More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2516 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2516  DNA repair protein RecN  100 
 
 		 572 aa  1143    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0942  DNA repair protein RecN  43.76 
 
 		 554 aa  436  1e-121  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2064  DNA repair protein RecN  43.36 
 
 		 558 aa  414  1e-114  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.488529  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3096  DNA repair protein RecN  40.18 
 
 		 574 aa  399  9.999999999999999e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.155422 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2680  DNA repair protein RecN  40.77 
 
 		 554 aa  392  1e-108  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2326  DNA repair protein RecN  39.9 
 
 		 560 aa  387  1e-106  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000910227  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1773  DNA repair protein RecN  40.64 
 
 		 553 aa  376  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000824865 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1578  DNA repair protein RecN  41.11 
 
 		 556 aa  376  1e-103  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0370  DNA repair protein RecN  38.99 
 
 		 578 aa  373  1e-102  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.431573  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2316  DNA repair protein RecN  37.54 
 
 		 573 aa  372  1e-102  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2444  DNA repair protein RecN  40.46 
 
 		 553 aa  371  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0113802  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1544  DNA repair protein RecN  37.59 
 
 		 566 aa  363  4e-99  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0596  DNA repair protein RecN  39.79 
 
 		 572 aa  363  4e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1707  DNA repair protein RecN  41.15 
 
 		 553 aa  360  5e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1666  DNA repair protein RecN  37 
 
 		 577 aa  359  9e-98  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3916  DNA repair protein  35.76 
 
 		 579 aa  352  8.999999999999999e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000027559  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3927  DNA repair protein  35.59 
 
 		 583 aa  351  2e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0317713  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4304  DNA repair protein RecN  35.59 
 
 		 579 aa  351  2e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000470862  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4194  DNA repair protein RecN  35.59 
 
 		 579 aa  351  2e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.9666000000000002e-33 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4078  DNA repair protein RecN  35.59 
 
 		 579 aa  350  4e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4397  DNA repair protein RecN  35.59 
 
 		 579 aa  350  4e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000441756  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0950  DNA repair protein RecN  35.59 
 
 		 579 aa  350  5e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0157368  hitchhiker  0.0000335441 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4284  DNA repair protein RecN  35.42 
 
 		 579 aa  349  6e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0425411  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4246  DNA repair protein RecN  35.42 
 
 		 583 aa  349  1e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00786878  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1763  DNA repair protein RecN  37.19 
 
 		 560 aa  346  8e-94  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137867  normal  0.0495571 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0254  DNA repair protein RecN  35.75 
 
 		 573 aa  343  4e-93  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2867  DNA repair protein RecN  35.37 
 
 		 579 aa  341  2e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4026  DNA repair protein RecN  34.66 
 
 		 579 aa  341  2e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0028037  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3397  DNA repair protein RecN  36.88 
 
 		 586 aa  340  5e-92  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00306133  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0594  DNA repair protein RecN  35.27 
 
 		 569 aa  330  3e-89  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0859323 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1047  DNA repair protein RecN  33.33 
 
 		 580 aa  328  2.0000000000000001e-88  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.266577  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1191  DNA repair protein RecN  35.4 
 
 		 559 aa  328  2.0000000000000001e-88  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0361  DNA repair protein RecN  36.54 
 
 		 601 aa  327  3e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00213355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0701  DNA repair protein RecN  38.26 
 
 		 567 aa  326  8.000000000000001e-88  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0932  DNA repair protein RecN  38.85 
 
 		 557 aa  323  6e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.613915 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06570  DNA repair protein RecN  36.46 
 
 		 565 aa  323  6e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000129264  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1896  DNA repair protein RecN  36.07 
 
 		 567 aa  318  2e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000247727  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1178  DNA repair protein RecN  35.26 
 
 		 559 aa  317  3e-85  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000946399  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0756  DNA repair ATPase  35.61 
 
 		 562 aa  317  4e-85  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000000414406  hitchhiker  0.0000280252 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_923  DNA repair protein  35.03 
 
 		 588 aa  316  7e-85  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0553147  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0866  DNA repair protein RecN  34.62 
 
 		 555 aa  315  9.999999999999999e-85  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1691  DNA repair protein RecN  36.24 
 
 		 557 aa  314  1.9999999999999998e-84  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.893605  hitchhiker  0.00244544 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0776  DNA repair protein RecN  37.05 
 
 		 611 aa  313  4.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.163902  normal  0.739738 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0769  DNA repair protein RecN  37.33 
 
 		 606 aa  313  5.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0732  DNA repair protein RecN  37.94 
 
 		 606 aa  313  6.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.813778  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1335  DNA repair protein RecN  33.33 
 
 		 551 aa  312  1e-83  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1055  DNA repair protein RecN  35.08 
 
 		 588 aa  311  2e-83  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2472  DNA repair protein RecN  36.12 
 
 		 605 aa  311  2e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.400775 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3483  DNA repair protein RecN  35 
 
 		 555 aa  310  4e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1904  DNA repair protein RecN  35.31 
 
 		 564 aa  310  5.9999999999999995e-83  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1749  DNA repair protein RecN  36.43 
 
 		 574 aa  309  6.999999999999999e-83  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1507  DNA repair protein RecN  36.47 
 
 		 558 aa  309  9e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1475  DNA repair protein RecN  36.57 
 
 		 554 aa  308  1.0000000000000001e-82  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.460183  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0814  DNA repair protein RecN  35.75 
 
 		 570 aa  307  3e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0934  DNA repair protein RecN  34.9 
 
 		 588 aa  307  4.0000000000000004e-82  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.590863  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0769  DNA repair protein RecN  37.33 
 
 		 606 aa  306  5.0000000000000004e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3320  DNA repair protein RecN  34.24 
 
 		 587 aa  306  9.000000000000001e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0119  DNA repair protein RecN  35.1 
 
 		 599 aa  305  1.0000000000000001e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1774  DNA repair protein RecN  35.75 
 
 		 556 aa  305  2.0000000000000002e-81  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1480  DNA repair protein RecN  36.47 
 
 		 556 aa  305  2.0000000000000002e-81  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.269893  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2888  DNA repair protein RecN  35.99 
 
 		 568 aa  304  3.0000000000000004e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0623  DNA repair protein RecN  34.68 
 
 		 568 aa  304  4.0000000000000003e-81  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.72171  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0576  DNA repair protein RecN  33.45 
 
 		 568 aa  303  6.000000000000001e-81  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2482  DNA repair protein RecN  35.64 
 
 		 568 aa  302  1e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1084  DNA repair protein RecN  33.62 
 
 		 565 aa  302  1e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000955113  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3966  DNA repair protein RecN  33.1 
 
 		 556 aa  301  2e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.284551 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2475  recombination and repair protein  33.16 
 
 		 565 aa  301  3e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2069  DNA repair protein RecN  33.33 
 
 		 565 aa  300  5e-80  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1301  DNA repair protein RecN  36.09 
 
 		 561 aa  300  6e-80  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2641  DNA repair protein RecN  35.46 
 
 		 549 aa  299  1e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227143  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2499  DNA repair protein RecN  34.03 
 
 		 561 aa  298  1e-79  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1783  DNA repair protein RecN  33.16 
 
 		 565 aa  299  1e-79  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0661  DNA repair protein RecN  35.28 
 
 		 549 aa  298  1e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0637  DNA repair protein RecN  35.11 
 
 		 549 aa  297  3e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004296  DNA repair protein RecN  33.22 
 
 		 554 aa  297  4e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.782069  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1026  recombination and repair protein  33.8 
 
 		 554 aa  296  7e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1301  DNA repair protein RecN  35.64 
 
 		 547 aa  295  2e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.549514 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2651  DNA repair protein  36.16 
 
 		 569 aa  294  3e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.829393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1179  DNA repair and genetic recombination protein  32.87 
 
 		 556 aa  293  4e-78  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2627  DNA repair protein RecN  31.18 
 
 		 574 aa  293  5e-78  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.434189  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0259  DNA repair protein RecN  34.75 
 
 		 549 aa  293  6e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.255628  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0713  DNA repair protein RecN  34.75 
 
 		 549 aa  293  6e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.685992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0743  DNA repair protein RecN  34.75 
 
 		 549 aa  293  6e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.259434  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2421  DNA repair protein RecN  34.88 
 
 		 563 aa  293  8e-78  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.955613  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0651  DNA repair protein  31.69 
 
 		 559 aa  293  9e-78  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2333  DNA repair protein RecN  35.37 
 
 		 549 aa  291  1e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1169  recombination and repair protein  32.45 
 
 		 553 aa  292  1e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0378  recombination and repair protein  33.39 
 
 		 554 aa  292  1e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.116911  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0492  DNA repair protein RecN  35.37 
 
 		 549 aa  291  1e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1107  DNA repair protein RecN  35.37 
 
 		 549 aa  291  1e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0249547  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3319  DNA repair protein RecN  35.37 
 
 		 549 aa  291  1e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.303665  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2214  DNA repair protein RecN  35.37 
 
 		 549 aa  291  1e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.725261  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3286  DNA repair protein RecN  35.37 
 
 		 549 aa  291  1e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0539815  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1080  DNA repair protein RecN  32.81 
 
 		 558 aa  291  2e-77  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0501  DNA repair protein RecN  34.2 
 
 		 552 aa  291  2e-77  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.424659  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0877  DNA repair protein RecN  34.62 
 
 		 552 aa  291  2e-77  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3329  DNA repair protein RecN  35.37 
 
 		 549 aa  291  2e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0968  DNA repair protein RecN  35.18 
 
 		 567 aa  291  3e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.858596  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01130  recombination and repair protein  32.69 
 
 		 554 aa  291  3e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3096  DNA repair protein RecN  34.73 
 
 		 557 aa  290  5.0000000000000004e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>