97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_4080 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_4080  hypothetical protein  100 
 
 		 397 aa  807    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.827014 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2264  hypothetical protein  54.78 
 
 		 385 aa  380  1e-104  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  unclonable  0.000000152095  unclonable  0.0000000148287 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1890  hypothetical protein  45.19 
 
 		 389 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0931  hypothetical protein  45.66 
 
 		 385 aa  311  2e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1846  ATPase-like protein  25.8 
 
 		 409 aa  85.5  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.207391  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2311  SMC domain protein  26.56 
 
 		 397 aa  84.7  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2181  SMC domain-containing protein  26.65 
 
 		 380 aa  82  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0007  ATPase  26.83 
 
 		 411 aa  72.4  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1486  ATPase-like protein  25.98 
 
 		 382 aa  69.7  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1460  ABC transport protein, ATP-binding subunit  25.98 
 
 		 382 aa  69.7  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2613  SMC domain protein  22.25 
 
 		 369 aa  64.7  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5825  SMC domain protein  23.45 
 
 		 369 aa  63.5  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.408353 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0310  SMC domain protein  45.31 
 
 		 412 aa  61.6  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2033  ATPase  25.47 
 
 		 399 aa  61.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1754  hypothetical protein  26.74 
 
 		 405 aa  59.3  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0307  SMC domain protein  45.16 
 
 		 448 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0307  SMC domain protein  43.55 
 
 		 448 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.675796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0013  RecF/RecN/SMC domain protein  23.2 
 
 		 362 aa  58.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2545  ATPase-like  23.68 
 
 		 419 aa  57.4  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000977998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0278  ABC transport protein, ATP-binding subunit  21.92 
 
 		 382 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0275531 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3645  SMC domain protein  32.46 
 
 		 386 aa  55.1  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1302  ATPase-like  24 
 
 		 419 aa  54.7  0.000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000145655  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1883  hypothetical protein  20.92 
 
 		 369 aa  54.7  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0636  SMC domain protein  20.58 
 
 		 367 aa  54.3  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.696374  normal  0.340192 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0620  SMC domain protein  20.58 
 
 		 367 aa  54.3  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0592  hypothetical protein  27.06 
 
 		 361 aa  53.5  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3220  SMC domain-containing protein  24.55 
 
 		 394 aa  53.1  0.000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0103  SMC domain protein  36.67 
 
 		 395 aa  51.2  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000482249  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3749  hypothetical protein  27.89 
 
 		 394 aa  49.7  0.00008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0004  recombination protein F  26.67 
 
 		 375 aa  49.7  0.00009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00277064  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2706  hypothetical protein  32.58 
 
 		 395 aa  49.7  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0004  recombination protein F  26.67 
 
 		 375 aa  49.7  0.00009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0004  recombination protein F  26.67 
 
 		 375 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.864622  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2001  SMC domain-containing protein  40.59 
 
 		 387 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.433742  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0004  recombination protein F  26.67 
 
 		 375 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000104808  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5316  recombination protein F  26.67 
 
 		 375 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0155044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0004  recombination protein F  26.67 
 
 		 375 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.340003 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0004  recombination protein F  26.67 
 
 		 375 aa  49.7  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0004  recombination protein F  26.67 
 
 		 375 aa  49.7  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0004  recombination protein F  26.67 
 
 		 375 aa  49.7  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1235  SMC domain-containing protein  36 
 
 		 359 aa  48.5  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3397  hypothetical protein  32.58 
 
 		 395 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213945  normal  0.39672 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4241  hypothetical protein  23.3 
 
 		 364 aa  48.5  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.136282  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1966  hypothetical protein  27.04 
 
 		 424 aa  48.5  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0849  hypothetical protein  36.23 
 
 		 410 aa  48.9  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0053  SMC domain protein  36.76 
 
 		 397 aa  48.1  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5526  hypothetical protein  23.83 
 
 		 384 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.768664  normal  0.0253524 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0004  recombination protein F  25.56 
 
 		 375 aa  47.8  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0004  recombination protein F  26.67 
 
 		 373 aa  47.8  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.177605  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0843  hypothetical protein  36.92 
 
 		 393 aa  47.4  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0588  hypothetical protein  24.61 
 
 		 397 aa  47.4  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.84533  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7563  ATPase-like protein  35.94 
 
 		 409 aa  47  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4613  SMC domain protein  21.08 
 
 		 378 aa  47  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0833889 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2026  hypothetical protein  22.16 
 
 		 367 aa  46.6  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2525  hypothetical protein  40.48 
 
 		 387 aa  46.6  0.0008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.125523  normal  0.711801 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1320  SMC domain protein  42.22 
 
 		 422 aa  46.6  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0883509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2512  hypothetical protein  28.89 
 
 		 378 aa  46.6  0.0008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.504364  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0490  hypothetical protein  34.21 
 
 		 416 aa  46.6  0.0008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3194  ATPase-like protein  40.48 
 
 		 387 aa  46.6  0.0008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.794504  normal  0.0937144 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4237  hypothetical protein  22.16 
 
 		 370 aa  46.2  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.120446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3822  hypothetical protein  20.29 
 
 		 370 aa  45.8  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0324063 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0833  hypothetical protein  35.87 
 
 		 390 aa  45.8  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3499  SMC domain protein  19.19 
 
 		 363 aa  46.2  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2161  hypothetical protein  35.92 
 
 		 392 aa  45.4  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.587323  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1080  hypothetical protein  20.22 
 
 		 369 aa  45.1  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.629407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02963  hypothetical protein  24.08 
 
 		 376 aa  45.1  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4680  hypothetical protein  43.14 
 
 		 458 aa  45.1  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.105377  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2561  ATP-dependent endonuclease  42.86 
 
 		 613 aa  45.1  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0763392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2968  SMC domain protein  31.67 
 
 		 393 aa  44.7  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2704  hypothetical protein  24.37 
 
 		 581 aa  44.7  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00140481  normal  0.0421451 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3792  hypothetical protein  34.78 
 
 		 390 aa  44.7  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2436  DNA replication and repair protein RecF  27.84 
 
 		 398 aa  44.7  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.532549  normal  0.0198697 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5488  putative nucleoside triphosphate hydrolase domain-containing protein  42.86 
 
 		 598 aa  44.7  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8073  ATPase-like protein  32.08 
 
 		 362 aa  44.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1811  hypothetical protein  39.51 
 
 		 390 aa  44.3  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.93186  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3134  hypothetical protein  34.78 
 
 		 390 aa  44.3  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0805  hypothetical protein  34.78 
 
 		 390 aa  44.3  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1858  hypothetical protein  39.51 
 
 		 390 aa  44.3  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.111795 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4170  hypothetical protein  29.57 
 
 		 399 aa  43.9  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03536  hypothetical protein  30.09 
 
 		 398 aa  43.9  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0507  hypothetical protein  31.08 
 
 		 373 aa  43.9  0.005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30705  predicted protein  28.3 
 
 		 1225 aa  43.9  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.830885  normal  0.342415 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3622  SMC domain protein  18.43 
 
 		 363 aa  43.5  0.006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0003  recombination protein F  36.51 
 
 		 379 aa  43.5  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0197  ATPase-like protein  22.34 
 
 		 367 aa  43.5  0.006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.875501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0794  ATP-dependent OLD family endonuclease  32 
 
 		 647 aa  43.5  0.006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0005  recombination protein F  25.88 
 
 		 377 aa  43.5  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.000288317  hitchhiker  0.00404548 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7103  ABC transporter related  35.23 
 
 		 305 aa  43.5  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.798057  normal  0.375982 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0004  recombination protein F  27.06 
 
 		 376 aa  43.1  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.366352  unclonable  0.0000000175389 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2214  DNA replication and repair protein RecF  27.17 
 
 		 394 aa  43.5  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00444262 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1362  DNA replication and repair protein RecF  38.18 
 
 		 339 aa  43.5  0.007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4093  SMC domain protein  37.5 
 
 		 454 aa  43.1  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.136453  normal  0.0462835 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0004  recombination protein F  41.3 
 
 		 374 aa  43.1  0.008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.60396e-25 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0229  hypothetical protein  35.38 
 
 		 386 aa  43.1  0.009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.745812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0311  recombination protein F  40.98 
 
 		 374 aa  43.1  0.009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.406883  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0003  recombination protein F  35.29 
 
 		 391 aa  43.1  0.009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.671854  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2912  SMC protein-like  34.69 
 
 		 418 aa  43.1  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.492401  normal  0.0605125 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>