More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1301 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE1301  DNA repair protein RecN  100 
 
 		 561 aa  1127    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2316  DNA repair protein RecN  37.35 
 
 		 573 aa  389  1e-107  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1544  DNA repair protein RecN  39.72 
 
 		 566 aa  382  1e-104  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0254  DNA repair protein RecN  35.93 
 
 		 573 aa  380  1e-104  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2627  DNA repair protein RecN  37.23 
 
 		 574 aa  375  1e-102  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.434189  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4284  DNA repair protein RecN  35.4 
 
 		 579 aa  372  1e-102  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0425411  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0950  DNA repair protein RecN  35.4 
 
 		 579 aa  371  1e-101  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0157368  hitchhiker  0.0000335441 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4026  DNA repair protein RecN  34.87 
 
 		 579 aa  370  1e-101  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0028037  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4304  DNA repair protein RecN  35.04 
 
 		 579 aa  370  1e-101  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000470862  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4246  DNA repair protein RecN  34.74 
 
 		 583 aa  369  1e-100  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00786878  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4078  DNA repair protein RecN  34.87 
 
 		 579 aa  367  1e-100  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3916  DNA repair protein  35.04 
 
 		 579 aa  368  1e-100  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000027559  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3927  DNA repair protein  34.87 
 
 		 583 aa  368  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0317713  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4397  DNA repair protein RecN  34.87 
 
 		 579 aa  367  1e-100  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000441756  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4194  DNA repair protein RecN  35.04 
 
 		 579 aa  367  1e-100  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.9666000000000002e-33 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06570  DNA repair protein RecN  39.43 
 
 		 565 aa  361  2e-98  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000129264  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2867  DNA repair protein RecN  35.22 
 
 		 579 aa  359  7e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2444  DNA repair protein RecN  38.79 
 
 		 553 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0113802  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2064  DNA repair protein RecN  36.62 
 
 		 558 aa  358  1.9999999999999998e-97  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.488529  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2680  DNA repair protein RecN  36.49 
 
 		 554 aa  354  2e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1763  DNA repair protein RecN  36.74 
 
 		 560 aa  355  2e-96  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137867  normal  0.0495571 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1773  DNA repair protein RecN  38.26 
 
 		 553 aa  353  5.9999999999999994e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000824865 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0942  DNA repair protein RecN  37.16 
 
 		 554 aa  352  7e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1896  DNA repair protein RecN  35.77 
 
 		 567 aa  352  1e-95  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000247727  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0814  DNA repair protein RecN  37.54 
 
 		 570 aa  349  6e-95  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1578  DNA repair protein RecN  37.7 
 
 		 556 aa  348  1e-94  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1178  DNA repair protein RecN  35 
 
 		 559 aa  346  6e-94  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000946399  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3096  DNA repair protein RecN  35.7 
 
 		 574 aa  344  2.9999999999999997e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.155422 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0596  DNA repair protein RecN  38.23 
 
 		 572 aa  340  2.9999999999999998e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1749  DNA repair protein RecN  35.78 
 
 		 574 aa  338  9.999999999999999e-92  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0930  ATPase for DNA repair  35.65 
 
 		 555 aa  336  7.999999999999999e-91  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2326  DNA repair protein RecN  34.41 
 
 		 560 aa  333  6e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000910227  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1691  DNA repair protein RecN  36.57 
 
 		 557 aa  332  1e-89  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.893605  hitchhiker  0.00244544 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1047  DNA repair protein RecN  38.26 
 
 		 580 aa  331  2e-89  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.266577  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1084  DNA repair protein RecN  36.33 
 
 		 565 aa  330  3e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000955113  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0594  DNA repair protein RecN  35.75 
 
 		 569 aa  329  9e-89  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0859323 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2579  DNA repair protein RecN  35.64 
 
 		 562 aa  329  1.0000000000000001e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.183283 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1666  DNA repair protein RecN  34.34 
 
 		 577 aa  324  2e-87  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2499  DNA repair protein RecN  37.99 
 
 		 561 aa  323  5e-87  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3602  DNA repair protein RecN  32.86 
 
 		 557 aa  322  9.000000000000001e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00779581 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0903  DNA repair protein RecN  33.63 
 
 		 554 aa  322  9.000000000000001e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0370  DNA repair protein RecN  35.44 
 
 		 578 aa  322  9.999999999999999e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.431573  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3364  DNA repair protein RecN  31.84 
 
 		 559 aa  321  3e-86  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.276138  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0968  DNA repair protein RecN  33.27 
 
 		 567 aa  320  3.9999999999999996e-86  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.858596  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3966  DNA repair protein RecN  35.66 
 
 		 556 aa  320  5e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.284551 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0832  DNA repair protein RecN  33.45 
 
 		 554 aa  320  5e-86  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.013795  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1774  DNA repair protein RecN  33.57 
 
 		 556 aa  318  1e-85  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1179  DNA repair and genetic recombination protein  34.99 
 
 		 556 aa  319  1e-85  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0701  DNA repair protein RecN  36.46 
 
 		 567 aa  317  3e-85  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5421  DNA repair protein RecN  32.74 
 
 		 591 aa  317  5e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0361  DNA repair protein RecN  34.2 
 
 		 601 aa  317  5e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00213355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2516  DNA repair protein RecN  36.09 
 
 		 572 aa  315  9.999999999999999e-85  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1707  DNA repair protein RecN  35.19 
 
 		 553 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1080  DNA repair protein RecN  32.56 
 
 		 558 aa  314  2.9999999999999996e-84  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1026  recombination and repair protein  34.41 
 
 		 554 aa  313  7.999999999999999e-84  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5483  DNA repair protein RecN  32.8 
 
 		 558 aa  312  1e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.582199  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42990  DNA repair protein RecN  33.45 
 
 		 557 aa  311  1e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3320  DNA repair protein RecN  34.43 
 
 		 587 aa  311  2e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0119  DNA repair protein RecN  34.09 
 
 		 599 aa  310  5e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4197  DNA repair protein RecN  31.66 
 
 		 557 aa  309  8e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.312426  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1335  DNA repair protein RecN  34.93 
 
 		 551 aa  308  1.0000000000000001e-82  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63010  DNA repair protein RecN  32.75 
 
 		 558 aa  309  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3397  DNA repair protein RecN  34.41 
 
 		 586 aa  308  2.0000000000000002e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00306133  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2032  DNA repair protein RecN  33.92 
 
 		 567 aa  307  3e-82  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2472  DNA repair protein RecN  31.33 
 
 		 605 aa  307  3e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.400775 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1599  DNA repair ATPase  33.57 
 
 		 555 aa  307  3e-82  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1578  DNA repair protein RecN  31.84 
 
 		 559 aa  307  4.0000000000000004e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1611  DNA repair protein RecN  31.84 
 
 		 559 aa  307  4.0000000000000004e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000188364  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1169  recombination and repair protein  31.84 
 
 		 553 aa  306  5.0000000000000004e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0756  DNA repair ATPase  31.96 
 
 		 562 aa  306  9.000000000000001e-82  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000000414406  hitchhiker  0.0000280252 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4507  DNA repair protein RecN  31.31 
 
 		 557 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1507  DNA repair protein RecN  35.65 
 
 		 558 aa  304  2.0000000000000002e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3489  DNA repair protein RecN  34.46 
 
 		 567 aa  305  2.0000000000000002e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000536624 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3483  DNA repair protein RecN  33.75 
 
 		 555 aa  304  3.0000000000000004e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0501  DNA repair protein RecN  33.63 
 
 		 552 aa  303  4.0000000000000003e-81  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.424659  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0611  DNA repair protein RecN  33.76 
 
 		 558 aa  304  4.0000000000000003e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0450  DNA repair protein RecN  33.76 
 
 		 558 aa  304  4.0000000000000003e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0576  DNA repair protein RecN  33.91 
 
 		 568 aa  303  4.0000000000000003e-81  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1475  DNA repair protein RecN  32.38 
 
 		 554 aa  302  9e-81  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.460183  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0866  DNA repair protein RecN  33.63 
 
 		 555 aa  302  9e-81  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4729  DNA repair protein RecN  33.16 
 
 		 557 aa  301  1e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00366375 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2771  recombination and repair protein  32.08 
 
 		 552 aa  301  2e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.170925  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4595  DNA repair protein RecN  33.16 
 
 		 557 aa  301  2e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.202375 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0587  DNA repair and genetic recombination protein  36.23 
 
 		 560 aa  301  3e-80  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2171  DNA repair protein RecN  33.51 
 
 		 575 aa  300  4e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00879264  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_923  DNA repair protein  33.98 
 
 		 588 aa  300  4e-80  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0553147  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1714  DNA repair protein RecN  31.96 
 
 		 557 aa  300  4e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1281  recombination and repair protein  32.56 
 
 		 553 aa  300  4e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000117137 
 
 
-
 
NC_002936  DET1055  DNA repair protein RecN  34.51 
 
 		 588 aa  298  1e-79  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1191  DNA repair protein RecN  33.69 
 
 		 559 aa  298  1e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3158  DNA repair protein RecN  32.16 
 
 		 584 aa  298  1e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0998846  normal  0.788962 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1043  recombination and repair protein  32.26 
 
 		 552 aa  299  1e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2651  DNA repair protein  31.07 
 
 		 569 aa  298  2e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.829393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0623  DNA repair protein RecN  35.74 
 
 		 568 aa  298  2e-79  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.72171  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3462  recombination and repair protein  32.62 
 
 		 552 aa  297  4e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1446  DNA repair protein RecN  32.44 
 
 		 556 aa  297  4e-79  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000211173  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3626  DNA repair protein RecN  31.91 
 
 		 558 aa  297  4e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2706  DNA repair protein RecN  33.87 
 
 		 552 aa  296  6e-79  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0426  DNA repair protein RecN  35.1 
 
 		 553 aa  296  7e-79  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4730  DNA repair protein RecN  32.44 
 
 		 557 aa  296  7e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.46357  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>