protein RecN  43.05 
 
 		 584 aa  362  1e-98  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0998846  normal  0.788962 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22130  DNA replication and repair protein RecN  42.48 
 
 		 583 aa  357  3.9999999999999996e-97  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.120117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3147  DNA repair protein RecN  42.32 
 
 		 611 aa  353  7e-96  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.0041532  normal  0.691504 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1753  DNA repair protein RecN  42.69 
 
 		 583 aa  349  1e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.391848  hitchhiker  0.000930146 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1659  DNA repair protein RecN  44.26 
 
 		 578 aa  344  2.9999999999999997e-93  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0674828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1245  DNA repair protein RecN  43.29 
 
 		 592 aa  341  2.9999999999999998e-92  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.790366 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14210  DNA repair protein RecN  43.56 
 
 		 580 aa  336  5.999999999999999e-91  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0453265  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1666  DNA repair protein RecN  35.13 
 
 		 577 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13670  DNA repair protein RecN  41.85 
 
 		 590 aa  304  4.0000000000000003e-81  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.325794  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2355  DNA repair protein RecN  40.68 
 
 		 612 aa  303  5.000000000000001e-81  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.887863  hitchhiker  0.00822868 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2316  DNA repair protein RecN  31.76 
 
 		 573 aa  295  1e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0793  DNA repair ATPase  37.99 
 
 		 608 aa  291  3e-77  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0254  DNA repair protein RecN  32.44 
 
 		 573 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1896  DNA repair protein RecN  32.05 
 
 		 567 aa  283  9e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000247727  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0681  DNA repair protein RecN  34.63 
 
 		 594 aa  276  8e-73  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2627  DNA repair protein RecN  29.51 
 
 		 574 aa  275  2.0000000000000002e-72  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.434189  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1544  DNA repair protein RecN  29.7 
 
 		 566 aa  271  2e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4026  DNA repair protein RecN  30.15 
 
 		 579 aa  270  4e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0028037  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2680  DNA repair protein RecN  34.41 
 
 		 554 aa  268  2e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0866  DNA repair protein RecN  32.94 
 
 		 555 aa  268  2e-70  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0950  DNA repair protein RecN  29.65 
 
 		 579 aa  268  2e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0157368  hitchhiker  0.0000335441 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4284  DNA repair protein RecN  29.82 
 
 		 579 aa  268  2e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0425411  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4246  DNA repair protein RecN  29.82 
 
 		 583 aa  266  8e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00786878  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4304  DNA repair protein RecN  29.82 
 
 		 579 aa  266  8.999999999999999e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000470862  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0930  ATPase for DNA repair  30.34 
 
 		 555 aa  265  2e-69  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1178  DNA repair protein RecN  31.08 
 
 		 559 aa  264  3e-69  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000946399  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4194  DNA repair protein RecN  29.82 
 
 		 579 aa  264  4e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.9666000000000002e-33 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3927  DNA repair protein  29.65 
 
 		 583 aa  264  4e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0317713  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4078  DNA repair protein RecN  29.65 
 
 		 579 aa  263  4.999999999999999e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4397  DNA repair protein RecN  29.65 
 
 		 579 aa  263  4.999999999999999e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000441756  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3916  DNA repair protein  29.65 
 
 		 579 aa  263  8e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000027559  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2867  DNA repair protein RecN  29.72 
 
 		 579 aa  259  1e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3462  recombination and repair protein  31.08 
 
 		 552 aa  257  4e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2516  DNA repair protein RecN  31.89 
 
 		 572 aa  257  4e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1179  DNA repair and genetic recombination protein  30.44 
 
 		 556 aa  257  5e-67  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1080  DNA repair protein RecN  27.5 
 
 		 558 aa  255  1.0000000000000001e-66  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2064  DNA repair protein RecN  34.28 
 
 		 558 aa  255  2.0000000000000002e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.488529  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0596  DNA repair protein RecN  33.83 
 
 		 572 aa  255  2.0000000000000002e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1281  recombination and repair protein  30.47 
 
 		 553 aa  254  3e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000117137 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1611  DNA repair protein RecN  28.33 
 
 		 559 aa  254  4.0000000000000004e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000188364  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1578  DNA repair protein RecN  28.33 
 
 		 559 aa  254  4.0000000000000004e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0474  DNA repair protein RecN  32.43 
 
 		 543 aa  253  8.000000000000001e-66  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.51796 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1026  recombination and repair protein  31.64 
 
 		 554 aa  252  1e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1104  recombination and repair protein  30.91 
 
 		 552 aa  251  2e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.562592 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1104  recombination and repair protein  30.74 
 
 		 552 aa  251  2e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.239344  normal  0.154382 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1218  recombination and repair protein  30.74 
 
 		 552 aa  250  5e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.187963  normal  0.0934404 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3153  recombination and repair protein  30.74 
 
 		 552 aa  250  5e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000145597  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3151  recombination and repair protein  30.74 
 
 		 552 aa  250  5e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0961248  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3296  recombination and repair protein  30.74 
 
 		 552 aa  250  5e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.182341  decreased coverage  0.000158665 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2069  DNA repair protein RecN  26.96 
 
 		 565 aa  250  6e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1170  recombination and repair protein  30.74 
 
 		 552 aa  249  8e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0260908 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1599  DNA repair ATPase  30.32 
 
 		 555 aa  249  8e-65  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0814  DNA repair protein RecN  27.95 
 
 		 570 aa  249  9e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3483  DNA repair protein RecN  30.68 
 
 		 555 aa  249  9e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5421  DNA repair protein RecN  33.05 
 
 		 591 aa  249  9e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1783  DNA repair protein RecN  26.54 
 
 		 565 aa  249  1e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0756  DNA repair ATPase  27.97 
 
 		 562 aa  249  1e-64  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000000414406  hitchhiker  0.0000280252 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1047  DNA repair protein RecN  29.83 
 
 		 580 aa  248  2e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.266577  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2579  DNA repair protein RecN  30.03 
 
 		 562 aa  248  2e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.183283 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2771  recombination and repair protein  30.57 
 
 		 552 aa  248  3e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.170925  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0903  DNA repair protein RecN  32.6 
 
 		 554 aa  247  4.9999999999999997e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3602  DNA repair protein RecN  32.94 
 
 		 557 aa  246  6.999999999999999e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00779581 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1998  DNA repair protein RecN  35.37 
 
 		 558 aa  246  6.999999999999999e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0942  DNA repair protein RecN  31.53 
 
 		 554 aa  246  9e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0832  DNA repair protein RecN  32.43 
 
 		 554 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.013795  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0331  DNA repair protein RecN  35.16 
 
 		 565 aa  244  3e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.398153  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2768  recombination and repair protein  30.29 
 
 		 553 aa  243  5e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00054696  normal  0.107417 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0938  DNA repair protein RecN  31.86 
 
 		 555 aa  243  7e-63  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000961269  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3298  recombination and repair protein  30.57 
 
 		 553 aa  243  7.999999999999999e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.121559  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02504  recombination and repair protein  30.12 
 
 		 553 aa  243  9e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0788874  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02468  hypothetical protein  30.12 
 
 		 553 aa  243  9e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.116899  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1385  DNA repair protein  29.13 
 
 		 608 aa  241  2e-62  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0276871  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1446  DNA repair protein RecN  29.13 
 
 		 556 aa  241  2.9999999999999997e-62  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000211173  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1068  recombination and repair protein  29.95 
 
 		 553 aa  241  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0569436  normal  0.137036 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>