More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1289 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2347  DNA repair protein RecN  63.32 
 
 		 557 aa  637    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.724371 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4037  DNA repair protein RecN  84.88 
 
 		 562 aa  898    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.531713  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6163  DNA repair protein RecN (recombination protein N)  81.79 
 
 		 557 aa  840    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0430688 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1061  DNA repair protein RecN  90.02 
 
 		 561 aa  950    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.73431 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0331  DNA repair protein RecN  63.81 
 
 		 565 aa  657    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.398153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2007  DNA repair protein RecN  85.03 
 
 		 561 aa  904    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.518502 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3295  DNA repair protein RecN  83.07 
 
 		 561 aa  892    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3383  DNA repair protein RecN  86.45 
 
 		 561 aa  892    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.342411  normal  0.0146677 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1289  DNA repair protein RecN  100 
 
 		 561 aa  1088    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6694  DNA repair protein RecN  64.65 
 
 		 557 aa  645    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.478556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3497  DNA repair protein RecN  61.43 
 
 		 553 aa  632  1e-180  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.185224 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2879  DNA repair protein RecN  59.02 
 
 		 557 aa  605  9.999999999999999e-173  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2842  DNA repair protein RecN  59.02 
 
 		 557 aa  603  1.0000000000000001e-171  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.049374  hitchhiker  0.0050611 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2583  DNA repair protein RecN  59.2 
 
 		 557 aa  603  1.0000000000000001e-171  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0083659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7433  DNA repair protein RecN  63.39 
 
 		 557 aa  598  1e-170  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.146948  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1377  DNA repair protein RecN  60.07 
 
 		 559 aa  595  1e-169  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.183083  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1421  DNA repair protein RecN  59.89 
 
 		 559 aa  593  1e-168  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.564129  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1753  DNA repair protein RecN  59.89 
 
 		 554 aa  593  1e-168  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0700  DNA repair protein RecN  60.54 
 
 		 554 aa  594  1e-168  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.415077 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2071  DNA repair protein RecN  57.95 
 
 		 557 aa  591  1e-167  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.240609  hitchhiker  0.00158855 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2954  DNA repair protein RecN  60.57 
 
 		 566 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0217727 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1998  DNA repair protein RecN  60.57 
 
 		 558 aa  580  1e-164  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3180  DNA repair protein RecN  60.57 
 
 		 566 aa  575  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3137  DNA repair protein RecN  60.07 
 
 		 565 aa  568  1e-161  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.103261 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0938  DNA repair protein RecN  55.48 
 
 		 555 aa  570  1e-161  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000961269  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2431  DNA repair protein RecN  56.81 
 
 		 557 aa  520  1e-146  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.320289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1736  DNA repair protein RecN  50.71 
 
 		 554 aa  435  1e-120  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0149698  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4729  DNA repair protein RecN  51.25 
 
 		 553 aa  429  1e-119  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.574204  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3161  DNA repair protein RecN  47.33 
 
 		 570 aa  408  1.0000000000000001e-112  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.957491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0793  DNA repair protein RecN  47.44 
 
 		 546 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.628008 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2118  DNA repair protein RecN  47.44 
 
 		 546 aa  398  1e-109  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.513575  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0940  DNA repair protein RecN  47.71 
 
 		 577 aa  387  1e-106  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.693692  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2747  DNA repair protein RecN  44.72 
 
 		 549 aa  387  1e-106  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2067  DNA repair protein RecN  47 
 
 		 565 aa  384  1e-105  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.614381 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0703  DNA repair protein RecN  46.7 
 
 		 546 aa  380  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0692  DNA repair protein RecN  43.43 
 
 		 549 aa  380  1e-104  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0261152  decreased coverage  0.000301908 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4484  DNA repair protein RecN  48.92 
 
 		 547 aa  378  1e-103  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2413  DNA repair protein  47.53 
 
 		 553 aa  367  1e-100  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00688711  normal  0.675409 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0546  DNA repair protein RecN  49.38 
 
 		 556 aa  367  1e-100  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.419857 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3099  DNA repair protein RecN  46.44 
 
 		 564 aa  354  2.9999999999999997e-96  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.545519  normal  0.794323 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0775  DNA repair protein RecN  38.32 
 
 		 552 aa  330  4e-89  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000179189 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0756  DNA repair protein RecN  45.88 
 
 		 559 aa  325  2e-87  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2735  alkylhydroperoxidase AhpD core  37.54 
 
 		 557 aa  323  7e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0271976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3364  DNA repair protein RecN  36.14 
 
 		 559 aa  322  8e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.276138  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1480  DNA repair protein RecN  40 
 
 		 556 aa  322  9.999999999999999e-87  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.269893  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1763  DNA repair protein RecN  38.19 
 
 		 560 aa  319  9e-86  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137867  normal  0.0495571 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2316  DNA repair protein RecN  34.26 
 
 		 573 aa  313  3.9999999999999997e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5483  DNA repair protein RecN  37.39 
 
 		 558 aa  313  6.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.582199  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0998  DNA repair protein RecN  39.09 
 
 		 589 aa  310  4e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.553113 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4197  DNA repair protein RecN  37.52 
 
 		 557 aa  310  5e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.312426  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42990  DNA repair protein RecN  38.41 
 
 		 557 aa  309  1.0000000000000001e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4026  DNA repair protein RecN  34.08 
 
 		 579 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0028037  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4507  DNA repair protein RecN  37.7 
 
 		 557 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63010  DNA repair protein RecN  37.39 
 
 		 558 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01130  recombination and repair protein  33.1 
 
 		 554 aa  307  4.0000000000000004e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3916  DNA repair protein  33.91 
 
 		 579 aa  306  5.0000000000000004e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000027559  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4194  DNA repair protein RecN  33.74 
 
 		 579 aa  306  7e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.9666000000000002e-33 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4284  DNA repair protein RecN  33.74 
 
 		 579 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0425411  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0950  DNA repair protein RecN  33.74 
 
 		 579 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0157368  hitchhiker  0.0000335441 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4304  DNA repair protein RecN  33.74 
 
 		 579 aa  305  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000470862  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3927  DNA repair protein  33.56 
 
 		 583 aa  304  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0317713  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4246  DNA repair protein RecN  33.56 
 
 		 583 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00786878  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4078  DNA repair protein RecN  33.56 
 
 		 579 aa  303  5.000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4397  DNA repair protein RecN  33.56 
 
 		 579 aa  303  5.000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000441756  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3096  DNA repair protein RecN  37.59 
 
 		 557 aa  303  7.000000000000001e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1191  DNA repair protein RecN  36.94 
 
 		 559 aa  301  1e-80  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0761  DNA repair protein RecN  37.46 
 
 		 557 aa  302  1e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.345087  normal  0.395212 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0930  ATPase for DNA repair  33.27 
 
 		 555 aa  300  5e-80  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1774  DNA repair protein RecN  36.7 
 
 		 556 aa  299  8e-80  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0713  DNA repair protein RecN  39.32 
 
 		 549 aa  299  9e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.685992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0259  DNA repair protein RecN  39.32 
 
 		 549 aa  299  1e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.255628  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0743  DNA repair protein RecN  39.32 
 
 		 549 aa  299  1e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.259434  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0501  DNA repair protein RecN  33.57 
 
 		 552 aa  298  2e-79  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.424659  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3602  DNA repair protein RecN  36.79 
 
 		 557 aa  298  2e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00779581 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3831  DNA repair protein RecN  39.15 
 
 		 549 aa  297  4e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0254  DNA repair protein RecN  33.74 
 
 		 573 aa  296  5e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1599  DNA repair ATPase  35.06 
 
 		 555 aa  296  6e-79  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0378  recombination and repair protein  32.86 
 
 		 554 aa  296  7e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.116911  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004296  DNA repair protein RecN  32.21 
 
 		 554 aa  295  1e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.782069  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2867  DNA repair protein RecN  35.33 
 
 		 579 aa  296  1e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0637  DNA repair protein RecN  39.15 
 
 		 549 aa  295  1e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1178  DNA repair protein RecN  33.69 
 
 		 559 aa  295  2e-78  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000946399  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3626  DNA repair protein RecN  36.86 
 
 		 558 aa  295  2e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2064  DNA repair protein RecN  36.56 
 
 		 558 aa  293  4e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.488529  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1281  recombination and repair protein  33.1 
 
 		 553 aa  293  4e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000117137 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0661  DNA repair protein RecN  38.79 
 
 		 549 aa  293  5e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2877  DNA repair protein recN  31.21 
 
 		 555 aa  293  6e-78  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1896  DNA repair protein RecN  32.98 
 
 		 567 aa  293  8e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000247727  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4729  DNA repair protein RecN  36.41 
 
 		 557 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00366375 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1446  DNA repair protein RecN  32.04 
 
 		 556 aa  291  2e-77  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000211173  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2651  DNA repair protein  39.51 
 
 		 569 aa  291  2e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.829393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2421  DNA repair protein RecN  35.09 
 
 		 563 aa  291  2e-77  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.955613  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1385  DNA repair protein  32.04 
 
 		 608 aa  291  2e-77  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0276871  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4595  DNA repair protein RecN  36.41 
 
 		 557 aa  291  3e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.202375 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2475  recombination and repair protein  31.44 
 
 		 565 aa  291  3e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0942  DNA repair protein RecN  37.57 
 
 		 554 aa  290  4e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4730  DNA repair protein RecN  36.41 
 
 		 557 aa  290  4e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.46357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2641  DNA repair protein RecN  38.38 
 
 		 549 aa  289  1e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1026  recombination and repair protein  34.22 
 
 		 554 aa  289  1e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0703  DNA repair protein RecN  36.57 
 
 		 557 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.926549  hitchhiker  0.000359109 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>