178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0144 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_0144  putative RecF protein  100 
 
 		 132 aa  271  2.0000000000000002e-72  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0013  RecF/RecN/SMC domain protein  30.43 
 
 		 362 aa  62.8  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1098  hypothetical protein  33.33 
 
 		 410 aa  62  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1577  hypothetical protein  31.82 
 
 		 377 aa  57.8  0.00000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0507  hypothetical protein  34.88 
 
 		 373 aa  56.2  0.0000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0620  SMC domain protein  37.88 
 
 		 367 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0636  SMC domain protein  37.88 
 
 		 367 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.696374  normal  0.340192 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3070  SMC domain-containing protein  39.71 
 
 		 365 aa  55.1  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.270072 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5526  hypothetical protein  29.41 
 
 		 384 aa  55.1  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.768664  normal  0.0253524 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1080  hypothetical protein  33.73 
 
 		 369 aa  54.3  0.0000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.629407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2161  hypothetical protein  35.82 
 
 		 392 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.587323  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1691  SMC domain protein  36.36 
 
 		 385 aa  53.9  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.253328  hitchhiker  0.000000699352 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0820  hypothetical protein  39.39 
 
 		 395 aa  53.5  0.0000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0843  hypothetical protein  39.39 
 
 		 393 aa  53.1  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0278  ABC transport protein, ATP-binding subunit  25.6 
 
 		 382 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0275531 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1811  hypothetical protein  27.93 
 
 		 390 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.93186  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1858  hypothetical protein  27.93 
 
 		 390 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.111795 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3073  ATPase  40.91 
 
 		 388 aa  52.4  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0833  hypothetical protein  37.88 
 
 		 390 aa  52  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0310  SMC domain protein  32.11 
 
 		 412 aa  51.6  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2974  hypothetical protein  35.21 
 
 		 393 aa  52  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00544047  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1792  hypothetical protein  27.93 
 
 		 390 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.118132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5019  ATPase, RecF-like protein  37.88 
 
 		 388 aa  51.6  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2434  hypothetical protein  34.33 
 
 		 392 aa  51.2  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.329765  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4347  hypothetical protein  37.88 
 
 		 385 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0794792  normal  0.0502044 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2274  hypothetical protein  34.33 
 
 		 392 aa  51.2  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.618217  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2313  hypothetical protein  34.33 
 
 		 392 aa  51.2  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.969478  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0849  hypothetical protein  37.88 
 
 		 410 aa  51.2  0.000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3134  hypothetical protein  36.36 
 
 		 390 aa  50.8  0.000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0805  hypothetical protein  36.36 
 
 		 390 aa  50.8  0.000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0343  hypothetical protein  31.58 
 
 		 385 aa  50.4  0.000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.261126 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1796  ATPase-like protein  35.94 
 
 		 391 aa  50.4  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1824  ATPase-like protein  35.94 
 
 		 391 aa  50.4  0.000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.248078  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0229  hypothetical protein  37.5 
 
 		 386 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.745812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5187  ATPase-like  35.94 
 
 		 391 aa  50.4  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.633614 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6192  ATPase-like  35.94 
 
 		 391 aa  50.4  0.000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1887  ATPase-like protein  35.94 
 
 		 391 aa  50.4  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1910  ATPase-like protein  35.94 
 
 		 391 aa  50.4  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00358131 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0592  hypothetical protein  27.85 
 
 		 361 aa  50.4  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1387  ATPase-like protein  34.38 
 
 		 392 aa  50.1  0.000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.365214  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3792  hypothetical protein  36.36 
 
 		 390 aa  50.1  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4241  hypothetical protein  30.68 
 
 		 364 aa  50.1  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.136282  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1947  ATPase, RecF-like protein  34.85 
 
 		 388 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.942384  normal  0.334746 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2525  hypothetical protein  37.88 
 
 		 387 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.125523  normal  0.711801 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1418  hypothetical protein  34.85 
 
 		 436 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.936146  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54090  hypothetical protein  33.33 
 
 		 387 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0421  hypothetical protein  33.78 
 
 		 368 aa  48.9  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1909  hypothetical protein  34.85 
 
 		 436 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3395  hypothetical protein  34.85 
 
 		 436 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0740  hypothetical protein  36.36 
 
 		 390 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1182  hypothetical protein  34.85 
 
 		 436 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3194  ATPase-like protein  37.88 
 
 		 387 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.794504  normal  0.0937144 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4732  hypothetical protein  33.33 
 
 		 387 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3578  hypothetical protein  36.36 
 
 		 390 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.916758  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3701  hypothetical protein  36.36 
 
 		 390 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.576161 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4848  ATP-dependent OLD family endonuclease  30 
 
 		 626 aa  49.3  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3510  hypothetical protein  36.36 
 
 		 390 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.807476 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2001  SMC domain-containing protein  37.88 
 
 		 387 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.433742  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4659  hypothetical protein  32.84 
 
 		 385 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.478904  normal  0.230813 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1460  ABC transport protein, ATP-binding subunit  25 
 
 		 382 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1486  ATPase-like protein  25 
 
 		 382 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2512  hypothetical protein  30 
 
 		 378 aa  47.4  0.00006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.504364  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2264  hypothetical protein  30.39 
 
 		 385 aa  47.8  0.00006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  unclonable  0.000000152095  unclonable  0.0000000148287 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4312  hypothetical protein  27.62 
 
 		 388 aa  47.8  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4641  ATP-dependent endonuclease  30.61 
 
 		 626 aa  47.4  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.01769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4613  SMC domain protein  33.33 
 
 		 378 aa  47  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0833889 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2281  ATPase  31.82 
 
 		 390 aa  47  0.00009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1230  SMC domain protein  34.21 
 
 		 386 aa  46.2  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.086198 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2255  ATPase, RecF-like  33.33 
 
 		 393 aa  46.6  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.225767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0257  hypothetical protein  44.19 
 
 		 159 aa  46.2  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00160125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0562  hypothetical protein  35.94 
 
 		 370 aa  46.2  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.260913  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1025  hypothetical protein  29.63 
 
 		 362 aa  45.8  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000305528 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3822  hypothetical protein  32.26 
 
 		 370 aa  45.4  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0324063 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2587  chromosome segregation protein SMC  36.84 
 
 		 1151 aa  45.4  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000427179 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2035  hypothetical protein  22.9 
 
 		 388 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.224754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4237  hypothetical protein  28.92 
 
 		 370 aa  46.2  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.120446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0163  chromosome segregation protein SMC  37.5 
 
 		 1150 aa  45.8  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47820  hypothetical protein  33.33 
 
 		 395 aa  46.2  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.088572  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2794  SMC domain-containing protein  26.96 
 
 		 378 aa  45.4  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000199417  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3749  hypothetical protein  40 
 
 		 394 aa  45.1  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2613  SMC domain protein  32.26 
 
 		 369 aa  44.7  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2755  hypothetical protein  33.33 
 
 		 370 aa  44.7  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0135345  normal  0.421403 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1016  SMC domain-containing protein  35.21 
 
 		 386 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0527217  normal  0.402685 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2931  hypothetical protein  25 
 
 		 382 aa  44.7  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0876  chromosome segregation protein SMC2  36.84 
 
 		 1151 aa  44.3  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.601564  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0204  hypothetical protein  28 
 
 		 394 aa  44.3  0.0005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4170  hypothetical protein  27.87 
 
 		 399 aa  44.7  0.0005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0004  recombination protein F  34.52 
 
 		 371 aa  44.3  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.106759  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0003  recombination protein F  40 
 
 		 373 aa  44.3  0.0005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7563  ATPase-like protein  36.62 
 
 		 409 aa  44.3  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3499  SMC domain protein  31.82 
 
 		 363 aa  44.3  0.0006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1171  ATPase, RecF-like protein  30.3 
 
 		 390 aa  44.3  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3622  SMC domain protein  31.82 
 
 		 363 aa  43.9  0.0007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5508  DNA replication and repair protein RecF  42.5 
 
 		 368 aa  43.9  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5825  SMC domain protein  39.62 
 
 		 369 aa  43.5  0.0009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.408353 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0003  DNA replication and repair protein RecF  43.48 
 
 		 358 aa  43.5  0.0009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0374  chromosome segregation protein SMC  35.53 
 
 		 1151 aa  43.5  0.0009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1418  chromosome segregation protein SMC  37.14 
 
 		 1181 aa  43.5  0.0009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0776  chromosome segregation SMC protein  35.29 
 
 		 1191 aa  43.5  0.0009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00198002  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7156  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (branched chain amino acid)  41.82 
 
 		 264 aa  43.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>