More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_14810 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_14810  DNA repair protein RecN  100 
 
 		 536 aa  1063    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0277816 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2491  DNA repair protein RecN  55.91 
 
 		 571 aa  547  1e-154  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0474  DNA repair protein RecN  51.2 
 
 		 543 aa  525  1e-148  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.51796 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05390  DNA repair protein RecN  50.52 
 
 		 578 aa  483  1e-135  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.256403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1518  DNA repair protein RecN  37 
 
 		 579 aa  295  1e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.301856  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1517  DNA repair protein RecN  37.35 
 
 		 579 aa  294  3e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000776355 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0950  DNA repair protein RecN  30.88 
 
 		 579 aa  276  6e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0157368  hitchhiker  0.0000335441 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4284  DNA repair protein RecN  30.88 
 
 		 579 aa  276  7e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0425411  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4026  DNA repair protein RecN  30.63 
 
 		 579 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0028037  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1666  DNA repair protein RecN  31.33 
 
 		 577 aa  275  2.0000000000000002e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1544  DNA repair protein RecN  29.72 
 
 		 566 aa  273  6e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2171  DNA repair protein RecN  37.88 
 
 		 575 aa  271  2e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00879264  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1178  DNA repair protein RecN  31.86 
 
 		 559 aa  271  2e-71  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000946399  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2516  DNA repair protein RecN  33.22 
 
 		 572 aa  271  2e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4304  DNA repair protein RecN  30.35 
 
 		 579 aa  271  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000470862  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4246  DNA repair protein RecN  30.18 
 
 		 583 aa  270  5e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00786878  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0930  ATPase for DNA repair  31.21 
 
 		 555 aa  270  5e-71  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3916  DNA repair protein  30.35 
 
 		 579 aa  270  5.9999999999999995e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000027559  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25450  DNA replication and repair protein RecN  37.07 
 
 		 593 aa  270  5.9999999999999995e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3927  DNA repair protein  30.18 
 
 		 583 aa  270  7e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0317713  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4194  DNA repair protein RecN  30.35 
 
 		 579 aa  269  8e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.9666000000000002e-33 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4078  DNA repair protein RecN  30.18 
 
 		 579 aa  269  1e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4397  DNA repair protein RecN  30.18 
 
 		 579 aa  269  1e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000441756  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0866  DNA repair protein RecN  32.85 
 
 		 555 aa  268  2e-70  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1194  DNA repair protein RecN  38.78 
 
 		 555 aa  268  2e-70  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.544631  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2011  DNA repair protein RecN  38.87 
 
 		 580 aa  268  2e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.270463  normal  0.0516704 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5429  DNA repair protein RecN  35.6 
 
 		 580 aa  267  4e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.477052 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1301  DNA repair protein RecN  33.09 
 
 		 561 aa  266  1e-69  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2867  DNA repair protein RecN  29.81 
 
 		 579 aa  265  1e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0998  DNA repair protein RecN  33.98 
 
 		 589 aa  260  5.0000000000000005e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.553113 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6056  DNA repair and genetic recombination  35.59 
 
 		 570 aa  259  7e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0143027  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1179  DNA repair and genetic recombination protein  30.62 
 
 		 556 aa  258  2e-67  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1763  DNA repair protein RecN  34.13 
 
 		 560 aa  257  3e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137867  normal  0.0495571 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1913  DNA repair protein RecN  35.47 
 
 		 585 aa  257  4e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0988612  normal  0.166083 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0594  DNA repair protein RecN  32.81 
 
 		 569 aa  256  7e-67  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0859323 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0254  DNA repair protein RecN  30.21 
 
 		 573 aa  256  8e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1774  DNA repair protein RecN  31.66 
 
 		 556 aa  256  8e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2326  DNA repair protein RecN  33.87 
 
 		 560 aa  256  9e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000910227  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1749  DNA repair protein RecN  32.47 
 
 		 574 aa  256  1.0000000000000001e-66  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2482  DNA repair protein RecN  37.72 
 
 		 584 aa  256  1.0000000000000001e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.315988  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0793  DNA repair ATPase  35.16 
 
 		 608 aa  254  4.0000000000000004e-66  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1034  DNA repair protein RecN  33.16 
 
 		 576 aa  253  4.0000000000000004e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2381  DNA repair protein RecN  36.13 
 
 		 590 aa  253  5.000000000000001e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2826  DNA repair protein RecN  34.41 
 
 		 590 aa  253  6e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.327916  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1578  DNA repair protein RecN  33.69 
 
 		 556 aa  253  6e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1904  DNA repair protein RecN  35.99 
 
 		 585 aa  252  1e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0641483  hitchhiker  0.00014462 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1047  DNA repair protein RecN  30.02 
 
 		 580 aa  252  1e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.266577  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1599  DNA repair ATPase  31.23 
 
 		 555 aa  251  2e-65  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1126  DNA repair protein RecN  35.31 
 
 		 577 aa  251  3e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1107  DNA repair protein RecN  33.99 
 
 		 549 aa  251  3e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0249547  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2333  DNA repair protein RecN  33.99 
 
 		 549 aa  251  3e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2214  DNA repair protein RecN  33.99 
 
 		 549 aa  251  3e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.725261  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1691  DNA repair protein RecN  29.52 
 
 		 557 aa  251  3e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.893605  hitchhiker  0.00244544 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3319  DNA repair protein RecN  33.99 
 
 		 549 aa  251  3e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.303665  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0492  DNA repair protein RecN  33.99 
 
 		 549 aa  251  3e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3286  DNA repair protein RecN  33.99 
 
 		 549 aa  251  3e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0539815  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3329  DNA repair protein RecN  33.99 
 
 		 549 aa  250  4e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2627  DNA repair protein RecN  29.35 
 
 		 574 aa  250  4e-65  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.434189  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4072  DNA repair protein RecN  34.66 
 
 		 588 aa  250  5e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0367674  normal  0.136098 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2316  DNA repair protein RecN  28.8 
 
 		 573 aa  250  5e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3483  DNA repair protein RecN  29.91 
 
 		 555 aa  249  1e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1896  DNA repair protein RecN  30.78 
 
 		 567 aa  248  1e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000247727  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2032  DNA repair protein RecN  36.14 
 
 		 567 aa  248  2e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0942  DNA repair protein RecN  32.85 
 
 		 554 aa  248  2e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0903  DNA repair protein RecN  33.7 
 
 		 554 aa  248  2e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1578  DNA repair protein RecN  29.29 
 
 		 559 aa  248  3e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1611  DNA repair protein RecN  29.29 
 
 		 559 aa  248  3e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000188364  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1342  DNA repair protein RecN  36.59 
 
 		 574 aa  248  3e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0832  DNA repair protein RecN  33.7 
 
 		 554 aa  247  4e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.013795  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2064  DNA repair protein RecN  32.61 
 
 		 558 aa  247  4.9999999999999997e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.488529  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3462  recombination and repair protein  31.26 
 
 		 552 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0426  DNA repair protein RecN  29.22 
 
 		 553 aa  247  4.9999999999999997e-64  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3096  DNA repair protein RecN  32.79 
 
 		 557 aa  247  4.9999999999999997e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22130  DNA replication and repair protein RecN  36.49 
 
 		 583 aa  246  6e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.120117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1300  DNA repair protein RecN  33.81 
 
 		 549 aa  246  6e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00383913  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3288  DNA repair protein RecN  36.41 
 
 		 591 aa  246  6e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0814  DNA repair protein RecN  28.17 
 
 		 570 aa  245  9.999999999999999e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0596  DNA repair protein RecN  32.38 
 
 		 572 aa  245  9.999999999999999e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1055  DNA repair protein RecN  31.7 
 
 		 588 aa  245  1.9999999999999999e-63  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3025  DNA repair protein RecN  36.38 
 
 		 569 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.185029 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2949  DNA repair protein RecN  35.63 
 
 		 590 aa  245  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2993  DNA repair protein RecN  35.63 
 
 		 590 aa  245  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.311205  normal  0.473383 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0370  DNA repair protein RecN  32.52 
 
 		 578 aa  245  1.9999999999999999e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.431573  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3158  DNA repair protein RecN  36.04 
 
 		 584 aa  244  3e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0998846  normal  0.788962 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1104  recombination and repair protein  30.41 
 
 		 552 aa  244  3e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.239344  normal  0.154382 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3096  DNA repair protein RecN  31.84 
 
 		 574 aa  243  5e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.155422 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2680  DNA repair protein RecN  35.35 
 
 		 554 aa  243  6e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1170  recombination and repair protein  31.26 
 
 		 552 aa  243  6e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0260908 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3507  DNA repair protein RecN  35.74 
 
 		 598 aa  243  7e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0691312 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4437  DNA repair protein RecN  36.81 
 
 		 583 aa  243  7e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.297367  normal  0.304528 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3831  DNA repair protein RecN  32.55 
 
 		 549 aa  243  7.999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1104  recombination and repair protein  30.91 
 
 		 552 aa  243  9e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.562592 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1191  DNA repair protein RecN  31.84 
 
 		 559 aa  242  1e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1084  DNA repair protein RecN  31.62 
 
 		 565 aa  242  1e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000955113  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2735  alkylhydroperoxidase AhpD core  31.83 
 
 		 557 aa  241  2e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0271976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0576  DNA repair protein RecN  31.1 
 
 		 568 aa  241  2e-62  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1026  recombination and repair protein  30.81 
 
 		 554 aa  241  2e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3218  recombination and repair protein  30.66 
 
 		 553 aa  241  2.9999999999999997e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0713  DNA repair protein RecN  32.73 
 
 		 549 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.685992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2771  recombination and repair protein  30.37 
 
 		 552 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.170925  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>