More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_1061 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_0331  DNA repair protein RecN  62.41 
 
 		 565 aa  654    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.398153  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6694  DNA repair protein RecN  63.92 
 
 		 557 aa  639    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.478556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1061  DNA repair protein RecN  100 
 
 		 561 aa  1095    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.73431 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2007  DNA repair protein RecN  82.17 
 
 		 561 aa  880    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.518502 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3295  DNA repair protein RecN  79.68 
 
 		 561 aa  861    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3383  DNA repair protein RecN  82.53 
 
 		 561 aa  857    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.342411  normal  0.0146677 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1289  DNA repair protein RecN  90.02 
 
 		 561 aa  970    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4037  DNA repair protein RecN  82.03 
 
 		 562 aa  867    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.531713  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6163  DNA repair protein RecN (recombination protein N)  79.64 
 
 		 557 aa  811    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0430688 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3497  DNA repair protein RecN  60.46 
 
 		 553 aa  628  1e-179  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.185224 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2347  DNA repair protein RecN  62.59 
 
 		 557 aa  628  1e-179  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.724371 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7433  DNA repair protein RecN  62.86 
 
 		 557 aa  600  1e-170  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.146948  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1377  DNA repair protein RecN  60.44 
 
 		 559 aa  597  1e-169  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.183083  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1421  DNA repair protein RecN  60.26 
 
 		 559 aa  594  1e-168  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.564129  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2583  DNA repair protein RecN  58.65 
 
 		 557 aa  594  1e-168  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0083659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2879  DNA repair protein RecN  58.29 
 
 		 557 aa  594  1e-168  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1753  DNA repair protein RecN  59.52 
 
 		 554 aa  589  1e-167  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2842  DNA repair protein RecN  58.29 
 
 		 557 aa  591  1e-167  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.049374  hitchhiker  0.0050611 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2071  DNA repair protein RecN  57.59 
 
 		 557 aa  586  1e-166  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.240609  hitchhiker  0.00158855 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2954  DNA repair protein RecN  60.22 
 
 		 566 aa  578  1e-164  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0217727 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0700  DNA repair protein RecN  59.64 
 
 		 554 aa  581  1e-164  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.415077 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1998  DNA repair protein RecN  59.68 
 
 		 558 aa  576  1.0000000000000001e-163  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3180  DNA repair protein RecN  60.22 
 
 		 566 aa  570  1e-161  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3137  DNA repair protein RecN  59.89 
 
 		 565 aa  569  1e-161  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.103261 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0938  DNA repair protein RecN  56.01 
 
 		 555 aa  567  1e-160  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000961269  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2431  DNA repair protein RecN  56.09 
 
 		 557 aa  512  1e-144  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.320289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4729  DNA repair protein RecN  52.14 
 
 		 553 aa  439  9.999999999999999e-123  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.574204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1736  DNA repair protein RecN  50.18 
 
 		 554 aa  429  1e-119  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0149698  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3161  DNA repair protein RecN  45.83 
 
 		 570 aa  409  1e-113  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.957491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0793  DNA repair protein RecN  46.34 
 
 		 546 aa  395  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.628008 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0940  DNA repair protein RecN  47.48 
 
 		 577 aa  395  1e-108  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.693692  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2118  DNA repair protein RecN  46.34 
 
 		 546 aa  391  1e-107  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.513575  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2747  DNA repair protein RecN  44.36 
 
 		 549 aa  385  1e-106  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0692  DNA repair protein RecN  44.34 
 
 		 549 aa  379  1e-104  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0261152  decreased coverage  0.000301908 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2067  DNA repair protein RecN  46.29 
 
 		 565 aa  380  1e-104  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.614381 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4484  DNA repair protein RecN  48.39 
 
 		 547 aa  380  1e-104  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0703  DNA repair protein RecN  46.72 
 
 		 546 aa  376  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0546  DNA repair protein RecN  49.73 
 
 		 556 aa  372  1e-102  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.419857 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2413  DNA repair protein  48.26 
 
 		 553 aa  375  1e-102  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00688711  normal  0.675409 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3099  DNA repair protein RecN  47.68 
 
 		 564 aa  370  1e-101  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.545519  normal  0.794323 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0775  DNA repair protein RecN  39.93 
 
 		 552 aa  349  1e-94  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000179189 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0756  DNA repair protein RecN  45.09 
 
 		 559 aa  327  3e-88  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3364  DNA repair protein RecN  36.25 
 
 		 559 aa  327  3e-88  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.276138  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2735  alkylhydroperoxidase AhpD core  37.9 
 
 		 557 aa  318  2e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0271976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1763  DNA repair protein RecN  37.31 
 
 		 560 aa  316  9e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137867  normal  0.0495571 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1480  DNA repair protein RecN  39.47 
 
 		 556 aa  315  9.999999999999999e-85  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.269893  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4026  DNA repair protein RecN  34.78 
 
 		 579 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0028037  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0998  DNA repair protein RecN  38.77 
 
 		 589 aa  311  2e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.553113 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5483  DNA repair protein RecN  37.35 
 
 		 558 aa  310  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.582199  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2316  DNA repair protein RecN  34.03 
 
 		 573 aa  307  4.0000000000000004e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0950  DNA repair protein RecN  34.54 
 
 		 579 aa  306  6e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0157368  hitchhiker  0.0000335441 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4284  DNA repair protein RecN  34.72 
 
 		 579 aa  306  7e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0425411  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3916  DNA repair protein  34.26 
 
 		 579 aa  306  9.000000000000001e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000027559  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4194  DNA repair protein RecN  34.26 
 
 		 579 aa  306  9.000000000000001e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.9666000000000002e-33 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63010  DNA repair protein RecN  37.35 
 
 		 558 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3927  DNA repair protein  34.08 
 
 		 583 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0317713  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4304  DNA repair protein RecN  34.26 
 
 		 579 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000470862  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4246  DNA repair protein RecN  34.08 
 
 		 583 aa  304  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00786878  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4078  DNA repair protein RecN  34.08 
 
 		 579 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42990  DNA repair protein RecN  37.41 
 
 		 557 aa  303  4.0000000000000003e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4397  DNA repair protein RecN  34.08 
 
 		 579 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000441756  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4197  DNA repair protein RecN  36.88 
 
 		 557 aa  303  7.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.312426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01130  recombination and repair protein  33.93 
 
 		 554 aa  303  7.000000000000001e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0930  ATPase for DNA repair  34.16 
 
 		 555 aa  303  7.000000000000001e-81  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1191  DNA repair protein RecN  36.9 
 
 		 559 aa  301  2e-80  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1896  DNA repair protein RecN  34.38 
 
 		 567 aa  300  7e-80  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000247727  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0254  DNA repair protein RecN  33.45 
 
 		 573 aa  299  8e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2867  DNA repair protein RecN  35.34 
 
 		 579 aa  299  1e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3096  DNA repair protein RecN  37.59 
 
 		 557 aa  299  1e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1599  DNA repair ATPase  35.43 
 
 		 555 aa  299  1e-79  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4507  DNA repair protein RecN  37.1 
 
 		 557 aa  298  2e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2421  DNA repair protein RecN  35.78 
 
 		 563 aa  298  2e-79  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.955613  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1774  DNA repair protein RecN  36.73 
 
 		 556 aa  298  2e-79  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004296  DNA repair protein RecN  33.57 
 
 		 554 aa  296  9e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.782069  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0501  DNA repair protein RecN  33.45 
 
 		 552 aa  295  1e-78  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.424659  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0761  DNA repair protein RecN  36.64 
 
 		 557 aa  294  4e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.345087  normal  0.395212 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2651  DNA repair protein  40.1 
 
 		 569 aa  293  7e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.829393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1178  DNA repair protein RecN  33.86 
 
 		 559 aa  291  1e-77  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000946399  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3602  DNA repair protein RecN  37.23 
 
 		 557 aa  292  1e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00779581 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3626  DNA repair protein RecN  36.93 
 
 		 558 aa  290  3e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4729  DNA repair protein RecN  37.06 
 
 		 557 aa  290  6e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00366375 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3831  DNA repair protein RecN  38.76 
 
 		 549 aa  290  6e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0378  recombination and repair protein  32.62 
 
 		 554 aa  289  8e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.116911  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0713  DNA repair protein RecN  38.9 
 
 		 549 aa  288  1e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.685992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4730  DNA repair protein RecN  37.23 
 
 		 557 aa  289  1e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.46357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1026  recombination and repair protein  34.03 
 
 		 554 aa  288  1e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0259  DNA repair protein RecN  38.9 
 
 		 549 aa  288  2e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.255628  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0743  DNA repair protein RecN  38.9 
 
 		 549 aa  288  2e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.259434  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0968  DNA repair protein RecN  37 
 
 		 567 aa  287  2.9999999999999996e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.858596  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3825  DNA repair protein RecN  32.87 
 
 		 561 aa  287  2.9999999999999996e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.321139  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2877  DNA repair protein recN  32.51 
 
 		 555 aa  287  2.9999999999999996e-76  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0932  DNA repair protein RecN  38.71 
 
 		 557 aa  287  2.9999999999999996e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.613915 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4595  DNA repair protein RecN  37.06 
 
 		 557 aa  288  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.202375 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2064  DNA repair protein RecN  36.2 
 
 		 558 aa  287  4e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.488529  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1446  DNA repair protein RecN  31.91 
 
 		 556 aa  287  4e-76  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000211173  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1385  DNA repair protein  31.91 
 
 		 608 aa  286  5e-76  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0276871  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1301  DNA repair protein RecN  32.74 
 
 		 561 aa  286  8e-76  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1281  recombination and repair protein  32.04 
 
 		 553 aa  286  8e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000117137 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0661  DNA repair protein RecN  39.26 
 
 		 549 aa  286  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2888  DNA repair protein RecN  38.33 
 
 		 568 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>