More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2347 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_2954  DNA repair protein RecN  77.54 
 
 
566 aa  763    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0217727 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6694  DNA repair protein RecN  82.99 
 
 
557 aa  827    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.478556  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7433  DNA repair protein RecN  82.41 
 
 
557 aa  781    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.146948  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4037  DNA repair protein RecN  64.35 
 
 
562 aa  642    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.531713  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3137  DNA repair protein RecN  77.84 
 
 
565 aa  742    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.103261 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2007  DNA repair protein RecN  64.29 
 
 
561 aa  647    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.518502 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3295  DNA repair protein RecN  63.93 
 
 
561 aa  653    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3497  DNA repair protein RecN  63.06 
 
 
553 aa  645    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.185224 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2347  DNA repair protein RecN  100 
 
 
557 aa  1071    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.724371 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1289  DNA repair protein RecN  63.57 
 
 
561 aa  650    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0331  DNA repair protein RecN  63.65 
 
 
565 aa  649    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.398153  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6163  DNA repair protein RecN (recombination protein N)  65.77 
 
 
557 aa  642    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0430688 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3180  DNA repair protein RecN  77.54 
 
 
566 aa  750    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1061  DNA repair protein RecN  62.86 
 
 
561 aa  625  1e-178  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.73431 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2879  DNA repair protein RecN  60.48 
 
 
557 aa  625  1e-178  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3383  DNA repair protein RecN  63.75 
 
 
561 aa  625  1e-178  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.342411  normal  0.0146677 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2842  DNA repair protein RecN  59.93 
 
 
557 aa  618  1e-176  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.049374  hitchhiker  0.0050611 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2583  DNA repair protein RecN  60.29 
 
 
557 aa  621  1e-176  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0083659  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1998  DNA repair protein RecN  61.48 
 
 
558 aa  616  1e-175  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2071  DNA repair protein RecN  59.96 
 
 
557 aa  614  9.999999999999999e-175  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.240609  hitchhiker  0.00158855 
 
 
-
 
NC_004310  BR1421  DNA repair protein RecN  60.52 
 
 
559 aa  603  1.0000000000000001e-171  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.564129  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1377  DNA repair protein RecN  60.52 
 
 
559 aa  603  1.0000000000000001e-171  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.183083  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0700  DNA repair protein RecN  62.88 
 
 
554 aa  596  1e-169  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.415077 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1753  DNA repair protein RecN  59.96 
 
 
554 aa  592  1e-168  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0938  DNA repair protein RecN  52.17 
 
 
555 aa  553  1e-156  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000961269  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2431  DNA repair protein RecN  57.32 
 
 
557 aa  523  1e-147  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.320289  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2747  DNA repair protein RecN  49.64 
 
 
549 aa  429  1e-119  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0940  DNA repair protein RecN  51.25 
 
 
577 aa  428  1e-118  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.693692  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1736  DNA repair protein RecN  50.63 
 
 
554 aa  426  1e-118  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0149698  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3161  DNA repair protein RecN  47.75 
 
 
570 aa  419  1e-116  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.957491  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4729  DNA repair protein RecN  52.33 
 
 
553 aa  417  9.999999999999999e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.574204  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0692  DNA repair protein RecN  48.71 
 
 
549 aa  416  9.999999999999999e-116  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0261152  decreased coverage  0.000301908 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0793  DNA repair protein RecN  49.91 
 
 
546 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.628008 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2118  DNA repair protein RecN  50.09 
 
 
546 aa  412  1e-114  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.513575  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4484  DNA repair protein RecN  51.44 
 
 
547 aa  410  1e-113  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2067  DNA repair protein RecN  48.49 
 
 
565 aa  392  1e-108  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.614381 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0703  DNA repair protein RecN  49.45 
 
 
546 aa  389  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2413  DNA repair protein  51.75 
 
 
553 aa  387  1e-106  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00688711  normal  0.675409 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0546  DNA repair protein RecN  51.52 
 
 
556 aa  371  1e-101  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.419857 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0756  DNA repair protein RecN  47.05 
 
 
559 aa  365  1e-99  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3099  DNA repair protein RecN  47.7 
 
 
564 aa  357  1.9999999999999998e-97  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.545519  normal  0.794323 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3364  DNA repair protein RecN  36.79 
 
 
559 aa  336  7.999999999999999e-91  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.276138  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1763  DNA repair protein RecN  39.5 
 
 
560 aa  330  5.0000000000000004e-89  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137867  normal  0.0495571 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1026  recombination and repair protein  37.06 
 
 
554 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0775  DNA repair protein RecN  37.68 
 
 
552 aa  320  6e-86  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000179189 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2064  DNA repair protein RecN  39.36 
 
 
558 aa  319  1e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.488529  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0254  DNA repair protein RecN  35.38 
 
 
573 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1196  recombination and repair protein  34.39 
 
 
553 aa  313  4.999999999999999e-84  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1480  DNA repair protein RecN  38.49 
 
 
556 aa  312  1e-83  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.269893  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3359  recombination and repair protein  34.68 
 
 
553 aa  311  2.9999999999999997e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0341558 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1043  recombination and repair protein  34.04 
 
 
552 aa  311  2.9999999999999997e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2316  DNA repair protein RecN  33.51 
 
 
573 aa  309  6.999999999999999e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1774  DNA repair protein RecN  36.23 
 
 
556 aa  309  6.999999999999999e-83  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1281  recombination and repair protein  33.93 
 
 
553 aa  309  8e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000117137 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2877  DNA repair protein recN  32.56 
 
 
555 aa  309  1.0000000000000001e-82  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01182  DNA repair protein RecN  38.16 
 
 
554 aa  307  3e-82  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.239665  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0930  ATPase for DNA repair  32.8 
 
 
555 aa  306  7e-82  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1515  recombination protein N  34.93 
 
 
557 aa  306  8.000000000000001e-82  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5483  DNA repair protein RecN  35.48 
 
 
558 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.582199  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4026  DNA repair protein RecN  32.46 
 
 
579 aa  304  3.0000000000000004e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0028037  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1191  DNA repair protein RecN  36.67 
 
 
559 aa  303  5.000000000000001e-81  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1151  recombination and repair protein  34.72 
 
 
554 aa  303  7.000000000000001e-81  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.901201  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2735  alkylhydroperoxidase AhpD core  34.77 
 
 
557 aa  300  4e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0271976  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0998  DNA repair protein RecN  38.07 
 
 
589 aa  300  4e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.553113 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2771  recombination and repair protein  33.8 
 
 
552 aa  300  4e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.170925  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2739  DNA repair protein recN  32.38 
 
 
555 aa  300  5e-80  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01130  recombination and repair protein  33.39 
 
 
554 aa  300  5e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1170  recombination and repair protein  33.8 
 
 
552 aa  300  7e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0260908 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63010  DNA repair protein RecN  35.84 
 
 
558 aa  299  7e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1104  recombination and repair protein  33.8 
 
 
552 aa  299  8e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.562592 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1104  recombination and repair protein  33.8 
 
 
552 aa  299  8e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.239344  normal  0.154382 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0501  DNA repair protein RecN  31.85 
 
 
552 aa  299  1e-79  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.424659  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004296  DNA repair protein RecN  32.68 
 
 
554 aa  298  1e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.782069  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4304  DNA repair protein RecN  32.75 
 
 
579 aa  298  2e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000470862  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3916  DNA repair protein  32.75 
 
 
579 aa  298  2e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000027559  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3927  DNA repair protein  32.58 
 
 
583 aa  297  3e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0317713  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0950  DNA repair protein RecN  32.4 
 
 
579 aa  297  3e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0157368  hitchhiker  0.0000335441 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4194  DNA repair protein RecN  32.75 
 
 
579 aa  297  3e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.9666000000000002e-33 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1179  DNA repair and genetic recombination protein  33.21 
 
 
556 aa  297  3e-79  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4078  DNA repair protein RecN  32.58 
 
 
579 aa  297  4e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4397  DNA repair protein RecN  32.58 
 
 
579 aa  297  4e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000441756  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4284  DNA repair protein RecN  32.4 
 
 
579 aa  296  5e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0425411  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4246  DNA repair protein RecN  32.58 
 
 
583 aa  296  6e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00786878  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3462  recombination and repair protein  33.45 
 
 
552 aa  296  7e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1218  recombination and repair protein  33.74 
 
 
552 aa  295  1e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.187963  normal  0.0934404 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3153  recombination and repair protein  33.74 
 
 
552 aa  295  1e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000145597  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3296  recombination and repair protein  33.74 
 
 
552 aa  295  1e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.182341  decreased coverage  0.000158665 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1904  DNA repair protein RecN  37.12 
 
 
564 aa  295  1e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42990  DNA repair protein RecN  35.32 
 
 
557 aa  295  1e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3151  recombination and repair protein  33.74 
 
 
552 aa  295  1e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0961248  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1458  DNA repair protein RecN  34.4 
 
 
557 aa  295  2e-78  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0380589  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0378  recombination and repair protein  32.68 
 
 
554 aa  294  3e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.116911  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2475  recombination and repair protein  31.91 
 
 
565 aa  293  4e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3626  DNA repair protein RecN  35.36 
 
 
558 aa  293  8e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0370  DNA repair protein RecN  35.38 
 
 
578 aa  293  8e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.431573  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1178  DNA repair protein RecN  35.52 
 
 
559 aa  292  9e-78  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000946399  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1896  DNA repair protein RecN  33.98 
 
 
567 aa  291  2e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000247727  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0968  DNA repair protein RecN  36.41 
 
 
567 aa  289  8e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.858596  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1169  recombination and repair protein  33.09 
 
 
553 aa  288  1e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0713  DNA repair protein RecN  39.53 
 
 
549 aa  289  1e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.685992  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>