More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4037 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_6694  DNA repair protein RecN  64.9 
 
 		 557 aa  640    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.478556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1061  DNA repair protein RecN  82.03 
 
 		 561 aa  860    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.73431 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0331  DNA repair protein RecN  64.39 
 
 		 565 aa  662    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.398153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2007  DNA repair protein RecN  92.53 
 
 		 561 aa  976    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.518502 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3295  DNA repair protein RecN  88.26 
 
 		 561 aa  941    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3383  DNA repair protein RecN  92.88 
 
 		 561 aa  949    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.342411  normal  0.0146677 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1289  DNA repair protein RecN  84.88 
 
 		 561 aa  909    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3497  DNA repair protein RecN  62.75 
 
 		 553 aa  634    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.185224 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6163  DNA repair protein RecN (recombination protein N)  83.42 
 
 		 557 aa  842    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0430688 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4037  DNA repair protein RecN  100 
 
 		 562 aa  1083    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.531713  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2347  DNA repair protein RecN  64.3 
 
 		 557 aa  642    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.724371 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2879  DNA repair protein RecN  61.82 
 
 		 557 aa  629  1e-179  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2842  DNA repair protein RecN  60.18 
 
 		 557 aa  612  9.999999999999999e-175  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.049374  hitchhiker  0.0050611 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2583  DNA repair protein RecN  60.18 
 
 		 557 aa  610  1e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0083659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1753  DNA repair protein RecN  61.06 
 
 		 554 aa  605  9.999999999999999e-173  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2071  DNA repair protein RecN  60.04 
 
 		 557 aa  608  9.999999999999999e-173  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.240609  hitchhiker  0.00158855 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1377  DNA repair protein RecN  61.06 
 
 		 559 aa  604  1.0000000000000001e-171  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.183083  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7433  DNA repair protein RecN  64.17 
 
 		 557 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.146948  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1421  DNA repair protein RecN  60.88 
 
 		 559 aa  601  1e-170  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.564129  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0700  DNA repair protein RecN  62.03 
 
 		 554 aa  599  1e-170  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.415077 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2954  DNA repair protein RecN  61.72 
 
 		 566 aa  595  1e-169  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0217727 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1998  DNA repair protein RecN  61.07 
 
 		 558 aa  591  1e-167  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3180  DNA repair protein RecN  61.72 
 
 		 566 aa  585  1e-166  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3137  DNA repair protein RecN  61.22 
 
 		 565 aa  581  1e-164  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.103261 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0938  DNA repair protein RecN  55.2 
 
 		 555 aa  567  1e-160  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000961269  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2431  DNA repair protein RecN  57.42 
 
 		 557 aa  508  9.999999999999999e-143  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.320289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4729  DNA repair protein RecN  52.14 
 
 		 553 aa  434  1e-120  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.574204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1736  DNA repair protein RecN  51.42 
 
 		 554 aa  431  1e-119  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0149698  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3161  DNA repair protein RecN  49.13 
 
 		 570 aa  409  1e-113  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.957491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0940  DNA repair protein RecN  49.04 
 
 		 577 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.693692  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0793  DNA repair protein RecN  48.45 
 
 		 546 aa  398  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.628008 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2118  DNA repair protein RecN  48.45 
 
 		 546 aa  393  1e-108  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.513575  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2067  DNA repair protein RecN  47.97 
 
 		 565 aa  389  1e-107  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.614381 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2747  DNA repair protein RecN  46.33 
 
 		 549 aa  387  1e-106  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0692  DNA repair protein RecN  45.36 
 
 		 549 aa  386  1e-106  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0261152  decreased coverage  0.000301908 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2413  DNA repair protein  49.09 
 
 		 553 aa  381  1e-104  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00688711  normal  0.675409 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4484  DNA repair protein RecN  49.91 
 
 		 547 aa  382  1e-104  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0703  DNA repair protein RecN  47.71 
 
 		 546 aa  377  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3099  DNA repair protein RecN  48.21 
 
 		 564 aa  371  1e-101  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.545519  normal  0.794323 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0546  DNA repair protein RecN  50.8 
 
 		 556 aa  366  1e-100  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.419857 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0756  DNA repair protein RecN  47.59 
 
 		 559 aa  343  5.999999999999999e-93  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0775  DNA repair protein RecN  40.47 
 
 		 552 aa  334  3e-90  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000179189 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2735  alkylhydroperoxidase AhpD core  38.43 
 
 		 557 aa  328  1.0000000000000001e-88  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0271976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3364  DNA repair protein RecN  35.71 
 
 		 559 aa  324  2e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.276138  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1480  DNA repair protein RecN  40.28 
 
 		 556 aa  324  3e-87  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.269893  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1763  DNA repair protein RecN  39.18 
 
 		 560 aa  317  4e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137867  normal  0.0495571 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3602  DNA repair protein RecN  38.5 
 
 		 557 aa  312  1e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00779581 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5483  DNA repair protein RecN  36.93 
 
 		 558 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.582199  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0930  ATPase for DNA repair  34.28 
 
 		 555 aa  304  3.0000000000000004e-81  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4197  DNA repair protein RecN  36.33 
 
 		 557 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.312426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0713  DNA repair protein RecN  39.19 
 
 		 549 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.685992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0259  DNA repair protein RecN  39.19 
 
 		 549 aa  303  6.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.255628  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0743  DNA repair protein RecN  39.19 
 
 		 549 aa  303  6.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.259434  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3831  DNA repair protein RecN  39.02 
 
 		 549 aa  302  1e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2316  DNA repair protein RecN  33.33 
 
 		 573 aa  302  1e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4507  DNA repair protein RecN  36.33 
 
 		 557 aa  301  2e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63010  DNA repair protein RecN  36.93 
 
 		 558 aa  300  3e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01130  recombination and repair protein  34.28 
 
 		 554 aa  301  3e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4026  DNA repair protein RecN  34.72 
 
 		 579 aa  300  4e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0028037  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2421  DNA repair protein RecN  35.89 
 
 		 563 aa  300  6e-80  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.955613  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3916  DNA repair protein  34.89 
 
 		 579 aa  298  2e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000027559  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0998  DNA repair protein RecN  38.49 
 
 		 589 aa  298  2e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.553113 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4194  DNA repair protein RecN  34.89 
 
 		 579 aa  298  2e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.9666000000000002e-33 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0903  DNA repair protein RecN  36.56 
 
 		 554 aa  297  3e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4284  DNA repair protein RecN  34.89 
 
 		 579 aa  297  4e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0425411  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4304  DNA repair protein RecN  34.89 
 
 		 579 aa  297  4e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000470862  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0254  DNA repair protein RecN  34.55 
 
 		 573 aa  296  6e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0950  DNA repair protein RecN  34.54 
 
 		 579 aa  296  8e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0157368  hitchhiker  0.0000335441 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0637  DNA repair protein RecN  39.15 
 
 		 549 aa  296  8e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3927  DNA repair protein  34.72 
 
 		 583 aa  296  9e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0317713  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4078  DNA repair protein RecN  34.72 
 
 		 579 aa  295  1e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2641  DNA repair protein RecN  39.65 
 
 		 549 aa  295  1e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4397  DNA repair protein RecN  34.72 
 
 		 579 aa  295  1e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000441756  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4246  DNA repair protein RecN  34.72 
 
 		 583 aa  295  2e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00786878  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0968  DNA repair protein RecN  37.7 
 
 		 567 aa  295  2e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.858596  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1191  DNA repair protein RecN  36.97 
 
 		 559 aa  294  3e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3096  DNA repair protein RecN  37.63 
 
 		 557 aa  294  3e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0661  DNA repair protein RecN  38.98 
 
 		 549 aa  293  4e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0501  DNA repair protein RecN  33.99 
 
 		 552 aa  293  5e-78  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.424659  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004296  DNA repair protein RecN  33.92 
 
 		 554 aa  293  5e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.782069  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42990  DNA repair protein RecN  36.68 
 
 		 557 aa  292  1e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1446  DNA repair protein RecN  32.74 
 
 		 556 aa  292  1e-77  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000211173  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0832  DNA repair protein RecN  36.38 
 
 		 554 aa  292  1e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.013795  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0378  recombination and repair protein  33.92 
 
 		 554 aa  292  1e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.116911  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1385  DNA repair protein  32.74 
 
 		 608 aa  291  2e-77  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0276871  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1714  DNA repair protein RecN  33.85 
 
 		 557 aa  291  2e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4595  DNA repair protein RecN  36.35 
 
 		 557 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.202375 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2888  DNA repair protein RecN  39.83 
 
 		 568 aa  291  3e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2651  DNA repair protein  40.07 
 
 		 569 aa  290  4e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.829393  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2064  DNA repair protein RecN  37.3 
 
 		 558 aa  290  5.0000000000000004e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.488529  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1107  DNA repair protein RecN  39.39 
 
 		 549 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0249547  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3626  DNA repair protein RecN  36.44 
 
 		 558 aa  290  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2333  DNA repair protein RecN  39.39 
 
 		 549 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3329  DNA repair protein RecN  39.86 
 
 		 549 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3319  DNA repair protein RecN  39.39 
 
 		 549 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.303665  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2214  DNA repair protein RecN  39.39 
 
 		 549 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.725261  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3286  DNA repair protein RecN  39.39 
 
 		 549 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0539815  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0492  DNA repair protein RecN  39.39 
 
 		 549 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1774  DNA repair protein RecN  34.81 
 
 		 556 aa  289  7e-77  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4729  DNA repair protein RecN  36.17 
 
 		 557 aa  289  8e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00366375 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>