23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B2778 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011149  SeAg_B2778  hypothetical protein  100 
 
 
490 aa  1012    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.0000000000124034  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2294  hypothetical protein  32.23 
 
 
549 aa  258  2e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.646796  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2392  hypothetical protein  26.98 
 
 
486 aa  117  3e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0546417  hitchhiker  0.00518189 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5059  AAA ATPase  26.15 
 
 
518 aa  100  8e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.32918 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1750  ATPase  24.4 
 
 
515 aa  88.6  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.52576  normal  0.584982 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0145  hypothetical protein  28.39 
 
 
518 aa  81.6  0.00000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0155  AAA ATPase  24.43 
 
 
544 aa  78.2  0.0000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.754147  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1454  ATPase  26.67 
 
 
597 aa  63.9  0.000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0211  ATPase  28.37 
 
 
586 aa  63.5  0.000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0158049  hitchhiker  0.00000676149 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0843  ATPase  23.29 
 
 
602 aa  61.2  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000396112  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3178  putative ATP binding protein  22.4 
 
 
496 aa  61.2  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.033124  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0049  prophage Lp2 protein 4  22.66 
 
 
558 aa  53.1  0.00001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.19169  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2912  SMC protein-like  28 
 
 
418 aa  52  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.492401  normal  0.0605125 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1288  SMC domain protein  37.04 
 
 
417 aa  50.1  0.00009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0947514  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2545  ATPase-like  36.36 
 
 
419 aa  47.4  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000977998  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2057  putative ATPase  24.83 
 
 
341 aa  46.6  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1709  SMC domain protein  36.59 
 
 
584 aa  45.8  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000133048  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0257  ATPase  43.18 
 
 
403 aa  45.1  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.116042  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0472  AAA ATPase  36 
 
 
369 aa  44.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4235  ATPase-like protein  30.91 
 
 
187 aa  44.3  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.837298  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5503  AAA ATPase  40.91 
 
 
464 aa  43.9  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0328038  hitchhiker  0.00036536 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2248  recombination protein F  40.91 
 
 
377 aa  43.1  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5825  SMC domain protein  30.1 
 
 
369 aa  43.1  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.408353 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>