More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3507 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_2964  DNA repair protein RecN  77.35 
 
 		 587 aa  813    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11711  DNA repair protein recN  70.69 
 
 		 587 aa  771    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.31285  normal  0.395213 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2949  DNA repair protein RecN  77.85 
 
 		 590 aa  830    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3507  DNA repair protein RecN  100 
 
 		 598 aa  1150    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0691312 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2993  DNA repair protein RecN  77.85 
 
 		 590 aa  830    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.311205  normal  0.473383 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3288  DNA repair protein RecN  88.12 
 
 		 591 aa  970    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2826  DNA repair protein RecN  53.55 
 
 		 590 aa  557  1e-157  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.327916  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2381  DNA repair protein RecN  55.22 
 
 		 590 aa  550  1e-155  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25450  DNA replication and repair protein RecN  53.58 
 
 		 593 aa  538  1e-151  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5439  DNA repair protein RecN  53.68 
 
 		 592 aa  516  1.0000000000000001e-145  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1904  DNA repair protein RecN  50.33 
 
 		 585 aa  461  9.999999999999999e-129  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0641483  hitchhiker  0.00014462 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1913  DNA repair protein RecN  50 
 
 		 585 aa  449  1e-125  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0988612  normal  0.166083 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6056  DNA repair and genetic recombination  47.17 
 
 		 570 aa  414  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0143027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4072  DNA repair protein RecN  48.06 
 
 		 588 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0367674  normal  0.136098 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4437  DNA repair protein RecN  47.34 
 
 		 583 aa  400  9.999999999999999e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.297367  normal  0.304528 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2171  DNA repair protein RecN  46.76 
 
 		 575 aa  401  9.999999999999999e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00879264  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3025  DNA repair protein RecN  45.48 
 
 		 569 aa  393  1e-108  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.185029 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2032  DNA repair protein RecN  44.98 
 
 		 567 aa  390  1e-107  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3010  DNA repair protein RecN  47.93 
 
 		 610 aa  392  1e-107  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2011  DNA repair protein RecN  47.18 
 
 		 580 aa  380  1e-104  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.270463  normal  0.0516704 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22130  DNA replication and repair protein RecN  45.61 
 
 		 583 aa  377  1e-103  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.120117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3158  DNA repair protein RecN  46.3 
 
 		 584 aa  379  1e-103  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0998846  normal  0.788962 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1126  DNA repair protein RecN  45.03 
 
 		 577 aa  376  1e-103  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2482  DNA repair protein RecN  44.46 
 
 		 584 aa  374  1e-102  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.315988  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1342  DNA repair protein RecN  45.29 
 
 		 574 aa  372  1e-101  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5429  DNA repair protein RecN  44.2 
 
 		 580 aa  372  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.477052 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1518  DNA repair protein RecN  43.67 
 
 		 579 aa  360  3e-98  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.301856  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1753  DNA repair protein RecN  44.58 
 
 		 583 aa  356  6.999999999999999e-97  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.391848  hitchhiker  0.000930146 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1517  DNA repair protein RecN  42.64 
 
 		 579 aa  349  1e-94  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000776355 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3147  DNA repair protein RecN  44.32 
 
 		 611 aa  347  4e-94  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.0041532  normal  0.691504 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1659  DNA repair protein RecN  45.86 
 
 		 578 aa  344  2.9999999999999997e-93  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0674828  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14210  DNA repair protein RecN  43 
 
 		 580 aa  337  2.9999999999999997e-91  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0453265  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1245  DNA repair protein RecN  43.28 
 
 		 592 aa  322  9.000000000000001e-87  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.790366 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2316  DNA repair protein RecN  32.61 
 
 		 573 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2355  DNA repair protein RecN  41.78 
 
 		 612 aa  303  8.000000000000001e-81  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.887863  hitchhiker  0.00822868 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0681  DNA repair protein RecN  35.03 
 
 		 594 aa  290  7e-77  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0254  DNA repair protein RecN  32.44 
 
 		 573 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13670  DNA repair protein RecN  40.36 
 
 		 590 aa  285  2.0000000000000002e-75  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.325794  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0793  DNA repair ATPase  37.96 
 
 		 608 aa  274  3e-72  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2627  DNA repair protein RecN  28.4 
 
 		 574 aa  273  7e-72  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.434189  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1301  DNA repair protein RecN  31.53 
 
 		 561 aa  266  8.999999999999999e-70  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2096  DNA repair protein RecN  36.61 
 
 		 523 aa  265  1e-69  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1763  DNA repair protein RecN  34 
 
 		 560 aa  265  3e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137867  normal  0.0495571 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1666  DNA repair protein RecN  32.73 
 
 		 577 aa  264  4e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2333  DNA repair protein RecN  35.08 
 
 		 549 aa  261  3e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0492  DNA repair protein RecN  35.08 
 
 		 549 aa  261  3e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3286  DNA repair protein RecN  35.08 
 
 		 549 aa  261  3e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0539815  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1107  DNA repair protein RecN  35.08 
 
 		 549 aa  261  3e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0249547  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2214  DNA repair protein RecN  35.08 
 
 		 549 aa  261  3e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.725261  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3319  DNA repair protein RecN  35.08 
 
 		 549 aa  261  3e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.303665  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1301  DNA repair protein RecN  34.74 
 
 		 547 aa  260  4e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.549514 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3329  DNA repair protein RecN  35.03 
 
 		 549 aa  259  9e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0903  DNA repair protein RecN  34.31 
 
 		 554 aa  259  9e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0907  DNA repair protein RecN  34.79 
 
 		 549 aa  258  3e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.933799  normal  0.849345 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1047  DNA repair protein RecN  29.44 
 
 		 580 aa  257  4e-67  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.266577  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0832  DNA repair protein RecN  33.97 
 
 		 554 aa  257  4e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.013795  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0501  DNA repair protein RecN  30.17 
 
 		 552 aa  257  5e-67  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.424659  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06570  DNA repair protein RecN  29.75 
 
 		 565 aa  256  7e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000129264  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4337  DNA repair protein RecN  36.89 
 
 		 559 aa  256  7e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0513473  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0950  DNA repair protein RecN  29.53 
 
 		 579 aa  256  7e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0157368  hitchhiker  0.0000335441 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1611  DNA repair protein RecN  29.33 
 
 		 559 aa  256  1.0000000000000001e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000188364  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1578  DNA repair protein RecN  29.33 
 
 		 559 aa  256  1.0000000000000001e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4304  DNA repair protein RecN  29.53 
 
 		 579 aa  255  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000470862  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0998  DNA repair protein RecN  33.16 
 
 		 589 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.553113 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4284  DNA repair protein RecN  29.53 
 
 		 579 aa  255  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0425411  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4246  DNA repair protein RecN  29.31 
 
 		 583 aa  254  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00786878  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0370  DNA repair protein RecN  32.45 
 
 		 578 aa  254  4.0000000000000004e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.431573  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3927  DNA repair protein  29.36 
 
 		 583 aa  254  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0317713  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4026  DNA repair protein RecN  29.41 
 
 		 579 aa  254  4.0000000000000004e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0028037  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4194  DNA repair protein RecN  29.53 
 
 		 579 aa  254  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.9666000000000002e-33 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1179  DNA repair and genetic recombination protein  30.55 
 
 		 556 aa  254  4.0000000000000004e-66  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1080  DNA repair protein RecN  28.33 
 
 		 558 aa  254  5.000000000000001e-66  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0930  ATPase for DNA repair  29.92 
 
 		 555 aa  253  5.000000000000001e-66  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4078  DNA repair protein RecN  29.36 
 
 		 579 aa  253  8.000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4397  DNA repair protein RecN  29.36 
 
 		 579 aa  253  8.000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000441756  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2064  DNA repair protein RecN  33.17 
 
 		 558 aa  252  1e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.488529  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3916  DNA repair protein  29.19 
 
 		 579 aa  252  1e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000027559  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1774  DNA repair protein RecN  32.15 
 
 		 556 aa  253  1e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2867  DNA repair protein RecN  29.49 
 
 		 579 aa  251  3e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2475  recombination and repair protein  30.35 
 
 		 565 aa  249  9e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1178  DNA repair protein RecN  29.46 
 
 		 559 aa  248  2e-64  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000946399  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3602  DNA repair protein RecN  35.17 
 
 		 557 aa  248  2e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00779581 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1896  DNA repair protein RecN  29.65 
 
 		 567 aa  248  2e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000247727  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1300  DNA repair protein RecN  35.03 
 
 		 549 aa  248  3e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00383913  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2071  DNA repair protein RecN  34.03 
 
 		 557 aa  246  6.999999999999999e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.240609  hitchhiker  0.00158855 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0866  DNA repair protein RecN  31.06 
 
 		 555 aa  245  1.9999999999999999e-63  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1170  recombination and repair protein  31.13 
 
 		 552 aa  244  3.9999999999999997e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0260908 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0637  DNA repair protein RecN  34.58 
 
 		 549 aa  244  3.9999999999999997e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0474  DNA repair protein RecN  33.84 
 
 		 543 aa  243  6e-63  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.51796 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1325  DNA repair protein RecN  35.25 
 
 		 529 aa  243  7e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.11608  normal  0.581272 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2641  DNA repair protein RecN  33 
 
 		 549 aa  243  9e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1104  recombination and repair protein  30.96 
 
 		 552 aa  243  1e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.562592 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1104  recombination and repair protein  30.96 
 
 		 552 aa  243  1e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.239344  normal  0.154382 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0661  DNA repair protein RecN  34.63 
 
 		 549 aa  242  2e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1034  DNA repair protein RecN  32.29 
 
 		 576 aa  242  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3364  DNA repair protein RecN  31.98 
 
 		 559 aa  241  2e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.276138  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3462  recombination and repair protein  30.52 
 
 		 552 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3856  recombination and repair protein  30.19 
 
 		 553 aa  241  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00344363  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02504  recombination and repair protein  30.19 
 
 		 553 aa  240  5.999999999999999e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0788874  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02468  hypothetical protein  30.19 
 
 		 553 aa  240  5.999999999999999e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.116899  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>