More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0546 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1736  DNA repair protein RecN  68.11 
 
 		 554 aa  644    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0149698  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0546  DNA repair protein RecN  100 
 
 		 556 aa  1058    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.419857 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4729  DNA repair protein RecN  69.37 
 
 		 553 aa  612  9.999999999999999e-175  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.574204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2431  DNA repair protein RecN  56.81 
 
 		 557 aa  466  9.999999999999999e-131  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.320289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1998  DNA repair protein RecN  51.43 
 
 		 558 aa  451  1e-125  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3295  DNA repair protein RecN  51.15 
 
 		 561 aa  443  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2071  DNA repair protein RecN  49 
 
 		 557 aa  436  1e-121  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.240609  hitchhiker  0.00158855 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2347  DNA repair protein RecN  52.64 
 
 		 557 aa  436  1e-121  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.724371 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1061  DNA repair protein RecN  50.35 
 
 		 561 aa  436  1e-121  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.73431 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1289  DNA repair protein RecN  50.53 
 
 		 561 aa  437  1e-121  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6694  DNA repair protein RecN  52.01 
 
 		 557 aa  432  1e-120  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.478556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2007  DNA repair protein RecN  51.77 
 
 		 561 aa  434  1e-120  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.518502 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2879  DNA repair protein RecN  48.45 
 
 		 557 aa  431  1e-119  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6163  DNA repair protein RecN (recombination protein N)  52.23 
 
 		 557 aa  431  1e-119  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0430688 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0331  DNA repair protein RecN  49.3 
 
 		 565 aa  431  1e-119  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.398153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4037  DNA repair protein RecN  51.86 
 
 		 562 aa  431  1e-119  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.531713  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3497  DNA repair protein RecN  49.91 
 
 		 553 aa  423  1e-117  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.185224 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3383  DNA repair protein RecN  51.77 
 
 		 561 aa  422  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.342411  normal  0.0146677 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1377  DNA repair protein RecN  49.27 
 
 		 559 aa  416  9.999999999999999e-116  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.183083  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1421  DNA repair protein RecN  49.27 
 
 		 559 aa  414  1e-114  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.564129  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2583  DNA repair protein RecN  48.19 
 
 		 557 aa  415  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0083659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1753  DNA repair protein RecN  49.18 
 
 		 554 aa  412  1e-114  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2842  DNA repair protein RecN  47.64 
 
 		 557 aa  411  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.049374  hitchhiker  0.0050611 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2067  DNA repair protein RecN  51.75 
 
 		 565 aa  410  1e-113  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.614381 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0940  DNA repair protein RecN  50.53 
 
 		 577 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.693692  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0692  DNA repair protein RecN  47.35 
 
 		 549 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0261152  decreased coverage  0.000301908 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3161  DNA repair protein RecN  49.48 
 
 		 570 aa  404  1e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.957491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4484  DNA repair protein RecN  53.51 
 
 		 547 aa  402  1e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7433  DNA repair protein RecN  52.68 
 
 		 557 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.146948  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0700  DNA repair protein RecN  50.44 
 
 		 554 aa  399  9.999999999999999e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.415077 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2954  DNA repair protein RecN  49.28 
 
 		 566 aa  389  1e-107  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0217727 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0938  DNA repair protein RecN  43.11 
 
 		 555 aa  389  1e-106  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000961269  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2747  DNA repair protein RecN  46.59 
 
 		 549 aa  385  1e-105  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3180  DNA repair protein RecN  48.75 
 
 		 566 aa  384  1e-105  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3137  DNA repair protein RecN  49.37 
 
 		 565 aa  380  1e-104  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.103261 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2118  DNA repair protein RecN  47.61 
 
 		 546 aa  375  1e-103  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.513575  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0793  DNA repair protein RecN  47.43 
 
 		 546 aa  377  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.628008 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3099  DNA repair protein RecN  48.29 
 
 		 564 aa  373  1e-102  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.545519  normal  0.794323 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0703  DNA repair protein RecN  47.24 
 
 		 546 aa  355  1e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2413  DNA repair protein  49.64 
 
 		 553 aa  353  4e-96  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00688711  normal  0.675409 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0756  DNA repair protein RecN  51.69 
 
 		 559 aa  350  3e-95  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3364  DNA repair protein RecN  39.43 
 
 		 559 aa  350  4e-95  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.276138  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0998  DNA repair protein RecN  40.39 
 
 		 589 aa  336  9e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.553113 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5483  DNA repair protein RecN  39.15 
 
 		 558 aa  335  1e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.582199  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63010  DNA repair protein RecN  39.68 
 
 		 558 aa  334  3e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1763  DNA repair protein RecN  38.12 
 
 		 560 aa  332  1e-89  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137867  normal  0.0495571 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1480  DNA repair protein RecN  42.07 
 
 		 556 aa  327  5e-88  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.269893  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4197  DNA repair protein RecN  37.37 
 
 		 557 aa  323  7e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.312426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1774  DNA repair protein RecN  38.17 
 
 		 556 aa  322  8e-87  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1034  DNA repair protein RecN  39.86 
 
 		 576 aa  322  9.999999999999999e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3626  DNA repair protein RecN  38.46 
 
 		 558 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2316  DNA repair protein RecN  33.97 
 
 		 573 aa  322  9.999999999999999e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3096  DNA repair protein RecN  39.68 
 
 		 557 aa  321  1.9999999999999998e-86  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0832  DNA repair protein RecN  39.75 
 
 		 554 aa  320  3e-86  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.013795  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0903  DNA repair protein RecN  39.25 
 
 		 554 aa  320  5e-86  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01182  DNA repair protein RecN  39.5 
 
 		 554 aa  319  7e-86  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.239665  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0713  DNA repair protein RecN  41.76 
 
 		 549 aa  319  9e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.685992  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4507  DNA repair protein RecN  37.37 
 
 		 557 aa  318  1e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1191  DNA repair protein RecN  38.39 
 
 		 559 aa  317  4e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0866  DNA repair protein RecN  36.36 
 
 		 555 aa  317  5e-85  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42990  DNA repair protein RecN  38.57 
 
 		 557 aa  316  7e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2641  DNA repair protein RecN  41.4 
 
 		 549 aa  316  7e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0259  DNA repair protein RecN  41.58 
 
 		 549 aa  316  8e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.255628  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0743  DNA repair protein RecN  41.58 
 
 		 549 aa  316  8e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.259434  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3218  recombination and repair protein  35.59 
 
 		 553 aa  315  9.999999999999999e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1446  DNA repair protein RecN  34.35 
 
 		 556 aa  315  9.999999999999999e-85  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000211173  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1515  recombination protein N  37.61 
 
 		 557 aa  315  9.999999999999999e-85  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3831  DNA repair protein RecN  41.04 
 
 		 549 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1385  DNA repair protein  34.35 
 
 		 608 aa  315  1.9999999999999998e-84  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0276871  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2889  recombination and repair protein  35.66 
 
 		 553 aa  313  3.9999999999999997e-84  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000988342  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0761  DNA repair protein RecN  37.5 
 
 		 557 aa  313  4.999999999999999e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.345087  normal  0.395212 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1458  DNA repair protein RecN  36.98 
 
 		 557 aa  313  6.999999999999999e-84  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0380589  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2976  recombination and repair protein  35.48 
 
 		 553 aa  311  1e-83  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0819489  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1376  recombination and repair protein  35.48 
 
 		 553 aa  311  1e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000000100313  normal  0.0248594 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1169  recombination and repair protein  36.46 
 
 		 553 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0661  DNA repair protein RecN  40.86 
 
 		 549 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0637  DNA repair protein RecN  40.86 
 
 		 549 aa  311  2.9999999999999997e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0254  DNA repair protein RecN  35.14 
 
 		 573 aa  310  4e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1026  recombination and repair protein  37.46 
 
 		 554 aa  310  4e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2333  DNA repair protein RecN  40.47 
 
 		 549 aa  310  5e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3319  DNA repair protein RecN  40.47 
 
 		 549 aa  310  5e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.303665  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3286  DNA repair protein RecN  40.47 
 
 		 549 aa  310  5e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0539815  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2214  DNA repair protein RecN  40.47 
 
 		 549 aa  310  5e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.725261  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0492  DNA repair protein RecN  40.47 
 
 		 549 aa  310  5e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1107  DNA repair protein RecN  40.47 
 
 		 549 aa  310  5e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0249547  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3329  DNA repair protein RecN  40.29 
 
 		 549 aa  309  8e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2888  DNA repair protein RecN  41.21 
 
 		 568 aa  309  9e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2877  DNA repair protein recN  32.86 
 
 		 555 aa  308  1.0000000000000001e-82  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1904  DNA repair protein RecN  40.14 
 
 		 564 aa  308  2.0000000000000002e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5421  DNA repair protein RecN  38.78 
 
 		 591 aa  307  4.0000000000000004e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1151  recombination and repair protein  35.54 
 
 		 554 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.901201  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2829  recombination and repair protein  35.24 
 
 		 553 aa  305  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00407233  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3966  DNA repair protein RecN  33.33 
 
 		 556 aa  305  2.0000000000000002e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.284551 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1475  DNA repair protein RecN  37.34 
 
 		 554 aa  304  2.0000000000000002e-81  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.460183  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2897  recombination and repair protein  35.24 
 
 		 553 aa  304  3.0000000000000004e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1281  recombination and repair protein  34.65 
 
 		 553 aa  304  3.0000000000000004e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000117137 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2899  recombination and repair protein  35.24 
 
 		 553 aa  304  3.0000000000000004e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2879  recombination and repair protein  35.24 
 
 		 553 aa  304  3.0000000000000004e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.158329 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3489  DNA repair protein RecN  40.39 
 
 		 567 aa  303  4.0000000000000003e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000536624 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2739  DNA repair protein recN  33.21 
 
 		 555 aa  303  6.000000000000001e-81  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>