More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_09463 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_09463  DNA repair protein RecN  100 
 
 		 550 aa  1094    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.070219  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3465  DNA repair protein RecN  47.45 
 
 		 550 aa  489  1e-137  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.393637  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1845  Sigma 54 interacting domain protein  46.81 
 
 		 552 aa  488  1e-137  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.34764  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1139  DNA repair protein RecN  43.35 
 
 		 555 aa  425  1e-118  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3012  DNA repair protein  42.26 
 
 		 551 aa  427  1e-118  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.398213 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1303  DNA repair protein RecN  41.71 
 
 		 557 aa  414  1e-114  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.523963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5209  DNA repair protein RecN  43.12 
 
 		 551 aa  402  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6893  DNA repair protein RecN  39.35 
 
 		 549 aa  390  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.23585  normal  0.532581 
 
 
-
 
NC_002950  PG1849  DNA repair protein RecN  39.52 
 
 		 551 aa  351  2e-95  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0370  DNA repair protein RecN  32.86 
 
 		 578 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.431573  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5483  DNA repair protein RecN  33.75 
 
 		 558 aa  298  1e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.582199  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63010  DNA repair protein RecN  34.41 
 
 		 558 aa  297  4e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3966  DNA repair protein RecN  34.41 
 
 		 556 aa  296  7e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.284551 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3602  DNA repair protein RecN  32.62 
 
 		 557 aa  295  2e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00779581 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3096  DNA repair protein RecN  33.03 
 
 		 574 aa  295  2e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.155422 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1026  recombination and repair protein  33.75 
 
 		 554 aa  294  4e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4730  DNA repair protein RecN  34.18 
 
 		 557 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.46357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3096  DNA repair protein RecN  32.31 
 
 		 557 aa  291  3e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0703  DNA repair protein RecN  34.54 
 
 		 557 aa  290  4e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.926549  hitchhiker  0.000359109 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4729  DNA repair protein RecN  34.54 
 
 		 557 aa  289  7e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00366375 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4595  DNA repair protein RecN  34.54 
 
 		 557 aa  289  1e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.202375 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1599  DNA repair ATPase  32.79 
 
 		 555 aa  287  4e-76  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4197  DNA repair protein RecN  33.21 
 
 		 557 aa  286  5.999999999999999e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.312426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4284  DNA repair protein RecN  33.57 
 
 		 579 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0425411  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42990  DNA repair protein RecN  33.57 
 
 		 557 aa  284  2.0000000000000002e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0950  DNA repair protein RecN  33.57 
 
 		 579 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0157368  hitchhiker  0.0000335441 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0866  DNA repair protein RecN  34 
 
 		 555 aa  284  4.0000000000000003e-75  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1179  DNA repair and genetic recombination protein  33.94 
 
 		 556 aa  283  4.0000000000000003e-75  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4507  DNA repair protein RecN  32.67 
 
 		 557 aa  283  7.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2867  DNA repair protein RecN  33.92 
 
 		 579 aa  283  7.000000000000001e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4304  DNA repair protein RecN  33.39 
 
 		 579 aa  283  7.000000000000001e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000470862  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4026  DNA repair protein RecN  33.98 
 
 		 579 aa  282  1e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0028037  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1544  DNA repair protein RecN  35.18 
 
 		 566 aa  282  1e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4246  DNA repair protein RecN  33.27 
 
 		 583 aa  281  2e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00786878  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3916  DNA repair protein  33.27 
 
 		 579 aa  281  2e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000027559  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3927  DNA repair protein  33.27 
 
 		 583 aa  281  2e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0317713  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3626  DNA repair protein RecN  34.05 
 
 		 558 aa  281  2e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4194  DNA repair protein RecN  33.27 
 
 		 579 aa  280  4e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.9666000000000002e-33 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0596  DNA repair protein RecN  32.98 
 
 		 572 aa  280  4e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4078  DNA repair protein RecN  33.27 
 
 		 579 aa  280  5e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4397  DNA repair protein RecN  33.27 
 
 		 579 aa  280  5e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000441756  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1763  DNA repair protein RecN  33.33 
 
 		 560 aa  280  5e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137867  normal  0.0495571 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1080  DNA repair protein RecN  33.39 
 
 		 558 aa  278  2e-73  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0701  DNA repair protein RecN  34.55 
 
 		 567 aa  277  3e-73  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0761  DNA repair protein RecN  34.47 
 
 		 557 aa  277  4e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.345087  normal  0.395212 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1783  DNA repair protein RecN  33.45 
 
 		 565 aa  277  4e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3364  DNA repair protein RecN  32.21 
 
 		 559 aa  277  4e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.276138  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2739  DNA repair protein recN  31.36 
 
 		 555 aa  276  7e-73  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2735  alkylhydroperoxidase AhpD core  32.67 
 
 		 557 aa  275  1.0000000000000001e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0271976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2069  DNA repair protein RecN  33.27 
 
 		 565 aa  275  1.0000000000000001e-72  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0594  DNA repair protein RecN  32.68 
 
 		 569 aa  275  2.0000000000000002e-72  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0859323 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1480  DNA repair protein RecN  32.36 
 
 		 556 aa  275  2.0000000000000002e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.269893  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1170  recombination and repair protein  32.86 
 
 		 552 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0260908 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1104  recombination and repair protein  32.86 
 
 		 552 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.239344  normal  0.154382 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2877  DNA repair protein recN  31 
 
 		 555 aa  274  3e-72  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2579  DNA repair protein RecN  34.53 
 
 		 562 aa  274  3e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.183283 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0930  ATPase for DNA repair  34.29 
 
 		 555 aa  274  3e-72  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1104  recombination and repair protein  32.86 
 
 		 552 aa  274  4.0000000000000004e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.562592 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1191  DNA repair protein RecN  30.32 
 
 		 559 aa  273  6e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0968  DNA repair protein RecN  32.26 
 
 		 567 aa  273  8.000000000000001e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.858596  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0814  DNA repair protein RecN  33.74 
 
 		 570 aa  272  1e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1749  DNA repair protein RecN  33.16 
 
 		 574 aa  272  1e-71  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3462  recombination and repair protein  32.37 
 
 		 552 aa  271  2e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0378  recombination and repair protein  31.49 
 
 		 554 aa  271  2e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.116911  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0907  DNA repair protein RecN  31.17 
 
 		 549 aa  270  4e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.933799  normal  0.849345 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1611  DNA repair protein RecN  33.39 
 
 		 559 aa  270  5e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000188364  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1578  DNA repair protein RecN  33.39 
 
 		 559 aa  270  5e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1281  recombination and repair protein  32.07 
 
 		 553 aa  268  1e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000117137 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1034  DNA repair protein RecN  30.46 
 
 		 576 aa  269  1e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0651  DNA repair protein  32.09 
 
 		 559 aa  269  1e-70  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1691  DNA repair protein RecN  31.4 
 
 		 557 aa  268  1e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.893605  hitchhiker  0.00244544 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2064  DNA repair protein RecN  31.77 
 
 		 558 aa  268  2e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.488529  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1774  DNA repair protein RecN  30.89 
 
 		 556 aa  268  2e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1043  recombination and repair protein  31.88 
 
 		 552 aa  268  2e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1666  DNA repair protein RecN  31.75 
 
 		 577 aa  267  2.9999999999999995e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1475  DNA repair protein RecN  30.51 
 
 		 554 aa  267  4e-70  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.460183  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1196  recombination and repair protein  31.46 
 
 		 553 aa  265  1e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2771  recombination and repair protein  31.32 
 
 		 552 aa  265  1e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.170925  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1218  recombination and repair protein  31.35 
 
 		 552 aa  265  2e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.187963  normal  0.0934404 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3296  recombination and repair protein  31.35 
 
 		 552 aa  265  2e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.182341  decreased coverage  0.000158665 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3153  recombination and repair protein  31.35 
 
 		 552 aa  265  2e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000145597  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3151  recombination and repair protein  31.35 
 
 		 552 aa  265  2e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0961248  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1169  recombination and repair protein  32.07 
 
 		 553 aa  264  3e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0576  DNA repair protein RecN  33.1 
 
 		 568 aa  264  3e-69  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0877  DNA repair protein RecN  31.22 
 
 		 552 aa  264  4e-69  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0942  DNA repair protein RecN  30.91 
 
 		 554 aa  263  4.999999999999999e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2706  DNA repair protein RecN  32.97 
 
 		 552 aa  263  4.999999999999999e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1769  DNA repair protein RecN  29.98 
 
 		 557 aa  263  6e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2516  DNA repair protein RecN  31.34 
 
 		 572 aa  262  1e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2316  DNA repair protein RecN  33.1 
 
 		 573 aa  261  2e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0832  DNA repair protein RecN  30.32 
 
 		 554 aa  261  2e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.013795  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3831  DNA repair protein RecN  30.18 
 
 		 549 aa  261  2e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1047  DNA repair protein RecN  31.56 
 
 		 580 aa  261  2e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.266577  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3359  recombination and repair protein  32.43 
 
 		 553 aa  261  2e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0341558 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0259  DNA repair protein RecN  30 
 
 		 549 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.255628  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0713  DNA repair protein RecN  30 
 
 		 549 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.685992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0743  DNA repair protein RecN  30 
 
 		 549 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.259434  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0501  DNA repair protein RecN  31.95 
 
 		 552 aa  260  4e-68  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.424659  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0623  DNA repair protein RecN  32.8 
 
 		 568 aa  260  4e-68  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.72171  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01130  recombination and repair protein  32.39 
 
 		 554 aa  260  5.0000000000000005e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>