More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3137 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_3180  DNA repair protein RecN  96.38 
 
 		 566 aa  937    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3497  DNA repair protein RecN  61.88 
 
 		 553 aa  641    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.185224 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2954  DNA repair protein RecN  96.2 
 
 		 566 aa  958    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0217727 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7433  DNA repair protein RecN  79.26 
 
 		 557 aa  743    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.146948  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2347  DNA repair protein RecN  77.84 
 
 		 557 aa  796    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.724371 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6694  DNA repair protein RecN  77.23 
 
 		 557 aa  776    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.478556  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3137  DNA repair protein RecN  100 
 
 		 565 aa  1086    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.103261 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0331  DNA repair protein RecN  61.35 
 
 		 565 aa  625  1e-178  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.398153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3295  DNA repair protein RecN  60.39 
 
 		 561 aa  622  1e-177  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1289  DNA repair protein RecN  60.39 
 
 		 561 aa  619  1e-176  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4037  DNA repair protein RecN  61.34 
 
 		 562 aa  612  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.531713  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2583  DNA repair protein RecN  59.71 
 
 		 557 aa  607  9.999999999999999e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0083659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1061  DNA repair protein RecN  60.21 
 
 		 561 aa  602  1.0000000000000001e-171  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.73431 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2842  DNA repair protein RecN  59.35 
 
 		 557 aa  604  1.0000000000000001e-171  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.049374  hitchhiker  0.0050611 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6163  DNA repair protein RecN (recombination protein N)  61.28 
 
 		 557 aa  602  1.0000000000000001e-171  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0430688 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2007  DNA repair protein RecN  60.39 
 
 		 561 aa  600  1e-170  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.518502 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2879  DNA repair protein RecN  57.53 
 
 		 557 aa  590  1e-167  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2071  DNA repair protein RecN  58.11 
 
 		 557 aa  587  1e-166  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.240609  hitchhiker  0.00158855 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0700  DNA repair protein RecN  61.46 
 
 		 554 aa  584  1.0000000000000001e-165  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.415077 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3383  DNA repair protein RecN  59.68 
 
 		 561 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.342411  normal  0.0146677 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1998  DNA repair protein RecN  59 
 
 		 558 aa  585  1.0000000000000001e-165  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1421  DNA repair protein RecN  58 
 
 		 559 aa  575  1.0000000000000001e-163  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.564129  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1377  DNA repair protein RecN  58 
 
 		 559 aa  575  1.0000000000000001e-162  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.183083  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1753  DNA repair protein RecN  58 
 
 		 554 aa  572  1.0000000000000001e-162  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0938  DNA repair protein RecN  52.49 
 
 		 555 aa  543  1e-153  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000961269  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2431  DNA repair protein RecN  54.37 
 
 		 557 aa  493  9.999999999999999e-139  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.320289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4729  DNA repair protein RecN  51.41 
 
 		 553 aa  412  1e-113  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.574204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0793  DNA repair protein RecN  48.36 
 
 		 546 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.628008 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0692  DNA repair protein RecN  46.84 
 
 		 549 aa  408  1.0000000000000001e-112  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0261152  decreased coverage  0.000301908 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2118  DNA repair protein RecN  48.55 
 
 		 546 aa  405  1e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.513575  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0940  DNA repair protein RecN  48.77 
 
 		 577 aa  405  1e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.693692  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2747  DNA repair protein RecN  47.15 
 
 		 549 aa  403  1e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1736  DNA repair protein RecN  48.32 
 
 		 554 aa  399  1e-109  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0149698  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3161  DNA repair protein RecN  45.09 
 
 		 570 aa  394  1e-108  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.957491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0703  DNA repair protein RecN  48 
 
 		 546 aa  393  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4484  DNA repair protein RecN  48.66 
 
 		 547 aa  389  1e-106  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2413  DNA repair protein  50.36 
 
 		 553 aa  376  1e-103  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00688711  normal  0.675409 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2067  DNA repair protein RecN  46.23 
 
 		 565 aa  371  1e-101  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.614381 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0756  DNA repair protein RecN  46.48 
 
 		 559 aa  350  4e-95  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0546  DNA repair protein RecN  49.12 
 
 		 556 aa  345  8.999999999999999e-94  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.419857 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3099  DNA repair protein RecN  45.25 
 
 		 564 aa  342  1e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.545519  normal  0.794323 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3364  DNA repair protein RecN  36.83 
 
 		 559 aa  330  6e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.276138  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1763  DNA repair protein RecN  38.58 
 
 		 560 aa  328  1.0000000000000001e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137867  normal  0.0495571 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0775  DNA repair protein RecN  37.74 
 
 		 552 aa  326  9e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000179189 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5483  DNA repair protein RecN  36.09 
 
 		 558 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.582199  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1026  recombination and repair protein  35.61 
 
 		 554 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01182  DNA repair protein RecN  37.61 
 
 		 554 aa  314  2.9999999999999996e-84  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.239665  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0998  DNA repair protein RecN  39.58 
 
 		 589 aa  313  3.9999999999999997e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.553113 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1446  DNA repair protein RecN  32.75 
 
 		 556 aa  310  5.9999999999999995e-83  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000211173  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1385  DNA repair protein  32.75 
 
 		 608 aa  309  6.999999999999999e-83  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0276871  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2877  DNA repair protein recN  32.75 
 
 		 555 aa  308  1.0000000000000001e-82  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2739  DNA repair protein recN  32.75 
 
 		 555 aa  307  4.0000000000000004e-82  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1774  DNA repair protein RecN  35.96 
 
 		 556 aa  306  5.0000000000000004e-82  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1191  DNA repair protein RecN  35.11 
 
 		 559 aa  306  7e-82  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63010  DNA repair protein RecN  35.92 
 
 		 558 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1515  recombination protein N  35.36 
 
 		 557 aa  301  2e-80  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2771  recombination and repair protein  33.51 
 
 		 552 aa  301  2e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.170925  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3462  recombination and repair protein  33.69 
 
 		 552 aa  301  2e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3626  DNA repair protein RecN  35.45 
 
 		 558 aa  300  5e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42990  DNA repair protein RecN  35.63 
 
 		 557 aa  300  6e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3359  recombination and repair protein  33.63 
 
 		 553 aa  299  8e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0341558 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1170  recombination and repair protein  33.69 
 
 		 552 aa  298  1e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0260908 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1104  recombination and repair protein  33.51 
 
 		 552 aa  297  3e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.239344  normal  0.154382 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1104  recombination and repair protein  33.51 
 
 		 552 aa  297  4e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.562592 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1904  DNA repair protein RecN  36.93 
 
 		 564 aa  296  5e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1034  DNA repair protein RecN  39.39 
 
 		 576 aa  296  7e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3153  recombination and repair protein  32.98 
 
 		 552 aa  295  1e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000145597  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3296  recombination and repair protein  32.98 
 
 		 552 aa  295  1e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.182341  decreased coverage  0.000158665 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3151  recombination and repair protein  32.98 
 
 		 552 aa  295  1e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0961248  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1218  recombination and repair protein  32.98 
 
 		 552 aa  295  1e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.187963  normal  0.0934404 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3096  DNA repair protein RecN  36.81 
 
 		 557 aa  295  2e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1458  DNA repair protein RecN  36.17 
 
 		 557 aa  295  2e-78  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0380589  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1196  recombination and repair protein  33.45 
 
 		 553 aa  294  3e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1151  recombination and repair protein  33.63 
 
 		 554 aa  293  5e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.901201  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1480  DNA repair protein RecN  36.88 
 
 		 556 aa  292  9e-78  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.269893  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1043  recombination and repair protein  32.46 
 
 		 552 aa  292  9e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1169  recombination and repair protein  33.63 
 
 		 553 aa  292  9e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4507  DNA repair protein RecN  33.1 
 
 		 557 aa  292  1e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0761  DNA repair protein RecN  33.92 
 
 		 557 aa  292  1e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.345087  normal  0.395212 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0866  DNA repair protein RecN  32.46 
 
 		 555 aa  292  1e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0930  ATPase for DNA repair  32.58 
 
 		 555 aa  292  1e-77  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1281  recombination and repair protein  33.16 
 
 		 553 aa  291  2e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000117137 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4197  DNA repair protein RecN  32.75 
 
 		 557 aa  291  3e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.312426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2680  DNA repair protein RecN  36.91 
 
 		 554 aa  291  3e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1896  DNA repair protein RecN  32.64 
 
 		 567 aa  290  6e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000247727  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4026  DNA repair protein RecN  32.44 
 
 		 579 aa  290  6e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0028037  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2316  DNA repair protein RecN  31.26 
 
 		 573 aa  288  1e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2069  DNA repair protein RecN  29.97 
 
 		 565 aa  289  1e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0594  DNA repair protein RecN  33.96 
 
 		 569 aa  288  2e-76  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0859323 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1714  DNA repair protein RecN  33.22 
 
 		 557 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0968  DNA repair protein RecN  36.79 
 
 		 567 aa  287  4e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.858596  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2735  alkylhydroperoxidase AhpD core  34.04 
 
 		 557 aa  287  4e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0271976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1783  DNA repair protein RecN  29.62 
 
 		 565 aa  287  4e-76  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2888  DNA repair protein RecN  38.66 
 
 		 568 aa  286  5.999999999999999e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4730  DNA repair protein RecN  34.28 
 
 		 557 aa  286  7e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.46357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1666  DNA repair protein RecN  34.53 
 
 		 577 aa  286  8e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1612  DNA repair protein RecN  35.75 
 
 		 573 aa  286  9e-76  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.458504 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2475  recombination and repair protein  31.06 
 
 		 565 aa  285  1.0000000000000001e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3916  DNA repair protein  32.02 
 
 		 579 aa  284  3.0000000000000004e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000027559  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2482  DNA repair protein RecN  38.38 
 
 		 568 aa  284  3.0000000000000004e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>