More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0793 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_0793  DNA repair ATPase  100 
 
 		 608 aa  1179    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0681  DNA repair protein RecN  50.5 
 
 		 594 aa  550  1e-155  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22130  DNA replication and repair protein RecN  43.18 
 
 		 583 aa  338  1.9999999999999998e-91  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.120117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1342  DNA repair protein RecN  43.11 
 
 		 574 aa  337  2.9999999999999997e-91  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1517  DNA repair protein RecN  38.97 
 
 		 579 aa  332  1e-89  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000776355 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1518  DNA repair protein RecN  38.6 
 
 		 579 aa  325  1e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.301856  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1126  DNA repair protein RecN  39.6 
 
 		 577 aa  323  8e-87  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2032  DNA repair protein RecN  39.67 
 
 		 567 aa  322  1.9999999999999998e-86  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1659  DNA repair protein RecN  43.56 
 
 		 578 aa  322  1.9999999999999998e-86  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0674828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25450  DNA replication and repair protein RecN  39.41 
 
 		 593 aa  311  2e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2011  DNA repair protein RecN  39.22 
 
 		 580 aa  308  2.0000000000000002e-82  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.270463  normal  0.0516704 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1904  DNA repair protein RecN  39.15 
 
 		 585 aa  308  2.0000000000000002e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0641483  hitchhiker  0.00014462 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5429  DNA repair protein RecN  39.9 
 
 		 580 aa  308  2.0000000000000002e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.477052 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2171  DNA repair protein RecN  39.7 
 
 		 575 aa  305  2.0000000000000002e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00879264  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1913  DNA repair protein RecN  39.32 
 
 		 585 aa  304  3.0000000000000004e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0988612  normal  0.166083 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6056  DNA repair and genetic recombination  38.64 
 
 		 570 aa  302  1e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0143027  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2381  DNA repair protein RecN  39.28 
 
 		 590 aa  298  2e-79  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2826  DNA repair protein RecN  37.99 
 
 		 590 aa  293  5e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.327916  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3025  DNA repair protein RecN  39.31 
 
 		 569 aa  293  8e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.185029 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3147  DNA repair protein RecN  38.83 
 
 		 611 aa  289  1e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.0041532  normal  0.691504 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4437  DNA repair protein RecN  38.11 
 
 		 583 aa  288  2e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.297367  normal  0.304528 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3288  DNA repair protein RecN  38.61 
 
 		 591 aa  286  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5439  DNA repair protein RecN  40.07 
 
 		 592 aa  283  5.000000000000001e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3507  DNA repair protein RecN  37.96 
 
 		 598 aa  281  2e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0691312 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4072  DNA repair protein RecN  36.01 
 
 		 588 aa  280  7e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0367674  normal  0.136098 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14210  DNA repair protein RecN  39.15 
 
 		 580 aa  278  2e-73  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0453265  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1753  DNA repair protein RecN  39.17 
 
 		 583 aa  278  3e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.391848  hitchhiker  0.000930146 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1666  DNA repair protein RecN  33.99 
 
 		 577 aa  274  3e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3158  DNA repair protein RecN  37.31 
 
 		 584 aa  274  3e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0998846  normal  0.788962 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2949  DNA repair protein RecN  36.76 
 
 		 590 aa  273  6e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2964  DNA repair protein RecN  37.08 
 
 		 587 aa  273  6e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2993  DNA repair protein RecN  36.76 
 
 		 590 aa  273  6e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.311205  normal  0.473383 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2482  DNA repair protein RecN  38.31 
 
 		 584 aa  269  1e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.315988  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11711  DNA repair protein recN  36.87 
 
 		 587 aa  268  2e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.31285  normal  0.395213 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1245  DNA repair protein RecN  37.27 
 
 		 592 aa  257  5e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.790366 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2316  DNA repair protein RecN  30.08 
 
 		 573 aa  256  7e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13670  DNA repair protein RecN  35.68 
 
 		 590 aa  254  2.0000000000000002e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.325794  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4284  DNA repair protein RecN  30.52 
 
 		 579 aa  254  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0425411  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0950  DNA repair protein RecN  30.52 
 
 		 579 aa  252  1e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0157368  hitchhiker  0.0000335441 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4304  DNA repair protein RecN  30.52 
 
 		 579 aa  253  1e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000470862  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3010  DNA repair protein RecN  39.04 
 
 		 610 aa  252  1e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3916  DNA repair protein  30.52 
 
 		 579 aa  251  2e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000027559  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4246  DNA repair protein RecN  30.36 
 
 		 583 aa  251  3e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00786878  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3927  DNA repair protein  30.36 
 
 		 583 aa  251  3e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0317713  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4194  DNA repair protein RecN  30.52 
 
 		 579 aa  251  3e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.9666000000000002e-33 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2355  DNA repair protein RecN  36.62 
 
 		 612 aa  251  3e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.887863  hitchhiker  0.00822868 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4078  DNA repair protein RecN  30.36 
 
 		 579 aa  250  4e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4397  DNA repair protein RecN  30.36 
 
 		 579 aa  250  4e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000441756  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2867  DNA repair protein RecN  30.71 
 
 		 579 aa  250  5e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4026  DNA repair protein RecN  29.59 
 
 		 579 aa  249  1e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0028037  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1301  DNA repair protein RecN  31.26 
 
 		 561 aa  247  4e-64  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0254  DNA repair protein RecN  30.74 
 
 		 573 aa  247  4e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1178  DNA repair protein RecN  30.46 
 
 		 559 aa  245  9.999999999999999e-64  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000946399  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05390  DNA repair protein RecN  34.98 
 
 		 578 aa  242  1e-62  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.256403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14810  DNA repair protein RecN  35.16 
 
 		 536 aa  238  2e-61  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0277816 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2627  DNA repair protein RecN  27.14 
 
 		 574 aa  238  2e-61  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.434189  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1896  DNA repair protein RecN  28.71 
 
 		 567 aa  238  3e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000247727  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1335  DNA repair protein RecN  27.18 
 
 		 551 aa  232  1e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1194  DNA repair protein RecN  34.45 
 
 		 555 aa  232  1e-59  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.544631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0903  DNA repair protein RecN  34.08 
 
 		 554 aa  231  2e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2064  DNA repair protein RecN  32.11 
 
 		 558 aa  231  3e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.488529  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2096  DNA repair protein RecN  33.06 
 
 		 523 aa  231  3e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0832  DNA repair protein RecN  33.91 
 
 		 554 aa  229  9e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.013795  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0930  ATPase for DNA repair  29.83 
 
 		 555 aa  228  2e-58  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0814  DNA repair protein RecN  28.01 
 
 		 570 aa  225  2e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1544  DNA repair protein RecN  26.47 
 
 		 566 aa  224  4e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0474  DNA repair protein RecN  32.28 
 
 		 543 aa  224  4e-57  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.51796 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0378  recombination and repair protein  31.1 
 
 		 554 aa  224  4e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.116911  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1578  DNA repair protein RecN  27.23 
 
 		 559 aa  221  1.9999999999999999e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1611  DNA repair protein RecN  27.23 
 
 		 559 aa  221  1.9999999999999999e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000188364  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1453  DNA repair protein RecN  34.73 
 
 		 557 aa  221  3.9999999999999997e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0975706  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1773  DNA repair protein RecN  32.01 
 
 		 553 aa  220  7e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000824865 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1080  DNA repair protein RecN  26.83 
 
 		 558 aa  218  2e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2579  DNA repair protein RecN  30.1 
 
 		 562 aa  218  2e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.183283 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1289  DNA repair protein RecN  33.73 
 
 		 561 aa  218  2.9999999999999998e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0942  DNA repair protein RecN  30.73 
 
 		 554 aa  216  9.999999999999999e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1325  DNA repair protein RecN  33.33 
 
 		 529 aa  216  9.999999999999999e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.11608  normal  0.581272 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2706  DNA repair protein RecN  26.01 
 
 		 552 aa  216  9.999999999999999e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2071  DNA repair protein RecN  32.65 
 
 		 557 aa  214  2.9999999999999995e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.240609  hitchhiker  0.00158855 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0036  DNA repair protein RecN  27.21 
 
 		 532 aa  214  2.9999999999999995e-54  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1783  DNA repair protein RecN  25.08 
 
 		 565 aa  214  2.9999999999999995e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2516  DNA repair protein RecN  30.36 
 
 		 572 aa  214  3.9999999999999995e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0587  DNA repair and genetic recombination protein  30.41 
 
 		 560 aa  214  4.9999999999999996e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3602  DNA repair protein RecN  32.44 
 
 		 557 aa  213  5.999999999999999e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00779581 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3483  DNA repair protein RecN  28.98 
 
 		 555 aa  213  7e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2680  DNA repair protein RecN  31.86 
 
 		 554 aa  213  9e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01130  recombination and repair protein  28.31 
 
 		 554 aa  212  1e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3082  DNA repair protein RecN  34.22 
 
 		 556 aa  212  1e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2069  DNA repair protein RecN  25.08 
 
 		 565 aa  213  1e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004296  DNA repair protein RecN  28.14 
 
 		 554 aa  211  2e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.782069  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1047  DNA repair protein RecN  28.24 
 
 		 580 aa  212  2e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.266577  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2491  DNA repair protein RecN  35.58 
 
 		 571 aa  212  2e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2444  DNA repair protein RecN  32.01 
 
 		 553 aa  212  2e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0113802  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_923  DNA repair protein  29.12 
 
 		 588 aa  211  3e-53  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0553147  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0596  DNA repair protein RecN  30.95 
 
 		 572 aa  211  4e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3012  DNA repair protein  28.45 
 
 		 551 aa  209  1e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.398213 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2641  DNA repair protein RecN  32.11 
 
 		 549 aa  209  1e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227143  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1769  DNA repair protein RecN  31.1 
 
 		 557 aa  208  2e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1061  DNA repair protein RecN  32.71 
 
 		 561 aa  209  2e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.73431 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1578  DNA repair protein RecN  30.69 
 
 		 556 aa  208  2e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>