More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2067 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2067  DNA repair protein RecN  100 
 
 		 565 aa  1094    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.614381 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2431  DNA repair protein RecN  52.4 
 
 		 557 aa  451  1e-125  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.320289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2118  DNA repair protein RecN  50.72 
 
 		 546 aa  436  1e-121  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.513575  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0793  DNA repair protein RecN  50.72 
 
 		 546 aa  436  1e-121  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.628008 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1736  DNA repair protein RecN  50.53 
 
 		 554 aa  438  1e-121  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0149698  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3099  DNA repair protein RecN  52.59 
 
 		 564 aa  432  1e-120  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.545519  normal  0.794323 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0703  DNA repair protein RecN  51.36 
 
 		 546 aa  434  1e-120  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0331  DNA repair protein RecN  47.57 
 
 		 565 aa  419  1e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.398153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4729  DNA repair protein RecN  51.06 
 
 		 553 aa  421  1e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.574204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1998  DNA repair protein RecN  46.17 
 
 		 558 aa  419  1e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2747  DNA repair protein RecN  48.66 
 
 		 549 aa  417  9.999999999999999e-116  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0692  DNA repair protein RecN  48.73 
 
 		 549 aa  417  9.999999999999999e-116  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0261152  decreased coverage  0.000301908 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2347  DNA repair protein RecN  48.46 
 
 		 557 aa  413  1e-114  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.724371 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4484  DNA repair protein RecN  52.39 
 
 		 547 aa  412  1e-114  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1289  DNA repair protein RecN  47 
 
 		 561 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2071  DNA repair protein RecN  45.77 
 
 		 557 aa  405  1e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.240609  hitchhiker  0.00158855 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2842  DNA repair protein RecN  45.39 
 
 		 557 aa  402  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.049374  hitchhiker  0.0050611 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2007  DNA repair protein RecN  47.61 
 
 		 561 aa  403  1e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.518502 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3295  DNA repair protein RecN  46.73 
 
 		 561 aa  405  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3497  DNA repair protein RecN  45.74 
 
 		 553 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.185224 
 
 
-
 
NC_004310  BR1421  DNA repair protein RecN  46.39 
 
 		 559 aa  400  9.999999999999999e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.564129  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4037  DNA repair protein RecN  47.97 
 
 		 562 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.531713  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1377  DNA repair protein RecN  46.39 
 
 		 559 aa  399  9.999999999999999e-111  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.183083  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2879  DNA repair protein RecN  45.86 
 
 		 557 aa  399  9.999999999999999e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2583  DNA repair protein RecN  45.03 
 
 		 557 aa  397  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0083659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6694  DNA repair protein RecN  47.37 
 
 		 557 aa  399  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.478556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1753  DNA repair protein RecN  46.39 
 
 		 554 aa  396  1e-109  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2413  DNA repair protein  49.64 
 
 		 553 aa  396  1e-109  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00688711  normal  0.675409 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0938  DNA repair protein RecN  43.29 
 
 		 555 aa  395  1e-109  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000961269  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1061  DNA repair protein RecN  46.29 
 
 		 561 aa  394  1e-108  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.73431 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0940  DNA repair protein RecN  49.21 
 
 		 577 aa  388  1e-106  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.693692  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3383  DNA repair protein RecN  47.08 
 
 		 561 aa  386  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.342411  normal  0.0146677 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3161  DNA repair protein RecN  45.87 
 
 		 570 aa  378  1e-103  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.957491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7433  DNA repair protein RecN  48.09 
 
 		 557 aa  378  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.146948  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2954  DNA repair protein RecN  45.91 
 
 		 566 aa  377  1e-103  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0217727 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0546  DNA repair protein RecN  50.79 
 
 		 556 aa  377  1e-103  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.419857 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6163  DNA repair protein RecN (recombination protein N)  46.54 
 
 		 557 aa  376  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0430688 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3180  DNA repair protein RecN  46.09 
 
 		 566 aa  373  1e-102  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3137  DNA repair protein RecN  45.81 
 
 		 565 aa  366  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.103261 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0700  DNA repair protein RecN  45.13 
 
 		 554 aa  365  1e-99  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.415077 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0756  DNA repair protein RecN  48.26 
 
 		 559 aa  344  2e-93  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1385  DNA repair protein  34.69 
 
 		 608 aa  315  9.999999999999999e-85  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0276871  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1446  DNA repair protein RecN  34.69 
 
 		 556 aa  315  1.9999999999999998e-84  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000211173  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3462  recombination and repair protein  34.98 
 
 		 552 aa  314  2.9999999999999996e-84  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5483  DNA repair protein RecN  38.96 
 
 		 558 aa  314  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.582199  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0713  DNA repair protein RecN  40.39 
 
 		 549 aa  314  3.9999999999999997e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.685992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0259  DNA repair protein RecN  40.39 
 
 		 549 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.255628  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0743  DNA repair protein RecN  40.39 
 
 		 549 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.259434  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1104  recombination and repair protein  35.04 
 
 		 552 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.239344  normal  0.154382 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0968  DNA repair protein RecN  39.57 
 
 		 567 aa  313  4.999999999999999e-84  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.858596  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0637  DNA repair protein RecN  39.86 
 
 		 549 aa  313  5.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1170  recombination and repair protein  35.04 
 
 		 552 aa  312  7.999999999999999e-84  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0260908 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1104  recombination and repair protein  34.87 
 
 		 552 aa  311  2e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.562592 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0661  DNA repair protein RecN  39.68 
 
 		 549 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3831  DNA repair protein RecN  40.04 
 
 		 549 aa  310  4e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0378  recombination and repair protein  35.94 
 
 		 554 aa  308  1.0000000000000001e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.116911  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2641  DNA repair protein RecN  39.75 
 
 		 549 aa  309  1.0000000000000001e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3096  DNA repair protein RecN  38.32 
 
 		 557 aa  308  2.0000000000000002e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1763  DNA repair protein RecN  36.74 
 
 		 560 aa  306  7e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137867  normal  0.0495571 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1480  DNA repair protein RecN  38.48 
 
 		 556 aa  305  1.0000000000000001e-81  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.269893  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2771  recombination and repair protein  34.81 
 
 		 552 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.170925  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1026  recombination and repair protein  35.59 
 
 		 554 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3359  recombination and repair protein  33.45 
 
 		 553 aa  304  3.0000000000000004e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0341558 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1475  DNA repair protein RecN  36.36 
 
 		 554 aa  304  4.0000000000000003e-81  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.460183  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1218  recombination and repair protein  34.81 
 
 		 552 aa  303  5.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.187963  normal  0.0934404 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3151  recombination and repair protein  34.81 
 
 		 552 aa  303  5.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0961248  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3153  recombination and repair protein  34.81 
 
 		 552 aa  303  5.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000145597  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1196  recombination and repair protein  33.98 
 
 		 553 aa  303  5.000000000000001e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3296  recombination and repair protein  34.81 
 
 		 552 aa  303  5.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.182341  decreased coverage  0.000158665 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3364  DNA repair protein RecN  35.66 
 
 		 559 aa  303  6.000000000000001e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.276138  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63010  DNA repair protein RecN  37.91 
 
 		 558 aa  303  7.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1774  DNA repair protein RecN  37.08 
 
 		 556 aa  303  8.000000000000001e-81  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4197  DNA repair protein RecN  37.19 
 
 		 557 aa  302  1e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.312426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01130  recombination and repair protein  34.4 
 
 		 554 aa  300  4e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4507  DNA repair protein RecN  37.02 
 
 		 557 aa  300  5e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3319  DNA repair protein RecN  39.26 
 
 		 549 aa  300  6e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.303665  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2333  DNA repair protein RecN  39.26 
 
 		 549 aa  300  6e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1107  DNA repair protein RecN  39.26 
 
 		 549 aa  300  6e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0249547  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0492  DNA repair protein RecN  39.26 
 
 		 549 aa  300  6e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3286  DNA repair protein RecN  39.26 
 
 		 549 aa  300  6e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0539815  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2214  DNA repair protein RecN  39.26 
 
 		 549 aa  300  6e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.725261  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3329  DNA repair protein RecN  39.26 
 
 		 549 aa  299  7e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004296  DNA repair protein RecN  34.52 
 
 		 554 aa  298  2e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.782069  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2475  recombination and repair protein  33.45 
 
 		 565 aa  297  3e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1281  recombination and repair protein  33.1 
 
 		 553 aa  297  4e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000117137 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1169  recombination and repair protein  33.8 
 
 		 553 aa  296  7e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0761  DNA repair protein RecN  36.67 
 
 		 557 aa  295  1e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.345087  normal  0.395212 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0596  DNA repair protein RecN  36.68 
 
 		 572 aa  295  2e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2316  DNA repair protein RecN  32.12 
 
 		 573 aa  295  2e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3626  DNA repair protein RecN  37.57 
 
 		 558 aa  294  4e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1300  DNA repair protein RecN  38.91 
 
 		 549 aa  291  2e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00383913  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2829  recombination and repair protein  34.33 
 
 		 553 aa  291  3e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00407233  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2899  recombination and repair protein  34.15 
 
 		 553 aa  290  6e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2897  recombination and repair protein  34.15 
 
 		 553 aa  290  6e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2879  recombination and repair protein  34.15 
 
 		 553 aa  290  6e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.158329 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2482  DNA repair protein RecN  38.1 
 
 		 568 aa  289  7e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2976  recombination and repair protein  34.1 
 
 		 553 aa  290  7e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0819489  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1376  recombination and repair protein  34.1 
 
 		 553 aa  290  7e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000000100313  normal  0.0248594 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2888  DNA repair protein RecN  37.92 
 
 		 568 aa  289  1e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2735  alkylhydroperoxidase AhpD core  34.83 
 
 		 557 aa  288  2e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0271976  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>