More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2381 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2381  DNA repair protein RecN  100 
 
 		 590 aa  1129    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2826  DNA repair protein RecN  56.62 
 
 		 590 aa  581  1e-164  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.327916  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11711  DNA repair protein recN  57.94 
 
 		 587 aa  581  1e-164  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.31285  normal  0.395213 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2949  DNA repair protein RecN  58.5 
 
 		 590 aa  556  1e-157  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25450  DNA replication and repair protein RecN  55.56 
 
 		 593 aa  557  1e-157  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3288  DNA repair protein RecN  56.8 
 
 		 591 aa  557  1e-157  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2993  DNA repair protein RecN  58.5 
 
 		 590 aa  556  1e-157  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.311205  normal  0.473383 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3507  DNA repair protein RecN  55.72 
 
 		 598 aa  554  1e-156  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0691312 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2964  DNA repair protein RecN  58.26 
 
 		 587 aa  547  1e-154  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5439  DNA repair protein RecN  56.28 
 
 		 592 aa  523  1e-147  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1913  DNA repair protein RecN  50.17 
 
 		 585 aa  452  1.0000000000000001e-126  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0988612  normal  0.166083 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1904  DNA repair protein RecN  48.81 
 
 		 585 aa  444  1e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0641483  hitchhiker  0.00014462 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2171  DNA repair protein RecN  49.49 
 
 		 575 aa  434  1e-120  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00879264  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3025  DNA repair protein RecN  49.4 
 
 		 569 aa  435  1e-120  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.185029 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2032  DNA repair protein RecN  48.11 
 
 		 567 aa  427  1e-118  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4437  DNA repair protein RecN  48.63 
 
 		 583 aa  422  1e-117  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.297367  normal  0.304528 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6056  DNA repair and genetic recombination  47.85 
 
 		 570 aa  421  1e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0143027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1342  DNA repair protein RecN  48.55 
 
 		 574 aa  422  1e-116  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4072  DNA repair protein RecN  47.25 
 
 		 588 aa  409  1.0000000000000001e-112  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0367674  normal  0.136098 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1518  DNA repair protein RecN  45.92 
 
 		 579 aa  407  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.301856  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1126  DNA repair protein RecN  46.13 
 
 		 577 aa  405  1e-111  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3158  DNA repair protein RecN  47.79 
 
 		 584 aa  403  1e-111  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0998846  normal  0.788962 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5429  DNA repair protein RecN  45.69 
 
 		 580 aa  401  9.999999999999999e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.477052 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1517  DNA repair protein RecN  44.73 
 
 		 579 aa  399  9.999999999999999e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000776355 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1753  DNA repair protein RecN  46.58 
 
 		 583 aa  397  1e-109  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.391848  hitchhiker  0.000930146 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2482  DNA repair protein RecN  46.74 
 
 		 584 aa  396  1e-109  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.315988  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2011  DNA repair protein RecN  48.68 
 
 		 580 aa  391  1e-107  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.270463  normal  0.0516704 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3147  DNA repair protein RecN  47.81 
 
 		 611 aa  386  1e-106  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.0041532  normal  0.691504 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1659  DNA repair protein RecN  48.47 
 
 		 578 aa  387  1e-106  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0674828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3010  DNA repair protein RecN  48.1 
 
 		 610 aa  383  1e-105  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22130  DNA replication and repair protein RecN  45.65 
 
 		 583 aa  373  1e-102  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.120117  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2355  DNA repair protein RecN  44.78 
 
 		 612 aa  355  1e-96  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.887863  hitchhiker  0.00822868 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14210  DNA repair protein RecN  46.53 
 
 		 580 aa  353  4e-96  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0453265  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1245  DNA repair protein RecN  43.87 
 
 		 592 aa  343  5.999999999999999e-93  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.790366 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13670  DNA repair protein RecN  42.26 
 
 		 590 aa  318  2e-85  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.325794  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0681  DNA repair protein RecN  36.07 
 
 		 594 aa  301  2e-80  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2316  DNA repair protein RecN  33.1 
 
 		 573 aa  301  2e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0793  DNA repair ATPase  39.12 
 
 		 608 aa  298  1e-79  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1666  DNA repair protein RecN  33.56 
 
 		 577 aa  286  1.0000000000000001e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0254  DNA repair protein RecN  32.03 
 
 		 573 aa  285  2.0000000000000002e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1544  DNA repair protein RecN  31.62 
 
 		 566 aa  282  1e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2627  DNA repair protein RecN  28.4 
 
 		 574 aa  278  2e-73  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.434189  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4026  DNA repair protein RecN  29.27 
 
 		 579 aa  276  5e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0028037  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2472  DNA repair protein RecN  35.57 
 
 		 605 aa  273  4.0000000000000004e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.400775 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1301  DNA repair protein RecN  32.4 
 
 		 561 aa  273  8.000000000000001e-72  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4284  DNA repair protein RecN  29.18 
 
 		 579 aa  273  9e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0425411  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3397  DNA repair protein RecN  33.39 
 
 		 586 aa  272  1e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00306133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1714  DNA repair protein RecN  32.08 
 
 		 557 aa  272  1e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0866  DNA repair protein RecN  33.1 
 
 		 555 aa  272  2e-71  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0903  DNA repair protein RecN  35.69 
 
 		 554 aa  272  2e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0950  DNA repair protein RecN  29.18 
 
 		 579 aa  271  2e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0157368  hitchhiker  0.0000335441 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0832  DNA repair protein RecN  35.34 
 
 		 554 aa  271  2.9999999999999997e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.013795  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4304  DNA repair protein RecN  29.01 
 
 		 579 aa  270  5e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000470862  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4246  DNA repair protein RecN  28.84 
 
 		 583 aa  269  1e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00786878  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3916  DNA repair protein  28.84 
 
 		 579 aa  268  1e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000027559  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3927  DNA repair protein  28.84 
 
 		 583 aa  269  1e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0317713  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0814  DNA repair protein RecN  30.86 
 
 		 570 aa  268  2e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4194  DNA repair protein RecN  29.37 
 
 		 579 aa  268  2e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.9666000000000002e-33 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2867  DNA repair protein RecN  29.51 
 
 		 579 aa  268  2.9999999999999995e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4078  DNA repair protein RecN  28.84 
 
 		 579 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4397  DNA repair protein RecN  28.84 
 
 		 579 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000441756  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1178  DNA repair protein RecN  31.37 
 
 		 559 aa  268  2.9999999999999995e-70  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000946399  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2680  DNA repair protein RecN  35.45 
 
 		 554 aa  267  4e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0594  DNA repair protein RecN  31.72 
 
 		 569 aa  265  2e-69  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0859323 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1026  recombination and repair protein  33.1 
 
 		 554 aa  263  4.999999999999999e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1896  DNA repair protein RecN  30.41 
 
 		 567 aa  261  2e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000247727  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1774  DNA repair protein RecN  32.01 
 
 		 556 aa  261  3e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0934  DNA repair protein RecN  31.72 
 
 		 588 aa  261  3e-68  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.590863  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1446  DNA repair protein RecN  33.16 
 
 		 556 aa  260  4e-68  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000211173  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1385  DNA repair protein  33.16 
 
 		 608 aa  261  4e-68  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0276871  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1453  DNA repair protein RecN  36.9 
 
 		 557 aa  260  6e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0975706  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0501  DNA repair protein RecN  32.18 
 
 		 552 aa  259  8e-68  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.424659  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2444  DNA repair protein RecN  35.42 
 
 		 553 aa  259  8e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0113802  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3082  DNA repair protein RecN  38.31 
 
 		 556 aa  258  2e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3320  DNA repair protein RecN  33.5 
 
 		 587 aa  258  2e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1773  DNA repair protein RecN  35.24 
 
 		 553 aa  258  2e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000824865 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1179  DNA repair and genetic recombination protein  30.41 
 
 		 556 aa  258  2e-67  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14810  DNA repair protein RecN  36.1 
 
 		 536 aa  257  4e-67  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0277816 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2579  DNA repair protein RecN  31.74 
 
 		 562 aa  257  4e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.183283 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3286  DNA repair protein RecN  36.38 
 
 		 549 aa  256  6e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0539815  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2333  DNA repair protein RecN  36.38 
 
 		 549 aa  256  6e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3319  DNA repair protein RecN  36.38 
 
 		 549 aa  256  6e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.303665  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2214  DNA repair protein RecN  36.38 
 
 		 549 aa  256  6e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.725261  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1107  DNA repair protein RecN  36.38 
 
 		 549 aa  256  6e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0249547  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0492  DNA repair protein RecN  36.38 
 
 		 549 aa  256  6e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2096  DNA repair protein RecN  36.13 
 
 		 523 aa  255  1.0000000000000001e-66  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1055  DNA repair protein RecN  32.01 
 
 		 588 aa  255  2.0000000000000002e-66  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3462  recombination and repair protein  32.53 
 
 		 552 aa  255  2.0000000000000002e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3329  DNA repair protein RecN  36.21 
 
 		 549 aa  255  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0930  ATPase for DNA repair  29.74 
 
 		 555 aa  255  2.0000000000000002e-66  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1170  recombination and repair protein  32.87 
 
 		 552 aa  254  3e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0260908 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_923  DNA repair protein  31.31 
 
 		 588 aa  254  3e-66  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0553147  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1763  DNA repair protein RecN  32.93 
 
 		 560 aa  254  3e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137867  normal  0.0495571 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1052  DNA repair protein RecN  36.22 
 
 		 565 aa  254  4.0000000000000004e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2064  DNA repair protein RecN  33.56 
 
 		 558 aa  253  5.000000000000001e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.488529  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1301  DNA repair protein RecN  33.1 
 
 		 547 aa  252  1e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.549514 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1084  DNA repair protein RecN  31.67 
 
 		 565 aa  252  1e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000955113  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1104  recombination and repair protein  32.7 
 
 		 552 aa  253  1e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.562592 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1104  recombination and repair protein  32.7 
 
 		 552 aa  252  1e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.239344  normal  0.154382 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1578  DNA repair protein RecN  32.87 
 
 		 556 aa  250  4e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>