More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2431 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2431  DNA repair protein RecN  100 
 
 		 557 aa  1070    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.320289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3295  DNA repair protein RecN  57.53 
 
 		 561 aa  555  1e-157  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1289  DNA repair protein RecN  56.81 
 
 		 561 aa  550  1e-155  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2347  DNA repair protein RecN  56.99 
 
 		 557 aa  538  1e-151  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.724371 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1061  DNA repair protein RecN  56.09 
 
 		 561 aa  533  1e-150  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.73431 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6163  DNA repair protein RecN (recombination protein N)  57.32 
 
 		 557 aa  533  1e-150  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0430688 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2007  DNA repair protein RecN  56.27 
 
 		 561 aa  533  1e-150  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.518502 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1998  DNA repair protein RecN  55.52 
 
 		 558 aa  532  1e-150  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4037  DNA repair protein RecN  57.25 
 
 		 562 aa  529  1e-149  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.531713  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3497  DNA repair protein RecN  55.04 
 
 		 553 aa  530  1e-149  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.185224 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3383  DNA repair protein RecN  57.53 
 
 		 561 aa  525  1e-148  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.342411  normal  0.0146677 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6694  DNA repair protein RecN  56.7 
 
 		 557 aa  525  1e-147  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.478556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2879  DNA repair protein RecN  53.28 
 
 		 557 aa  519  1e-146  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2071  DNA repair protein RecN  52.67 
 
 		 557 aa  516  1.0000000000000001e-145  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.240609  hitchhiker  0.00158855 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0331  DNA repair protein RecN  53.2 
 
 		 565 aa  517  1.0000000000000001e-145  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.398153  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1421  DNA repair protein RecN  54.33 
 
 		 559 aa  512  1e-144  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.564129  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2583  DNA repair protein RecN  52.48 
 
 		 557 aa  511  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0083659  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2842  DNA repair protein RecN  52.48 
 
 		 557 aa  510  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.049374  hitchhiker  0.0050611 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1753  DNA repair protein RecN  53.78 
 
 		 554 aa  509  1e-143  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1377  DNA repair protein RecN  54.33 
 
 		 559 aa  511  1e-143  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.183083  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7433  DNA repair protein RecN  57.3 
 
 		 557 aa  508  1e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.146948  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2954  DNA repair protein RecN  54.76 
 
 		 566 aa  495  9.999999999999999e-139  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0217727 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0700  DNA repair protein RecN  53.51 
 
 		 554 aa  494  9.999999999999999e-139  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.415077 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3180  DNA repair protein RecN  54.76 
 
 		 566 aa  489  1e-137  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3137  DNA repair protein RecN  53.99 
 
 		 565 aa  484  1e-135  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.103261 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1736  DNA repair protein RecN  54.86 
 
 		 554 aa  480  1e-134  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0149698  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0938  DNA repair protein RecN  48.46 
 
 		 555 aa  476  1e-133  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000961269  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0793  DNA repair protein RecN  53.78 
 
 		 546 aa  474  1e-132  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.628008 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2118  DNA repair protein RecN  53.96 
 
 		 546 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.513575  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0940  DNA repair protein RecN  54.53 
 
 		 577 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.693692  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4729  DNA repair protein RecN  55.4 
 
 		 553 aa  461  9.999999999999999e-129  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.574204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2747  DNA repair protein RecN  52.08 
 
 		 549 aa  456  1e-127  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4484  DNA repair protein RecN  54.07 
 
 		 547 aa  447  1.0000000000000001e-124  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0703  DNA repair protein RecN  52.85 
 
 		 546 aa  444  1e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0692  DNA repair protein RecN  49.82 
 
 		 549 aa  442  9.999999999999999e-123  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0261152  decreased coverage  0.000301908 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2067  DNA repair protein RecN  52.22 
 
 		 565 aa  440  9.999999999999999e-123  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.614381 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3099  DNA repair protein RecN  53.6 
 
 		 564 aa  429  1e-119  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.545519  normal  0.794323 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0546  DNA repair protein RecN  56.19 
 
 		 556 aa  423  1e-117  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.419857 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2413  DNA repair protein  52.02 
 
 		 553 aa  412  1e-113  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00688711  normal  0.675409 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3161  DNA repair protein RecN  48.17 
 
 		 570 aa  409  1.0000000000000001e-112  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.957491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0756  DNA repair protein RecN  48.57 
 
 		 559 aa  364  2e-99  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3364  DNA repair protein RecN  38.28 
 
 		 559 aa  353  2.9999999999999997e-96  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.276138  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0866  DNA repair protein RecN  36.56 
 
 		 555 aa  336  7.999999999999999e-91  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0713  DNA repair protein RecN  40.32 
 
 		 549 aa  334  2e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.685992  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2333  DNA repair protein RecN  40.57 
 
 		 549 aa  331  2e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3329  DNA repair protein RecN  40.57 
 
 		 549 aa  331  2e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1191  DNA repair protein RecN  39.15 
 
 		 559 aa  332  2e-89  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1107  DNA repair protein RecN  40.57 
 
 		 549 aa  331  2e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0249547  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0492  DNA repair protein RecN  40.57 
 
 		 549 aa  331  2e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0259  DNA repair protein RecN  40.14 
 
 		 549 aa  331  2e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.255628  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2214  DNA repair protein RecN  40.57 
 
 		 549 aa  331  2e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.725261  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3286  DNA repair protein RecN  40.57 
 
 		 549 aa  331  2e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0539815  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0743  DNA repair protein RecN  40.14 
 
 		 549 aa  331  2e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.259434  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3319  DNA repair protein RecN  40.57 
 
 		 549 aa  331  2e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.303665  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1026  recombination and repair protein  38.01 
 
 		 554 aa  325  1e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1300  DNA repair protein RecN  40.39 
 
 		 549 aa  325  2e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00383913  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2641  DNA repair protein RecN  40.04 
 
 		 549 aa  323  5e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3831  DNA repair protein RecN  39.96 
 
 		 549 aa  323  5e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42990  DNA repair protein RecN  38.53 
 
 		 557 aa  321  1.9999999999999998e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0637  DNA repair protein RecN  39.68 
 
 		 549 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0661  DNA repair protein RecN  39.68 
 
 		 549 aa  321  3e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3096  DNA repair protein RecN  39.17 
 
 		 557 aa  320  3.9999999999999996e-86  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0998  DNA repair protein RecN  39.57 
 
 		 589 aa  319  7.999999999999999e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.553113 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0775  DNA repair protein RecN  39.93 
 
 		 552 aa  318  2e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000179189 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1904  DNA repair protein RecN  39.55 
 
 		 564 aa  318  2e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01130  recombination and repair protein  35.06 
 
 		 554 aa  315  9.999999999999999e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5483  DNA repair protein RecN  36.77 
 
 		 558 aa  314  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.582199  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1763  DNA repair protein RecN  39.72 
 
 		 560 aa  313  3.9999999999999997e-84  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137867  normal  0.0495571 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0968  DNA repair protein RecN  39.64 
 
 		 567 aa  313  6.999999999999999e-84  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.858596  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3462  recombination and repair protein  35.65 
 
 		 552 aa  312  1e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1480  DNA repair protein RecN  39.93 
 
 		 556 aa  312  1e-83  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.269893  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004296  DNA repair protein RecN  35 
 
 		 554 aa  311  2e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.782069  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2771  recombination and repair protein  34.83 
 
 		 552 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.170925  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1104  recombination and repair protein  35.83 
 
 		 552 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.562592 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01182  DNA repair protein RecN  38.97 
 
 		 554 aa  310  4e-83  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.239665  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1196  recombination and repair protein  35.28 
 
 		 553 aa  310  5.9999999999999995e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1281  recombination and repair protein  35.18 
 
 		 553 aa  309  8e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000117137 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1170  recombination and repair protein  35.83 
 
 		 552 aa  309  8e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0260908 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3153  recombination and repair protein  34.94 
 
 		 552 aa  309  9e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000145597  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3296  recombination and repair protein  34.94 
 
 		 552 aa  309  9e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.182341  decreased coverage  0.000158665 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3151  recombination and repair protein  34.94 
 
 		 552 aa  309  9e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0961248  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1218  recombination and repair protein  34.94 
 
 		 552 aa  309  9e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.187963  normal  0.0934404 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63010  DNA repair protein RecN  37.57 
 
 		 558 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2888  DNA repair protein RecN  40 
 
 		 568 aa  308  2.0000000000000002e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1597  DNA repair protein RecN  38.26 
 
 		 553 aa  308  2.0000000000000002e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4197  DNA repair protein RecN  36.67 
 
 		 557 aa  307  3e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.312426  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2482  DNA repair protein RecN  39.82 
 
 		 568 aa  307  3e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1104  recombination and repair protein  35.65 
 
 		 552 aa  307  3e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.239344  normal  0.154382 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0378  recombination and repair protein  35.4 
 
 		 554 aa  307  4.0000000000000004e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.116911  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2735  alkylhydroperoxidase AhpD core  38.21 
 
 		 557 aa  307  4.0000000000000004e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0271976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1034  DNA repair protein RecN  39.06 
 
 		 576 aa  306  5.0000000000000004e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0456  DNA repair protein RecN  38.85 
 
 		 553 aa  306  6e-82  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3359  recombination and repair protein  35.11 
 
 		 553 aa  306  7e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0341558 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2475  recombination and repair protein  33.15 
 
 		 565 aa  305  1.0000000000000001e-81  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3626  DNA repair protein RecN  37.46 
 
 		 558 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1169  recombination and repair protein  34.93 
 
 		 553 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1774  DNA repair protein RecN  36.01 
 
 		 556 aa  305  2.0000000000000002e-81  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0761  DNA repair protein RecN  37.03 
 
 		 557 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.345087  normal  0.395212 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0814  DNA repair protein RecN  34.39 
 
 		 570 aa  304  3.0000000000000004e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1515  recombination protein N  36.54 
 
 		 557 aa  303  5.000000000000001e-81  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>