112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_29255 on replicon NC_009355
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009355  OSTLU_29255  predicted protein  100 
 
 		 1076 aa  2236    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.170598  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08742  structural maintenance of chromosome complex subunit SmcA (AFU_orthologue; AFUA_6G02700)  31.33 
 
 		 1185 aa  397  1e-109  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.183997  normal  0.16607 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_54192  predicted protein  28.15 
 
 		 1099 aa  327  6e-88  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30460  structural maintenance of chromosomes protein  25.05 
 
 		 1093 aa  311  4e-83  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.157057 
 
 
-
 
NC_006686  CND06390  nucleus protein, putative  30.38 
 
 		 1157 aa  182  2e-44  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32662  predicted protein  22.62 
 
 		 1060 aa  127  1e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.429677 
 
 
-
 
NC_006686  CND03960  DNA repair-related protein, putative  23.54 
 
 		 1125 aa  98.6  6e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_31021  Protein involved in recombination repair  21 
 
 		 1063 aa  91.3  8e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.109982 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_19472  predicted protein  27.48 
 
 		 1186 aa  67.8  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.222049  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1819  SMC domain-containing protein  31.53 
 
 		 702 aa  65.9  0.000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.000524613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0302  SMC domain-containing protein  31.96 
 
 		 702 aa  60.8  0.0000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0356  SMC domain-containing protein  38.36 
 
 		 700 aa  59.7  0.0000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_30352  predicted protein  24.27 
 
 		 1213 aa  59.3  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0173  chromosome segregation protein SMC  22.41 
 
 		 1172 aa  59.3  0.0000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05899  Condensin subunit [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8J150]  26.23 
 
 		 1179 aa  57.8  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.566819 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0985  SMC domain-containing protein  29.91 
 
 		 702 aa  55.8  0.000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000497741 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_641  chromosome condensation and segregation protein  24.17 
 
 		 1011 aa  55.5  0.000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.15922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59451  Chromosome segregation and condensation  21.39 
 
 		 1171 aa  55.5  0.000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.819288  decreased coverage  0.00000261165 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0642  chromosome segregation protein SMC  27.03 
 
 		 1189 aa  55.5  0.000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00029691 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2045  condensin subunit Smc  25 
 
 		 1195 aa  54.3  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.265343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4025  chromosome segregation protein SMC  30.25 
 
 		 1188 aa  54.3  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.115508  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1551  condensin subunit Smc  23.56 
 
 		 1219 aa  54.3  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.177198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0708  chromosome segregation protein SMC  28.23 
 
 		 1189 aa  53.9  0.00001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.208267  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0747  chromosome segregation protein SMC  22.68 
 
 		 1146 aa  54.3  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.204801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2124  chromosome segregation protein SMC  28.42 
 
 		 1191 aa  53.5  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00819579 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0181  condensin subunit Smc  26.71 
 
 		 1189 aa  53.5  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.797796  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0985  chromosome segregation protein SMC  27.78 
 
 		 1191 aa  53.5  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.112036  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0655  condensin subunit Smc  29.38 
 
 		 1183 aa  53.1  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0216  chromosome segregation protein SMC  30.86 
 
 		 1181 aa  52.8  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0744  chromosome segregation protein SMC  25.12 
 
 		 1217 aa  53.1  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4429  chromosome segregation protein SMC  23.91 
 
 		 1190 aa  52.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4689  condensin subunit Smc  26.04 
 
 		 1208 aa  52.8  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1276  chromosome segregation protein SMC  20.58 
 
 		 1189 aa  52.4  0.00004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.526592  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0961  SMC domain protein  25.23 
 
 		 891 aa  52.4  0.00004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000356641  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0181  chromosome segregation protein  25.56 
 
 		 902 aa  52.4  0.00004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1889  chromosome segregation protein SMC  28.75 
 
 		 1214 aa  52.4  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.274558  normal  0.174948 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4465  chromosome segregation protein SMC  23.77 
 
 		 1175 aa  52.4  0.00005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1291  chromosome segregation protein SMC  28.75 
 
 		 1198 aa  52.4  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.898682 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1181  chromosome segregation protein SMC  28.75 
 
 		 1198 aa  52  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.733756  hitchhiker  0.000532551 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7990  chromosome segregation SMC protein  31.68 
 
 		 1227 aa  52  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.900943  normal  0.462175 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09570  condensin subunit Smc  29.01 
 
 		 1199 aa  52  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.244608 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2843  chromosome segregation protein SMC  23.2 
 
 		 1175 aa  51.6  0.00008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1145  chromosome segregation protein SMC  30 
 
 		 1263 aa  51.6  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00888217 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02963  subunit of the multiprotein cohesin complex (Eurofung)  22.34 
 
 		 1261 aa  51.2  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.869659  normal  0.319828 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2463  chromosome segregation protein SMC  23.55 
 
 		 1144 aa  51.2  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000141924  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12936  chromosome partitioning protein smc  27.5 
 
 		 1205 aa  50.8  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0598484  normal  0.252083 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2495  condensin subunit Smc  29.63 
 
 		 1222 aa  50.4  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.749634  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0917  SMC domain protein  23.16 
 
 		 1180 aa  50.4  0.0002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1031  DNA repair protein RecN  30.65 
 
 		 572 aa  50.1  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_28237  predicted protein  30.13 
 
 		 220 aa  50.1  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.359759  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2235  chromosome segregation protein SMC  28.75 
 
 		 1195 aa  50.1  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000934649 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2550  chromosome segregation protein SMC  28.75 
 
 		 1191 aa  50.4  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.355324  normal  0.42272 
 
 
-
 
NC_006692  CNG04180  nuclear condensin complex protein, putative  26.14 
 
 		 1215 aa  49.7  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.360826  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0257  ATPase  36 
 
 		 403 aa  49.7  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.116042  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3716  DNA replication and repair protein RecF  28.36 
 
 		 359 aa  49.7  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.362635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2175  chromosome segregation protein SMC  30.23 
 
 		 1194 aa  49.7  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4188  chromosome segregation protein SMC  29.38 
 
 		 1194 aa  49.7  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.269339  normal  0.69068 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3541  exonuclease SbcC  29.41 
 
 		 1003 aa  49.3  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.757761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5952  chromosome segregation protein SMC  31.3 
 
 		 1194 aa  49.7  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1953  condensin subunit Smc  29.38 
 
 		 1195 aa  49.3  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1999  condensin subunit Smc  29.38 
 
 		 1195 aa  49.3  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.463394 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1462  chromosome segregation protein SMC  29.63 
 
 		 1186 aa  49.3  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0128703  normal  0.569809 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1933  condensin subunit Smc  29.38 
 
 		 1195 aa  49.3  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00525455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2076  chromosome segregation protein SMC  29.38 
 
 		 1217 aa  49.3  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.164859  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3597  chromosome segregation protein SMC  30.25 
 
 		 1222 aa  48.9  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2776  chromosome segregation protein SMC  28.75 
 
 		 1234 aa  48.9  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.371529  normal  0.187776 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2514  chromosome segregation protein SMC  25.37 
 
 		 1170 aa  48.9  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0530303 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1491  chromosome segregation protein SMC  23.94 
 
 		 1226 aa  48.9  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00661  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  25 
 
 		 1194 aa  48.5  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1332  SMC domain-containing protein  21.9 
 
 		 993 aa  48.9  0.0006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1464  chromosome segregation protein SMC  23.94 
 
 		 1226 aa  48.9  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1571  chromosome segregation protein SMC  26.44 
 
 		 1170 aa  48.5  0.0007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0762  SMC domain-containing protein  31.58 
 
 		 858 aa  48.1  0.0008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0108669  decreased coverage  0.00239369 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0863  condensin subunit Smc  22.76 
 
 		 1174 aa  48.1  0.0009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06364  Chromosome segregation protein sudA (DA-box protein sudA) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00737]  26.26 
 
 		 1215 aa  48.1  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23830  condensin subunit Smc  28.12 
 
 		 1213 aa  47.8  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_52607  predicted protein  23.94 
 
 		 1232 aa  48.1  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2952  chromosome segregation protein SMC  23.83 
 
 		 1171 aa  47.8  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0128917  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8008  chromosome segregation protein SMC  30.25 
 
 		 1224 aa  48.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0068  Rad50 zinc hook domain protein  26.98 
 
 		 864 aa  47  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.191393  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02930  chromosome associated protein, putative  24.29 
 
 		 1208 aa  46.6  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.828344  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1228  condensin subunit Smc  24.71 
 
 		 1165 aa  47.4  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.31729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6051  chromosome segregation protein SMC  22.86 
 
 		 1170 aa  47  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2026  chromosome segregation protein SMC  22.86 
 
 		 1170 aa  47  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.676203  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1570  condensin subunit Smc  28.4 
 
 		 1188 aa  47  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.069704 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1012  condensin subunit Smc  21.43 
 
 		 1149 aa  46.6  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.750966 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3590  chromosome segregation protein SMC  24 
 
 		 1204 aa  47  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0968509  normal  0.0336538 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2046  chromosome segregation protein SMC  22.86 
 
 		 1170 aa  47  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.884019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1669  chromosome segregation protein SMC  22.37 
 
 		 1174 aa  46.6  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1159  chromosome segregation protein SMC  29.01 
 
 		 1203 aa  47  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0977  chromosome segregation protein SMC  29.38 
 
 		 1172 aa  47.4  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1888  chromosome segregation protein SMC  24.82 
 
 		 1171 aa  46.6  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.531391  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1401  condensin subunit Smc  24.32 
 
 		 1168 aa  46.6  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.934786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0930  ATPase for DNA repair  29.01 
 
 		 555 aa  46.2  0.003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2086  chromosome segregation protein SMC  22.37 
 
 		 1174 aa  46.2  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.87089 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1250  chromosome segregation protein SMC  22.86 
 
 		 1206 aa  46.2  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1637  chromosome segregation protein SMC  26.44 
 
 		 1170 aa  46.2  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  26.57 
 
 		 1191 aa  46.2  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44165  predicted protein  23.15 
 
 		 1356 aa  46.2  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2026  chromosome segregation SMC protein  25.1 
 
 		 1168 aa  46.6  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.557942  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>