More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3158 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1753  DNA repair protein RecN  77.15 
 
 		 583 aa  819    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.391848  hitchhiker  0.000930146 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3158  DNA repair protein RecN  100 
 
 		 584 aa  1102    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0998846  normal  0.788962 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2032  DNA repair protein RecN  56.28 
 
 		 567 aa  576  1.0000000000000001e-163  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3025  DNA repair protein RecN  56.85 
 
 		 569 aa  562  1.0000000000000001e-159  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.185029 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6056  DNA repair and genetic recombination  56.01 
 
 		 570 aa  562  1.0000000000000001e-159  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0143027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5429  DNA repair protein RecN  55.2 
 
 		 580 aa  559  1e-158  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.477052 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2171  DNA repair protein RecN  55.65 
 
 		 575 aa  550  1e-155  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00879264  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2011  DNA repair protein RecN  56.41 
 
 		 580 aa  525  1e-148  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.270463  normal  0.0516704 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1913  DNA repair protein RecN  53.95 
 
 		 585 aa  509  1e-143  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0988612  normal  0.166083 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25450  DNA replication and repair protein RecN  52.98 
 
 		 593 aa  506  9.999999999999999e-143  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1904  DNA repair protein RecN  53.09 
 
 		 585 aa  504  1e-141  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0641483  hitchhiker  0.00014462 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5439  DNA repair protein RecN  54.47 
 
 		 592 aa  501  1e-140  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3147  DNA repair protein RecN  53.92 
 
 		 611 aa  490  1e-137  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.0041532  normal  0.691504 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2482  DNA repair protein RecN  52.46 
 
 		 584 aa  488  1e-136  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.315988  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4437  DNA repair protein RecN  53.36 
 
 		 583 aa  483  1e-135  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.297367  normal  0.304528 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1518  DNA repair protein RecN  50.09 
 
 		 579 aa  466  9.999999999999999e-131  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.301856  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1517  DNA repair protein RecN  50.34 
 
 		 579 aa  462  9.999999999999999e-129  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000776355 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1342  DNA repair protein RecN  51.19 
 
 		 574 aa  456  1e-127  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1126  DNA repair protein RecN  47.27 
 
 		 577 aa  438  1e-121  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22130  DNA replication and repair protein RecN  48.82 
 
 		 583 aa  432  1e-120  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.120117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4072  DNA repair protein RecN  49.07 
 
 		 588 aa  426  1e-118  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0367674  normal  0.136098 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1659  DNA repair protein RecN  49.75 
 
 		 578 aa  416  9.999999999999999e-116  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0674828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3010  DNA repair protein RecN  51.81 
 
 		 610 aa  413  1e-114  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2381  DNA repair protein RecN  46.75 
 
 		 590 aa  415  1e-114  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1245  DNA repair protein RecN  48.27 
 
 		 592 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.790366 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3288  DNA repair protein RecN  47.04 
 
 		 591 aa  389  1e-107  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11711  DNA repair protein recN  44.37 
 
 		 587 aa  389  1e-107  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.31285  normal  0.395213 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3507  DNA repair protein RecN  46.46 
 
 		 598 aa  386  1e-106  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0691312 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2949  DNA repair protein RecN  46.99 
 
 		 590 aa  388  1e-106  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2964  DNA repair protein RecN  47.07 
 
 		 587 aa  385  1e-106  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2993  DNA repair protein RecN  46.99 
 
 		 590 aa  388  1e-106  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.311205  normal  0.473383 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14210  DNA repair protein RecN  48.21 
 
 		 580 aa  379  1e-103  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0453265  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2826  DNA repair protein RecN  43.52 
 
 		 590 aa  374  1e-102  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.327916  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12390  DNA repair protein RecN  40.51 
 
 		 651 aa  341  2.9999999999999998e-92  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00374737  normal  0.634901 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2355  DNA repair protein RecN  43.96 
 
 		 612 aa  336  5.999999999999999e-91  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.887863  hitchhiker  0.00822868 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13670  DNA repair protein RecN  43 
 
 		 590 aa  332  1e-89  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.325794  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2316  DNA repair protein RecN  31.95 
 
 		 573 aa  317  4e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1666  DNA repair protein RecN  33.85 
 
 		 577 aa  312  1e-83  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1896  DNA repair protein RecN  30.46 
 
 		 567 aa  309  9e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000247727  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0681  DNA repair protein RecN  35.06 
 
 		 594 aa  309  1.0000000000000001e-82  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1301  DNA repair protein RecN  32.75 
 
 		 561 aa  305  2.0000000000000002e-81  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2627  DNA repair protein RecN  28.55 
 
 		 574 aa  297  3e-79  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.434189  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1084  DNA repair protein RecN  32.24 
 
 		 565 aa  294  4e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000955113  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0814  DNA repair protein RecN  30.41 
 
 		 570 aa  294  4e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1578  DNA repair protein RecN  36.94 
 
 		 556 aa  293  8e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0254  DNA repair protein RecN  32.01 
 
 		 573 aa  290  5.0000000000000004e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1544  DNA repair protein RecN  28.64 
 
 		 566 aa  290  7e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2579  DNA repair protein RecN  31.54 
 
 		 562 aa  289  8e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.183283 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0950  DNA repair protein RecN  30.39 
 
 		 579 aa  289  1e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0157368  hitchhiker  0.0000335441 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4284  DNA repair protein RecN  30.1 
 
 		 579 aa  287  4e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0425411  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3916  DNA repair protein  30.15 
 
 		 579 aa  286  8e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000027559  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2867  DNA repair protein RecN  30.68 
 
 		 579 aa  286  8e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4304  DNA repair protein RecN  30.1 
 
 		 579 aa  286  9e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000470862  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4194  DNA repair protein RecN  30.1 
 
 		 579 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.9666000000000002e-33 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3397  DNA repair protein RecN  34.42 
 
 		 586 aa  285  2.0000000000000002e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00306133  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4078  DNA repair protein RecN  29.93 
 
 		 579 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3927  DNA repair protein  29.93 
 
 		 583 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0317713  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0942  DNA repair protein RecN  34.49 
 
 		 554 aa  285  2.0000000000000002e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4397  DNA repair protein RecN  29.93 
 
 		 579 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000441756  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3364  DNA repair protein RecN  33.73 
 
 		 559 aa  285  2.0000000000000002e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.276138  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4246  DNA repair protein RecN  29.97 
 
 		 583 aa  284  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00786878  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4026  DNA repair protein RecN  30.17 
 
 		 579 aa  284  3.0000000000000004e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0028037  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05390  DNA repair protein RecN  38.63 
 
 		 578 aa  283  7.000000000000001e-75  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.256403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3082  DNA repair protein RecN  38.94 
 
 		 556 aa  283  9e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0793  DNA repair ATPase  37.44 
 
 		 608 aa  280  6e-74  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1047  DNA repair protein RecN  30.07 
 
 		 580 aa  277  4e-73  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.266577  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3218  recombination and repair protein  30.21 
 
 		 553 aa  276  6e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2879  recombination and repair protein  32.76 
 
 		 553 aa  275  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.158329 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2899  recombination and repair protein  32.76 
 
 		 553 aa  275  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2897  recombination and repair protein  32.76 
 
 		 553 aa  275  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2829  recombination and repair protein  32.76 
 
 		 553 aa  275  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00407233  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0728  recombination and repair protein  31.6 
 
 		 553 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.118324  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1055  DNA repair protein RecN  32.99 
 
 		 588 aa  274  3e-72  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1178  DNA repair protein RecN  30.69 
 
 		 559 aa  274  3e-72  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000946399  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2680  DNA repair protein RecN  35.01 
 
 		 554 aa  273  4.0000000000000004e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3011  recombination and repair protein  32.59 
 
 		 553 aa  273  5.000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0426  DNA repair protein RecN  30.22 
 
 		 553 aa  272  1e-71  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2064  DNA repair protein RecN  33.1 
 
 		 558 aa  271  2e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.488529  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1191  DNA repair protein RecN  32.35 
 
 		 559 aa  271  2e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1774  DNA repair protein RecN  33.45 
 
 		 556 aa  271  2e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3096  recombination and repair protein  31.61 
 
 		 553 aa  271  2e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.316238  normal  0.467754 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0963  recombination and repair protein  31.25 
 
 		 553 aa  270  4e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0199907  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02504  recombination and repair protein  31.42 
 
 		 553 aa  270  5e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0788874  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02468  hypothetical protein  31.42 
 
 		 553 aa  270  5e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.116899  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1652  DNA repair protein RecN  34.88 
 
 		 558 aa  270  7e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0998  DNA repair protein RecN  35.95 
 
 		 589 aa  270  7e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.553113 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2768  recombination and repair protein  31.42 
 
 		 553 aa  269  1e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00054696  normal  0.107417 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1059  DNA repair protein RecN  31.25 
 
 		 553 aa  268  2e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0987529  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1068  recombination and repair protein  31.25 
 
 		 553 aa  268  2e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0569436  normal  0.137036 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0934  DNA repair protein RecN  31.63 
 
 		 588 aa  268  2e-70  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.590863  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_923  DNA repair protein  32.37 
 
 		 588 aa  268  2e-70  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0553147  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0119  DNA repair protein RecN  34.57 
 
 		 599 aa  268  2e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2774  recombination and repair protein  31.25 
 
 		 553 aa  268  2e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000103072  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0596  DNA repair protein RecN  32.77 
 
 		 572 aa  268  2e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2900  recombination and repair protein  31.08 
 
 		 553 aa  267  5e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.004413  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2482  DNA repair protein RecN  35.68 
 
 		 568 aa  266  5e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06570  DNA repair protein RecN  29.85 
 
 		 565 aa  266  5.999999999999999e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000129264  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3298  recombination and repair protein  30.38 
 
 		 553 aa  266  5.999999999999999e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.121559  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2888  DNA repair protein RecN  35.33 
 
 		 568 aa  266  8e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3856  recombination and repair protein  31.25 
 
 		 553 aa  266  8.999999999999999e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00344363  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>