More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1194 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1194  DNA repair protein RecN  100 
 
 		 555 aa  1076    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.544631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2096  DNA repair protein RecN  47.65 
 
 		 523 aa  386  1e-106  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1325  DNA repair protein RecN  48.11 
 
 		 529 aa  378  1e-103  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.11608  normal  0.581272 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1178  DNA repair protein RecN  34.95 
 
 		 559 aa  320  5e-86  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000946399  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1578  DNA repair protein RecN  39.02 
 
 		 556 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2680  DNA repair protein RecN  38.7 
 
 		 554 aa  311  2e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2064  DNA repair protein RecN  37.57 
 
 		 558 aa  302  1e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.488529  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0814  DNA repair protein RecN  32.51 
 
 		 570 aa  296  7e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0596  DNA repair protein RecN  36.91 
 
 		 572 aa  296  9e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1507  DNA repair protein RecN  39.29 
 
 		 558 aa  295  2e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0930  ATPase for DNA repair  33.45 
 
 		 555 aa  292  9e-78  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1666  DNA repair protein RecN  34.43 
 
 		 577 aa  291  1e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1301  DNA repair protein RecN  35.07 
 
 		 561 aa  290  3e-77  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1896  DNA repair protein RecN  32.97 
 
 		 567 aa  290  3e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000247727  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2316  DNA repair protein RecN  31.5 
 
 		 573 aa  289  8e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0254  DNA repair protein RecN  32.69 
 
 		 573 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1518  DNA repair protein RecN  38.38 
 
 		 579 aa  285  1.0000000000000001e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.301856  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0942  DNA repair protein RecN  36.84 
 
 		 554 aa  285  2.0000000000000002e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4026  DNA repair protein RecN  31.15 
 
 		 579 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0028037  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1544  DNA repair protein RecN  29.53 
 
 		 566 aa  283  6.000000000000001e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0756  DNA repair ATPase  31.46 
 
 		 562 aa  283  8.000000000000001e-75  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000000414406  hitchhiker  0.0000280252 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1179  DNA repair and genetic recombination protein  31.64 
 
 		 556 aa  282  1e-74  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1517  DNA repair protein RecN  38.09 
 
 		 579 aa  281  2e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000776355 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1769  DNA repair protein RecN  37.57 
 
 		 557 aa  281  3e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1047  DNA repair protein RecN  33.39 
 
 		 580 aa  280  4e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.266577  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1773  DNA repair protein RecN  37.82 
 
 		 553 aa  279  1e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000824865 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3483  DNA repair protein RecN  32.91 
 
 		 555 aa  277  5e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5429  DNA repair protein RecN  37.52 
 
 		 580 aa  276  5e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.477052 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1599  DNA repair ATPase  33.58 
 
 		 555 aa  276  7e-73  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2579  DNA repair protein RecN  33.33 
 
 		 562 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.183283 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4246  DNA repair protein RecN  31 
 
 		 583 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00786878  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0501  DNA repair protein RecN  32.55 
 
 		 552 aa  275  1.0000000000000001e-72  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.424659  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3927  DNA repair protein  31 
 
 		 583 aa  276  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0317713  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1080  DNA repair protein RecN  29.7 
 
 		 558 aa  275  2.0000000000000002e-72  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4304  DNA repair protein RecN  30.99 
 
 		 579 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000470862  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0950  DNA repair protein RecN  30.97 
 
 		 579 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0157368  hitchhiker  0.0000335441 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4284  DNA repair protein RecN  30.99 
 
 		 579 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0425411  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4194  DNA repair protein RecN  30.99 
 
 		 579 aa  274  4.0000000000000004e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.9666000000000002e-33 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3916  DNA repair protein  30.81 
 
 		 579 aa  273  7e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000027559  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06570  DNA repair protein RecN  32.49 
 
 		 565 aa  273  8.000000000000001e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000129264  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4078  DNA repair protein RecN  30.81 
 
 		 579 aa  272  9e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4397  DNA repair protein RecN  30.81 
 
 		 579 aa  272  9e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000441756  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0378  recombination and repair protein  34.55 
 
 		 554 aa  271  2.9999999999999997e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.116911  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2627  DNA repair protein RecN  29.28 
 
 		 574 aa  270  4e-71  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.434189  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1783  DNA repair protein RecN  29.09 
 
 		 565 aa  270  4e-71  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1335  DNA repair protein RecN  28.91 
 
 		 551 aa  270  4e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2326  DNA repair protein RecN  35.58 
 
 		 560 aa  270  5e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000910227  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2032  DNA repair protein RecN  39.21 
 
 		 567 aa  269  1e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1084  DNA repair protein RecN  32.79 
 
 		 565 aa  269  1e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000955113  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2069  DNA repair protein RecN  29.09 
 
 		 565 aa  269  1e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1611  DNA repair protein RecN  29.23 
 
 		 559 aa  269  1e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000188364  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1578  DNA repair protein RecN  29.23 
 
 		 559 aa  269  1e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14810  DNA repair protein RecN  38.78 
 
 		 536 aa  268  2e-70  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0277816 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1707  DNA repair protein RecN  35.82 
 
 		 553 aa  267  4e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1763  DNA repair protein RecN  35.86 
 
 		 560 aa  266  8.999999999999999e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137867  normal  0.0495571 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0370  DNA repair protein RecN  36.63 
 
 		 578 aa  265  1e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.431573  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2867  DNA repair protein RecN  31.57 
 
 		 579 aa  265  1e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1774  DNA repair protein RecN  34.66 
 
 		 556 aa  265  2e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01130  recombination and repair protein  33.27 
 
 		 554 aa  264  3e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0474  DNA repair protein RecN  35.42 
 
 		 543 aa  263  4e-69  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.51796 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3096  DNA repair protein RecN  35.29 
 
 		 574 aa  264  4e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.155422 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0426  DNA repair protein RecN  31.26 
 
 		 553 aa  263  4.999999999999999e-69  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3831  DNA repair protein RecN  36.98 
 
 		 549 aa  263  6e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1394  DNA repair protein RecN  37.38 
 
 		 551 aa  263  6e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4337  DNA repair protein RecN  35.65 
 
 		 559 aa  262  1e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0513473  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004296  DNA repair protein RecN  33.27 
 
 		 554 aa  261  2e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.782069  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2444  DNA repair protein RecN  36.91 
 
 		 553 aa  261  2e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0113802  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25450  DNA replication and repair protein RecN  37.74 
 
 		 593 aa  262  2e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4437  DNA repair protein RecN  38.61 
 
 		 583 aa  261  3e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.297367  normal  0.304528 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2499  DNA repair protein RecN  29.91 
 
 		 561 aa  259  6e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3489  DNA repair protein RecN  36.31 
 
 		 567 aa  259  7e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000536624 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3602  DNA repair protein RecN  35.11 
 
 		 557 aa  259  8e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00779581 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2516  DNA repair protein RecN  33.97 
 
 		 572 aa  259  1e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0661  DNA repair protein RecN  36.89 
 
 		 549 aa  258  2e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0259  DNA repair protein RecN  36.61 
 
 		 549 aa  258  2e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.255628  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0743  DNA repair protein RecN  36.61 
 
 		 549 aa  258  2e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.259434  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0637  DNA repair protein RecN  36.35 
 
 		 549 aa  257  3e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0866  DNA repair protein RecN  34.71 
 
 		 555 aa  257  4e-67  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0713  DNA repair protein RecN  36.43 
 
 		 549 aa  257  5e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.685992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1233  DNA repair ATPase  30.04 
 
 		 551 aa  257  5e-67  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.337705  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1139  DNA repair protein RecN  30.8 
 
 		 555 aa  256  8e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2171  DNA repair protein RecN  38.86 
 
 		 575 aa  256  9e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00879264  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1779  DNA repair protein RecN  33.87 
 
 		 581 aa  256  9e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.666721 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2641  DNA repair protein RecN  35.95 
 
 		 549 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0587  DNA repair and genetic recombination protein  32.26 
 
 		 560 aa  256  1.0000000000000001e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0651  DNA repair protein  30.43 
 
 		 559 aa  253  6e-66  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2739  DNA repair protein recN  30.51 
 
 		 555 aa  252  1e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0907  DNA repair protein RecN  33.15 
 
 		 549 aa  252  1e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.933799  normal  0.849345 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1691  DNA repair protein RecN  30.43 
 
 		 557 aa  251  2e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.893605  hitchhiker  0.00244544 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2877  DNA repair protein recN  30.51 
 
 		 555 aa  251  2e-65  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1913  DNA repair protein RecN  37.95 
 
 		 585 aa  251  2e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0988612  normal  0.166083 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1995  DNA repair protein RecN  30.56 
 
 		 586 aa  251  2e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1191  DNA repair protein RecN  36.58 
 
 		 559 aa  251  3e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2651  DNA repair protein  36.5 
 
 		 569 aa  249  6e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.829393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2022  DNA repair protein RecN  30.56 
 
 		 586 aa  249  9e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.499212  normal  0.676493 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3298  recombination and repair protein  32.79 
 
 		 553 aa  249  9e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.121559  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2491  DNA repair protein RecN  36.49 
 
 		 571 aa  249  9e-65  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2889  recombination and repair protein  32.91 
 
 		 553 aa  249  1e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000988342  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02270  DNA repair ATPase RecN  33.03 
 
 		 561 aa  249  1e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1376  recombination and repair protein  32.91 
 
 		 553 aa  249  1e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000000100313  normal  0.0248594 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>