More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3099 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_3099  DNA repair protein RecN  100 
 
 		 564 aa  1071    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.545519  normal  0.794323 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2067  DNA repair protein RecN  52.9 
 
 		 565 aa  452  1.0000000000000001e-126  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.614381 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2431  DNA repair protein RecN  53.6 
 
 		 557 aa  436  1e-121  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.320289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4729  DNA repair protein RecN  54.35 
 
 		 553 aa  427  1e-118  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.574204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1998  DNA repair protein RecN  48.15 
 
 		 558 aa  412  1e-114  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4037  DNA repair protein RecN  48.51 
 
 		 562 aa  402  1e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.531713  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2007  DNA repair protein RecN  47.55 
 
 		 561 aa  405  1e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.518502 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3295  DNA repair protein RecN  48.69 
 
 		 561 aa  404  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0331  DNA repair protein RecN  47.5 
 
 		 565 aa  398  1e-109  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.398153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2583  DNA repair protein RecN  46.25 
 
 		 557 aa  392  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0083659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1753  DNA repair protein RecN  46.5 
 
 		 554 aa  393  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1736  DNA repair protein RecN  49.21 
 
 		 554 aa  395  1e-108  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0149698  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1421  DNA repair protein RecN  46.5 
 
 		 559 aa  390  1e-107  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.564129  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2842  DNA repair protein RecN  46.02 
 
 		 557 aa  389  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.049374  hitchhiker  0.0050611 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1061  DNA repair protein RecN  48.16 
 
 		 561 aa  391  1e-107  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.73431 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1377  DNA repair protein RecN  46.5 
 
 		 559 aa  390  1e-107  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.183083  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1289  DNA repair protein RecN  47.29 
 
 		 561 aa  388  1e-106  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2879  DNA repair protein RecN  44.9 
 
 		 557 aa  384  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2071  DNA repair protein RecN  43.75 
 
 		 557 aa  384  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.240609  hitchhiker  0.00158855 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3383  DNA repair protein RecN  47.03 
 
 		 561 aa  382  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.342411  normal  0.0146677 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6694  DNA repair protein RecN  48.92 
 
 		 557 aa  385  1e-105  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.478556  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2347  DNA repair protein RecN  48.06 
 
 		 557 aa  381  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.724371 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6163  DNA repair protein RecN (recombination protein N)  47.62 
 
 		 557 aa  382  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0430688 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0938  DNA repair protein RecN  41.65 
 
 		 555 aa  375  1e-103  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000961269  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3161  DNA repair protein RecN  46.52 
 
 		 570 aa  371  1e-101  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.957491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3497  DNA repair protein RecN  44.21 
 
 		 553 aa  372  1e-101  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.185224 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0940  DNA repair protein RecN  49.22 
 
 		 577 aa  368  1e-100  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.693692  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0793  DNA repair protein RecN  45.03 
 
 		 546 aa  365  1e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.628008 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2118  DNA repair protein RecN  45.21 
 
 		 546 aa  365  1e-99  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.513575  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2954  DNA repair protein RecN  45.87 
 
 		 566 aa  363  5.0000000000000005e-99  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0217727 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4484  DNA repair protein RecN  47.07 
 
 		 547 aa  362  1e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7433  DNA repair protein RecN  48.25 
 
 		 557 aa  361  2e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.146948  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0692  DNA repair protein RecN  44.95 
 
 		 549 aa  357  1.9999999999999998e-97  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0261152  decreased coverage  0.000301908 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0700  DNA repair protein RecN  46.13 
 
 		 554 aa  357  2.9999999999999997e-97  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.415077 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3180  DNA repair protein RecN  46.05 
 
 		 566 aa  355  1e-96  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2747  DNA repair protein RecN  44.29 
 
 		 549 aa  353  5.9999999999999994e-96  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3137  DNA repair protein RecN  45.95 
 
 		 565 aa  351  2e-95  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.103261 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0703  DNA repair protein RecN  45.03 
 
 		 546 aa  345  2e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0546  DNA repair protein RecN  49.91 
 
 		 556 aa  340  2.9999999999999998e-92  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.419857 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0756  DNA repair protein RecN  46.15 
 
 		 559 aa  320  3e-86  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2413  DNA repair protein  45.36 
 
 		 553 aa  316  8e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00688711  normal  0.675409 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3364  DNA repair protein RecN  37.04 
 
 		 559 aa  315  1.9999999999999998e-84  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.276138  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0637  DNA repair protein RecN  38.18 
 
 		 549 aa  301  3e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0661  DNA repair protein RecN  38 
 
 		 549 aa  299  1e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0713  DNA repair protein RecN  37.32 
 
 		 549 aa  297  4e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.685992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1763  DNA repair protein RecN  37.28 
 
 		 560 aa  297  4e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137867  normal  0.0495571 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0259  DNA repair protein RecN  37.32 
 
 		 549 aa  296  7e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.255628  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0743  DNA repair protein RecN  37.32 
 
 		 549 aa  296  7e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.259434  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1480  DNA repair protein RecN  37.67 
 
 		 556 aa  296  9e-79  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.269893  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3966  DNA repair protein RecN  33.75 
 
 		 556 aa  295  1e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.284551 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3831  DNA repair protein RecN  37.08 
 
 		 549 aa  295  2e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0866  DNA repair protein RecN  35.27 
 
 		 555 aa  294  3e-78  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5483  DNA repair protein RecN  36.54 
 
 		 558 aa  294  3e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.582199  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1300  DNA repair protein RecN  37.5 
 
 		 549 aa  294  4e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00383913  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2641  DNA repair protein RecN  37.87 
 
 		 549 aa  293  7e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3286  DNA repair protein RecN  37.7 
 
 		 549 aa  292  9e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0539815  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2333  DNA repair protein RecN  37.7 
 
 		 549 aa  292  9e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0492  DNA repair protein RecN  37.7 
 
 		 549 aa  292  9e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3319  DNA repair protein RecN  37.7 
 
 		 549 aa  292  9e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.303665  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2214  DNA repair protein RecN  37.7 
 
 		 549 aa  292  9e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.725261  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1107  DNA repair protein RecN  37.7 
 
 		 549 aa  292  9e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0249547  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3329  DNA repair protein RecN  37.35 
 
 		 549 aa  292  1e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0775  DNA repair protein RecN  37.12 
 
 		 552 aa  287  2.9999999999999996e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000179189 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0998  DNA repair protein RecN  37.89 
 
 		 589 aa  287  4e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.553113 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0456  DNA repair protein RecN  37.06 
 
 		 553 aa  286  5e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1191  DNA repair protein RecN  35.73 
 
 		 559 aa  286  8e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3096  DNA repair protein RecN  37.7 
 
 		 557 aa  285  1.0000000000000001e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4507  DNA repair protein RecN  35.25 
 
 		 557 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1385  DNA repair protein  31.8 
 
 		 608 aa  284  3.0000000000000004e-75  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0276871  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1446  DNA repair protein RecN  31.8 
 
 		 556 aa  283  4.0000000000000003e-75  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000211173  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42990  DNA repair protein RecN  36.3 
 
 		 557 aa  282  1e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0596  DNA repair protein RecN  35.83 
 
 		 572 aa  282  1e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01182  DNA repair protein RecN  35.76 
 
 		 554 aa  281  2e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.239665  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4026  DNA repair protein RecN  31.63 
 
 		 579 aa  280  3e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0028037  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4197  DNA repair protein RecN  34.73 
 
 		 557 aa  280  5e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.312426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1034  DNA repair protein RecN  38.08 
 
 		 576 aa  280  5e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63010  DNA repair protein RecN  36.06 
 
 		 558 aa  280  6e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1597  DNA repair protein RecN  36.3 
 
 		 553 aa  279  1e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0968  DNA repair protein RecN  35.81 
 
 		 567 aa  278  2e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.858596  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2482  DNA repair protein RecN  37.94 
 
 		 568 aa  277  3e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2505  DNA repair protein RecN  37.24 
 
 		 555 aa  277  4e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2735  alkylhydroperoxidase AhpD core  35.33 
 
 		 557 aa  276  5e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0271976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01130  recombination and repair protein  32.51 
 
 		 554 aa  276  6e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1714  DNA repair protein RecN  32.82 
 
 		 557 aa  276  1.0000000000000001e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2475  recombination and repair protein  30.74 
 
 		 565 aa  275  2.0000000000000002e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2421  DNA repair protein RecN  34.04 
 
 		 563 aa  274  3e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.955613  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2680  DNA repair protein RecN  37.61 
 
 		 554 aa  274  4.0000000000000004e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1904  DNA repair protein RecN  37.26 
 
 		 564 aa  274  4.0000000000000004e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4730  DNA repair protein RecN  35.73 
 
 		 557 aa  273  5.000000000000001e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.46357  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2651  DNA repair protein  39.64 
 
 		 569 aa  273  7e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.829393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0942  DNA repair protein RecN  36.73 
 
 		 554 aa  273  7e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2888  DNA repair protein RecN  37.41 
 
 		 568 aa  272  1e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3011  recombination and repair protein  31.64 
 
 		 553 aa  272  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004296  DNA repair protein RecN  31.68 
 
 		 554 aa  272  1e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.782069  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2829  recombination and repair protein  31.64 
 
 		 553 aa  271  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00407233  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3856  recombination and repair protein  31.12 
 
 		 553 aa  271  2e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00344363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3626  DNA repair protein RecN  35.66 
 
 		 558 aa  271  2e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2899  recombination and repair protein  31.64 
 
 		 553 aa  271  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2879  recombination and repair protein  31.64 
 
 		 553 aa  271  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.158329 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2897  recombination and repair protein  31.64 
 
 		 553 aa  271  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>