More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6163 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_1061  DNA repair protein RecN  79.64 
 
 
561 aa  825    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.73431 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6694  DNA repair protein RecN  65.99 
 
 
557 aa  652    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.478556  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0331  DNA repair protein RecN  63.48 
 
 
565 aa  652    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.398153  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2007  DNA repair protein RecN  83.57 
 
 
561 aa  868    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.518502 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3295  DNA repair protein RecN  83.39 
 
 
561 aa  884    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6163  DNA repair protein RecN (recombination protein N)  100 
 
 
557 aa  1080    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0430688 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3383  DNA repair protein RecN  84.29 
 
 
561 aa  851    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.342411  normal  0.0146677 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1289  DNA repair protein RecN  81.79 
 
 
561 aa  873    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2347  DNA repair protein RecN  65.56 
 
 
557 aa  658    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.724371 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4037  DNA repair protein RecN  83.42 
 
 
562 aa  863    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.531713  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3497  DNA repair protein RecN  60.5 
 
 
553 aa  625  1e-178  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.185224 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2842  DNA repair protein RecN  60.66 
 
 
557 aa  622  1e-177  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.049374  hitchhiker  0.0050611 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2583  DNA repair protein RecN  60.48 
 
 
557 aa  620  1e-176  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0083659  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7433  DNA repair protein RecN  65.35 
 
 
557 aa  618  1e-176  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.146948  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1753  DNA repair protein RecN  62.11 
 
 
554 aa  616  1e-175  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1377  DNA repair protein RecN  61.55 
 
 
559 aa  612  9.999999999999999e-175  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.183083  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2879  DNA repair protein RecN  60.11 
 
 
557 aa  613  9.999999999999999e-175  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2071  DNA repair protein RecN  59.04 
 
 
557 aa  610  1e-173  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.240609  hitchhiker  0.00158855 
 
 
-
 
NC_004310  BR1421  DNA repair protein RecN  61.37 
 
 
559 aa  610  1e-173  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.564129  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0700  DNA repair protein RecN  62.23 
 
 
554 aa  610  1e-173  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.415077 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1998  DNA repair protein RecN  61.58 
 
 
558 aa  603  1.0000000000000001e-171  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2954  DNA repair protein RecN  61.12 
 
 
566 aa  589  1e-167  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0217727 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0938  DNA repair protein RecN  56.52 
 
 
555 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000961269  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3180  DNA repair protein RecN  61.12 
 
 
566 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3137  DNA repair protein RecN  60.98 
 
 
565 aa  579  1e-164  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.103261 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2431  DNA repair protein RecN  57.32 
 
 
557 aa  523  1e-147  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.320289  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1736  DNA repair protein RecN  51.88 
 
 
554 aa  439  9.999999999999999e-123  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0149698  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4729  DNA repair protein RecN  52.87 
 
 
553 aa  436  1e-121  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.574204  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3161  DNA repair protein RecN  48.26 
 
 
570 aa  426  1e-118  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.957491  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0793  DNA repair protein RecN  48.24 
 
 
546 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.628008 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2118  DNA repair protein RecN  48.24 
 
 
546 aa  404  1e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.513575  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0940  DNA repair protein RecN  48.66 
 
 
577 aa  405  1e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.693692  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4484  DNA repair protein RecN  50.63 
 
 
547 aa  399  9.999999999999999e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2747  DNA repair protein RecN  46.03 
 
 
549 aa  390  1e-107  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0692  DNA repair protein RecN  45.49 
 
 
549 aa  391  1e-107  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0261152  decreased coverage  0.000301908 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0703  DNA repair protein RecN  47.32 
 
 
546 aa  384  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2067  DNA repair protein RecN  46.71 
 
 
565 aa  377  1e-103  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.614381 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2413  DNA repair protein  48.43 
 
 
553 aa  377  1e-103  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00688711  normal  0.675409 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0546  DNA repair protein RecN  50.8 
 
 
556 aa  375  1e-102  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.419857 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3099  DNA repair protein RecN  48.11 
 
 
564 aa  365  1e-99  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.545519  normal  0.794323 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3364  DNA repair protein RecN  36.64 
 
 
559 aa  335  9e-91  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.276138  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0775  DNA repair protein RecN  38.8 
 
 
552 aa  330  3e-89  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000179189 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1480  DNA repair protein RecN  40.92 
 
 
556 aa  328  2.0000000000000001e-88  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.269893  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2316  DNA repair protein RecN  33.91 
 
 
573 aa  322  8e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0259  DNA repair protein RecN  41.08 
 
 
549 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.255628  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0713  DNA repair protein RecN  41.08 
 
 
549 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.685992  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0743  DNA repair protein RecN  41.08 
 
 
549 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.259434  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0254  DNA repair protein RecN  36.51 
 
 
573 aa  318  1e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3831  DNA repair protein RecN  40.72 
 
 
549 aa  319  1e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1763  DNA repair protein RecN  39.25 
 
 
560 aa  318  2e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137867  normal  0.0495571 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0661  DNA repair protein RecN  40.72 
 
 
549 aa  317  4e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0637  DNA repair protein RecN  40.72 
 
 
549 aa  316  6e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2735  alkylhydroperoxidase AhpD core  37.7 
 
 
557 aa  316  7e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0271976  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4026  DNA repair protein RecN  34.55 
 
 
579 aa  314  2.9999999999999996e-84  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0028037  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4284  DNA repair protein RecN  35.16 
 
 
579 aa  313  4.999999999999999e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0425411  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3916  DNA repair protein  35.16 
 
 
579 aa  312  7.999999999999999e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000027559  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2641  DNA repair protein RecN  40.54 
 
 
549 aa  312  9e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227143  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4197  DNA repair protein RecN  37.52 
 
 
557 aa  311  2e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.312426  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4194  DNA repair protein RecN  34.99 
 
 
579 aa  311  2e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.9666000000000002e-33 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0950  DNA repair protein RecN  34.99 
 
 
579 aa  311  2e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0157368  hitchhiker  0.0000335441 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4304  DNA repair protein RecN  34.99 
 
 
579 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000470862  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1774  DNA repair protein RecN  35.6 
 
 
556 aa  310  4e-83  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3927  DNA repair protein  34.82 
 
 
583 aa  310  5e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0317713  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4246  DNA repair protein RecN  34.82 
 
 
583 aa  310  5.9999999999999995e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00786878  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4078  DNA repair protein RecN  34.82 
 
 
579 aa  309  8e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4397  DNA repair protein RecN  34.82 
 
 
579 aa  309  8e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000441756  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0998  DNA repair protein RecN  38.29 
 
 
589 aa  309  9e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.553113 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1191  DNA repair protein RecN  38.28 
 
 
559 aa  308  2.0000000000000002e-82  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4507  DNA repair protein RecN  37.25 
 
 
557 aa  306  6e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2867  DNA repair protein RecN  35.18 
 
 
579 aa  306  7e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2333  DNA repair protein RecN  40.72 
 
 
549 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0492  DNA repair protein RecN  40.72 
 
 
549 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1107  DNA repair protein RecN  40.72 
 
 
549 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0249547  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2214  DNA repair protein RecN  40.72 
 
 
549 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.725261  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3286  DNA repair protein RecN  40.72 
 
 
549 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0539815  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3319  DNA repair protein RecN  40.72 
 
 
549 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.303665  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5483  DNA repair protein RecN  36.99 
 
 
558 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.582199  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3329  DNA repair protein RecN  40.54 
 
 
549 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2064  DNA repair protein RecN  36.4 
 
 
558 aa  303  6.000000000000001e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.488529  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3602  DNA repair protein RecN  37.35 
 
 
557 aa  301  3e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00779581 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1281  recombination and repair protein  33.63 
 
 
553 aa  300  4e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000117137 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1300  DNA repair protein RecN  40.54 
 
 
549 aa  300  5e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00383913  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1178  DNA repair protein RecN  34.4 
 
 
559 aa  300  6e-80  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000946399  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0968  DNA repair protein RecN  37.99 
 
 
567 aa  299  1e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.858596  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42990  DNA repair protein RecN  37.01 
 
 
557 aa  298  1e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1034  DNA repair protein RecN  38.26 
 
 
576 aa  298  2e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3626  DNA repair protein RecN  37.63 
 
 
558 aa  297  4e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5421  DNA repair protein RecN  36.98 
 
 
591 aa  296  6e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1904  DNA repair protein RecN  38.45 
 
 
564 aa  296  6e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63010  DNA repair protein RecN  36.81 
 
 
558 aa  296  6e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0942  DNA repair protein RecN  36.74 
 
 
554 aa  295  2e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01130  recombination and repair protein  33.57 
 
 
554 aa  294  3e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3359  recombination and repair protein  34.62 
 
 
553 aa  294  3e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0341558 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1026  recombination and repair protein  34.81 
 
 
554 aa  294  3e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0501  DNA repair protein RecN  34.29 
 
 
552 aa  293  6e-78  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.424659  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3462  recombination and repair protein  33.99 
 
 
552 aa  292  1e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2877  DNA repair protein recN  31.66 
 
 
555 aa  291  2e-77  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4595  DNA repair protein RecN  36.41 
 
 
557 aa  291  3e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.202375 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0761  DNA repair protein RecN  36.48 
 
 
557 aa  290  4e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.345087  normal  0.395212 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3096  DNA repair protein RecN  37.21 
 
 
557 aa  290  4e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>