20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1988 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1988  hypothetical protein  100 
 
 		 347 aa  705    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0924  hypothetical protein  71.76 
 
 		 347 aa  543  1e-153  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.281728 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0895  hypothetical protein  73.78 
 
 		 347 aa  543  1e-153  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.295883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1615  hypothetical protein  66.86 
 
 		 347 aa  477  1e-133  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.273235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0051  hypothetical protein  37.46 
 
 		 343 aa  231  1e-59  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.118613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1691  SMC domain protein  36.84 
 
 		 378 aa  50.4  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.611613 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0279  hypothetical protein  50 
 
 		 278 aa  50.1  0.00006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1819  SMC domain-containing protein  48.28 
 
 		 702 aa  49.3  0.00009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.000524613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3408  putative ATP-dependent endonuclease (OLD family protein)  35.71 
 
 		 363 aa  48.1  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0529287 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1027  hypothetical protein  22.38 
 
 		 374 aa  48.1  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0995  hypothetical protein  20.77 
 
 		 345 aa  47.4  0.0004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.488601 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0302  SMC domain-containing protein  44.44 
 
 		 702 aa  45.1  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0764  hypothetical protein  39.02 
 
 		 371 aa  45.1  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5825  SMC domain protein  36.36 
 
 		 369 aa  44.3  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.408353 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1106  hypothetical protein  43.9 
 
 		 372 aa  43.5  0.005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0316487  hitchhiker  0.000249477 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0356  SMC domain-containing protein  42.59 
 
 		 700 aa  43.1  0.006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0545  ATP-dependent OLD family endonuclease  38.64 
 
 		 615 aa  43.1  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01780  hypothetical protein  34.78 
 
 		 378 aa  43.1  0.007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0985  SMC domain-containing protein  45.65 
 
 		 702 aa  43.1  0.007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000497741 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0269  hypothetical protein  46.81 
 
 		 423 aa  42.7  0.01  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>