More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6893 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6893  DNA repair protein RecN  100 
 
 		 549 aa  1113    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.23585  normal  0.532581 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1139  DNA repair protein RecN  44.26 
 
 		 555 aa  462  1e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1303  DNA repair protein RecN  42.99 
 
 		 557 aa  448  1.0000000000000001e-124  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.523963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3012  DNA repair protein  42.18 
 
 		 551 aa  443  1e-123  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.398213 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5209  DNA repair protein RecN  42.52 
 
 		 551 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1845  Sigma 54 interacting domain protein  39.45 
 
 		 552 aa  406  1.0000000000000001e-112  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.34764  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3465  DNA repair protein RecN  38.43 
 
 		 550 aa  389  1e-107  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.393637  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09463  DNA repair protein RecN  39.35 
 
 		 550 aa  380  1e-104  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.070219  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1849  DNA repair protein RecN  37.55 
 
 		 551 aa  370  1e-101  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0370  DNA repair protein RecN  34.62 
 
 		 578 aa  316  9e-85  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.431573  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1026  recombination and repair protein  33.45 
 
 		 554 aa  296  6e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1714  DNA repair protein RecN  33.81 
 
 		 557 aa  295  1e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0932  DNA repair protein RecN  33.7 
 
 		 557 aa  295  2e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.613915 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1749  DNA repair protein RecN  34.04 
 
 		 574 aa  292  1e-77  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0814  DNA repair protein RecN  30.73 
 
 		 570 aa  290  5.0000000000000004e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1281  recombination and repair protein  32.13 
 
 		 553 aa  289  7e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000117137 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5483  DNA repair protein RecN  33.81 
 
 		 558 aa  289  9e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.582199  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2627  DNA repair protein RecN  29.91 
 
 		 574 aa  289  1e-76  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.434189  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1179  DNA repair and genetic recombination protein  31.34 
 
 		 556 aa  288  2e-76  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3462  recombination and repair protein  32.68 
 
 		 552 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1104  recombination and repair protein  33.1 
 
 		 552 aa  286  7e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.562592 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1169  recombination and repair protein  32.85 
 
 		 553 aa  286  8e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63010  DNA repair protein RecN  33.51 
 
 		 558 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1170  recombination and repair protein  33.1 
 
 		 552 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0260908 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1104  recombination and repair protein  33.1 
 
 		 552 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.239344  normal  0.154382 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3096  DNA repair protein RecN  33.21 
 
 		 574 aa  283  5.000000000000001e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.155422 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3364  DNA repair protein RecN  31.36 
 
 		 559 aa  282  1e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.276138  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1335  DNA repair protein RecN  29.82 
 
 		 551 aa  281  2e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1080  DNA repair protein RecN  31.71 
 
 		 558 aa  281  3e-74  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1196  recombination and repair protein  31.46 
 
 		 553 aa  280  3e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1896  DNA repair protein RecN  32.26 
 
 		 567 aa  280  4e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000247727  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1043  recombination and repair protein  31.12 
 
 		 552 aa  280  6e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2771  recombination and repair protein  32.14 
 
 		 552 aa  280  7e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.170925  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1611  DNA repair protein RecN  31.35 
 
 		 559 aa  279  1e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000188364  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1578  DNA repair protein RecN  31.35 
 
 		 559 aa  279  1e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0576  DNA repair protein RecN  32.22 
 
 		 568 aa  278  1e-73  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1218  recombination and repair protein  31.89 
 
 		 552 aa  278  3e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.187963  normal  0.0934404 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3296  recombination and repair protein  31.89 
 
 		 552 aa  278  3e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.182341  decreased coverage  0.000158665 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3151  recombination and repair protein  31.89 
 
 		 552 aa  278  3e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0961248  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3153  recombination and repair protein  31.89 
 
 		 552 aa  278  3e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000145597  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2739  DNA repair protein recN  31.52 
 
 		 555 aa  276  5e-73  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4730  DNA repair protein RecN  33.09 
 
 		 557 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.46357  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2877  DNA repair protein recN  31.16 
 
 		 555 aa  276  1.0000000000000001e-72  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1233  DNA repair ATPase  32.49 
 
 		 551 aa  275  1.0000000000000001e-72  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.337705  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3298  recombination and repair protein  32.61 
 
 		 553 aa  275  2.0000000000000002e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.121559  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0501  DNA repair protein RecN  30.49 
 
 		 552 aa  274  2.0000000000000002e-72  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.424659  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1151  recombination and repair protein  32.91 
 
 		 554 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.901201  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4507  DNA repair protein RecN  32.91 
 
 		 557 aa  274  3e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3218  recombination and repair protein  33.93 
 
 		 553 aa  274  3e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0594  DNA repair protein RecN  32.45 
 
 		 569 aa  274  3e-72  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0859323 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0378  recombination and repair protein  31.7 
 
 		 554 aa  274  3e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.116911  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1666  DNA repair protein RecN  31.86 
 
 		 577 aa  274  4.0000000000000004e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0963  recombination and repair protein  32.01 
 
 		 553 aa  273  5.000000000000001e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0199907  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4595  DNA repair protein RecN  33.27 
 
 		 557 aa  273  6e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.202375 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3359  recombination and repair protein  32.55 
 
 		 553 aa  273  8.000000000000001e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0341558 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4729  DNA repair protein RecN  33.09 
 
 		 557 aa  272  1e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00366375 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1178  DNA repair protein RecN  30.7 
 
 		 559 aa  272  1e-71  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000946399  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0728  recombination and repair protein  32.01 
 
 		 553 aa  271  2e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.118324  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2064  DNA repair protein RecN  30.62 
 
 		 558 aa  271  2.9999999999999997e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.488529  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4197  DNA repair protein RecN  32.37 
 
 		 557 aa  270  4e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.312426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02270  DNA repair ATPase RecN  33.69 
 
 		 561 aa  270  4e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1763  DNA repair protein RecN  31.47 
 
 		 560 aa  269  8e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137867  normal  0.0495571 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3825  DNA repair protein RecN  30.3 
 
 		 561 aa  269  1e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.321139  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2069  DNA repair protein RecN  29.11 
 
 		 565 aa  269  1e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1301  DNA repair protein RecN  32.08 
 
 		 561 aa  268  2e-70  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0942  DNA repair protein RecN  31.27 
 
 		 554 aa  268  2e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0596  DNA repair protein RecN  31.67 
 
 		 572 aa  268  2e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1783  DNA repair protein RecN  28.99 
 
 		 565 aa  267  4e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1773  DNA repair protein RecN  32.25 
 
 		 553 aa  267  5e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000824865 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06570  DNA repair protein RecN  29.96 
 
 		 565 aa  267  5e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000129264  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1544  DNA repair protein RecN  30.16 
 
 		 566 aa  266  5e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1480  DNA repair protein RecN  32.41 
 
 		 556 aa  266  7e-70  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.269893  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2421  DNA repair protein RecN  32.8 
 
 		 563 aa  266  8.999999999999999e-70  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.955613  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1059  DNA repair protein RecN  32.5 
 
 		 553 aa  265  1e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0987529  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1068  recombination and repair protein  32.5 
 
 		 553 aa  265  1e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0569436  normal  0.137036 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1446  DNA repair protein RecN  28.85 
 
 		 556 aa  265  1e-69  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000211173  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2680  DNA repair protein RecN  30.58 
 
 		 554 aa  265  1e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2774  recombination and repair protein  32.5 
 
 		 553 aa  265  1e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000103072  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02504  recombination and repair protein  32.5 
 
 		 553 aa  265  2e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0788874  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02468  hypothetical protein  32.5 
 
 		 553 aa  265  2e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.116899  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3856  recombination and repair protein  32.5 
 
 		 553 aa  264  3e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00344363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2900  recombination and repair protein  32.33 
 
 		 553 aa  264  4e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.004413  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1769  DNA repair protein RecN  30.25 
 
 		 557 aa  264  4e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2032  DNA repair protein RecN  33.04 
 
 		 567 aa  263  4.999999999999999e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3626  DNA repair protein RecN  32.5 
 
 		 558 aa  263  6e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1385  DNA repair protein  28.67 
 
 		 608 aa  263  6e-69  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0276871  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2735  alkylhydroperoxidase AhpD core  29.8 
 
 		 557 aa  263  6e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0271976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2475  recombination and repair protein  31.53 
 
 		 565 aa  263  6.999999999999999e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2768  recombination and repair protein  32.5 
 
 		 553 aa  263  6.999999999999999e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00054696  normal  0.107417 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42990  DNA repair protein RecN  31.71 
 
 		 557 aa  263  8e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3686  recombination and repair protein  33.16 
 
 		 553 aa  262  8.999999999999999e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00128842  normal  0.127979 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0866  DNA repair protein RecN  31.7 
 
 		 555 aa  263  8.999999999999999e-69  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3011  recombination and repair protein  31.79 
 
 		 553 aa  263  8.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2829  recombination and repair protein  31.79 
 
 		 553 aa  262  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00407233  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0703  DNA repair protein RecN  33.09 
 
 		 557 aa  262  1e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.926549  hitchhiker  0.000359109 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0701  DNA repair protein RecN  32.09 
 
 		 567 aa  261  2e-68  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2899  recombination and repair protein  31.79 
 
 		 553 aa  261  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1904  DNA repair protein RecN  30.65 
 
 		 564 aa  262  2e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2897  recombination and repair protein  31.79 
 
 		 553 aa  261  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3005  recombination and repair protein  32.16 
 
 		 553 aa  261  2e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000658292  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>