More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_3161 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_3161  DNA repair protein RecN  100 
 
 		 570 aa  1091    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.957491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0756  DNA repair protein RecN  58.61 
 
 		 559 aa  486  1e-136  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2007  DNA repair protein RecN  50 
 
 		 561 aa  433  1e-120  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.518502 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3295  DNA repair protein RecN  48.96 
 
 		 561 aa  434  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2879  DNA repair protein RecN  48.22 
 
 		 557 aa  431  1e-119  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1998  DNA repair protein RecN  49.65 
 
 		 558 aa  429  1e-119  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1289  DNA repair protein RecN  47.68 
 
 		 561 aa  421  1e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2071  DNA repair protein RecN  46.79 
 
 		 557 aa  416  9.999999999999999e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.240609  hitchhiker  0.00158855 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4037  DNA repair protein RecN  49.48 
 
 		 562 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.531713  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2347  DNA repair protein RecN  48.08 
 
 		 557 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.724371 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2842  DNA repair protein RecN  46.88 
 
 		 557 aa  414  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.049374  hitchhiker  0.0050611 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2583  DNA repair protein RecN  46.7 
 
 		 557 aa  413  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0083659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3497  DNA repair protein RecN  46.89 
 
 		 553 aa  412  1e-114  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.185224 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0940  DNA repair protein RecN  50.17 
 
 		 577 aa  415  1e-114  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.693692  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3383  DNA repair protein RecN  49.65 
 
 		 561 aa  414  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.342411  normal  0.0146677 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0331  DNA repair protein RecN  46.9 
 
 		 565 aa  413  1e-114  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.398153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1736  DNA repair protein RecN  49.21 
 
 		 554 aa  410  1e-113  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0149698  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6163  DNA repair protein RecN (recombination protein N)  48.78 
 
 		 557 aa  410  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0430688 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1061  DNA repair protein RecN  47.05 
 
 		 561 aa  408  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.73431 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1377  DNA repair protein RecN  47.23 
 
 		 559 aa  405  1.0000000000000001e-112  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.183083  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1421  DNA repair protein RecN  47.23 
 
 		 559 aa  405  1e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.564129  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6694  DNA repair protein RecN  46.87 
 
 		 557 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.478556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4729  DNA repair protein RecN  48.43 
 
 		 553 aa  395  1e-109  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.574204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1753  DNA repair protein RecN  46.51 
 
 		 554 aa  398  1e-109  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2431  DNA repair protein RecN  48.69 
 
 		 557 aa  396  1e-109  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.320289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2747  DNA repair protein RecN  46.33 
 
 		 549 aa  391  1e-107  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7433  DNA repair protein RecN  47.23 
 
 		 557 aa  380  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.146948  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2954  DNA repair protein RecN  44.98 
 
 		 566 aa  377  1e-103  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0217727 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0938  DNA repair protein RecN  43.68 
 
 		 555 aa  377  1e-103  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000961269  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4484  DNA repair protein RecN  49.12 
 
 		 547 aa  377  1e-103  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0692  DNA repair protein RecN  44.9 
 
 		 549 aa  373  1e-102  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0261152  decreased coverage  0.000301908 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3180  DNA repair protein RecN  44.98 
 
 		 566 aa  374  1e-102  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0793  DNA repair protein RecN  47.43 
 
 		 546 aa  374  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.628008 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2118  DNA repair protein RecN  47.43 
 
 		 546 aa  370  1e-101  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.513575  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3137  DNA repair protein RecN  44.82 
 
 		 565 aa  366  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.103261 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2067  DNA repair protein RecN  45.55 
 
 		 565 aa  364  2e-99  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.614381 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0700  DNA repair protein RecN  46.26 
 
 		 554 aa  364  2e-99  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.415077 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1763  DNA repair protein RecN  42.46 
 
 		 560 aa  363  3e-99  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137867  normal  0.0495571 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3099  DNA repair protein RecN  46.7 
 
 		 564 aa  355  1e-96  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.545519  normal  0.794323 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0703  DNA repair protein RecN  46.7 
 
 		 546 aa  355  1e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0775  DNA repair protein RecN  42.16 
 
 		 552 aa  349  8e-95  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000179189 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0546  DNA repair protein RecN  47.99 
 
 		 556 aa  338  1.9999999999999998e-91  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.419857 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2413  DNA repair protein  44.7 
 
 		 553 aa  335  1e-90  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00688711  normal  0.675409 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3364  DNA repair protein RecN  38.88 
 
 		 559 aa  333  4e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.276138  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1026  recombination and repair protein  38.18 
 
 		 554 aa  325  1e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1774  DNA repair protein RecN  37.83 
 
 		 556 aa  323  7e-87  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1191  DNA repair protein RecN  40.11 
 
 		 559 aa  322  9.999999999999999e-87  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5483  DNA repair protein RecN  38.07 
 
 		 558 aa  321  3e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.582199  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63010  DNA repair protein RecN  38.07 
 
 		 558 aa  319  9e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2421  DNA repair protein RecN  39.16 
 
 		 563 aa  318  2e-85  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.955613  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2735  alkylhydroperoxidase AhpD core  38.11 
 
 		 557 aa  317  3e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0271976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1446  DNA repair protein RecN  34.55 
 
 		 556 aa  314  1.9999999999999998e-84  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000211173  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1385  DNA repair protein  34.55 
 
 		 608 aa  315  1.9999999999999998e-84  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0276871  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2771  recombination and repair protein  36.56 
 
 		 552 aa  313  5.999999999999999e-84  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.170925  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1480  DNA repair protein RecN  39.58 
 
 		 556 aa  311  2.9999999999999997e-83  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.269893  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1218  recombination and repair protein  36.11 
 
 		 552 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.187963  normal  0.0934404 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3153  recombination and repair protein  36.11 
 
 		 552 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000145597  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3296  recombination and repair protein  36.11 
 
 		 552 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.182341  decreased coverage  0.000158665 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3151  recombination and repair protein  36.11 
 
 		 552 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0961248  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3462  recombination and repair protein  35.38 
 
 		 552 aa  306  5.0000000000000004e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4197  DNA repair protein RecN  37.26 
 
 		 557 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.312426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1196  recombination and repair protein  35.31 
 
 		 553 aa  306  7e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2064  DNA repair protein RecN  39.12 
 
 		 558 aa  305  2.0000000000000002e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.488529  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1107  DNA repair protein RecN  39.72 
 
 		 549 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0249547  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4507  DNA repair protein RecN  37.08 
 
 		 557 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2333  DNA repair protein RecN  39.72 
 
 		 549 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3319  DNA repair protein RecN  39.72 
 
 		 549 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.303665  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3286  DNA repair protein RecN  39.72 
 
 		 549 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0539815  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0492  DNA repair protein RecN  39.72 
 
 		 549 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2214  DNA repair protein RecN  39.72 
 
 		 549 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.725261  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0942  DNA repair protein RecN  39.25 
 
 		 554 aa  303  4.0000000000000003e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1300  DNA repair protein RecN  40.35 
 
 		 549 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00383913  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3329  DNA repair protein RecN  39.72 
 
 		 549 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0932  DNA repair protein RecN  39.35 
 
 		 557 aa  303  7.000000000000001e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.613915 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0703  DNA repair protein RecN  38.14 
 
 		 557 aa  303  8.000000000000001e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.926549  hitchhiker  0.000359109 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1104  recombination and repair protein  35.84 
 
 		 552 aa  302  1e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.239344  normal  0.154382 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3359  recombination and repair protein  36.14 
 
 		 553 aa  301  2e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0341558 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3096  DNA repair protein RecN  39.1 
 
 		 557 aa  301  2e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1043  recombination and repair protein  34.97 
 
 		 552 aa  301  2e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3626  DNA repair protein RecN  37.61 
 
 		 558 aa  301  2e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0713  DNA repair protein RecN  40.53 
 
 		 549 aa  300  3e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.685992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0259  DNA repair protein RecN  40.53 
 
 		 549 aa  301  3e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.255628  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1170  recombination and repair protein  35.84 
 
 		 552 aa  301  3e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0260908 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0743  DNA repair protein RecN  40.53 
 
 		 549 aa  301  3e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.259434  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1104  recombination and repair protein  35.61 
 
 		 552 aa  300  4e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.562592 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0761  DNA repair protein RecN  37.79 
 
 		 557 aa  299  1e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.345087  normal  0.395212 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0651  DNA repair protein  32.86 
 
 		 559 aa  299  1e-79  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01182  DNA repair protein RecN  38.67 
 
 		 554 aa  298  2e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.239665  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4729  DNA repair protein RecN  37.08 
 
 		 557 aa  297  4e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00366375 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4730  DNA repair protein RecN  37.08 
 
 		 557 aa  297  4e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.46357  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42990  DNA repair protein RecN  36.8 
 
 		 557 aa  297  4e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4595  DNA repair protein RecN  37.08 
 
 		 557 aa  296  6e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.202375 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0456  DNA repair protein RecN  38.18 
 
 		 553 aa  296  6e-79  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0661  DNA repair protein RecN  40.14 
 
 		 549 aa  296  7e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3831  DNA repair protein RecN  40.18 
 
 		 549 aa  295  1e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0637  DNA repair protein RecN  40.14 
 
 		 549 aa  296  1e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1904  DNA repair protein RecN  38.61 
 
 		 564 aa  295  2e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1281  recombination and repair protein  34.45 
 
 		 553 aa  294  3e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000117137 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3825  DNA repair protein RecN  31.01 
 
 		 561 aa  293  6e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.321139  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2641  DNA repair protein RecN  40.25 
 
 		 549 aa  293  6e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227143  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>