More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1736 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_1736  DNA repair protein RecN  100 
 
 
554 aa  1056    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0149698  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4729  DNA repair protein RecN  65.34 
 
 
553 aa  568  1e-161  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.574204  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0546  DNA repair protein RecN  68.11 
 
 
556 aa  551  1e-156  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.419857 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2431  DNA repair protein RecN  55.04 
 
 
557 aa  456  1e-127  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.320289  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1289  DNA repair protein RecN  50.71 
 
 
561 aa  439  9.999999999999999e-123  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1061  DNA repair protein RecN  50.18 
 
 
561 aa  435  1e-121  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.73431 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6163  DNA repair protein RecN (recombination protein N)  51.88 
 
 
557 aa  435  1e-121  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0430688 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3295  DNA repair protein RecN  50.62 
 
 
561 aa  437  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3497  DNA repair protein RecN  48.84 
 
 
553 aa  434  1e-120  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.185224 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1998  DNA repair protein RecN  49.1 
 
 
558 aa  432  1e-120  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4037  DNA repair protein RecN  51.42 
 
 
562 aa  429  1e-119  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.531713  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2879  DNA repair protein RecN  47.81 
 
 
557 aa  427  1e-118  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2007  DNA repair protein RecN  50.27 
 
 
561 aa  422  1e-117  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.518502 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2347  DNA repair protein RecN  50.27 
 
 
557 aa  419  1e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.724371 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0331  DNA repair protein RecN  48.95 
 
 
565 aa  420  1e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.398153  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3383  DNA repair protein RecN  50.8 
 
 
561 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.342411  normal  0.0146677 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2071  DNA repair protein RecN  47.08 
 
 
557 aa  418  9.999999999999999e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.240609  hitchhiker  0.00158855 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2842  DNA repair protein RecN  46.91 
 
 
557 aa  409  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.049374  hitchhiker  0.0050611 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2583  DNA repair protein RecN  46.91 
 
 
557 aa  410  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0083659  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0940  DNA repair protein RecN  50.26 
 
 
577 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.693692  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0938  DNA repair protein RecN  44.8 
 
 
555 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000961269  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3161  DNA repair protein RecN  48.34 
 
 
570 aa  404  1e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.957491  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2067  DNA repair protein RecN  50.53 
 
 
565 aa  403  1e-111  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.614381 
 
 
-
 
NC_004310  BR1421  DNA repair protein RecN  47.79 
 
 
559 aa  400  9.999999999999999e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.564129  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1377  DNA repair protein RecN  47.79 
 
 
559 aa  401  9.999999999999999e-111  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.183083  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0700  DNA repair protein RecN  48.48 
 
 
554 aa  399  1e-109  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.415077 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1753  DNA repair protein RecN  47.61 
 
 
554 aa  397  1e-109  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6694  DNA repair protein RecN  48.99 
 
 
557 aa  394  1e-108  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.478556  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7433  DNA repair protein RecN  50.45 
 
 
557 aa  388  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.146948  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2954  DNA repair protein RecN  47.84 
 
 
566 aa  381  1e-104  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0217727 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0692  DNA repair protein RecN  46.9 
 
 
549 aa  380  1e-104  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0261152  decreased coverage  0.000301908 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3180  DNA repair protein RecN  47.84 
 
 
566 aa  376  1e-103  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0793  DNA repair protein RecN  48.25 
 
 
546 aa  376  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.628008 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2747  DNA repair protein RecN  46.22 
 
 
549 aa  377  1e-103  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3137  DNA repair protein RecN  47.3 
 
 
565 aa  373  1e-102  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.103261 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2118  DNA repair protein RecN  48.25 
 
 
546 aa  371  1e-101  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.513575  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4484  DNA repair protein RecN  50.54 
 
 
547 aa  369  1e-100  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3099  DNA repair protein RecN  47.48 
 
 
564 aa  363  4e-99  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.545519  normal  0.794323 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0703  DNA repair protein RecN  47.16 
 
 
546 aa  351  2e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0756  DNA repair protein RecN  47.54 
 
 
559 aa  332  8e-90  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2316  DNA repair protein RecN  34.74 
 
 
573 aa  328  2.0000000000000001e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3364  DNA repair protein RecN  36.62 
 
 
559 aa  323  7e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.276138  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2413  DNA repair protein  46.32 
 
 
553 aa  322  9.999999999999999e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00688711  normal  0.675409 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5483  DNA repair protein RecN  38.62 
 
 
558 aa  318  1e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.582199  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0713  DNA repair protein RecN  41.29 
 
 
549 aa  317  3e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.685992  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0661  DNA repair protein RecN  41.29 
 
 
549 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0259  DNA repair protein RecN  41.11 
 
 
549 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.255628  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0637  DNA repair protein RecN  41.29 
 
 
549 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0743  DNA repair protein RecN  41.11 
 
 
549 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.259434  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0950  DNA repair protein RecN  34.27 
 
 
579 aa  315  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0157368  hitchhiker  0.0000335441 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3831  DNA repair protein RecN  40.86 
 
 
549 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4304  DNA repair protein RecN  34.49 
 
 
579 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000470862  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63010  DNA repair protein RecN  38.45 
 
 
558 aa  313  5.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0930  ATPase for DNA repair  34.4 
 
 
555 aa  313  5.999999999999999e-84  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3916  DNA repair protein  34.49 
 
 
579 aa  311  1e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000027559  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4284  DNA repair protein RecN  33.74 
 
 
579 aa  312  1e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0425411  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4246  DNA repair protein RecN  34.15 
 
 
583 aa  310  4e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00786878  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4194  DNA repair protein RecN  34.32 
 
 
579 aa  310  5.9999999999999995e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.9666000000000002e-33 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3927  DNA repair protein  34.15 
 
 
583 aa  310  5.9999999999999995e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0317713  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4078  DNA repair protein RecN  34.15 
 
 
579 aa  309  1.0000000000000001e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4397  DNA repair protein RecN  34.15 
 
 
579 aa  309  1.0000000000000001e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000441756  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1480  DNA repair protein RecN  39.5 
 
 
556 aa  308  1.0000000000000001e-82  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.269893  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2641  DNA repair protein RecN  40.75 
 
 
549 aa  309  1.0000000000000001e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227143  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1763  DNA repair protein RecN  38.32 
 
 
560 aa  309  1.0000000000000001e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137867  normal  0.0495571 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1026  recombination and repair protein  36.45 
 
 
554 aa  307  3e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4026  DNA repair protein RecN  33.98 
 
 
579 aa  306  5.0000000000000004e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0028037  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1904  DNA repair protein RecN  38.94 
 
 
564 aa  306  5.0000000000000004e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4197  DNA repair protein RecN  37.03 
 
 
557 aa  306  7e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.312426  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2976  recombination and repair protein  36.02 
 
 
553 aa  306  7e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0819489  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1376  recombination and repair protein  36.02 
 
 
553 aa  306  7e-82  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000000100313  normal  0.0248594 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3626  DNA repair protein RecN  37.79 
 
 
558 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1446  DNA repair protein RecN  35.01 
 
 
556 aa  305  2.0000000000000002e-81  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000211173  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1385  DNA repair protein  35.01 
 
 
608 aa  305  2.0000000000000002e-81  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0276871  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2889  recombination and repair protein  35.84 
 
 
553 aa  304  3.0000000000000004e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000988342  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1107  DNA repair protein RecN  40 
 
 
549 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0249547  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2333  DNA repair protein RecN  40 
 
 
549 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0492  DNA repair protein RecN  40 
 
 
549 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3319  DNA repair protein RecN  40 
 
 
549 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.303665  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2214  DNA repair protein RecN  40 
 
 
549 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.725261  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3286  DNA repair protein RecN  40 
 
 
549 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0539815  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4507  DNA repair protein RecN  37.03 
 
 
557 aa  303  5.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3329  DNA repair protein RecN  40 
 
 
549 aa  302  1e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1774  DNA repair protein RecN  36.64 
 
 
556 aa  301  2e-80  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0761  DNA repair protein RecN  38.9 
 
 
557 aa  301  3e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.345087  normal  0.395212 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2505  DNA repair protein RecN  40.54 
 
 
555 aa  300  3e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0254  DNA repair protein RecN  33.86 
 
 
573 aa  300  3e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42990  DNA repair protein RecN  38.79 
 
 
557 aa  300  3e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01130  recombination and repair protein  33.33 
 
 
554 aa  299  7e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2064  DNA repair protein RecN  38.28 
 
 
558 aa  299  1e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.488529  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004296  DNA repair protein RecN  33.69 
 
 
554 aa  298  1e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.782069  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3218  recombination and repair protein  34.05 
 
 
553 aa  298  1e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2867  DNA repair protein RecN  34.15 
 
 
579 aa  298  2e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0866  DNA repair protein RecN  34.82 
 
 
555 aa  297  4e-79  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0914  DNA repair protein RecN  32.74 
 
 
558 aa  296  6e-79  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.473015  normal  0.408005 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0998  DNA repair protein RecN  37.8 
 
 
589 aa  296  7e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.553113 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0775  DNA repair protein RecN  37.28 
 
 
552 aa  295  1e-78  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000179189 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1170  recombination and repair protein  34.47 
 
 
552 aa  295  1e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0260908 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0968  DNA repair protein RecN  37.9 
 
 
567 aa  295  2e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.858596  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1281  recombination and repair protein  33.69 
 
 
553 aa  294  3e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000117137 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1104  recombination and repair protein  34.29 
 
 
552 aa  293  4e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.239344  normal  0.154382 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>