More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1753 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3158  DNA repair protein RecN  77.49 
 
 		 584 aa  814    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0998846  normal  0.788962 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1753  DNA repair protein RecN  100 
 
 		 583 aa  1100    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.391848  hitchhiker  0.000930146 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6056  DNA repair and genetic recombination  56.72 
 
 		 570 aa  563  1.0000000000000001e-159  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0143027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5429  DNA repair protein RecN  55.77 
 
 		 580 aa  560  1e-158  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.477052 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2032  DNA repair protein RecN  54.94 
 
 		 567 aa  546  1e-154  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2171  DNA repair protein RecN  56.03 
 
 		 575 aa  535  1e-151  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00879264  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3025  DNA repair protein RecN  55.02 
 
 		 569 aa  525  1e-147  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.185029 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2011  DNA repair protein RecN  56.64 
 
 		 580 aa  519  1e-146  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.270463  normal  0.0516704 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1913  DNA repair protein RecN  53.85 
 
 		 585 aa  513  1e-144  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0988612  normal  0.166083 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1904  DNA repair protein RecN  53 
 
 		 585 aa  510  1e-143  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0641483  hitchhiker  0.00014462 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5439  DNA repair protein RecN  55.46 
 
 		 592 aa  506  9.999999999999999e-143  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3147  DNA repair protein RecN  55.33 
 
 		 611 aa  498  1e-140  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.0041532  normal  0.691504 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4437  DNA repair protein RecN  52.67 
 
 		 583 aa  481  1e-134  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.297367  normal  0.304528 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25450  DNA replication and repair protein RecN  50.43 
 
 		 593 aa  479  1e-134  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2482  DNA repair protein RecN  51.02 
 
 		 584 aa  459  9.999999999999999e-129  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.315988  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1518  DNA repair protein RecN  49.32 
 
 		 579 aa  446  1.0000000000000001e-124  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.301856  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3010  DNA repair protein RecN  53.71 
 
 		 610 aa  442  1e-123  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1517  DNA repair protein RecN  49.74 
 
 		 579 aa  438  1e-121  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000776355 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1126  DNA repair protein RecN  46.75 
 
 		 577 aa  436  1e-121  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4072  DNA repair protein RecN  49.4 
 
 		 588 aa  433  1e-120  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0367674  normal  0.136098 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1342  DNA repair protein RecN  50.34 
 
 		 574 aa  429  1e-119  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1659  DNA repair protein RecN  52.82 
 
 		 578 aa  418  9.999999999999999e-116  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0674828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22130  DNA replication and repair protein RecN  47.82 
 
 		 583 aa  402  9.999999999999999e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.120117  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2381  DNA repair protein RecN  47.18 
 
 		 590 aa  400  9.999999999999999e-111  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1245  DNA repair protein RecN  47.41 
 
 		 592 aa  396  1e-109  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.790366 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11711  DNA repair protein recN  44.59 
 
 		 587 aa  369  1e-101  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.31285  normal  0.395213 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3507  DNA repair protein RecN  44.87 
 
 		 598 aa  366  1e-100  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0691312 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2826  DNA repair protein RecN  43.12 
 
 		 590 aa  366  1e-100  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.327916  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3288  DNA repair protein RecN  45.69 
 
 		 591 aa  367  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14210  DNA repair protein RecN  46.52 
 
 		 580 aa  364  2e-99  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0453265  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2993  DNA repair protein RecN  46.04 
 
 		 590 aa  362  1e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.311205  normal  0.473383 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2949  DNA repair protein RecN  46.04 
 
 		 590 aa  362  1e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2964  DNA repair protein RecN  46.11 
 
 		 587 aa  358  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2355  DNA repair protein RecN  45.22 
 
 		 612 aa  343  5e-93  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.887863  hitchhiker  0.00822868 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13670  DNA repair protein RecN  41.6 
 
 		 590 aa  326  6e-88  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.325794  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1666  DNA repair protein RecN  33.74 
 
 		 577 aa  302  1e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0681  DNA repair protein RecN  35.07 
 
 		 594 aa  298  2e-79  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1896  DNA repair protein RecN  29.6 
 
 		 567 aa  297  4e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000247727  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2316  DNA repair protein RecN  30.31 
 
 		 573 aa  295  1e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0254  DNA repair protein RecN  32.12 
 
 		 573 aa  287  5e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1301  DNA repair protein RecN  32.22 
 
 		 561 aa  286  1.0000000000000001e-75  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3397  DNA repair protein RecN  35.09 
 
 		 586 aa  285  1.0000000000000001e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00306133  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2627  DNA repair protein RecN  27.18 
 
 		 574 aa  286  1.0000000000000001e-75  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.434189  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1084  DNA repair protein RecN  33.22 
 
 		 565 aa  285  2.0000000000000002e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000955113  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2867  DNA repair protein RecN  30.66 
 
 		 579 aa  284  3.0000000000000004e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0942  DNA repair protein RecN  34.61 
 
 		 554 aa  281  3e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1178  DNA repair protein RecN  31.13 
 
 		 559 aa  281  3e-74  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000946399  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3916  DNA repair protein  30.98 
 
 		 579 aa  280  4e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000027559  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0793  DNA repair ATPase  38.37 
 
 		 608 aa  280  4e-74  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0814  DNA repair protein RecN  30.09 
 
 		 570 aa  280  4e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2579  DNA repair protein RecN  30.29 
 
 		 562 aa  280  5e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.183283 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4304  DNA repair protein RecN  30.98 
 
 		 579 aa  280  6e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000470862  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4194  DNA repair protein RecN  30.98 
 
 		 579 aa  280  7e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.9666000000000002e-33 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2680  DNA repair protein RecN  36.03 
 
 		 554 aa  279  8e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4078  DNA repair protein RecN  30.81 
 
 		 579 aa  278  1e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3927  DNA repair protein  30.81 
 
 		 583 aa  279  1e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0317713  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4397  DNA repair protein RecN  30.81 
 
 		 579 aa  278  1e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000441756  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4246  DNA repair protein RecN  30.85 
 
 		 583 aa  278  2e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00786878  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4026  DNA repair protein RecN  30.78 
 
 		 579 aa  278  2e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0028037  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4284  DNA repair protein RecN  30.64 
 
 		 579 aa  278  3e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0425411  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0950  DNA repair protein RecN  30.48 
 
 		 579 aa  278  3e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0157368  hitchhiker  0.0000335441 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02504  recombination and repair protein  32.81 
 
 		 553 aa  275  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0788874  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1047  DNA repair protein RecN  28.84 
 
 		 580 aa  275  2.0000000000000002e-72  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.266577  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0596  DNA repair protein RecN  33.78 
 
 		 572 aa  275  2.0000000000000002e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02468  hypothetical protein  32.81 
 
 		 553 aa  275  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.116899  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1059  DNA repair protein RecN  32.64 
 
 		 553 aa  273  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0987529  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2774  recombination and repair protein  32.64 
 
 		 553 aa  273  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000103072  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1068  recombination and repair protein  32.64 
 
 		 553 aa  273  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0569436  normal  0.137036 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2768  recombination and repair protein  32.81 
 
 		 553 aa  274  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00054696  normal  0.107417 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1578  DNA repair protein RecN  36.11 
 
 		 556 aa  274  4.0000000000000004e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2064  DNA repair protein RecN  33.79 
 
 		 558 aa  273  9e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.488529  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2900  recombination and repair protein  32.47 
 
 		 553 aa  272  1e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.004413  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3856  recombination and repair protein  32.64 
 
 		 553 aa  271  2e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00344363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3005  recombination and repair protein  32.12 
 
 		 553 aa  270  4e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000658292  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3011  recombination and repair protein  32.11 
 
 		 553 aa  270  5e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0728  recombination and repair protein  32.23 
 
 		 553 aa  270  5.9999999999999995e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.118324  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2829  recombination and repair protein  32.11 
 
 		 553 aa  270  8e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00407233  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2899  recombination and repair protein  32.11 
 
 		 553 aa  269  8.999999999999999e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2897  recombination and repair protein  32.11 
 
 		 553 aa  269  8.999999999999999e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2879  recombination and repair protein  32.11 
 
 		 553 aa  269  8.999999999999999e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.158329 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05390  DNA repair protein RecN  37.85 
 
 		 578 aa  268  2e-70  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.256403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3320  DNA repair protein RecN  33.16 
 
 		 587 aa  268  2.9999999999999995e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1652  DNA repair protein RecN  36.13 
 
 		 558 aa  267  4e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1026  recombination and repair protein  31.7 
 
 		 554 aa  266  8.999999999999999e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0361  DNA repair protein RecN  34.25 
 
 		 601 aa  265  2e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00213355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0426  DNA repair protein RecN  29.55 
 
 		 553 aa  265  2e-69  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0934  DNA repair protein RecN  30.72 
 
 		 588 aa  264  3e-69  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.590863  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3218  recombination and repair protein  30.59 
 
 		 553 aa  264  3e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06570  DNA repair protein RecN  30.31 
 
 		 565 aa  263  4.999999999999999e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000129264  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3082  DNA repair protein RecN  38.62 
 
 		 556 aa  261  2e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1611  DNA repair protein RecN  26.8 
 
 		 559 aa  261  2e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000188364  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1544  DNA repair protein RecN  27.1 
 
 		 566 aa  261  2e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1578  DNA repair protein RecN  26.8 
 
 		 559 aa  261  2e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3364  DNA repair protein RecN  33.33 
 
 		 559 aa  261  3e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.276138  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1281  recombination and repair protein  30.02 
 
 		 553 aa  261  3e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000117137 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0963  recombination and repair protein  31.18 
 
 		 553 aa  259  8e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0199907  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0998  DNA repair protein RecN  35.54 
 
 		 589 aa  259  9e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.553113 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1080  DNA repair protein RecN  26.49 
 
 		 558 aa  258  3e-67  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3825  DNA repair protein RecN  28.84 
 
 		 561 aa  258  3e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.321139  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3096  DNA repair protein RecN  31.94 
 
 		 574 aa  258  3e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.155422 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>