More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1849 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG1849  DNA repair protein RecN  100 
 
 		 551 aa  1112    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1139  DNA repair protein RecN  40.11 
 
 		 555 aa  426  1e-118  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3012  DNA repair protein  39.38 
 
 		 551 aa  416  9.999999999999999e-116  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.398213 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5209  DNA repair protein RecN  39.75 
 
 		 551 aa  401  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3465  DNA repair protein RecN  39.82 
 
 		 550 aa  400  9.999999999999999e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.393637  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1303  DNA repair protein RecN  37.57 
 
 		 557 aa  385  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.523963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6893  DNA repair protein RecN  37.7 
 
 		 549 aa  378  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.23585  normal  0.532581 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09463  DNA repair protein RecN  39.53 
 
 		 550 aa  358  1.9999999999999998e-97  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.070219  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1845  Sigma 54 interacting domain protein  35.51 
 
 		 552 aa  354  2e-96  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.34764  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1026  recombination and repair protein  34.18 
 
 		 554 aa  337  3.9999999999999995e-91  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1196  recombination and repair protein  33.27 
 
 		 553 aa  317  4e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1281  recombination and repair protein  32.91 
 
 		 553 aa  316  7e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000117137 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3364  DNA repair protein RecN  32.62 
 
 		 559 aa  309  8e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.276138  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5483  DNA repair protein RecN  33.39 
 
 		 558 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.582199  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42990  DNA repair protein RecN  33.87 
 
 		 557 aa  308  2.0000000000000002e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3462  recombination and repair protein  32.73 
 
 		 552 aa  306  4.0000000000000004e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1043  recombination and repair protein  32.55 
 
 		 552 aa  306  5.0000000000000004e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4507  DNA repair protein RecN  33.09 
 
 		 557 aa  306  7e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2771  recombination and repair protein  32.55 
 
 		 552 aa  306  9.000000000000001e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.170925  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63010  DNA repair protein RecN  33.93 
 
 		 558 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4197  DNA repair protein RecN  32.91 
 
 		 557 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.312426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3359  recombination and repair protein  33.27 
 
 		 553 aa  303  5.000000000000001e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0341558 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1104  recombination and repair protein  32.73 
 
 		 552 aa  303  5.000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.562592 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1104  recombination and repair protein  32.55 
 
 		 552 aa  302  9e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.239344  normal  0.154382 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1170  recombination and repair protein  32.55 
 
 		 552 aa  301  2e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0260908 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3153  recombination and repair protein  31.83 
 
 		 552 aa  299  8e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000145597  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3151  recombination and repair protein  31.83 
 
 		 552 aa  299  8e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0961248  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1218  recombination and repair protein  31.83 
 
 		 552 aa  299  8e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.187963  normal  0.0934404 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3296  recombination and repair protein  31.83 
 
 		 552 aa  299  8e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.182341  decreased coverage  0.000158665 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1749  DNA repair protein RecN  34.27 
 
 		 574 aa  298  2e-79  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0866  DNA repair protein RecN  32.49 
 
 		 555 aa  296  5e-79  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0594  DNA repair protein RecN  33.04 
 
 		 569 aa  296  9e-79  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0859323 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0378  recombination and repair protein  31.54 
 
 		 554 aa  296  9e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.116911  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4729  DNA repair protein RecN  33.27 
 
 		 557 aa  295  1e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00366375 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1376  recombination and repair protein  31.59 
 
 		 553 aa  295  1e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000000100313  normal  0.0248594 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1169  recombination and repair protein  31.83 
 
 		 553 aa  295  1e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2976  recombination and repair protein  31.59 
 
 		 553 aa  295  1e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0819489  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0761  DNA repair protein RecN  32.91 
 
 		 557 aa  294  2e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.345087  normal  0.395212 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4730  DNA repair protein RecN  33.27 
 
 		 557 aa  295  2e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.46357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1763  DNA repair protein RecN  35.6 
 
 		 560 aa  295  2e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137867  normal  0.0495571 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2889  recombination and repair protein  31.59 
 
 		 553 aa  295  2e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000988342  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0728  recombination and repair protein  32.85 
 
 		 553 aa  294  3e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.118324  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4595  DNA repair protein RecN  33.09 
 
 		 557 aa  293  5e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.202375 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0703  DNA repair protein RecN  33.51 
 
 		 557 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.926549  hitchhiker  0.000359109 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2900  recombination and repair protein  31.59 
 
 		 553 aa  290  5.0000000000000004e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.004413  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1151  recombination and repair protein  32.19 
 
 		 554 aa  290  5.0000000000000004e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.901201  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1059  DNA repair protein RecN  31.59 
 
 		 553 aa  290  6e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0987529  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2768  recombination and repair protein  31.59 
 
 		 553 aa  290  6e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00054696  normal  0.107417 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2774  recombination and repair protein  31.59 
 
 		 553 aa  290  6e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000103072  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1068  recombination and repair protein  31.59 
 
 		 553 aa  290  6e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0569436  normal  0.137036 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0370  DNA repair protein RecN  35.18 
 
 		 578 aa  290  7e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.431573  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02504  recombination and repair protein  31.59 
 
 		 553 aa  289  8e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0788874  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02468  hypothetical protein  31.59 
 
 		 553 aa  289  8e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.116899  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2735  alkylhydroperoxidase AhpD core  31.52 
 
 		 557 aa  289  9e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0271976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0963  recombination and repair protein  32.49 
 
 		 553 aa  289  1e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0199907  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3856  recombination and repair protein  31.23 
 
 		 553 aa  287  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00344363  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3218  recombination and repair protein  31.59 
 
 		 553 aa  288  2.9999999999999996e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3686  recombination and repair protein  31.23 
 
 		 553 aa  286  5.999999999999999e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00128842  normal  0.127979 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0814  DNA repair protein RecN  30.44 
 
 		 570 aa  286  5.999999999999999e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3005  recombination and repair protein  31.23 
 
 		 553 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000658292  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3096  DNA repair protein RecN  34.28 
 
 		 574 aa  286  1.0000000000000001e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.155422 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1080  DNA repair protein RecN  31.36 
 
 		 558 aa  284  2.0000000000000002e-75  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0596  DNA repair protein RecN  34.16 
 
 		 572 aa  284  3.0000000000000004e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3298  recombination and repair protein  31.66 
 
 		 553 aa  283  5.000000000000001e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.121559  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01130  recombination and repair protein  31.06 
 
 		 554 aa  283  6.000000000000001e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2475  recombination and repair protein  30.58 
 
 		 565 aa  283  8.000000000000001e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2316  DNA repair protein RecN  32.17 
 
 		 573 aa  281  2e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1860  DNA repair protein RecN  34.83 
 
 		 558 aa  280  5e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.457848  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3011  recombination and repair protein  31.23 
 
 		 553 aa  280  5e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1385  DNA repair protein  31.96 
 
 		 608 aa  280  6e-74  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0276871  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2627  DNA repair protein RecN  29.91 
 
 		 574 aa  280  6e-74  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.434189  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2897  recombination and repair protein  31.23 
 
 		 553 aa  280  6e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2899  recombination and repair protein  31.23 
 
 		 553 aa  280  6e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2829  recombination and repair protein  31.23 
 
 		 553 aa  280  6e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00407233  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2879  recombination and repair protein  31.23 
 
 		 553 aa  280  6e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.158329 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1896  DNA repair protein RecN  30.47 
 
 		 567 aa  279  9e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000247727  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3825  DNA repair protein RecN  29.81 
 
 		 561 aa  279  1e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.321139  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1446  DNA repair protein RecN  31.41 
 
 		 556 aa  278  2e-73  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000211173  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1578  DNA repair protein RecN  31.24 
 
 		 559 aa  278  2e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1611  DNA repair protein RecN  31.24 
 
 		 559 aa  278  2e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000188364  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3626  DNA repair protein RecN  31.41 
 
 		 558 aa  277  3e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1774  DNA repair protein RecN  30.77 
 
 		 556 aa  277  3e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2706  DNA repair protein RecN  31.65 
 
 		 552 aa  277  3e-73  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2877  DNA repair protein recN  30.27 
 
 		 555 aa  277  4e-73  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0651  DNA repair protein  30.34 
 
 		 559 aa  277  4e-73  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3096  DNA repair protein RecN  32.73 
 
 		 557 aa  276  5e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2421  DNA repair protein RecN  32.26 
 
 		 563 aa  276  9e-73  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.955613  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1335  DNA repair protein RecN  30 
 
 		 551 aa  275  1.0000000000000001e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004296  DNA repair protein RecN  30.34 
 
 		 554 aa  275  2.0000000000000002e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.782069  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0903  DNA repair protein RecN  32.49 
 
 		 554 aa  275  2.0000000000000002e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1714  DNA repair protein RecN  30.32 
 
 		 557 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1179  DNA repair and genetic recombination protein  31.05 
 
 		 556 aa  275  2.0000000000000002e-72  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0832  DNA repair protein RecN  32.55 
 
 		 554 aa  273  7e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.013795  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3096  recombination and repair protein  30.87 
 
 		 553 aa  272  1e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.316238  normal  0.467754 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0254  DNA repair protein RecN  32.29 
 
 		 573 aa  272  1e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0932  DNA repair protein RecN  32.61 
 
 		 557 aa  271  2e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.613915 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1191  DNA repair protein RecN  31.77 
 
 		 559 aa  271  2e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4026  DNA repair protein RecN  31.36 
 
 		 579 aa  271  2e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0028037  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0701  DNA repair protein RecN  32.86 
 
 		 567 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0775  DNA repair protein RecN  31.58 
 
 		 552 aa  271  2.9999999999999997e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000179189 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>