More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2069 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_2069  DNA repair protein RecN  100 
 
 		 565 aa  1120    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1783  DNA repair protein RecN  98.94 
 
 		 565 aa  1108    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1896  DNA repair protein RecN  41.9 
 
 		 567 aa  425  1e-117  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000247727  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1544  DNA repair protein RecN  43.53 
 
 		 566 aa  425  1e-117  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0814  DNA repair protein RecN  41.23 
 
 		 570 aa  414  1e-114  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4246  DNA repair protein RecN  39.41 
 
 		 583 aa  403  1e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00786878  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4284  DNA repair protein RecN  39.58 
 
 		 579 aa  404  1e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0425411  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4304  DNA repair protein RecN  39.58 
 
 		 579 aa  404  1e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000470862  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4026  DNA repair protein RecN  39.13 
 
 		 579 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0028037  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4078  DNA repair protein RecN  39.41 
 
 		 579 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3916  DNA repair protein  39.41 
 
 		 579 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000027559  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3927  DNA repair protein  39.41 
 
 		 583 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0317713  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0254  DNA repair protein RecN  39.23 
 
 		 573 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4194  DNA repair protein RecN  39.41 
 
 		 579 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.9666000000000002e-33 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4397  DNA repair protein RecN  39.41 
 
 		 579 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000441756  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0950  DNA repair protein RecN  39.41 
 
 		 579 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0157368  hitchhiker  0.0000335441 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2316  DNA repair protein RecN  38.42 
 
 		 573 aa  389  1e-107  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2867  DNA repair protein RecN  38.75 
 
 		 579 aa  387  1e-106  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1178  DNA repair protein RecN  35.66 
 
 		 559 aa  384  1e-105  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000946399  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06570  DNA repair protein RecN  38.8 
 
 		 565 aa  374  1e-102  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000129264  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1599  DNA repair ATPase  35.93 
 
 		 555 aa  373  1e-102  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1179  DNA repair and genetic recombination protein  35.08 
 
 		 556 aa  364  2e-99  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0501  DNA repair protein RecN  36.48 
 
 		 552 aa  358  9.999999999999999e-98  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.424659  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2064  DNA repair protein RecN  37.1 
 
 		 558 aa  355  8.999999999999999e-97  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.488529  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0361  DNA repair protein RecN  34.07 
 
 		 601 aa  355  1e-96  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00213355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0942  DNA repair protein RecN  35.33 
 
 		 554 aa  354  2e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1080  DNA repair protein RecN  36.04 
 
 		 558 aa  352  8.999999999999999e-96  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1335  DNA repair protein RecN  37.73 
 
 		 551 aa  352  1e-95  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1611  DNA repair protein RecN  36.64 
 
 		 559 aa  350  3e-95  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000188364  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1578  DNA repair protein RecN  36.64 
 
 		 559 aa  350  3e-95  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1691  DNA repair protein RecN  38.13 
 
 		 557 aa  350  5e-95  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.893605  hitchhiker  0.00244544 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1084  DNA repair protein RecN  36.85 
 
 		 565 aa  348  1e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000955113  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0756  DNA repair ATPase  34.41 
 
 		 562 aa  348  2e-94  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000000414406  hitchhiker  0.0000280252 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3397  DNA repair protein RecN  33.1 
 
 		 586 aa  346  6e-94  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00306133  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2499  DNA repair protein RecN  38.34 
 
 		 561 aa  345  1e-93  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2579  DNA repair protein RecN  34.81 
 
 		 562 aa  343  2.9999999999999997e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.183283 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0119  DNA repair protein RecN  34.76 
 
 		 599 aa  343  4e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2706  DNA repair protein RecN  37.79 
 
 		 552 aa  331  2e-89  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0930  ATPase for DNA repair  33.39 
 
 		 555 aa  331  3e-89  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0370  DNA repair protein RecN  33.51 
 
 		 578 aa  329  6e-89  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.431573  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2326  DNA repair protein RecN  33.39 
 
 		 560 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000910227  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3320  DNA repair protein RecN  32.3 
 
 		 587 aa  327  4.0000000000000003e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0594  DNA repair protein RecN  33.97 
 
 		 569 aa  326  7e-88  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0859323 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1707  DNA repair protein RecN  35.92 
 
 		 553 aa  325  1e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3483  DNA repair protein RecN  34.5 
 
 		 555 aa  325  1e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1027  DNA repair protein RecN  36.6 
 
 		 562 aa  323  4e-87  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0596  DNA repair protein RecN  32.33 
 
 		 572 aa  323  4e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1666  DNA repair protein RecN  33.1 
 
 		 577 aa  322  9.999999999999999e-87  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1047  DNA repair protein RecN  34.39 
 
 		 580 aa  320  6e-86  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.266577  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1578  DNA repair protein RecN  32.98 
 
 		 556 aa  319  7e-86  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2680  DNA repair protein RecN  31.89 
 
 		 554 aa  317  4e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1773  DNA repair protein RecN  33.63 
 
 		 553 aa  312  1e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000824865 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0587  DNA repair and genetic recombination protein  32.86 
 
 		 560 aa  311  2e-83  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2516  DNA repair protein RecN  33.04 
 
 		 572 aa  310  5e-83  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3096  DNA repair protein RecN  31.03 
 
 		 574 aa  309  6.999999999999999e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.155422 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1233  DNA repair ATPase  34.51 
 
 		 551 aa  309  1.0000000000000001e-82  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.337705  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0701  DNA repair protein RecN  33.33 
 
 		 567 aa  308  3e-82  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1507  DNA repair protein RecN  33.77 
 
 		 558 aa  306  5.0000000000000004e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1055  DNA repair protein RecN  32.58 
 
 		 588 aa  306  9.000000000000001e-82  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_923  DNA repair protein  32.41 
 
 		 588 aa  305  1.0000000000000001e-81  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0553147  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3096  DNA repair protein RecN  29.48 
 
 		 557 aa  305  2.0000000000000002e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1104  recombination and repair protein  32.02 
 
 		 552 aa  303  6.000000000000001e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.239344  normal  0.154382 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1170  recombination and repair protein  31.84 
 
 		 552 aa  302  9e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0260908 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1749  DNA repair protein RecN  31.27 
 
 		 574 aa  301  2e-80  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1104  recombination and repair protein  31.96 
 
 		 552 aa  301  2e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.562592 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0934  DNA repair protein RecN  32.24 
 
 		 588 aa  300  5e-80  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.590863  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2444  DNA repair protein RecN  33.45 
 
 		 553 aa  298  1e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0113802  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3462  recombination and repair protein  31.42 
 
 		 552 aa  297  4e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1860  DNA repair protein RecN  31.76 
 
 		 558 aa  296  5e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.457848  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1031  DNA repair protein RecN  32.37 
 
 		 572 aa  296  6e-79  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1026  recombination and repair protein  30.47 
 
 		 554 aa  296  8e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3465  DNA repair protein RecN  33.63 
 
 		 550 aa  296  9e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.393637  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1480  DNA repair protein RecN  29.8 
 
 		 556 aa  294  3e-78  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.269893  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3966  DNA repair protein RecN  31.12 
 
 		 556 aa  294  4e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.284551 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1059  DNA repair protein RecN  30.88 
 
 		 553 aa  293  5e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0987529  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1068  recombination and repair protein  30.88 
 
 		 553 aa  293  5e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0569436  normal  0.137036 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2774  recombination and repair protein  30.88 
 
 		 553 aa  293  5e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000103072  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2768  recombination and repair protein  31.06 
 
 		 553 aa  293  5e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00054696  normal  0.107417 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2472  DNA repair protein RecN  29.48 
 
 		 605 aa  293  6e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.400775 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02504  recombination and repair protein  30.88 
 
 		 553 aa  293  7e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0788874  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02468  hypothetical protein  30.88 
 
 		 553 aa  293  7e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.116899  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2900  recombination and repair protein  30.88 
 
 		 553 aa  293  7e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.004413  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2771  recombination and repair protein  30.52 
 
 		 552 aa  292  1e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.170925  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0378  recombination and repair protein  31.41 
 
 		 554 aa  291  2e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.116911  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3153  recombination and repair protein  30.7 
 
 		 552 aa  291  3e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000145597  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1218  recombination and repair protein  30.7 
 
 		 552 aa  291  3e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.187963  normal  0.0934404 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3151  recombination and repair protein  30.7 
 
 		 552 aa  291  3e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0961248  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3296  recombination and repair protein  30.7 
 
 		 552 aa  291  3e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.182341  decreased coverage  0.000158665 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2032  DNA repair protein RecN  27.84 
 
 		 567 aa  290  6e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3005  recombination and repair protein  31 
 
 		 553 aa  290  6e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000658292  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1385  DNA repair protein  31.31 
 
 		 608 aa  290  7e-77  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0276871  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1446  DNA repair protein RecN  30.27 
 
 		 556 aa  289  8e-77  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000211173  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0354  DNA repair protein RecN  36.62 
 
 		 542 aa  289  8e-77  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3856  recombination and repair protein  30.7 
 
 		 553 aa  289  9e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00344363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1281  recombination and repair protein  31.62 
 
 		 553 aa  289  1e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000117137 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1196  recombination and repair protein  29.8 
 
 		 553 aa  288  2e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2627  DNA repair protein RecN  33.28 
 
 		 574 aa  288  2e-76  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.434189  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0576  DNA repair protein RecN  30.81 
 
 		 568 aa  288  2e-76  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1169  recombination and repair protein  30.7 
 
 		 553 aa  287  4e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1769  DNA repair protein RecN  30.32 
 
 		 557 aa  286  5e-76  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>