More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_2747 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_2118  DNA repair protein RecN  67.78 
 
 		 546 aa  650    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.513575  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2747  DNA repair protein RecN  100 
 
 		 549 aa  1068    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0692  DNA repair protein RecN  66.98 
 
 		 549 aa  661    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0261152  decreased coverage  0.000301908 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0793  DNA repair protein RecN  67.6 
 
 		 546 aa  652    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.628008 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4484  DNA repair protein RecN  68.43 
 
 		 547 aa  660    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0703  DNA repair protein RecN  66.85 
 
 		 546 aa  628  1e-178  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2413  DNA repair protein  66.79 
 
 		 553 aa  600  1e-170  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00688711  normal  0.675409 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3497  DNA repair protein RecN  48.46 
 
 		 553 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.185224 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6694  DNA repair protein RecN  50.28 
 
 		 557 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.478556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2431  DNA repair protein RecN  52.08 
 
 		 557 aa  440  9.999999999999999e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.320289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2347  DNA repair protein RecN  49.45 
 
 		 557 aa  433  1e-120  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.724371 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7433  DNA repair protein RecN  50.65 
 
 		 557 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.146948  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0331  DNA repair protein RecN  45.91 
 
 		 565 aa  408  1.0000000000000001e-112  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.398153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1289  DNA repair protein RecN  44.8 
 
 		 561 aa  402  1e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1998  DNA repair protein RecN  46.28 
 
 		 558 aa  404  1e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2067  DNA repair protein RecN  48.66 
 
 		 565 aa  405  1e-111  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.614381 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4729  DNA repair protein RecN  49.28 
 
 		 553 aa  396  1e-109  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.574204  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1421  DNA repair protein RecN  45.59 
 
 		 559 aa  396  1e-109  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.564129  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1377  DNA repair protein RecN  45.59 
 
 		 559 aa  396  1e-109  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.183083  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2007  DNA repair protein RecN  46.42 
 
 		 561 aa  398  1e-109  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.518502 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2879  DNA repair protein RecN  44.57 
 
 		 557 aa  398  1e-109  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0940  DNA repair protein RecN  49.65 
 
 		 577 aa  394  1e-108  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.693692  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3295  DNA repair protein RecN  44.8 
 
 		 561 aa  394  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1753  DNA repair protein RecN  45.4 
 
 		 554 aa  394  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3161  DNA repair protein RecN  46.15 
 
 		 570 aa  393  1e-108  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.957491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1061  DNA repair protein RecN  44.44 
 
 		 561 aa  389  1e-107  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.73431 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2954  DNA repair protein RecN  47.37 
 
 		 566 aa  389  1e-107  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0217727 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2842  DNA repair protein RecN  44.22 
 
 		 557 aa  389  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.049374  hitchhiker  0.0050611 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4037  DNA repair protein RecN  46.33 
 
 		 562 aa  388  1e-106  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.531713  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2071  DNA repair protein RecN  43.36 
 
 		 557 aa  389  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.240609  hitchhiker  0.00158855 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3180  DNA repair protein RecN  47.37 
 
 		 566 aa  386  1e-106  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2583  DNA repair protein RecN  44.04 
 
 		 557 aa  385  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0083659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6163  DNA repair protein RecN (recombination protein N)  46.03 
 
 		 557 aa  384  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0430688 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1736  DNA repair protein RecN  46.22 
 
 		 554 aa  385  1e-105  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0149698  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3137  DNA repair protein RecN  46.91 
 
 		 565 aa  382  1e-104  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.103261 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3383  DNA repair protein RecN  45.88 
 
 		 561 aa  379  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.342411  normal  0.0146677 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0938  DNA repair protein RecN  41.16 
 
 		 555 aa  375  1e-102  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000961269  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0700  DNA repair protein RecN  44.57 
 
 		 554 aa  367  1e-100  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.415077 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0546  DNA repair protein RecN  46.32 
 
 		 556 aa  331  2e-89  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.419857 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3099  DNA repair protein RecN  44.24 
 
 		 564 aa  323  4e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.545519  normal  0.794323 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1026  recombination and repair protein  36.35 
 
 		 554 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3364  DNA repair protein RecN  35.61 
 
 		 559 aa  310  5.9999999999999995e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.276138  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2735  alkylhydroperoxidase AhpD core  35.97 
 
 		 557 aa  304  2.0000000000000002e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0271976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1763  DNA repair protein RecN  38.13 
 
 		 560 aa  302  8.000000000000001e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137867  normal  0.0495571 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3462  recombination and repair protein  36.27 
 
 		 552 aa  301  1e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004296  DNA repair protein RecN  34 
 
 		 554 aa  300  3e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.782069  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01130  recombination and repair protein  33.82 
 
 		 554 aa  299  9e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1480  DNA repair protein RecN  38.54 
 
 		 556 aa  298  1e-79  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.269893  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0378  recombination and repair protein  34 
 
 		 554 aa  298  2e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.116911  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1104  recombination and repair protein  35.38 
 
 		 552 aa  298  2e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.562592 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1191  DNA repair protein RecN  36.1 
 
 		 559 aa  298  3e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01182  DNA repair protein RecN  38.26 
 
 		 554 aa  297  3e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.239665  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1281  recombination and repair protein  33.58 
 
 		 553 aa  297  3e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000117137 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1170  recombination and repair protein  35.38 
 
 		 552 aa  297  3e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0260908 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1104  recombination and repair protein  35.2 
 
 		 552 aa  296  5e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.239344  normal  0.154382 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2641  DNA repair protein RecN  39.64 
 
 		 549 aa  296  7e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227143  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0713  DNA repair protein RecN  39.1 
 
 		 549 aa  295  1e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.685992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2771  recombination and repair protein  35.37 
 
 		 552 aa  295  1e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.170925  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1385  DNA repair protein  33.51 
 
 		 608 aa  295  1e-78  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0276871  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0259  DNA repair protein RecN  39.1 
 
 		 549 aa  295  1e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.255628  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0743  DNA repair protein RecN  39.1 
 
 		 549 aa  295  1e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.259434  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3359  recombination and repair protein  34.18 
 
 		 553 aa  295  2e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0341558 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1446  DNA repair protein RecN  33.51 
 
 		 556 aa  295  2e-78  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000211173  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3296  recombination and repair protein  35.55 
 
 		 552 aa  294  3e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.182341  decreased coverage  0.000158665 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3151  recombination and repair protein  35.55 
 
 		 552 aa  294  3e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0961248  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1218  recombination and repair protein  35.55 
 
 		 552 aa  294  3e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.187963  normal  0.0934404 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3153  recombination and repair protein  35.55 
 
 		 552 aa  294  3e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000145597  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0903  DNA repair protein RecN  36.17 
 
 		 554 aa  293  4e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0942  DNA repair protein RecN  36.78 
 
 		 554 aa  292  8e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0832  DNA repair protein RecN  35.99 
 
 		 554 aa  293  8e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.013795  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1169  recombination and repair protein  33.39 
 
 		 553 aa  291  1e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3831  DNA repair protein RecN  37.14 
 
 		 549 aa  291  2e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1515  recombination protein N  36.25 
 
 		 557 aa  291  3e-77  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1774  DNA repair protein RecN  35.79 
 
 		 556 aa  290  4e-77  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0661  DNA repair protein RecN  38.56 
 
 		 549 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2064  DNA repair protein RecN  36.52 
 
 		 558 aa  288  1e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.488529  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0968  DNA repair protein RecN  36.49 
 
 		 567 aa  289  1e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.858596  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0637  DNA repair protein RecN  38.38 
 
 		 549 aa  288  1e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1196  recombination and repair protein  34.1 
 
 		 553 aa  288  2e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0775  DNA repair protein RecN  35.73 
 
 		 552 aa  288  2e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000179189 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1904  DNA repair protein RecN  38.26 
 
 		 564 aa  288  2e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1151  recombination and repair protein  33.39 
 
 		 554 aa  286  5.999999999999999e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.901201  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2475  recombination and repair protein  32.29 
 
 		 565 aa  286  7e-76  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3298  recombination and repair protein  33.51 
 
 		 553 aa  286  7e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.121559  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1043  recombination and repair protein  34.59 
 
 		 552 aa  286  7e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0492  DNA repair protein RecN  37.86 
 
 		 549 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2214  DNA repair protein RecN  37.86 
 
 		 549 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.725261  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2333  DNA repair protein RecN  37.86 
 
 		 549 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1773  DNA repair protein RecN  37.07 
 
 		 553 aa  285  2.0000000000000002e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000824865 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3286  DNA repair protein RecN  37.86 
 
 		 549 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0539815  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1107  DNA repair protein RecN  37.86 
 
 		 549 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0249547  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3096  DNA repair protein RecN  35.14 
 
 		 557 aa  285  2.0000000000000002e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3319  DNA repair protein RecN  37.86 
 
 		 549 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.303665  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0998  DNA repair protein RecN  36.95 
 
 		 589 aa  284  3.0000000000000004e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.553113 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2888  DNA repair protein RecN  38.81 
 
 		 568 aa  284  4.0000000000000003e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3329  DNA repair protein RecN  37.68 
 
 		 549 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1458  DNA repair protein RecN  35.36 
 
 		 557 aa  282  1e-74  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0380589  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1300  DNA repair protein RecN  37.75 
 
 		 549 aa  281  3e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00383913  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3218  recombination and repair protein  32.25 
 
 		 553 aa  281  3e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5421  DNA repair protein RecN  36.12 
 
 		 591 aa  281  3e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>