More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3288 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_2964  DNA repair protein RecN  78.15 
 
 		 587 aa  820    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2949  DNA repair protein RecN  78.49 
 
 		 590 aa  835    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11711  DNA repair protein recN  71.86 
 
 		 587 aa  775    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.31285  normal  0.395213 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3507  DNA repair protein RecN  87.94 
 
 		 598 aa  973    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0691312 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2993  DNA repair protein RecN  78.49 
 
 		 590 aa  835    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.311205  normal  0.473383 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3288  DNA repair protein RecN  100 
 
 		 591 aa  1134    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2826  DNA repair protein RecN  54.67 
 
 		 590 aa  558  1e-157  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.327916  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2381  DNA repair protein RecN  56.54 
 
 		 590 aa  551  1e-155  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25450  DNA replication and repair protein RecN  54.88 
 
 		 593 aa  543  1e-153  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5439  DNA repair protein RecN  54.67 
 
 		 592 aa  520  1e-146  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1904  DNA repair protein RecN  50.25 
 
 		 585 aa  454  1.0000000000000001e-126  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0641483  hitchhiker  0.00014462 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1913  DNA repair protein RecN  49.83 
 
 		 585 aa  442  9.999999999999999e-123  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0988612  normal  0.166083 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6056  DNA repair and genetic recombination  48.57 
 
 		 570 aa  413  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0143027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4437  DNA repair protein RecN  48.74 
 
 		 583 aa  407  1.0000000000000001e-112  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.297367  normal  0.304528 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4072  DNA repair protein RecN  48.55 
 
 		 588 aa  404  1e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0367674  normal  0.136098 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2171  DNA repair protein RecN  48.24 
 
 		 575 aa  401  9.999999999999999e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00879264  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2032  DNA repair protein RecN  46.71 
 
 		 567 aa  396  1e-109  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3025  DNA repair protein RecN  46.8 
 
 		 569 aa  393  1e-108  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.185029 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1126  DNA repair protein RecN  44.82 
 
 		 577 aa  387  1e-106  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2482  DNA repair protein RecN  47.19 
 
 		 584 aa  387  1e-106  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.315988  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3158  DNA repair protein RecN  46.76 
 
 		 584 aa  383  1e-105  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0998846  normal  0.788962 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5429  DNA repair protein RecN  45.36 
 
 		 580 aa  380  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.477052 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22130  DNA replication and repair protein RecN  46.6 
 
 		 583 aa  379  1e-103  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.120117  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2011  DNA repair protein RecN  48.36 
 
 		 580 aa  376  1e-103  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.270463  normal  0.0516704 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1342  DNA repair protein RecN  46.22 
 
 		 574 aa  374  1e-102  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3010  DNA repair protein RecN  47.49 
 
 		 610 aa  371  1e-101  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1518  DNA repair protein RecN  45.32 
 
 		 579 aa  372  1e-101  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.301856  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3147  DNA repair protein RecN  45.39 
 
 		 611 aa  362  1e-98  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.0041532  normal  0.691504 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1753  DNA repair protein RecN  45.39 
 
 		 583 aa  361  2e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.391848  hitchhiker  0.000930146 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1517  DNA repair protein RecN  44.03 
 
 		 579 aa  360  3e-98  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000776355 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1659  DNA repair protein RecN  47.58 
 
 		 578 aa  347  3e-94  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0674828  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14210  DNA repair protein RecN  43.38 
 
 		 580 aa  330  3e-89  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0453265  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1245  DNA repair protein RecN  44.22 
 
 		 592 aa  328  2.0000000000000001e-88  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.790366 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2355  DNA repair protein RecN  43.46 
 
 		 612 aa  319  1e-85  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.887863  hitchhiker  0.00822868 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2316  DNA repair protein RecN  32.78 
 
 		 573 aa  305  2.0000000000000002e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0681  DNA repair protein RecN  35.71 
 
 		 594 aa  296  6e-79  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13670  DNA repair protein RecN  42.67 
 
 		 590 aa  288  1e-76  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.325794  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0254  DNA repair protein RecN  33.16 
 
 		 573 aa  285  2.0000000000000002e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0793  DNA repair ATPase  38.52 
 
 		 608 aa  277  4e-73  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1301  DNA repair protein RecN  32.14 
 
 		 561 aa  273  5.000000000000001e-72  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2096  DNA repair protein RecN  37.24 
 
 		 523 aa  271  2.9999999999999997e-71  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0832  DNA repair protein RecN  36.33 
 
 		 554 aa  270  5e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.013795  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0930  ATPase for DNA repair  31.68 
 
 		 555 aa  270  5e-71  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0903  DNA repair protein RecN  36.51 
 
 		 554 aa  270  5.9999999999999995e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1763  DNA repair protein RecN  35.42 
 
 		 560 aa  269  8e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137867  normal  0.0495571 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0907  DNA repair protein RecN  36.11 
 
 		 549 aa  267  4e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.933799  normal  0.849345 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0501  DNA repair protein RecN  30.58 
 
 		 552 aa  266  8e-70  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.424659  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1666  DNA repair protein RecN  33.56 
 
 		 577 aa  263  6e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2627  DNA repair protein RecN  27.55 
 
 		 574 aa  263  6.999999999999999e-69  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.434189  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0950  DNA repair protein RecN  30.19 
 
 		 579 aa  263  8e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0157368  hitchhiker  0.0000335441 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4284  DNA repair protein RecN  30.35 
 
 		 579 aa  263  1e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0425411  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3927  DNA repair protein  30.19 
 
 		 583 aa  261  2e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0317713  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4194  DNA repair protein RecN  30.35 
 
 		 579 aa  261  2e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.9666000000000002e-33 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4304  DNA repair protein RecN  30.35 
 
 		 579 aa  262  2e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000470862  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2867  DNA repair protein RecN  30.35 
 
 		 579 aa  261  2e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06570  DNA repair protein RecN  31.49 
 
 		 565 aa  261  2e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000129264  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1178  DNA repair protein RecN  31.35 
 
 		 559 aa  262  2e-68  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000946399  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4026  DNA repair protein RecN  30.69 
 
 		 579 aa  261  2e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0028037  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4078  DNA repair protein RecN  30.19 
 
 		 579 aa  260  4e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4397  DNA repair protein RecN  30.19 
 
 		 579 aa  260  4e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000441756  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1325  DNA repair protein RecN  37.69 
 
 		 529 aa  260  4e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.11608  normal  0.581272 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4246  DNA repair protein RecN  30.19 
 
 		 583 aa  260  6e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00786878  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1047  DNA repair protein RecN  30.3 
 
 		 580 aa  260  6e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.266577  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2064  DNA repair protein RecN  34.58 
 
 		 558 aa  259  7e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.488529  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1301  DNA repair protein RecN  35.21 
 
 		 547 aa  259  9e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.549514 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0998  DNA repair protein RecN  35.03 
 
 		 589 aa  259  9e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.553113 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3916  DNA repair protein  30.02 
 
 		 579 aa  259  1e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000027559  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1179  DNA repair and genetic recombination protein  30.82 
 
 		 556 aa  256  1.0000000000000001e-66  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1107  DNA repair protein RecN  35.22 
 
 		 549 aa  255  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0249547  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2333  DNA repair protein RecN  35.22 
 
 		 549 aa  255  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3286  DNA repair protein RecN  35.22 
 
 		 549 aa  255  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0539815  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0492  DNA repair protein RecN  35.22 
 
 		 549 aa  255  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3319  DNA repair protein RecN  35.22 
 
 		 549 aa  255  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.303665  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2214  DNA repair protein RecN  35.22 
 
 		 549 aa  255  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.725261  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4337  DNA repair protein RecN  37.54 
 
 		 559 aa  254  4.0000000000000004e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0513473  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3329  DNA repair protein RecN  35.05 
 
 		 549 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1896  DNA repair protein RecN  30.32 
 
 		 567 aa  253  6e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000247727  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1774  DNA repair protein RecN  32.76 
 
 		 556 aa  253  8.000000000000001e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1611  DNA repair protein RecN  29.63 
 
 		 559 aa  252  1e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000188364  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1578  DNA repair protein RecN  29.63 
 
 		 559 aa  252  1e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1080  DNA repair protein RecN  28.21 
 
 		 558 aa  251  2e-65  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3602  DNA repair protein RecN  35.55 
 
 		 557 aa  251  2e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00779581 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0378  recombination and repair protein  32.03 
 
 		 554 aa  251  3e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.116911  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1385  DNA repair protein  30.07 
 
 		 608 aa  251  3e-65  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0276871  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1446  DNA repair protein RecN  30.07 
 
 		 556 aa  250  4e-65  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000211173  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0637  DNA repair protein RecN  36.43 
 
 		 549 aa  250  5e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0661  DNA repair protein RecN  36.25 
 
 		 549 aa  248  2e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1544  DNA repair protein RecN  27.94 
 
 		 566 aa  247  4e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0259  DNA repair protein RecN  36.47 
 
 		 549 aa  247  4.9999999999999997e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.255628  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0743  DNA repair protein RecN  36.47 
 
 		 549 aa  247  4.9999999999999997e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.259434  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1026  recombination and repair protein  33.33 
 
 		 554 aa  246  8e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0474  DNA repair protein RecN  34.35 
 
 		 543 aa  246  9.999999999999999e-64  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.51796 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0713  DNA repair protein RecN  36.47 
 
 		 549 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.685992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2071  DNA repair protein RecN  35.08 
 
 		 557 aa  245  1.9999999999999999e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.240609  hitchhiker  0.00158855 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2641  DNA repair protein RecN  34.3 
 
 		 549 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227143  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3218  recombination and repair protein  30.55 
 
 		 553 aa  244  1.9999999999999999e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0914  DNA repair protein RecN  30.36 
 
 		 558 aa  244  1.9999999999999999e-63  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.473015  normal  0.408005 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3011  recombination and repair protein  31.23 
 
 		 553 aa  244  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01130  recombination and repair protein  30.57 
 
 		 554 aa  244  3e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0370  DNA repair protein RecN  32.82 
 
 		 578 aa  244  3e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.431573  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>