66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_1471 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_1471  ATPase-like protein  100 
 
 
368 aa  752    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1106  hypothetical protein  32.24 
 
 
372 aa  86.3  7e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0316487  hitchhiker  0.000249477 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1945  hypothetical protein  31.31 
 
 
374 aa  82.4  0.00000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.710745  hitchhiker  0.000000000000362051 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0344  hypothetical protein  32.24 
 
 
378 aa  79.7  0.00000000000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0229  hypothetical protein  34.88 
 
 
386 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.745812  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3073  ATPase  34.02 
 
 
388 aa  53.1  0.000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1577  hypothetical protein  30.17 
 
 
377 aa  53.1  0.000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113684  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2512  hypothetical protein  30.84 
 
 
378 aa  53.1  0.000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.504364  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2755  hypothetical protein  34.67 
 
 
370 aa  53.1  0.000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0135345  normal  0.421403 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3749  hypothetical protein  35.78 
 
 
394 aa  52.4  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1846  ATPase-like protein  30 
 
 
409 aa  52.8  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.207391  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2001  SMC domain-containing protein  37.8 
 
 
387 aa  52  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.433742  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0013  RecF/RecN/SMC domain protein  31.96 
 
 
362 aa  51.2  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0421  hypothetical protein  32.04 
 
 
368 aa  51.2  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1460  ABC transport protein, ATP-binding subunit  27.52 
 
 
382 aa  50.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3645  SMC domain protein  31.43 
 
 
386 aa  50.8  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1486  ATPase-like protein  27.52 
 
 
382 aa  50.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1775  endonuclease III  26.89 
 
 
357 aa  50.1  0.00006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.17856  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1098  hypothetical protein  35.87 
 
 
410 aa  48.5  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4347  hypothetical protein  29.73 
 
 
385 aa  48.9  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0794792  normal  0.0502044 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0805  hypothetical protein  34.34 
 
 
390 aa  47.8  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2525  hypothetical protein  36.36 
 
 
387 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.125523  normal  0.711801 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3578  hypothetical protein  34.34 
 
 
390 aa  47.8  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.916758  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3194  ATPase-like protein  36.36 
 
 
387 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.794504  normal  0.0937144 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0740  hypothetical protein  34.34 
 
 
390 aa  48.1  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4312  hypothetical protein  33.01 
 
 
388 aa  47.4  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3708  ATPase-like protein  38.71 
 
 
364 aa  47.4  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4241  hypothetical protein  31.19 
 
 
364 aa  47.4  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.136282  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3701  hypothetical protein  35.29 
 
 
390 aa  47.4  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.576161 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3134  hypothetical protein  34.34 
 
 
390 aa  47.4  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01780  hypothetical protein  36.49 
 
 
378 aa  47.4  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0849  hypothetical protein  34.21 
 
 
410 aa  47.4  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0843  hypothetical protein  35.53 
 
 
393 aa  47  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0833  hypothetical protein  34.34 
 
 
390 aa  47  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1016  SMC domain-containing protein  36.36 
 
 
386 aa  46.6  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0527217  normal  0.402685 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2161  hypothetical protein  30.19 
 
 
392 aa  46.6  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.587323  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3622  SMC domain protein  26.86 
 
 
363 aa  47  0.0006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3510  hypothetical protein  33.33 
 
 
390 aa  46.6  0.0007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.807476 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5526  hypothetical protein  31.43 
 
 
384 aa  46.6  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.768664  normal  0.0253524 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0278  ABC transport protein, ATP-binding subunit  34.33 
 
 
382 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0275531 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0197  ATPase-like protein  31.76 
 
 
367 aa  46.2  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.875501  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3792  hypothetical protein  35.05 
 
 
390 aa  46.2  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2794  SMC domain-containing protein  32.18 
 
 
378 aa  45.8  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000199417  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3070  SMC domain-containing protein  28.57 
 
 
365 aa  45.1  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.270072 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0146  ATPase-like  32.35 
 
 
226 aa  44.7  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2281  ATPase  33.33 
 
 
390 aa  45.4  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0310  SMC domain protein  21.33 
 
 
412 aa  44.7  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0562  hypothetical protein  36.36 
 
 
370 aa  45.4  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.260913  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5019  ATPase, RecF-like protein  32.05 
 
 
388 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3822  hypothetical protein  34.25 
 
 
370 aa  44.7  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0324063 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1824  ATPase-like protein  39.51 
 
 
391 aa  44.3  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.248078  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4237  hypothetical protein  34.25 
 
 
370 aa  44.7  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.120446  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2035  hypothetical protein  35.14 
 
 
388 aa  44.3  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.224754  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2314  hypothetical protein  37.88 
 
 
376 aa  43.9  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.198863 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1984  hypothetical protein  24.03 
 
 
566 aa  43.9  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.370866  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0820  hypothetical protein  32.89 
 
 
395 aa  43.5  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0765  hypothetical protein  28.97 
 
 
365 aa  43.5  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.63543  normal  0.572705 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1171  ATPase, RecF-like protein  26.73 
 
 
390 aa  43.1  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1691  SMC domain protein  34.85 
 
 
385 aa  43.5  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.253328  hitchhiker  0.000000699352 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4732  hypothetical protein  31.94 
 
 
387 aa  43.5  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1947  ATPase, RecF-like protein  35.14 
 
 
388 aa  43.1  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.942384  normal  0.334746 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54090  hypothetical protein  33.8 
 
 
387 aa  43.1  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1226  hypothetical protein  38.75 
 
 
384 aa  42.7  0.009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1027  hypothetical protein  23.91 
 
 
374 aa  42.7  0.009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0636  SMC domain protein  25.44 
 
 
367 aa  42.7  0.01  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.696374  normal  0.340192 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0620  SMC domain protein  25.44 
 
 
367 aa  42.7  0.01  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>