82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_32662 on replicon NC_009361
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009361  OSTLU_32662  predicted protein  100 
 
 
1060 aa  2186    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.429677 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_31021  Protein involved in recombination repair  26.58 
 
 
1063 aa  290  1e-76  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.109982 
 
 
-
 
NC_006686  CND03960  DNA repair-related protein, putative  25.88 
 
 
1125 aa  290  1e-76  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10415  DNA repair protein Rad18, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G05440)  24.54 
 
 
1146 aa  274  7e-72  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0107863  hitchhiker  0.00000500177 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29255  predicted protein  22.76 
 
 
1076 aa  131  9.000000000000001e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.170598  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_28237  predicted protein  37.65 
 
 
220 aa  112  5e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.359759  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_54192  predicted protein  29.11 
 
 
1099 aa  70.9  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30460  structural maintenance of chromosomes protein  29.11 
 
 
1093 aa  64.7  0.000000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.157057 
 
 
-
 
NC_006686  CND06390  nucleus protein, putative  23.17 
 
 
1157 aa  64.3  0.00000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0985  SMC domain-containing protein  24.84 
 
 
702 aa  60.5  0.0000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000497741 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08742  structural maintenance of chromosome complex subunit SmcA (AFU_orthologue; AFUA_6G02700)  33.64 
 
 
1185 aa  59.7  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.183997  normal  0.16607 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1819  SMC domain-containing protein  32.58 
 
 
702 aa  55.5  0.000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.000524613  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0302  SMC domain-containing protein  27.21 
 
 
702 aa  55.5  0.000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0748  SMC domain-containing protein  21.7 
 
 
935 aa  55.1  0.000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.874201  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2587  chromosome segregation protein SMC  35.71 
 
 
1189 aa  54.3  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3002  chromosome segregation protein SMC  25.79 
 
 
1192 aa  53.1  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1341  chromosome segregation protein SMC  24.35 
 
 
1196 aa  52.8  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0961  SMC domain protein  34.72 
 
 
891 aa  51.6  0.00008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000356641  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00691  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  36.36 
 
 
1196 aa  50.8  0.0001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2343  SMC domain protein  31.71 
 
 
912 aa  50.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00681  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  36.36 
 
 
1196 aa  50.8  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1245  SMC domain-containing protein  29.25 
 
 
693 aa  50.8  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1495  SMC domain protein  26.58 
 
 
895 aa  50.8  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0059  condensin subunit Smc  36.36 
 
 
1196 aa  50.8  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2776  chromosome segregation protein SMC  23.1 
 
 
1234 aa  49.7  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.371529  normal  0.187776 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2898  chromosome segregation protein  27.41 
 
 
891 aa  50.1  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2482  DNA repair protein RecN  39.06 
 
 
584 aa  49.3  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.315988  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0356  SMC domain-containing protein  23.04 
 
 
700 aa  49.3  0.0004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2736  chromosome segregation protein SMC  36.36 
 
 
1188 aa  49.3  0.0004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3030  SMC domain-containing protein  32.93 
 
 
406 aa  49.3  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.726851  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00661  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  35.06 
 
 
1194 aa  48.9  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0419  hypothetical protein  39.22 
 
 
421 aa  48.9  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.247719  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2437  SMC domain protein  25.69 
 
 
924 aa  48.9  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4093  SMC domain-containing protein  33.73 
 
 
1022 aa  48.5  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.240758  normal  0.708538 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0003  DNA replication and repair protein RecF  30.7 
 
 
370 aa  48.1  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0905  SMC domain-containing protein  33.33 
 
 
1022 aa  48.1  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.995306  hitchhiker  0.000299578 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01211  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  52.5 
 
 
1201 aa  47.4  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0068  Rad50 zinc hook domain protein  25.64 
 
 
864 aa  47.8  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.191393  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1420  condensin subunit Smc  52.5 
 
 
1183 aa  47.4  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1381  chromosome segregation protein SMC  33.33 
 
 
1184 aa  47.8  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.530369  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0257  ATPase  39.29 
 
 
403 aa  47.8  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.116042  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0527  chromosome segregation protein SMC  50 
 
 
1193 aa  47.8  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.534964 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03271  hypothetical protein  46.81 
 
 
1184 aa  47.8  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0371  chromosome segregation protein  33.73 
 
 
890 aa  47  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1233  DNA repair ATPase  24.28 
 
 
551 aa  47  0.002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.337705  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1691  DNA repair protein RecN  36.99 
 
 
557 aa  46.6  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.893605  hitchhiker  0.00244544 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1325  DNA repair protein RecN  30.25 
 
 
529 aa  47.4  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.11608  normal  0.581272 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00651  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  52.5 
 
 
1207 aa  47.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.929261  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1031  DNA repair protein RecN  32.91 
 
 
572 aa  47  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4429  chromosome segregation protein SMC  47.5 
 
 
1190 aa  46.2  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0334  chromosome segregation protein SMC  47.5 
 
 
1198 aa  46.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.452064  normal  0.638019 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3429  chromosome segregation protein SMC  22.34 
 
 
1218 aa  46.2  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4729  DNA repair protein RecN  30 
 
 
553 aa  46.2  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.574204  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1174  hypothetical protein  26.52 
 
 
682 aa  46.2  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.37094  normal  0.121319 
 
 
-
 
NC_006684  CNB02640  cohesin complex subunit psm1, putative  36.92 
 
 
1202 aa  46.2  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.176363  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0762  SMC domain-containing protein  25.11 
 
 
858 aa  46.2  0.003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0108669  decreased coverage  0.00239369 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1551  condensin subunit Smc  47.5 
 
 
1219 aa  46.2  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.177198  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0425  chromosome segregation protein SMC  50 
 
 
1204 aa  45.8  0.004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.501211  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1750  SMC domain protein  22.73 
 
 
445 aa  45.8  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.524117  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0004  DNA replication and repair protein RecF  46.67 
 
 
371 aa  45.8  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.244423  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1499  condensin subunit Smc  47.5 
 
 
1174 aa  46.2  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2009  hypothetical protein  34.78 
 
 
922 aa  45.8  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2255  condensin subunit Smc  50 
 
 
1202 aa  45.8  0.004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.204212 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0592  condensin subunit Smc  47.5 
 
 
1175 aa  45.8  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1274  DNA repair protein RecN  37.25 
 
 
595 aa  45.4  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0644  DNA repair protein RecN  42.86 
 
 
592 aa  45.4  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.659362  normal  0.0659728 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1390  chromosome segregation protein SMC  22.68 
 
 
1191 aa  45.4  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0475682 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2045  condensin subunit Smc  47.5 
 
 
1195 aa  45.4  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.265343  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1544  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.77 
 
 
731 aa  45.1  0.006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1491  chromosome segregation protein SMC  45 
 
 
1226 aa  45.4  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1594  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.77 
 
 
543 aa  45.4  0.006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.489984  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1464  chromosome segregation protein SMC  45 
 
 
1226 aa  45.4  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2683  hypothetical protein  31.43 
 
 
478 aa  45.1  0.007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.497582  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0744  chromosome segregation protein SMC  45 
 
 
1217 aa  45.1  0.007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1332  SMC domain-containing protein  34.78 
 
 
993 aa  45.1  0.008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0005  DNA replication and repair protein RecF  25.45 
 
 
401 aa  45.1  0.008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0596  DNA repair protein RecN  26.67 
 
 
572 aa  44.7  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1709  exonuclease SbcC  23.83 
 
 
1008 aa  44.7  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1831  chromosome segregation protein SMC  47.5 
 
 
1147 aa  44.7  0.009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1789  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.58 
 
 
729 aa  44.7  0.009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000025801 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0137  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.58 
 
 
732 aa  44.7  0.009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0586  SMC domain-containing protein  34.78 
 
 
993 aa  44.7  0.01  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.594919  normal  0.0182683 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>