More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1027 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_1027  DNA repair protein RecN  100 
 
 		 562 aa  1102    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06570  DNA repair protein RecN  36.41 
 
 		 565 aa  328  1.0000000000000001e-88  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000129264  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1783  DNA repair protein RecN  37.26 
 
 		 565 aa  323  4e-87  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2316  DNA repair protein RecN  34.65 
 
 		 573 aa  320  6e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2069  DNA repair protein RecN  36.67 
 
 		 565 aa  318  1e-85  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1544  DNA repair protein RecN  36.91 
 
 		 566 aa  318  1e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1896  DNA repair protein RecN  35.19 
 
 		 567 aa  312  7.999999999999999e-84  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000247727  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1178  DNA repair protein RecN  32.93 
 
 		 559 aa  311  2e-83  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000946399  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4284  DNA repair protein RecN  34.02 
 
 		 579 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0425411  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0950  DNA repair protein RecN  34.02 
 
 		 579 aa  306  9.000000000000001e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0157368  hitchhiker  0.0000335441 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4026  DNA repair protein RecN  33.68 
 
 		 579 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0028037  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4304  DNA repair protein RecN  33.96 
 
 		 579 aa  305  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000470862  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0942  DNA repair protein RecN  32.14 
 
 		 554 aa  304  3.0000000000000004e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4194  DNA repair protein RecN  33.68 
 
 		 579 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.9666000000000002e-33 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3927  DNA repair protein  33.51 
 
 		 583 aa  303  7.000000000000001e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0317713  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0254  DNA repair protein RecN  32.18 
 
 		 573 aa  303  8.000000000000001e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4246  DNA repair protein RecN  33.79 
 
 		 583 aa  302  9e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00786878  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3916  DNA repair protein  33.68 
 
 		 579 aa  302  9e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000027559  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4078  DNA repair protein RecN  33.51 
 
 		 579 aa  302  1e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1691  DNA repair protein RecN  37.01 
 
 		 557 aa  301  1e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.893605  hitchhiker  0.00244544 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4397  DNA repair protein RecN  33.51 
 
 		 579 aa  302  1e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000441756  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2499  DNA repair protein RecN  35.45 
 
 		 561 aa  301  2e-80  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0814  DNA repair protein RecN  34.94 
 
 		 570 aa  301  2e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0756  DNA repair ATPase  33.57 
 
 		 562 aa  301  2e-80  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000000414406  hitchhiker  0.0000280252 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2867  DNA repair protein RecN  33.16 
 
 		 579 aa  295  1e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2064  DNA repair protein RecN  31.66 
 
 		 558 aa  294  2e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.488529  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0930  ATPase for DNA repair  32.85 
 
 		 555 aa  291  2e-77  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1599  DNA repair ATPase  31.69 
 
 		 555 aa  291  2e-77  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2627  DNA repair protein RecN  34.41 
 
 		 574 aa  287  4e-76  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.434189  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0587  DNA repair and genetic recombination protein  31.79 
 
 		 560 aa  282  1e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1773  DNA repair protein RecN  31.62 
 
 		 553 aa  281  3e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000824865 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3483  DNA repair protein RecN  31.09 
 
 		 555 aa  280  7e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1666  DNA repair protein RecN  32.09 
 
 		 577 aa  278  1e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1335  DNA repair protein RecN  34.88 
 
 		 551 aa  279  1e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1578  DNA repair protein RecN  32.69 
 
 		 556 aa  278  2e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1707  DNA repair protein RecN  30.71 
 
 		 553 aa  277  3e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1507  DNA repair protein RecN  31.36 
 
 		 558 aa  276  6e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0354  DNA repair protein RecN  37.75 
 
 		 542 aa  276  8e-73  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1301  DNA repair protein RecN  32.8 
 
 		 561 aa  275  1.0000000000000001e-72  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3647  DNA repair protein RecN  30.42 
 
 		 575 aa  275  1.0000000000000001e-72  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2706  DNA repair protein RecN  34.69 
 
 		 552 aa  274  3e-72  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2236  DNA repair protein RecN  29.72 
 
 		 582 aa  273  8.000000000000001e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.48735  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0501  DNA repair protein RecN  34.57 
 
 		 552 aa  272  1e-71  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.424659  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2444  DNA repair protein RecN  31.56 
 
 		 553 aa  270  5e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0113802  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0998  DNA repair protein RecN  28.55 
 
 		 589 aa  270  5.9999999999999995e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.553113 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1179  DNA repair and genetic recombination protein  33.04 
 
 		 556 aa  270  5.9999999999999995e-71  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1763  DNA repair protein RecN  28.09 
 
 		 560 aa  270  5.9999999999999995e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137867  normal  0.0495571 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1047  DNA repair protein RecN  31.2 
 
 		 580 aa  268  1e-70  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.266577  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2472  DNA repair protein RecN  27.26 
 
 		 605 aa  268  2e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.400775 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2739  DNA repair protein recN  28.98 
 
 		 555 aa  268  2e-70  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1084  DNA repair protein RecN  30.55 
 
 		 565 aa  268  2e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000955113  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3364  DNA repair protein RecN  28.9 
 
 		 559 aa  267  2.9999999999999995e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.276138  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0370  DNA repair protein RecN  30.14 
 
 		 578 aa  266  1e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.431573  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0596  DNA repair protein RecN  30.99 
 
 		 572 aa  265  1e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2171  DNA repair protein RecN  26.1 
 
 		 575 aa  263  4.999999999999999e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00879264  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1126  DNA repair protein RecN  26.99 
 
 		 577 aa  263  6.999999999999999e-69  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5483  DNA repair protein RecN  28.85 
 
 		 558 aa  262  1e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.582199  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1196  recombination and repair protein  29.7 
 
 		 553 aa  262  1e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2482  DNA repair protein RecN  28.05 
 
 		 568 aa  262  1e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1043  recombination and repair protein  30.8 
 
 		 552 aa  262  1e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2888  DNA repair protein RecN  28.05 
 
 		 568 aa  261  3e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2877  DNA repair protein recN  28.98 
 
 		 555 aa  261  4e-68  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1779  DNA repair protein RecN  27.96 
 
 		 581 aa  260  4e-68  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.666721 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1517  DNA repair protein RecN  27.37 
 
 		 579 aa  260  5.0000000000000005e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000776355 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0775  DNA repair protein RecN  28.88 
 
 		 552 aa  260  5.0000000000000005e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000179189 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63010  DNA repair protein RecN  29.02 
 
 		 558 aa  260  6e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2651  DNA repair protein  27.91 
 
 		 569 aa  259  7e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.829393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1026  recombination and repair protein  28.88 
 
 		 554 aa  259  7e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3825  DNA repair protein RecN  30.63 
 
 		 561 aa  259  1e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.321139  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3118  DNA repair protein RecN  32.08 
 
 		 586 aa  258  1e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2579  DNA repair protein RecN  29.79 
 
 		 562 aa  258  2e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.183283 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1446  DNA repair protein RecN  29.57 
 
 		 556 aa  258  3e-67  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000211173  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1578  DNA repair protein RecN  30.4 
 
 		 559 aa  257  3e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1611  DNA repair protein RecN  30.4 
 
 		 559 aa  257  3e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000188364  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1274  DNA repair protein RecN  26.84 
 
 		 595 aa  257  4e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2032  DNA repair protein RecN  27.19 
 
 		 567 aa  256  5e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1034  DNA repair protein RecN  28.1 
 
 		 576 aa  256  6e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3462  recombination and repair protein  29.75 
 
 		 552 aa  256  7e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1385  DNA repair protein  29.57 
 
 		 608 aa  256  7e-67  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0276871  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0361  DNA repair protein RecN  28.28 
 
 		 601 aa  255  1.0000000000000001e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00213355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3397  DNA repair protein RecN  28.83 
 
 		 586 aa  255  1.0000000000000001e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00306133  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1151  recombination and repair protein  30.51 
 
 		 554 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.901201  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3151  recombination and repair protein  30 
 
 		 552 aa  254  4.0000000000000004e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0961248  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1218  recombination and repair protein  30 
 
 		 552 aa  254  4.0000000000000004e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.187963  normal  0.0934404 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3296  recombination and repair protein  30 
 
 		 552 aa  254  4.0000000000000004e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.182341  decreased coverage  0.000158665 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3153  recombination and repair protein  30 
 
 		 552 aa  254  4.0000000000000004e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000145597  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1518  DNA repair protein RecN  27.87 
 
 		 579 aa  253  6e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.301856  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1774  DNA repair protein RecN  28.01 
 
 		 556 aa  253  8.000000000000001e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3096  DNA repair protein RecN  27.22 
 
 		 557 aa  253  9.000000000000001e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1301  DNA repair protein RecN  27.85 
 
 		 547 aa  252  1e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.549514 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1170  recombination and repair protein  29.38 
 
 		 552 aa  252  1e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0260908 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1169  recombination and repair protein  30 
 
 		 553 aa  252  1e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1104  recombination and repair protein  29.56 
 
 		 552 aa  252  1e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.239344  normal  0.154382 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2771  recombination and repair protein  29.65 
 
 		 552 aa  252  1e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.170925  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2421  DNA repair protein RecN  29.41 
 
 		 563 aa  251  2e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.955613  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5421  DNA repair protein RecN  27.06 
 
 		 591 aa  252  2e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1104  recombination and repair protein  29.38 
 
 		 552 aa  251  2e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.562592 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0651  DNA repair protein  29.57 
 
 		 559 aa  251  3e-65  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3489  DNA repair protein RecN  27.66 
 
 		 567 aa  251  3e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000536624 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1281  recombination and repair protein  30.66 
 
 		 553 aa  250  4e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000117137 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>