55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_1750 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_1750  SMC domain protein  100 
 
 		 445 aa  869    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.524117  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1391  SMC domain protein  37.21 
 
 		 526 aa  176  7e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.156144 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0944  SMC protein-like protein  25.1 
 
 		 483 aa  157  3e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.665094  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6288  DNA repair ATPase-like protein  38.36 
 
 		 644 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0357583  normal  0.430633 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7212  DNA repair ATPase-like protein  35.45 
 
 		 648 aa  89.7  8e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.236988  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1278  metallophosphoesterase  36.47 
 
 		 695 aa  87.8  3e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0961  SMC domain protein  22.85 
 
 		 891 aa  73.2  0.00000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000356641  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0586  SMC domain-containing protein  29.82 
 
 		 993 aa  68.9  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.594919  normal  0.0182683 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0237  SMC domain-containing protein  29.41 
 
 		 993 aa  68.6  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0769992  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1332  SMC domain-containing protein  29.24 
 
 		 993 aa  68.2  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0652  SMC domain-containing protein  26.47 
 
 		 1019 aa  61.2  0.00000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.105285  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0068  Rad50 zinc hook domain protein  22.83 
 
 		 864 aa  59.7  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.191393  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0748  SMC domain-containing protein  23.16 
 
 		 935 aa  57.4  0.0000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.874201  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0762  SMC domain-containing protein  23.77 
 
 		 858 aa  53.5  0.000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0108669  decreased coverage  0.00239369 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0939  SMC domain-containing protein  25.14 
 
 		 812 aa  51.6  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0924914  normal  0.567341 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1922  SMC domain protein  21.43 
 
 		 987 aa  50.1  0.00009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.664102 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23830  condensin subunit Smc  26.24 
 
 		 1213 aa  49.3  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4337  DNA repair protein RecN  40.58 
 
 		 559 aa  48.9  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0513473  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10940  condensin subunit Smc  27.01 
 
 		 1217 aa  48.1  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.638543  normal  0.192819 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2301  SMC domain protein  21.76 
 
 		 987 aa  48.1  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0832  DNA repair protein RecN  35.62 
 
 		 554 aa  47.8  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.013795  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4848  ATP-dependent OLD family endonuclease  27.78 
 
 		 626 aa  47.8  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0903  DNA repair protein RecN  35.62 
 
 		 554 aa  47.8  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0907  DNA repair protein RecN  33.8 
 
 		 549 aa  47  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.933799  normal  0.849345 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1811  SMC domain-containing protein  22.46 
 
 		 794 aa  47  0.0007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.305534 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01182  DNA repair protein RecN  36.23 
 
 		 554 aa  47  0.0007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.239665  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0711  SMC domain-containing protein  22.89 
 
 		 994 aa  46.6  0.0008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00173757  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0527  SMC domain-containing protein  30.06 
 
 		 784 aa  46.2  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1597  DNA repair protein RecN  36.76 
 
 		 553 aa  46.2  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0216  chromosome segregation protein SMC  23.53 
 
 		 1181 aa  45.8  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1462  chromosome segregation protein SMC  24.89 
 
 		 1186 aa  46.6  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0128703  normal  0.569809 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1052  DNA repair protein RecN  36.23 
 
 		 565 aa  46.2  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1159  chromosome segregation protein SMC  24.89 
 
 		 1203 aa  46.2  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1652  DNA repair protein RecN  34.29 
 
 		 558 aa  45.8  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2545  ATPase-like  50 
 
 		 419 aa  45.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000977998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1341  chromosome segregation protein SMC  23.71 
 
 		 1196 aa  45.4  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32662  predicted protein  22.73 
 
 		 1060 aa  45.8  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.429677 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2009  hypothetical protein  30.69 
 
 		 922 aa  45.8  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND03960  DNA repair-related protein, putative  23.17 
 
 		 1125 aa  44.7  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3273  condensin subunit Smc  24.55 
 
 		 1188 aa  45.1  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.739482  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1301  DNA repair protein RecN  32.86 
 
 		 547 aa  44.7  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.549514 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0655  condensin subunit Smc  24.43 
 
 		 1183 aa  44.7  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1245  SMC domain-containing protein  34.38 
 
 		 693 aa  44.3  0.004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1302  ATP-dependent OLD family endonuclease  32.31 
 
 		 634 aa  44.3  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.314426  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4641  ATP-dependent endonuclease  25.68 
 
 		 626 aa  43.9  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.01769  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0004  DNA replication and repair protein RecF  32.43 
 
 		 398 aa  43.9  0.006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2030  DNA repair protein RecN  36.51 
 
 		 551 aa  43.9  0.006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2051  SMC domain protein  43.14 
 
 		 1080 aa  43.9  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.380302  normal  0.930097 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2596  DNA repair protein RecN  36.11 
 
 		 537 aa  43.5  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_641  chromosome condensation and segregation protein  25.34 
 
 		 1011 aa  43.5  0.008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.15922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1026  recombination and repair protein  28.47 
 
 		 554 aa  43.5  0.008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4711  ATP-dependent endonuclease of the OLD family- like protein  34.15 
 
 		 648 aa  43.1  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0756  DNA repair ATPase  26.92 
 
 		 562 aa  43.1  0.009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000000414406  hitchhiker  0.0000280252 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09570  condensin subunit Smc  22.83 
 
 		 1199 aa  43.1  0.01  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.244608 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0004  DNA replication and repair protein RecF  47.62 
 
 		 371 aa  43.1  0.01  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.244423  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>