More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_05390 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_05390  DNA repair protein RecN  100 
 
 		 578 aa  1142    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.256403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2491  DNA repair protein RecN  51.9 
 
 		 571 aa  513  1e-144  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0474  DNA repair protein RecN  47.05 
 
 		 543 aa  486  1e-136  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.51796 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14810  DNA repair protein RecN  50.17 
 
 		 536 aa  485  1e-136  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0277816 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2171  DNA repair protein RecN  37.11 
 
 		 575 aa  297  5e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00879264  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6056  DNA repair and genetic recombination  35.97 
 
 		 570 aa  287  4e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0143027  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3025  DNA repair protein RecN  37.14 
 
 		 569 aa  286  1.0000000000000001e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.185029 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3158  DNA repair protein RecN  38.43 
 
 		 584 aa  285  1.0000000000000001e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0998846  normal  0.788962 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1666  DNA repair protein RecN  34.15 
 
 		 577 aa  284  3.0000000000000004e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2064  DNA repair protein RecN  35.29 
 
 		 558 aa  280  5e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.488529  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1544  DNA repair protein RecN  28.47 
 
 		 566 aa  278  2e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25450  DNA replication and repair protein RecN  35.2 
 
 		 593 aa  275  2.0000000000000002e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1691  DNA repair protein RecN  31.39 
 
 		 557 aa  274  3e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.893605  hitchhiker  0.00244544 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2032  DNA repair protein RecN  35.34 
 
 		 567 aa  273  6e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1342  DNA repair protein RecN  38.49 
 
 		 574 aa  271  2e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2011  DNA repair protein RecN  35.21 
 
 		 580 aa  269  1e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.270463  normal  0.0516704 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1753  DNA repair protein RecN  37.63 
 
 		 583 aa  268  2e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.391848  hitchhiker  0.000930146 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0942  DNA repair protein RecN  34.37 
 
 		 554 aa  268  2e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5429  DNA repair protein RecN  35.46 
 
 		 580 aa  268  2e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.477052 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2680  DNA repair protein RecN  35.21 
 
 		 554 aa  266  8e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1518  DNA repair protein RecN  36.85 
 
 		 579 aa  266  8.999999999999999e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.301856  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2316  DNA repair protein RecN  28.36 
 
 		 573 aa  265  1e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1517  DNA repair protein RecN  36.45 
 
 		 579 aa  261  2e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000776355 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1178  DNA repair protein RecN  30.9 
 
 		 559 aa  261  2e-68  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000946399  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2516  DNA repair protein RecN  32.38 
 
 		 572 aa  261  2e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1896  DNA repair protein RecN  31.88 
 
 		 567 aa  261  4e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000247727  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2482  DNA repair protein RecN  36.15 
 
 		 584 aa  258  2e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.315988  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2444  DNA repair protein RecN  36.19 
 
 		 553 aa  257  5e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0113802  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1773  DNA repair protein RecN  35.4 
 
 		 553 aa  256  7e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000824865 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0814  DNA repair protein RecN  30.32 
 
 		 570 aa  255  1.0000000000000001e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0907  DNA repair protein RecN  32.26 
 
 		 549 aa  256  1.0000000000000001e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.933799  normal  0.849345 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0370  DNA repair protein RecN  33.05 
 
 		 578 aa  255  2.0000000000000002e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.431573  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1126  DNA repair protein RecN  34.17 
 
 		 577 aa  254  3e-66  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1084  DNA repair protein RecN  32.3 
 
 		 565 aa  253  5.000000000000001e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000955113  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2472  DNA repair protein RecN  32.45 
 
 		 605 aa  253  5.000000000000001e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.400775 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0681  DNA repair protein RecN  32.45 
 
 		 594 aa  253  6e-66  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2826  DNA repair protein RecN  34.44 
 
 		 590 aa  253  8.000000000000001e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.327916  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4437  DNA repair protein RecN  34.5 
 
 		 583 aa  253  9.000000000000001e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.297367  normal  0.304528 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1904  DNA repair protein RecN  35.44 
 
 		 585 aa  252  1e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0641483  hitchhiker  0.00014462 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0903  DNA repair protein RecN  35.75 
 
 		 554 aa  251  2e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1578  DNA repair protein RecN  35.14 
 
 		 556 aa  250  6e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1659  DNA repair protein RecN  36.91 
 
 		 578 aa  249  8e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0674828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1783  DNA repair protein RecN  26.98 
 
 		 565 aa  249  1e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2651  DNA repair protein  35.08 
 
 		 569 aa  248  2e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.829393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1707  DNA repair protein RecN  33.91 
 
 		 553 aa  248  2e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2706  DNA repair protein RecN  27.18 
 
 		 552 aa  248  2e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2381  DNA repair protein RecN  34.82 
 
 		 590 aa  248  2e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2069  DNA repair protein RecN  27.1 
 
 		 565 aa  247  3e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1301  DNA repair protein RecN  33.45 
 
 		 547 aa  247  4e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.549514 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3288  DNA repair protein RecN  34.33 
 
 		 591 aa  247  4e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1774  DNA repair protein RecN  32.01 
 
 		 556 aa  247  4.9999999999999997e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3483  DNA repair protein RecN  29.53 
 
 		 555 aa  246  6e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0594  DNA repair protein RecN  31.05 
 
 		 569 aa  246  6.999999999999999e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0859323 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3082  DNA repair protein RecN  33.22 
 
 		 556 aa  246  6.999999999999999e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2326  DNA repair protein RecN  34.69 
 
 		 560 aa  246  8e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000910227  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0832  DNA repair protein RecN  35.55 
 
 		 554 aa  245  9.999999999999999e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.013795  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3147  DNA repair protein RecN  35.77 
 
 		 611 aa  246  9.999999999999999e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.0041532  normal  0.691504 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3507  DNA repair protein RecN  34.09 
 
 		 598 aa  245  9.999999999999999e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0691312 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2888  DNA repair protein RecN  34.59 
 
 		 568 aa  245  1.9999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06570  DNA repair protein RecN  30.68 
 
 		 565 aa  245  1.9999999999999999e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000129264  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1047  DNA repair protein RecN  30.34 
 
 		 580 aa  244  3e-63  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.266577  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0793  DNA repair ATPase  36.2 
 
 		 608 aa  244  3e-63  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11711  DNA repair protein recN  34.11 
 
 		 587 aa  244  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.31285  normal  0.395213 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0426  DNA repair protein RecN  29.45 
 
 		 553 aa  243  7.999999999999999e-63  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1913  DNA repair protein RecN  33.89 
 
 		 585 aa  242  1e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0988612  normal  0.166083 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3096  DNA repair protein RecN  32.08 
 
 		 574 aa  242  1e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.155422 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1599  DNA repair ATPase  30.02 
 
 		 555 aa  241  2e-62  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0866  DNA repair protein RecN  31.08 
 
 		 555 aa  241  2.9999999999999997e-62  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2627  DNA repair protein RecN  28.17 
 
 		 574 aa  240  4e-62  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.434189  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2482  DNA repair protein RecN  34.31 
 
 		 568 aa  240  4e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1335  DNA repair protein RecN  27.85 
 
 		 551 aa  241  4e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4072  DNA repair protein RecN  33.78 
 
 		 588 aa  240  6.999999999999999e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0367674  normal  0.136098 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1769  DNA repair protein RecN  34.02 
 
 		 557 aa  239  6.999999999999999e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1652  DNA repair protein RecN  32.37 
 
 		 558 aa  239  9e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4284  DNA repair protein RecN  27.21 
 
 		 579 aa  239  1e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0425411  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2096  DNA repair protein RecN  32.92 
 
 		 523 aa  239  1e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22130  DNA replication and repair protein RecN  34.78 
 
 		 583 aa  238  2e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.120117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0998  DNA repair protein RecN  32.55 
 
 		 589 aa  238  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.553113 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1749  DNA repair protein RecN  32.2 
 
 		 574 aa  238  3e-61  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2949  DNA repair protein RecN  35.5 
 
 		 590 aa  238  3e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2993  DNA repair protein RecN  35.5 
 
 		 590 aa  238  3e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.311205  normal  0.473383 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3364  DNA repair protein RecN  31.59 
 
 		 559 aa  237  4e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.276138  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01130  recombination and repair protein  32.12 
 
 		 554 aa  236  7e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2867  DNA repair protein RecN  27.95 
 
 		 579 aa  236  8e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4304  DNA repair protein RecN  27.05 
 
 		 579 aa  236  8e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000470862  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4337  DNA repair protein RecN  34.6 
 
 		 559 aa  236  8e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0513473  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3916  DNA repair protein  27.05 
 
 		 579 aa  236  1.0000000000000001e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000027559  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0950  DNA repair protein RecN  27.01 
 
 		 579 aa  236  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0157368  hitchhiker  0.0000335441 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5439  DNA repair protein RecN  35.48 
 
 		 592 aa  235  2.0000000000000002e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1191  DNA repair protein RecN  30.77 
 
 		 559 aa  235  2.0000000000000002e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0254  DNA repair protein RecN  27.9 
 
 		 573 aa  235  2.0000000000000002e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0576  DNA repair protein RecN  29.85 
 
 		 568 aa  235  2.0000000000000002e-60  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1059  DNA repair protein RecN  31.85 
 
 		 553 aa  234  3e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0987529  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4246  DNA repair protein RecN  26.88 
 
 		 583 aa  234  3e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00786878  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3927  DNA repair protein  26.88 
 
 		 583 aa  234  3e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0317713  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1068  recombination and repair protein  31.85 
 
 		 553 aa  234  3e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0569436  normal  0.137036 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2774  recombination and repair protein  31.85 
 
 		 553 aa  234  3e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000103072  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4194  DNA repair protein RecN  27.05 
 
 		 579 aa  234  3e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.9666000000000002e-33 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2499  DNA repair protein RecN  28.77 
 
 		 561 aa  234  4.0000000000000004e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3218  recombination and repair protein  30.74 
 
 		 553 aa  234  4.0000000000000004e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>