More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0331 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_0331  DNA repair protein RecN  100 
 
 		 565 aa  1084    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.398153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4037  DNA repair protein RecN  64.39 
 
 		 562 aa  644    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.531713  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2007  DNA repair protein RecN  64.32 
 
 		 561 aa  642    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.518502 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3295  DNA repair protein RecN  63.44 
 
 		 561 aa  650    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1289  DNA repair protein RecN  63.81 
 
 		 561 aa  646    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1061  DNA repair protein RecN  62.41 
 
 		 561 aa  629  1e-179  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.73431 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3383  DNA repair protein RecN  63.8 
 
 		 561 aa  623  1e-177  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.342411  normal  0.0146677 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2347  DNA repair protein RecN  63.41 
 
 		 557 aa  624  1e-177  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.724371 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6163  DNA repair protein RecN (recombination protein N)  63.48 
 
 		 557 aa  619  1e-176  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0430688 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6694  DNA repair protein RecN  63.09 
 
 		 557 aa  615  1e-175  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.478556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2879  DNA repair protein RecN  58.7 
 
 		 557 aa  606  9.999999999999999e-173  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3497  DNA repair protein RecN  58.76 
 
 		 553 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.185224 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2071  DNA repair protein RecN  58.08 
 
 		 557 aa  599  1e-170  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.240609  hitchhiker  0.00158855 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2842  DNA repair protein RecN  57.61 
 
 		 557 aa  588  1e-167  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.049374  hitchhiker  0.0050611 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2583  DNA repair protein RecN  57.97 
 
 		 557 aa  588  1e-167  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0083659  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1421  DNA repair protein RecN  58.55 
 
 		 559 aa  582  1.0000000000000001e-165  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.564129  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1377  DNA repair protein RecN  58.55 
 
 		 559 aa  581  1e-164  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.183083  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2954  DNA repair protein RecN  61.41 
 
 		 566 aa  580  1e-164  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0217727 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1753  DNA repair protein RecN  57.64 
 
 		 554 aa  573  1.0000000000000001e-162  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1998  DNA repair protein RecN  57.65 
 
 		 558 aa  574  1.0000000000000001e-162  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7433  DNA repair protein RecN  63.14 
 
 		 557 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.146948  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3180  DNA repair protein RecN  61.41 
 
 		 566 aa  567  1e-160  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3137  DNA repair protein RecN  61.05 
 
 		 565 aa  559  1e-158  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.103261 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0700  DNA repair protein RecN  58.69 
 
 		 554 aa  556  1e-157  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.415077 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0938  DNA repair protein RecN  52.49 
 
 		 555 aa  545  1e-154  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000961269  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2431  DNA repair protein RecN  53.2 
 
 		 557 aa  483  1e-135  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.320289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1736  DNA repair protein RecN  48.95 
 
 		 554 aa  415  9.999999999999999e-116  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0149698  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0940  DNA repair protein RecN  49.83 
 
 		 577 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.693692  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4729  DNA repair protein RecN  50.62 
 
 		 553 aa  403  1e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.574204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0692  DNA repair protein RecN  45.65 
 
 		 549 aa  400  9.999999999999999e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0261152  decreased coverage  0.000301908 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0793  DNA repair protein RecN  47.65 
 
 		 546 aa  397  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.628008 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2118  DNA repair protein RecN  47.83 
 
 		 546 aa  394  1e-108  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.513575  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3161  DNA repair protein RecN  46.03 
 
 		 570 aa  393  1e-108  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.957491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2747  DNA repair protein RecN  45.91 
 
 		 549 aa  390  1e-107  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2067  DNA repair protein RecN  47.57 
 
 		 565 aa  383  1e-105  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.614381 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4484  DNA repair protein RecN  47.7 
 
 		 547 aa  385  1e-105  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0703  DNA repair protein RecN  48.46 
 
 		 546 aa  380  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2413  DNA repair protein  50.27 
 
 		 553 aa  380  1e-104  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00688711  normal  0.675409 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3099  DNA repair protein RecN  47.36 
 
 		 564 aa  358  1.9999999999999998e-97  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.545519  normal  0.794323 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0546  DNA repair protein RecN  48.08 
 
 		 556 aa  352  8.999999999999999e-96  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.419857 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1480  DNA repair protein RecN  38.17 
 
 		 556 aa  315  9.999999999999999e-85  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.269893  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0775  DNA repair protein RecN  36.94 
 
 		 552 aa  307  4.0000000000000004e-82  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000179189 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0930  ATPase for DNA repair  33.92 
 
 		 555 aa  303  5.000000000000001e-81  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0998  DNA repair protein RecN  37.93 
 
 		 589 aa  303  8.000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.553113 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1446  DNA repair protein RecN  31.62 
 
 		 556 aa  301  3e-80  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000211173  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1385  DNA repair protein  31.62 
 
 		 608 aa  300  4e-80  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0276871  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1763  DNA repair protein RecN  37.8 
 
 		 560 aa  300  4e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137867  normal  0.0495571 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0254  DNA repair protein RecN  34.08 
 
 		 573 aa  300  6e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1178  DNA repair protein RecN  34.49 
 
 		 559 aa  299  7e-80  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000946399  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1774  DNA repair protein RecN  35.64 
 
 		 556 aa  298  2e-79  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2316  DNA repair protein RecN  32.07 
 
 		 573 aa  298  2e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0950  DNA repair protein RecN  31.9 
 
 		 579 aa  297  4e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0157368  hitchhiker  0.0000335441 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4304  DNA repair protein RecN  31.73 
 
 		 579 aa  296  5e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000470862  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3916  DNA repair protein  31.56 
 
 		 579 aa  295  1e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000027559  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3927  DNA repair protein  31.56 
 
 		 583 aa  295  2e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0317713  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3364  DNA repair protein RecN  33.16 
 
 		 559 aa  295  2e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.276138  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1904  DNA repair protein RecN  37.35 
 
 		 564 aa  295  2e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4246  DNA repair protein RecN  31.56 
 
 		 583 aa  294  3e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00786878  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4078  DNA repair protein RecN  31.56 
 
 		 579 aa  294  3e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2482  DNA repair protein RecN  37.95 
 
 		 568 aa  294  3e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4284  DNA repair protein RecN  31.56 
 
 		 579 aa  294  3e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0425411  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4397  DNA repair protein RecN  31.56 
 
 		 579 aa  294  3e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000441756  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4026  DNA repair protein RecN  32.25 
 
 		 579 aa  293  4e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0028037  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4194  DNA repair protein RecN  31.56 
 
 		 579 aa  293  5e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.9666000000000002e-33 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1191  DNA repair protein RecN  35.5 
 
 		 559 aa  292  9e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2651  DNA repair protein  39.14 
 
 		 569 aa  292  1e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.829393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2888  DNA repair protein RecN  37.95 
 
 		 568 aa  292  1e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2867  DNA repair protein RecN  32.76 
 
 		 579 aa  291  1e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1179  DNA repair and genetic recombination protein  32.7 
 
 		 556 aa  292  1e-77  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2475  recombination and repair protein  32.4 
 
 		 565 aa  291  2e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2877  DNA repair protein recN  30.88 
 
 		 555 aa  288  1e-76  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01182  DNA repair protein RecN  36.52 
 
 		 554 aa  289  1e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.239665  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1896  DNA repair protein RecN  31.65 
 
 		 567 aa  288  2e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000247727  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1034  DNA repair protein RecN  37.02 
 
 		 576 aa  286  5e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2739  DNA repair protein recN  31.22 
 
 		 555 aa  286  1.0000000000000001e-75  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0942  DNA repair protein RecN  35.81 
 
 		 554 aa  286  1.0000000000000001e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42990  DNA repair protein RecN  35.63 
 
 		 557 aa  285  2.0000000000000002e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1301  DNA repair protein RecN  35.54 
 
 		 547 aa  284  3.0000000000000004e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.549514 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1515  recombination protein N  33.8 
 
 		 557 aa  284  4.0000000000000003e-75  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2064  DNA repair protein RecN  35.69 
 
 		 558 aa  282  9e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.488529  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3096  DNA repair protein RecN  37.02 
 
 		 557 aa  282  1e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5483  DNA repair protein RecN  34.49 
 
 		 558 aa  281  2e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.582199  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4730  DNA repair protein RecN  34.08 
 
 		 557 aa  280  3e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.46357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2579  DNA repair protein RecN  33.22 
 
 		 562 aa  280  5e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.183283 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1458  DNA repair protein RecN  33.45 
 
 		 557 aa  280  7e-74  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0380589  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2735  alkylhydroperoxidase AhpD core  34.09 
 
 		 557 aa  279  8e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0271976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01130  recombination and repair protein  31.98 
 
 		 554 aa  278  1e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4595  DNA repair protein RecN  34.44 
 
 		 557 aa  279  1e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.202375 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1597  DNA repair protein RecN  35.3 
 
 		 553 aa  278  2e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4729  DNA repair protein RecN  34.27 
 
 		 557 aa  278  3e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00366375 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0378  recombination and repair protein  32.57 
 
 		 554 aa  277  3e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.116911  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0903  DNA repair protein RecN  36.41 
 
 		 554 aa  277  3e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0968  DNA repair protein RecN  35.58 
 
 		 567 aa  277  3e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.858596  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0703  DNA repair protein RecN  34.26 
 
 		 557 aa  277  4e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.926549  hitchhiker  0.000359109 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4507  DNA repair protein RecN  33.39 
 
 		 557 aa  277  4e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3626  DNA repair protein RecN  34.54 
 
 		 558 aa  277  4e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2421  DNA repair protein RecN  34.32 
 
 		 563 aa  276  5e-73  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.955613  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4197  DNA repair protein RecN  33.04 
 
 		 557 aa  276  7e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.312426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63010  DNA repair protein RecN  34.32 
 
 		 558 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0661  DNA repair protein RecN  36.85 
 
 		 549 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>