More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0703 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0703  DNA repair protein RecN  100 
 
 		 546 aa  1055    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2118  DNA repair protein RecN  94.39 
 
 		 546 aa  917    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.513575  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2747  DNA repair protein RecN  67.09 
 
 		 549 aa  659    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0692  DNA repair protein RecN  69.96 
 
 		 549 aa  686    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0261152  decreased coverage  0.000301908 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0793  DNA repair protein RecN  94.21 
 
 		 546 aa  922    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.628008 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4484  DNA repair protein RecN  74.31 
 
 		 547 aa  694    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2413  DNA repair protein  67.72 
 
 		 553 aa  595  1e-169  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00688711  normal  0.675409 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2431  DNA repair protein RecN  52.8 
 
 		 557 aa  450  1e-125  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.320289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3497  DNA repair protein RecN  48.82 
 
 		 553 aa  443  1e-123  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.185224 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2067  DNA repair protein RecN  51.52 
 
 		 565 aa  442  1e-123  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.614381 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0331  DNA repair protein RecN  48.67 
 
 		 565 aa  423  1e-117  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.398153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2879  DNA repair protein RecN  48.35 
 
 		 557 aa  419  1e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1421  DNA repair protein RecN  47.46 
 
 		 559 aa  416  9.999999999999999e-116  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.564129  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2347  DNA repair protein RecN  49.45 
 
 		 557 aa  419  9.999999999999999e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.724371 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2842  DNA repair protein RecN  48.16 
 
 		 557 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.049374  hitchhiker  0.0050611 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1377  DNA repair protein RecN  47.46 
 
 		 559 aa  415  1e-114  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.183083  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2583  DNA repair protein RecN  48.07 
 
 		 557 aa  413  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0083659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6694  DNA repair protein RecN  48.61 
 
 		 557 aa  413  1e-114  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.478556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2071  DNA repair protein RecN  46.61 
 
 		 557 aa  411  1e-113  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.240609  hitchhiker  0.00158855 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3295  DNA repair protein RecN  47.49 
 
 		 561 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1998  DNA repair protein RecN  46.91 
 
 		 558 aa  406  1.0000000000000001e-112  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2007  DNA repair protein RecN  47.5 
 
 		 561 aa  404  1e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.518502 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1289  DNA repair protein RecN  46.86 
 
 		 561 aa  402  1e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1753  DNA repair protein RecN  46.35 
 
 		 554 aa  402  1e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7433  DNA repair protein RecN  48.8 
 
 		 557 aa  392  1e-108  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.146948  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1061  DNA repair protein RecN  46.43 
 
 		 561 aa  394  1e-108  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.73431 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0940  DNA repair protein RecN  50.35 
 
 		 577 aa  395  1e-108  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.693692  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0700  DNA repair protein RecN  48.24 
 
 		 554 aa  393  1e-108  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.415077 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2954  DNA repair protein RecN  47.91 
 
 		 566 aa  395  1e-108  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0217727 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6163  DNA repair protein RecN (recombination protein N)  47.39 
 
 		 557 aa  390  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0430688 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4037  DNA repair protein RecN  47.67 
 
 		 562 aa  392  1e-107  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.531713  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3180  DNA repair protein RecN  47.91 
 
 		 566 aa  390  1e-107  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3137  DNA repair protein RecN  48 
 
 		 565 aa  390  1e-107  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.103261 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4729  DNA repair protein RecN  50.36 
 
 		 553 aa  390  1e-107  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.574204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3383  DNA repair protein RecN  47.14 
 
 		 561 aa  387  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.342411  normal  0.0146677 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3161  DNA repair protein RecN  46.41 
 
 		 570 aa  383  1e-105  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.957491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1736  DNA repair protein RecN  47.04 
 
 		 554 aa  380  1e-104  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0149698  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0938  DNA repair protein RecN  43.63 
 
 		 555 aa  382  1e-104  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000961269  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0756  DNA repair protein RecN  49.2 
 
 		 559 aa  351  2e-95  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3099  DNA repair protein RecN  44.62 
 
 		 564 aa  338  9.999999999999999e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.545519  normal  0.794323 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1480  DNA repair protein RecN  40.61 
 
 		 556 aa  320  3e-86  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.269893  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0546  DNA repair protein RecN  46.76 
 
 		 556 aa  320  5e-86  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.419857 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1763  DNA repair protein RecN  40.68 
 
 		 560 aa  314  2.9999999999999996e-84  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137867  normal  0.0495571 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01182  DNA repair protein RecN  39.03 
 
 		 554 aa  312  1e-83  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.239665  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3364  DNA repair protein RecN  36.59 
 
 		 559 aa  310  5e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.276138  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0942  DNA repair protein RecN  39.15 
 
 		 554 aa  309  1.0000000000000001e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3096  DNA repair protein RecN  38.13 
 
 		 557 aa  305  2.0000000000000002e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1026  recombination and repair protein  37.07 
 
 		 554 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1385  DNA repair protein  33.51 
 
 		 608 aa  303  7.000000000000001e-81  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0276871  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1446  DNA repair protein RecN  33.51 
 
 		 556 aa  303  7.000000000000001e-81  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000211173  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1179  DNA repair and genetic recombination protein  32.67 
 
 		 556 aa  302  1e-80  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1597  DNA repair protein RecN  38.67 
 
 		 553 aa  301  3e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3825  DNA repair protein RecN  32.86 
 
 		 561 aa  299  9e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.321139  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2867  DNA repair protein RecN  33.57 
 
 		 579 aa  298  2e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0501  DNA repair protein RecN  32.85 
 
 		 552 aa  297  3e-79  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.424659  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3462  recombination and repair protein  36.33 
 
 		 552 aa  297  3e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1170  recombination and repair protein  37.21 
 
 		 552 aa  296  5e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0260908 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1104  recombination and repair protein  37.03 
 
 		 552 aa  296  6e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.239344  normal  0.154382 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01130  recombination and repair protein  35.43 
 
 		 554 aa  295  1e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1104  recombination and repair protein  36.33 
 
 		 552 aa  295  1e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.562592 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3916  DNA repair protein  33.74 
 
 		 579 aa  294  2e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000027559  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4304  DNA repair protein RecN  33.57 
 
 		 579 aa  294  2e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000470862  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0950  DNA repair protein RecN  33.57 
 
 		 579 aa  295  2e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0157368  hitchhiker  0.0000335441 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0637  DNA repair protein RecN  40.32 
 
 		 549 aa  294  2e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4026  DNA repair protein RecN  33.63 
 
 		 579 aa  295  2e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0028037  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0930  ATPase for DNA repair  31.47 
 
 		 555 aa  294  3e-78  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4284  DNA repair protein RecN  33.39 
 
 		 579 aa  294  3e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0425411  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2735  alkylhydroperoxidase AhpD core  35.44 
 
 		 557 aa  293  4e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0271976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1707  DNA repair protein RecN  37.52 
 
 		 553 aa  293  5e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2680  DNA repair protein RecN  38.38 
 
 		 554 aa  293  5e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4194  DNA repair protein RecN  33.57 
 
 		 579 aa  293  6e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.9666000000000002e-33 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3927  DNA repair protein  33.39 
 
 		 583 aa  293  7e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0317713  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4078  DNA repair protein RecN  33.39 
 
 		 579 aa  292  8e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3218  recombination and repair protein  34.59 
 
 		 553 aa  293  8e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4397  DNA repair protein RecN  33.39 
 
 		 579 aa  292  8e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000441756  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0661  DNA repair protein RecN  40.14 
 
 		 549 aa  292  9e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1458  DNA repair protein RecN  35.5 
 
 		 557 aa  292  9e-78  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0380589  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4246  DNA repair protein RecN  33.39 
 
 		 583 aa  292  1e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00786878  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3831  DNA repair protein RecN  39.93 
 
 		 549 aa  292  1e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1774  DNA repair protein RecN  37.06 
 
 		 556 aa  291  2e-77  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1191  DNA repair protein RecN  37.03 
 
 		 559 aa  291  2e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1515  recombination protein N  35.42 
 
 		 557 aa  291  2e-77  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5421  DNA repair protein RecN  36.94 
 
 		 591 aa  291  3e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0968  DNA repair protein RecN  37.61 
 
 		 567 aa  290  4e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.858596  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1475  DNA repair protein RecN  35.99 
 
 		 554 aa  290  4e-77  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.460183  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004296  DNA repair protein RecN  34.53 
 
 		 554 aa  290  6e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.782069  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0587  DNA repair and genetic recombination protein  35.55 
 
 		 560 aa  289  9e-77  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0713  DNA repair protein RecN  39.57 
 
 		 549 aa  289  1e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.685992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0259  DNA repair protein RecN  39.57 
 
 		 549 aa  289  1e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.255628  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0743  DNA repair protein RecN  39.57 
 
 		 549 aa  289  1e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.259434  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0378  recombination and repair protein  35.32 
 
 		 554 aa  288  2e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.116911  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2326  DNA repair protein RecN  38.11 
 
 		 560 aa  288  2e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000910227  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2064  DNA repair protein RecN  38.28 
 
 		 558 aa  287  2.9999999999999996e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.488529  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0832  DNA repair protein RecN  36.58 
 
 		 554 aa  287  2.9999999999999996e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.013795  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2475  recombination and repair protein  32.98 
 
 		 565 aa  287  2.9999999999999996e-76  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1169  recombination and repair protein  34.59 
 
 		 553 aa  287  4e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1896  DNA repair protein RecN  33.86 
 
 		 567 aa  287  4e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000247727  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2641  DNA repair protein RecN  39.75 
 
 		 549 aa  286  5e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0775  DNA repair protein RecN  37.32 
 
 		 552 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000179189 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1196  recombination and repair protein  34.89 
 
 		 553 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>