More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4072 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4072  DNA repair protein RecN  100 
 
 		 588 aa  1123    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0367674  normal  0.136098 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25450  DNA replication and repair protein RecN  54.14 
 
 		 593 aa  532  1e-150  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5439  DNA repair protein RecN  55.24 
 
 		 592 aa  521  1e-146  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1913  DNA repair protein RecN  50.6 
 
 		 585 aa  465  1e-129  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0988612  normal  0.166083 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1904  DNA repair protein RecN  50.43 
 
 		 585 aa  459  9.999999999999999e-129  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0641483  hitchhiker  0.00014462 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11711  DNA repair protein recN  49.23 
 
 		 587 aa  448  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.31285  normal  0.395213 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1753  DNA repair protein RecN  49.83 
 
 		 583 aa  438  1e-121  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.391848  hitchhiker  0.000930146 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2032  DNA repair protein RecN  47.51 
 
 		 567 aa  430  1e-119  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3158  DNA repair protein RecN  49.66 
 
 		 584 aa  431  1e-119  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0998846  normal  0.788962 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2949  DNA repair protein RecN  49.49 
 
 		 590 aa  431  1e-119  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2993  DNA repair protein RecN  49.49 
 
 		 590 aa  431  1e-119  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.311205  normal  0.473383 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2964  DNA repair protein RecN  49.92 
 
 		 587 aa  428  1e-118  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5429  DNA repair protein RecN  48.35 
 
 		 580 aa  426  1e-118  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.477052 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6056  DNA repair and genetic recombination  49.31 
 
 		 570 aa  423  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0143027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2171  DNA repair protein RecN  49.66 
 
 		 575 aa  425  1e-117  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00879264  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4437  DNA repair protein RecN  49.57 
 
 		 583 aa  420  1e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.297367  normal  0.304528 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3507  DNA repair protein RecN  48.06 
 
 		 598 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0691312 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2381  DNA repair protein RecN  47.25 
 
 		 590 aa  414  1e-114  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2011  DNA repair protein RecN  49.65 
 
 		 580 aa  414  1e-114  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.270463  normal  0.0516704 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2482  DNA repair protein RecN  47.29 
 
 		 584 aa  415  1e-114  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.315988  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2826  DNA repair protein RecN  45.27 
 
 		 590 aa  413  1e-114  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.327916  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3010  DNA repair protein RecN  50.77 
 
 		 610 aa  410  1e-113  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3288  DNA repair protein RecN  48.8 
 
 		 591 aa  411  1e-113  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3025  DNA repair protein RecN  46.55 
 
 		 569 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.185029 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1659  DNA repair protein RecN  50.92 
 
 		 578 aa  392  1e-108  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0674828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1517  DNA repair protein RecN  43.84 
 
 		 579 aa  386  1e-106  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000776355 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1518  DNA repair protein RecN  43.74 
 
 		 579 aa  389  1e-106  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.301856  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3147  DNA repair protein RecN  46.43 
 
 		 611 aa  384  1e-105  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.0041532  normal  0.691504 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22130  DNA replication and repair protein RecN  45.35 
 
 		 583 aa  382  1e-104  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.120117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1126  DNA repair protein RecN  44.03 
 
 		 577 aa  376  1e-103  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1342  DNA repair protein RecN  45.44 
 
 		 574 aa  370  1e-101  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1245  DNA repair protein RecN  44.6 
 
 		 592 aa  346  8e-94  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.790366 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14210  DNA repair protein RecN  43.65 
 
 		 580 aa  326  7e-88  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0453265  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2355  DNA repair protein RecN  43.04 
 
 		 612 aa  308  1.0000000000000001e-82  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.887863  hitchhiker  0.00822868 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1666  DNA repair protein RecN  34.75 
 
 		 577 aa  293  4e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0814  DNA repair protein RecN  31.59 
 
 		 570 aa  291  3e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0793  DNA repair ATPase  36.94 
 
 		 608 aa  282  1e-74  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0681  DNA repair protein RecN  34.33 
 
 		 594 aa  281  3e-74  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2627  DNA repair protein RecN  27.88 
 
 		 574 aa  273  4.0000000000000004e-72  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.434189  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4026  DNA repair protein RecN  29.54 
 
 		 579 aa  272  1e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0028037  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2316  DNA repair protein RecN  30.55 
 
 		 573 aa  272  1e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0950  DNA repair protein RecN  29.47 
 
 		 579 aa  271  2e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0157368  hitchhiker  0.0000335441 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4304  DNA repair protein RecN  29.54 
 
 		 579 aa  271  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000470862  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1325  DNA repair protein RecN  37.76 
 
 		 529 aa  271  2.9999999999999997e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.11608  normal  0.581272 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4284  DNA repair protein RecN  29.3 
 
 		 579 aa  269  8.999999999999999e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0425411  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2064  DNA repair protein RecN  36.18 
 
 		 558 aa  268  1e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.488529  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4246  DNA repair protein RecN  29.5 
 
 		 583 aa  269  1e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00786878  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2867  DNA repair protein RecN  29.85 
 
 		 579 aa  269  1e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3298  recombination and repair protein  32.93 
 
 		 553 aa  268  1e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.121559  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3397  DNA repair protein RecN  34.14 
 
 		 586 aa  269  1e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00306133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1178  DNA repair protein RecN  31.5 
 
 		 559 aa  269  1e-70  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000946399  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3927  DNA repair protein  29.2 
 
 		 583 aa  268  2e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0317713  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4194  DNA repair protein RecN  29.37 
 
 		 579 aa  268  2e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.9666000000000002e-33 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1896  DNA repair protein RecN  29.38 
 
 		 567 aa  268  2e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000247727  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1059  DNA repair protein RecN  32.06 
 
 		 553 aa  267  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0987529  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2774  recombination and repair protein  32.06 
 
 		 553 aa  267  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000103072  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3218  recombination and repair protein  31.72 
 
 		 553 aa  268  2.9999999999999995e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1068  recombination and repair protein  32.06 
 
 		 553 aa  267  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0569436  normal  0.137036 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4078  DNA repair protein RecN  29.2 
 
 		 579 aa  267  4e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4397  DNA repair protein RecN  29.2 
 
 		 579 aa  267  4e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000441756  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13670  DNA repair protein RecN  39.53 
 
 		 590 aa  266  5.999999999999999e-70  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.325794  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3916  DNA repair protein  29.2 
 
 		 579 aa  266  5.999999999999999e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000027559  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02504  recombination and repair protein  32.06 
 
 		 553 aa  266  7e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0788874  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02468  hypothetical protein  32.06 
 
 		 553 aa  266  7e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.116899  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3005  recombination and repair protein  32.06 
 
 		 553 aa  265  1e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000658292  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2900  recombination and repair protein  31.89 
 
 		 553 aa  265  1e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.004413  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3011  recombination and repair protein  32.24 
 
 		 553 aa  265  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2829  recombination and repair protein  32.24 
 
 		 553 aa  265  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00407233  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2768  recombination and repair protein  32.06 
 
 		 553 aa  265  2e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00054696  normal  0.107417 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2879  recombination and repair protein  32.24 
 
 		 553 aa  264  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.158329 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2899  recombination and repair protein  32.24 
 
 		 553 aa  264  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2897  recombination and repair protein  32.24 
 
 		 553 aa  264  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1301  DNA repair protein RecN  30.43 
 
 		 561 aa  263  4.999999999999999e-69  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3856  recombination and repair protein  31.72 
 
 		 553 aa  263  6e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00344363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0254  DNA repair protein RecN  31.1 
 
 		 573 aa  263  6.999999999999999e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3096  DNA repair protein RecN  34.83 
 
 		 574 aa  261  2e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.155422 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2579  DNA repair protein RecN  31.91 
 
 		 562 aa  261  3e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.183283 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1544  DNA repair protein RecN  28.99 
 
 		 566 aa  260  5.0000000000000005e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0942  DNA repair protein RecN  34.76 
 
 		 554 aa  259  1e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3364  DNA repair protein RecN  32.81 
 
 		 559 aa  256  8e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.276138  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0934  DNA repair protein RecN  31.12 
 
 		 588 aa  256  9e-67  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.590863  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3320  DNA repair protein RecN  34.08 
 
 		 587 aa  255  1.0000000000000001e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0596  DNA repair protein RecN  32.48 
 
 		 572 aa  254  3e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1774  DNA repair protein RecN  33.39 
 
 		 556 aa  254  3e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2516  DNA repair protein RecN  33.5 
 
 		 572 aa  253  5.000000000000001e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1179  DNA repair and genetic recombination protein  31.54 
 
 		 556 aa  253  5.000000000000001e-66  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3483  DNA repair protein RecN  31.53 
 
 		 555 aa  253  6e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0361  DNA repair protein RecN  35.95 
 
 		 601 aa  253  7e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00213355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1763  DNA repair protein RecN  34.36 
 
 		 560 aa  253  9.000000000000001e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137867  normal  0.0495571 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01130  recombination and repair protein  30.99 
 
 		 554 aa  252  2e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_923  DNA repair protein  30.95 
 
 		 588 aa  251  2e-65  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0553147  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0119  DNA repair protein RecN  35.59 
 
 		 599 aa  250  4e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1191  DNA repair protein RecN  33.73 
 
 		 559 aa  250  5e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0998  DNA repair protein RecN  33.11 
 
 		 589 aa  249  7e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.553113 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2096  DNA repair protein RecN  35.75 
 
 		 523 aa  249  1e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0728  recombination and repair protein  31.54 
 
 		 553 aa  248  2e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.118324  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2735  alkylhydroperoxidase AhpD core  32.36 
 
 		 557 aa  248  3e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0271976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0474  DNA repair protein RecN  33.45 
 
 		 543 aa  248  3e-64  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.51796 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1691  DNA repair protein RecN  27.49 
 
 		 557 aa  247  4e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.893605  hitchhiker  0.00244544 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2976  recombination and repair protein  30.22 
 
 		 553 aa  247  4e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0819489  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>