More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_2706 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_2706  DNA repair protein RecN  100 
 
 
552 aa  1077    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0354  DNA repair protein RecN  52.36 
 
 
542 aa  476  1e-133  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1544  DNA repair protein RecN  39.89 
 
 
566 aa  379  1e-104  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2316  DNA repair protein RecN  38.52 
 
 
573 aa  372  1e-101  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06570  DNA repair protein RecN  38.75 
 
 
565 aa  368  1e-100  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000129264  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4284  DNA repair protein RecN  38.5 
 
 
579 aa  363  5.0000000000000005e-99  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0425411  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0254  DNA repair protein RecN  36.4 
 
 
573 aa  362  9e-99  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3916  DNA repair protein  38.15 
 
 
579 aa  360  5e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000027559  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4304  DNA repair protein RecN  38.15 
 
 
579 aa  360  5e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000470862  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0950  DNA repair protein RecN  38.33 
 
 
579 aa  359  8e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0157368  hitchhiker  0.0000335441 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2064  DNA repair protein RecN  35.51 
 
 
558 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.488529  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4246  DNA repair protein RecN  37.98 
 
 
583 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00786878  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3927  DNA repair protein  37.98 
 
 
583 aa  358  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0317713  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4194  DNA repair protein RecN  38.15 
 
 
579 aa  358  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.9666000000000002e-33 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4078  DNA repair protein RecN  37.98 
 
 
579 aa  357  3.9999999999999996e-97  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3483  DNA repair protein RecN  34.06 
 
 
555 aa  357  3.9999999999999996e-97  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4397  DNA repair protein RecN  37.98 
 
 
579 aa  357  3.9999999999999996e-97  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000441756  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1179  DNA repair and genetic recombination protein  35.2 
 
 
556 aa  356  5e-97  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0942  DNA repair protein RecN  36.66 
 
 
554 aa  355  7.999999999999999e-97  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0756  DNA repair ATPase  37.16 
 
 
562 aa  355  1e-96  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000000414406  hitchhiker  0.0000280252 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4026  DNA repair protein RecN  37.24 
 
 
579 aa  354  2e-96  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0028037  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1178  DNA repair protein RecN  35 
 
 
559 aa  353  4e-96  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000946399  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2867  DNA repair protein RecN  37.81 
 
 
579 aa  352  8.999999999999999e-96  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0814  DNA repair protein RecN  38.79 
 
 
570 aa  349  6e-95  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0930  ATPase for DNA repair  35.86 
 
 
555 aa  342  1e-92  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2680  DNA repair protein RecN  34.6 
 
 
554 aa  341  2e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1578  DNA repair protein RecN  34.84 
 
 
556 aa  338  9.999999999999999e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1599  DNA repair ATPase  34.36 
 
 
555 aa  337  3.9999999999999995e-91  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3096  DNA repair protein RecN  35.04 
 
 
574 aa  336  7e-91  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.155422 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2069  DNA repair protein RecN  37.79 
 
 
565 aa  335  2e-90  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1783  DNA repair protein RecN  38.39 
 
 
565 aa  335  2e-90  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1773  DNA repair protein RecN  36.58 
 
 
553 aa  334  3e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000824865 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1335  DNA repair protein RecN  35.44 
 
 
551 aa  334  3e-90  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1047  DNA repair protein RecN  36.7 
 
 
580 aa  334  3e-90  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.266577  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2579  DNA repair protein RecN  35.65 
 
 
562 aa  332  1e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.183283 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2444  DNA repair protein RecN  37.66 
 
 
553 aa  330  6e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0113802  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1611  DNA repair protein RecN  34.54 
 
 
559 aa  327  4.0000000000000003e-88  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000188364  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1578  DNA repair protein RecN  34.54 
 
 
559 aa  327  4.0000000000000003e-88  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1896  DNA repair protein RecN  39.4 
 
 
567 aa  327  4.0000000000000003e-88  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000247727  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1080  DNA repair protein RecN  34.84 
 
 
558 aa  325  1e-87  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0501  DNA repair protein RecN  34.18 
 
 
552 aa  325  2e-87  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.424659  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1666  DNA repair protein RecN  33.92 
 
 
577 aa  325  2e-87  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1084  DNA repair protein RecN  35.36 
 
 
565 aa  319  7e-86  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000955113  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0370  DNA repair protein RecN  33.51 
 
 
578 aa  317  4e-85  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.431573  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0596  DNA repair protein RecN  34.16 
 
 
572 aa  316  8e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1707  DNA repair protein RecN  34.96 
 
 
553 aa  312  1e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01130  recombination and repair protein  32.25 
 
 
554 aa  308  2.0000000000000002e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1691  DNA repair protein RecN  34.77 
 
 
557 aa  308  2.0000000000000002e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.893605  hitchhiker  0.00244544 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1026  recombination and repair protein  30.51 
 
 
554 aa  306  7e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1233  DNA repair ATPase  34.57 
 
 
551 aa  306  8.000000000000001e-82  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.337705  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1774  DNA repair protein RecN  30.88 
 
 
556 aa  304  2.0000000000000002e-81  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004296  DNA repair protein RecN  31.89 
 
 
554 aa  304  2.0000000000000002e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.782069  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1507  DNA repair protein RecN  34.3 
 
 
558 aa  300  7e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3364  DNA repair protein RecN  31.13 
 
 
559 aa  299  7e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.276138  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3825  DNA repair protein RecN  30.96 
 
 
561 aa  298  2e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.321139  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1763  DNA repair protein RecN  30.77 
 
 
560 aa  297  3e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137867  normal  0.0495571 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1170  recombination and repair protein  29.98 
 
 
552 aa  296  4e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0260908 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3462  recombination and repair protein  30.16 
 
 
552 aa  296  1e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2326  DNA repair protein RecN  31.17 
 
 
560 aa  295  1e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000910227  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1714  DNA repair protein RecN  31.06 
 
 
557 aa  295  1e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1104  recombination and repair protein  29.98 
 
 
552 aa  295  1e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.562592 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2516  DNA repair protein RecN  33.04 
 
 
572 aa  294  2e-78  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1104  recombination and repair protein  29.98 
 
 
552 aa  294  3e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.239344  normal  0.154382 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0361  DNA repair protein RecN  31.72 
 
 
601 aa  293  7e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00213355  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0623  DNA repair protein RecN  34.56 
 
 
568 aa  292  1e-77  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.72171  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1191  DNA repair protein RecN  31.05 
 
 
559 aa  292  1e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0914  DNA repair protein RecN  30.65 
 
 
558 aa  292  1e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.473015  normal  0.408005 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0378  recombination and repair protein  31.56 
 
 
554 aa  291  2e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.116911  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0866  DNA repair protein RecN  33.03 
 
 
555 aa  290  5.0000000000000004e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1169  recombination and repair protein  29.63 
 
 
553 aa  290  6e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2771  recombination and repair protein  29.98 
 
 
552 aa  290  6e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.170925  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1749  DNA repair protein RecN  33.33 
 
 
574 aa  289  7e-77  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0576  DNA repair protein RecN  33.63 
 
 
568 aa  289  7e-77  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1034  DNA repair protein RecN  28.52 
 
 
576 aa  289  1e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0701  DNA repair protein RecN  33.8 
 
 
567 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2627  DNA repair protein RecN  34.51 
 
 
574 aa  287  2.9999999999999996e-76  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.434189  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1301  DNA repair protein RecN  33.87 
 
 
561 aa  286  5e-76  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3296  recombination and repair protein  29.98 
 
 
552 aa  286  7e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.182341  decreased coverage  0.000158665 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1218  recombination and repair protein  29.98 
 
 
552 aa  286  7e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.187963  normal  0.0934404 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3151  recombination and repair protein  29.98 
 
 
552 aa  286  7e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0961248  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3153  recombination and repair protein  29.98 
 
 
552 aa  286  7e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000145597  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1196  recombination and repair protein  29.08 
 
 
553 aa  286  8e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0998  DNA repair protein RecN  27.85 
 
 
589 aa  286  9e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.553113 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1059  DNA repair protein RecN  29.14 
 
 
553 aa  285  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0987529  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1068  recombination and repair protein  29.14 
 
 
553 aa  285  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0569436  normal  0.137036 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2774  recombination and repair protein  29.14 
 
 
553 aa  285  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000103072  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3298  recombination and repair protein  29.03 
 
 
553 aa  285  2.0000000000000002e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.121559  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2472  DNA repair protein RecN  29.87 
 
 
605 aa  285  2.0000000000000002e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.400775 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2829  recombination and repair protein  29.26 
 
 
553 aa  285  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00407233  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1043  recombination and repair protein  29.63 
 
 
552 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3011  recombination and repair protein  29.08 
 
 
553 aa  284  3.0000000000000004e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2897  recombination and repair protein  29.08 
 
 
553 aa  284  3.0000000000000004e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1027  DNA repair protein RecN  34.69 
 
 
562 aa  284  3.0000000000000004e-75  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3096  recombination and repair protein  29.59 
 
 
553 aa  284  3.0000000000000004e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.316238  normal  0.467754 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2899  recombination and repair protein  29.08 
 
 
553 aa  284  3.0000000000000004e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2879  recombination and repair protein  29.08 
 
 
553 aa  284  3.0000000000000004e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.158329 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2889  recombination and repair protein  28.93 
 
 
553 aa  283  4.0000000000000003e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000988342  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2475  recombination and repair protein  29.88 
 
 
565 aa  283  5.000000000000001e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2976  recombination and repair protein  28.93 
 
 
553 aa  283  5.000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0819489  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0743  DNA repair protein RecN  29.42 
 
 
549 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.259434  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>