More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR1421 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR1421  DNA repair protein RecN  100 
 
 		 559 aa  1102    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.564129  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2583  DNA repair protein RecN  68.22 
 
 		 557 aa  700    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0083659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1998  DNA repair protein RecN  73.3 
 
 		 558 aa  735    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2842  DNA repair protein RecN  68.4 
 
 		 557 aa  701    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.049374  hitchhiker  0.0050611 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1377  DNA repair protein RecN  99.82 
 
 		 559 aa  1099    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.183083  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2879  DNA repair protein RecN  67.46 
 
 		 557 aa  703    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2071  DNA repair protein RecN  69.93 
 
 		 557 aa  724    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.240609  hitchhiker  0.00158855 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1753  DNA repair protein RecN  93.16 
 
 		 554 aa  974    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0938  DNA repair protein RecN  62.64 
 
 		 555 aa  665    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000961269  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1289  DNA repair protein RecN  60.07 
 
 		 561 aa  612  9.999999999999999e-175  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6694  DNA repair protein RecN  60.81 
 
 		 557 aa  614  9.999999999999999e-175  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.478556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0331  DNA repair protein RecN  59 
 
 		 565 aa  608  1e-173  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.398153  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2347  DNA repair protein RecN  60.59 
 
 		 557 aa  606  9.999999999999999e-173  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.724371 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3497  DNA repair protein RecN  58.08 
 
 		 553 aa  605  9.999999999999999e-173  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.185224 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1061  DNA repair protein RecN  60.43 
 
 		 561 aa  605  9.999999999999999e-173  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.73431 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2007  DNA repair protein RecN  60.96 
 
 		 561 aa  607  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.518502 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3295  DNA repair protein RecN  60.07 
 
 		 561 aa  605  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4037  DNA repair protein RecN  60.85 
 
 		 562 aa  607  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.531713  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6163  DNA repair protein RecN (recombination protein N)  61.78 
 
 		 557 aa  602  1.0000000000000001e-171  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0430688 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7433  DNA repair protein RecN  61 
 
 		 557 aa  594  1e-168  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.146948  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3383  DNA repair protein RecN  60.96 
 
 		 561 aa  588  1e-167  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.342411  normal  0.0146677 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2954  DNA repair protein RecN  58.51 
 
 		 566 aa  566  1e-160  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0217727 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0700  DNA repair protein RecN  58.04 
 
 		 554 aa  562  1.0000000000000001e-159  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.415077 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3180  DNA repair protein RecN  58.51 
 
 		 566 aa  558  1e-158  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3137  DNA repair protein RecN  58.08 
 
 		 565 aa  553  1e-156  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.103261 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2431  DNA repair protein RecN  54.5 
 
 		 557 aa  498  1e-139  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.320289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4729  DNA repair protein RecN  51.71 
 
 		 553 aa  439  9.999999999999999e-123  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.574204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2118  DNA repair protein RecN  48.8 
 
 		 546 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.513575  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0793  DNA repair protein RecN  48.62 
 
 		 546 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.628008 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0940  DNA repair protein RecN  48.76 
 
 		 577 aa  410  1e-113  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.693692  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1736  DNA repair protein RecN  48.29 
 
 		 554 aa  411  1e-113  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0149698  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4484  DNA repair protein RecN  50.27 
 
 		 547 aa  408  1.0000000000000001e-112  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3161  DNA repair protein RecN  47.63 
 
 		 570 aa  407  1.0000000000000001e-112  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.957491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0692  DNA repair protein RecN  46.59 
 
 		 549 aa  399  1e-109  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0261152  decreased coverage  0.000301908 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2747  DNA repair protein RecN  45.85 
 
 		 549 aa  391  1e-107  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2067  DNA repair protein RecN  46.55 
 
 		 565 aa  391  1e-107  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.614381 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0703  DNA repair protein RecN  47.42 
 
 		 546 aa  387  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2413  DNA repair protein  48.34 
 
 		 553 aa  372  1e-101  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00688711  normal  0.675409 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3099  DNA repair protein RecN  46.5 
 
 		 564 aa  363  5.0000000000000005e-99  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.545519  normal  0.794323 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0756  DNA repair protein RecN  47.9 
 
 		 559 aa  361  2e-98  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0546  DNA repair protein RecN  48.38 
 
 		 556 aa  345  8.999999999999999e-94  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.419857 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3364  DNA repair protein RecN  36.36 
 
 		 559 aa  333  5e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.276138  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0775  DNA repair protein RecN  37.79 
 
 		 552 aa  327  4.0000000000000003e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000179189 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0998  DNA repair protein RecN  39.62 
 
 		 589 aa  327  4.0000000000000003e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.553113 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1480  DNA repair protein RecN  40.64 
 
 		 556 aa  325  2e-87  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.269893  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1763  DNA repair protein RecN  39.32 
 
 		 560 aa  322  9.999999999999999e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137867  normal  0.0495571 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4026  DNA repair protein RecN  34.72 
 
 		 579 aa  321  3e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0028037  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2214  DNA repair protein RecN  40.04 
 
 		 549 aa  318  2e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.725261  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0492  DNA repair protein RecN  40.04 
 
 		 549 aa  318  2e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2333  DNA repair protein RecN  40.04 
 
 		 549 aa  318  2e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3286  DNA repair protein RecN  40.04 
 
 		 549 aa  318  2e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0539815  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3329  DNA repair protein RecN  39.86 
 
 		 549 aa  318  2e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3319  DNA repair protein RecN  40.04 
 
 		 549 aa  318  2e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.303665  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1107  DNA repair protein RecN  40.04 
 
 		 549 aa  318  2e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0249547  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1034  DNA repair protein RecN  39.93 
 
 		 576 aa  313  3.9999999999999997e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1300  DNA repair protein RecN  39.86 
 
 		 549 aa  312  9e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00383913  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4284  DNA repair protein RecN  34.2 
 
 		 579 aa  311  2e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0425411  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0950  DNA repair protein RecN  34.03 
 
 		 579 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0157368  hitchhiker  0.0000335441 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3916  DNA repair protein  34.2 
 
 		 579 aa  311  2.9999999999999997e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000027559  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2888  DNA repair protein RecN  39.37 
 
 		 568 aa  311  2.9999999999999997e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1385  DNA repair protein  32.44 
 
 		 608 aa  310  4e-83  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0276871  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0713  DNA repair protein RecN  39.64 
 
 		 549 aa  310  5e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.685992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4304  DNA repair protein RecN  34.03 
 
 		 579 aa  310  5.9999999999999995e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000470862  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0259  DNA repair protein RecN  39.64 
 
 		 549 aa  310  5.9999999999999995e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.255628  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0743  DNA repair protein RecN  39.64 
 
 		 549 aa  310  5.9999999999999995e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.259434  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2482  DNA repair protein RecN  39.19 
 
 		 568 aa  310  5.9999999999999995e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3831  DNA repair protein RecN  40.21 
 
 		 549 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1446  DNA repair protein RecN  32.44 
 
 		 556 aa  309  9e-83  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000211173  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2651  DNA repair protein  40.38 
 
 		 569 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.829393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2735  alkylhydroperoxidase AhpD core  36.03 
 
 		 557 aa  308  1.0000000000000001e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0271976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4194  DNA repair protein RecN  33.86 
 
 		 579 aa  309  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.9666000000000002e-33 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4246  DNA repair protein RecN  33.85 
 
 		 583 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00786878  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3927  DNA repair protein  33.85 
 
 		 583 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0317713  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1774  DNA repair protein RecN  36.57 
 
 		 556 aa  308  2.0000000000000002e-82  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0661  DNA repair protein RecN  39.82 
 
 		 549 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0637  DNA repair protein RecN  39.82 
 
 		 549 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4078  DNA repair protein RecN  33.85 
 
 		 579 aa  307  4.0000000000000004e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4397  DNA repair protein RecN  33.85 
 
 		 579 aa  307  4.0000000000000004e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000441756  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0866  DNA repair protein RecN  34.77 
 
 		 555 aa  306  6e-82  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1904  DNA repair protein RecN  37.94 
 
 		 564 aa  306  6e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5483  DNA repair protein RecN  37.01 
 
 		 558 aa  303  6.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.582199  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1191  DNA repair protein RecN  35.48 
 
 		 559 aa  302  1e-80  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0728  recombination and repair protein  34.23 
 
 		 553 aa  301  2e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.118324  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0501  DNA repair protein RecN  32.69 
 
 		 552 aa  301  2e-80  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.424659  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2641  DNA repair protein RecN  38.5 
 
 		 549 aa  301  2e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227143  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2680  DNA repair protein RecN  37.27 
 
 		 554 aa  301  2e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0930  ATPase for DNA repair  32.81 
 
 		 555 aa  301  2e-80  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3218  recombination and repair protein  33.57 
 
 		 553 aa  300  4e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3298  recombination and repair protein  33.33 
 
 		 553 aa  300  6e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.121559  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0651  DNA repair protein  33.39 
 
 		 559 aa  300  6e-80  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1178  DNA repair protein RecN  34.35 
 
 		 559 aa  300  7e-80  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000946399  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2421  DNA repair protein RecN  37.08 
 
 		 563 aa  298  2e-79  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.955613  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2475  recombination and repair protein  33.03 
 
 		 565 aa  297  3e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2316  DNA repair protein RecN  32.47 
 
 		 573 aa  297  4e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63010  DNA repair protein RecN  37.19 
 
 		 558 aa  297  4e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1599  DNA repair ATPase  35.18 
 
 		 555 aa  296  6e-79  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1059  DNA repair protein RecN  32.91 
 
 		 553 aa  295  1e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0987529  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1068  recombination and repair protein  32.91 
 
 		 553 aa  295  1e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0569436  normal  0.137036 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2774  recombination and repair protein  32.91 
 
 		 553 aa  295  1e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000103072  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2867  DNA repair protein RecN  33.68 
 
 		 579 aa  295  1e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>