74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1890 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_1890  hypothetical protein  100 
 
 
389 aa  798    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0931  hypothetical protein  47.34 
 
 
385 aa  316  4e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4080  hypothetical protein  45.19 
 
 
397 aa  309  5e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.827014 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2264  hypothetical protein  45.41 
 
 
385 aa  266  5e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  unclonable  0.000000152095  unclonable  0.0000000148287 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2181  SMC domain-containing protein  25.8 
 
 
380 aa  95.5  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2311  SMC domain protein  27.32 
 
 
397 aa  86.7  7e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2968  SMC domain protein  27.46 
 
 
393 aa  83.2  0.000000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0204  hypothetical protein  27.11 
 
 
394 aa  79  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0053  SMC domain protein  27.98 
 
 
397 aa  73.9  0.000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03536  hypothetical protein  26.49 
 
 
398 aa  72.4  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2706  hypothetical protein  24.33 
 
 
395 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3397  hypothetical protein  24.57 
 
 
395 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213945  normal  0.39672 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1846  ATPase-like protein  25.43 
 
 
409 aa  71.2  0.00000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.207391  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3822  hypothetical protein  24.04 
 
 
370 aa  70.5  0.00000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0324063 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4237  hypothetical protein  24.04 
 
 
370 aa  69.7  0.00000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.120446  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4170  hypothetical protein  25.42 
 
 
399 aa  69.7  0.00000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1754  hypothetical protein  26.3 
 
 
405 aa  69.7  0.00000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3220  SMC domain-containing protein  24.88 
 
 
394 aa  68.9  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0007  ATPase  25.58 
 
 
411 aa  68.6  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2794  SMC domain-containing protein  24.17 
 
 
378 aa  67.4  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000199417  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1577  hypothetical protein  23.69 
 
 
377 aa  67.4  0.0000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113684  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1486  ATPase-like protein  23.62 
 
 
382 aa  66.2  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1460  ABC transport protein, ATP-binding subunit  23.62 
 
 
382 aa  66.2  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0013  RecF/RecN/SMC domain protein  23.89 
 
 
362 aa  66.6  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4613  SMC domain protein  22.96 
 
 
378 aa  65.1  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0833889 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1080  hypothetical protein  24.07 
 
 
369 aa  63.9  0.000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.629407  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0112  hypothetical protein  23.06 
 
 
430 aa  63.5  0.000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0103  SMC domain protein  26.04 
 
 
395 aa  63.2  0.000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000482249  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2545  ATPase-like  24.8 
 
 
419 aa  61.2  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000977998  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2033  ATPase  26.26 
 
 
399 aa  60.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0620  SMC domain protein  24.17 
 
 
367 aa  60.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0636  SMC domain protein  24.17 
 
 
367 aa  60.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.696374  normal  0.340192 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0278  ABC transport protein, ATP-binding subunit  22.83 
 
 
382 aa  60.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0275531 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02963  hypothetical protein  26.29 
 
 
376 aa  59.7  0.00000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2613  SMC domain protein  23.31 
 
 
369 aa  58.5  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5825  SMC domain protein  23.64 
 
 
369 aa  57.8  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.408353 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4241  hypothetical protein  21.68 
 
 
364 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.136282  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0310  SMC domain protein  36.05 
 
 
412 aa  57  0.0000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3622  SMC domain protein  22.31 
 
 
363 aa  56.2  0.0000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0421  hypothetical protein  21.74 
 
 
368 aa  56.2  0.0000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2512  hypothetical protein  22.84 
 
 
378 aa  55.1  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.504364  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1288  SMC domain protein  24.13 
 
 
417 aa  55.5  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0947514  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3499  SMC domain protein  22.16 
 
 
363 aa  55.1  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0507  hypothetical protein  22.22 
 
 
373 aa  54.7  0.000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7563  ATPase-like protein  24.4 
 
 
409 aa  54.3  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3070  SMC domain-containing protein  22.43 
 
 
365 aa  53.9  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.270072 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0307  SMC domain protein  35.71 
 
 
448 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1302  ATPase-like  23.66 
 
 
419 aa  52.8  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000145655  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1966  hypothetical protein  25.13 
 
 
424 aa  52.8  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0307  SMC domain protein  34.52 
 
 
448 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.675796  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0197  ATPase-like protein  24.07 
 
 
367 aa  50.8  0.00004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.875501  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0229  hypothetical protein  28.78 
 
 
386 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.745812  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1514  ATPase-like protein  27.88 
 
 
131 aa  50.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3708  ATPase-like protein  21.24 
 
 
364 aa  48.5  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1226  hypothetical protein  22.57 
 
 
384 aa  48.1  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0490  hypothetical protein  38.78 
 
 
416 aa  48.1  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8073  ATPase-like protein  38.71 
 
 
362 aa  47.4  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0562  hypothetical protein  25.68 
 
 
370 aa  47.4  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.260913  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0765  hypothetical protein  34.41 
 
 
365 aa  47  0.0007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.63543  normal  0.572705 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0343  hypothetical protein  22.8 
 
 
385 aa  46.2  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.261126 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2912  SMC protein-like  35.29 
 
 
418 aa  45.1  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.492401  normal  0.0605125 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2755  hypothetical protein  24.26 
 
 
370 aa  45.1  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0135345  normal  0.421403 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4093  SMC domain protein  45.83 
 
 
454 aa  45.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.136453  normal  0.0462835 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1541  hypothetical protein  27.88 
 
 
131 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0141757 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3194  ATPase-like protein  43.48 
 
 
387 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.794504  normal  0.0937144 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2001  SMC domain-containing protein  41.77 
 
 
387 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.433742  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2525  hypothetical protein  43.48 
 
 
387 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.125523  normal  0.711801 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3858  ABC transporter related  28.06 
 
 
348 aa  43.9  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.228867 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5488  putative nucleoside triphosphate hydrolase domain-containing protein  36.73 
 
 
598 aa  43.9  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3552  hypothetical protein  32.05 
 
 
416 aa  43.5  0.006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2281  ATPase  25 
 
 
390 aa  43.1  0.008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3600  ATPase-like protein  22.07 
 
 
416 aa  43.1  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.960092 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4153  SMC domain-containing protein  26.88 
 
 
574 aa  42.7  0.01  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0910063 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  46.81 
 
 
1185 aa  42.7  0.01  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>