More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2355 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_2355  DNA repair protein RecN  100 
 
 		 612 aa  1144    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.887863  hitchhiker  0.00822868 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1517  DNA repair protein RecN  48.63 
 
 		 579 aa  451  1e-125  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000776355 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1518  DNA repair protein RecN  47.17 
 
 		 579 aa  444  1e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.301856  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3147  DNA repair protein RecN  51.82 
 
 		 611 aa  438  1e-121  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.0041532  normal  0.691504 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1659  DNA repair protein RecN  51.92 
 
 		 578 aa  436  1e-121  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0674828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1342  DNA repair protein RecN  51.76 
 
 		 574 aa  438  1e-121  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1126  DNA repair protein RecN  47.39 
 
 		 577 aa  434  1e-120  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22130  DNA replication and repair protein RecN  49.2 
 
 		 583 aa  431  1e-119  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.120117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1904  DNA repair protein RecN  47.51 
 
 		 585 aa  419  1e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0641483  hitchhiker  0.00014462 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2032  DNA repair protein RecN  47.27 
 
 		 567 aa  419  9.999999999999999e-116  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2171  DNA repair protein RecN  47.85 
 
 		 575 aa  415  1e-114  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00879264  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1913  DNA repair protein RecN  46.55 
 
 		 585 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0988612  normal  0.166083 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3025  DNA repair protein RecN  48.02 
 
 		 569 aa  404  1e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.185029 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2011  DNA repair protein RecN  47.67 
 
 		 580 aa  401  9.999999999999999e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.270463  normal  0.0516704 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6056  DNA repair and genetic recombination  44.54 
 
 		 570 aa  400  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0143027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25450  DNA replication and repair protein RecN  46.19 
 
 		 593 aa  399  1e-109  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2482  DNA repair protein RecN  44.91 
 
 		 584 aa  393  1e-108  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.315988  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5439  DNA repair protein RecN  46.2 
 
 		 592 aa  389  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1753  DNA repair protein RecN  45.26 
 
 		 583 aa  379  1e-104  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.391848  hitchhiker  0.000930146 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4437  DNA repair protein RecN  45.73 
 
 		 583 aa  379  1e-104  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.297367  normal  0.304528 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5429  DNA repair protein RecN  44.52 
 
 		 580 aa  372  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.477052 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2381  DNA repair protein RecN  45.25 
 
 		 590 aa  368  1e-100  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3158  DNA repair protein RecN  43.99 
 
 		 584 aa  366  1e-100  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0998846  normal  0.788962 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1245  DNA repair protein RecN  45.38 
 
 		 592 aa  368  1e-100  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.790366 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11711  DNA repair protein recN  43.4 
 
 		 587 aa  350  4e-95  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.31285  normal  0.395213 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3288  DNA repair protein RecN  43.96 
 
 		 591 aa  348  1e-94  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3010  DNA repair protein RecN  47.13 
 
 		 610 aa  348  2e-94  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2964  DNA repair protein RecN  42.72 
 
 		 587 aa  342  1e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3507  DNA repair protein RecN  42.1 
 
 		 598 aa  342  2e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0691312 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14210  DNA repair protein RecN  45.88 
 
 		 580 aa  340  5.9999999999999996e-92  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0453265  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2949  DNA repair protein RecN  42.5 
 
 		 590 aa  336  7e-91  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2993  DNA repair protein RecN  42.5 
 
 		 590 aa  336  7e-91  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.311205  normal  0.473383 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4072  DNA repair protein RecN  43.52 
 
 		 588 aa  333  5e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0367674  normal  0.136098 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2826  DNA repair protein RecN  41.03 
 
 		 590 aa  333  8e-90  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.327916  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12390  DNA repair protein RecN  41.46 
 
 		 651 aa  318  3e-85  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00374737  normal  0.634901 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13670  DNA repair protein RecN  40.26 
 
 		 590 aa  293  9e-78  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.325794  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0681  DNA repair protein RecN  33.18 
 
 		 594 aa  275  1.0000000000000001e-72  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3082  DNA repair protein RecN  39.25 
 
 		 556 aa  270  4e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1301  DNA repair protein RecN  30.89 
 
 		 561 aa  270  5e-71  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0793  DNA repair ATPase  36.15 
 
 		 608 aa  270  5e-71  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2482  DNA repair protein RecN  37.97 
 
 		 568 aa  270  7e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1896  DNA repair protein RecN  29.41 
 
 		 567 aa  269  8.999999999999999e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000247727  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1544  DNA repair protein RecN  28.12 
 
 		 566 aa  269  1e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2888  DNA repair protein RecN  37.64 
 
 		 568 aa  268  2e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1453  DNA repair protein RecN  41.23 
 
 		 557 aa  267  4e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0975706  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1179  DNA repair and genetic recombination protein  29.95 
 
 		 556 aa  260  6e-68  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1763  DNA repair protein RecN  34.09 
 
 		 560 aa  260  7e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137867  normal  0.0495571 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0254  DNA repair protein RecN  30.81 
 
 		 573 aa  255  2.0000000000000002e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4284  DNA repair protein RecN  27.38 
 
 		 579 aa  254  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0425411  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0950  DNA repair protein RecN  27.46 
 
 		 579 aa  254  5.000000000000001e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0157368  hitchhiker  0.0000335441 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3916  DNA repair protein  27.14 
 
 		 579 aa  253  8.000000000000001e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000027559  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4304  DNA repair protein RecN  27.38 
 
 		 579 aa  253  9.000000000000001e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000470862  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2579  DNA repair protein RecN  30.29 
 
 		 562 aa  253  1e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.183283 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3483  DNA repair protein RecN  31.89 
 
 		 555 aa  252  1e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2316  DNA repair protein RecN  27.29 
 
 		 573 aa  252  2e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3927  DNA repair protein  27.21 
 
 		 583 aa  251  2e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0317713  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4194  DNA repair protein RecN  27.38 
 
 		 579 aa  251  2e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.9666000000000002e-33 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4246  DNA repair protein RecN  27.21 
 
 		 583 aa  251  3e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00786878  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4078  DNA repair protein RecN  27.21 
 
 		 579 aa  251  3e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4397  DNA repair protein RecN  27.21 
 
 		 579 aa  251  3e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000441756  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1774  DNA repair protein RecN  33.87 
 
 		 556 aa  251  4e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2421  DNA repair protein RecN  34.42 
 
 		 563 aa  249  7e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.955613  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3602  DNA repair protein RecN  33.66 
 
 		 557 aa  249  9e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00779581 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1666  DNA repair protein RecN  29.95 
 
 		 577 aa  249  1e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0474  DNA repair protein RecN  33.22 
 
 		 543 aa  248  3e-64  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.51796 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1084  DNA repair protein RecN  30.31 
 
 		 565 aa  248  3e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000955113  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4026  DNA repair protein RecN  27.05 
 
 		 579 aa  247  6e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0028037  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0501  DNA repair protein RecN  28.76 
 
 		 552 aa  246  9.999999999999999e-64  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.424659  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06570  DNA repair protein RecN  28.36 
 
 		 565 aa  246  9.999999999999999e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000129264  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0942  DNA repair protein RecN  34.97 
 
 		 554 aa  245  1.9999999999999999e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2867  DNA repair protein RecN  26.98 
 
 		 579 aa  244  3.9999999999999997e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0930  ATPase for DNA repair  28.41 
 
 		 555 aa  244  3.9999999999999997e-63  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1104  recombination and repair protein  30 
 
 		 552 aa  244  3.9999999999999997e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.239344  normal  0.154382 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0596  DNA repair protein RecN  32.15 
 
 		 572 aa  244  5e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3462  recombination and repair protein  29.84 
 
 		 552 aa  243  6e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1652  DNA repair protein RecN  34.55 
 
 		 558 aa  242  2e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01130  recombination and repair protein  30.36 
 
 		 554 aa  241  2e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1170  recombination and repair protein  30 
 
 		 552 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0260908 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0119  DNA repair protein RecN  33.23 
 
 		 599 aa  241  4e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2771  recombination and repair protein  29.67 
 
 		 552 aa  238  2e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.170925  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2326  DNA repair protein RecN  33.01 
 
 		 560 aa  238  2e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000910227  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1104  recombination and repair protein  29.95 
 
 		 552 aa  238  2e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.562592 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2475  recombination and repair protein  28.83 
 
 		 565 aa  239  2e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0259  DNA repair protein RecN  35.09 
 
 		 549 aa  238  3e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.255628  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0743  DNA repair protein RecN  35.09 
 
 		 549 aa  238  3e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.259434  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2096  DNA repair protein RecN  36.86 
 
 		 523 aa  238  3e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1301  DNA repair protein RecN  33.17 
 
 		 547 aa  236  7e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.549514 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0713  DNA repair protein RecN  34.93 
 
 		 549 aa  236  8e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.685992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004296  DNA repair protein RecN  29.82 
 
 		 554 aa  236  1.0000000000000001e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.782069  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2333  DNA repair protein RecN  35.53 
 
 		 549 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0361  DNA repair protein RecN  33.28 
 
 		 601 aa  235  2.0000000000000002e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00213355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3329  DNA repair protein RecN  35.53 
 
 		 549 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3319  DNA repair protein RecN  35.53 
 
 		 549 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.303665  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0866  DNA repair protein RecN  29.49 
 
 		 555 aa  235  2.0000000000000002e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0492  DNA repair protein RecN  35.53 
 
 		 549 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3286  DNA repair protein RecN  35.53 
 
 		 549 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0539815  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1107  DNA repair protein RecN  35.53 
 
 		 549 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0249547  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2214  DNA repair protein RecN  35.53 
 
 		 549 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.725261  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1300  DNA repair protein RecN  35.58 
 
 		 549 aa  234  4.0000000000000004e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00383913  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1578  DNA repair protein RecN  24.84 
 
 		 559 aa  234  4.0000000000000004e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>